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scnpilot_p_inoc_scaffold_1720_7

Organism: scnpilot_dereplicated_Chloroplast_Parachlorella_1

partial RP 20 / 55 BSCG 17 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 12520..17004

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01324}; EC=2.7.7.6 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01324};; PEP {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01324}; Plastid-encoded RNA polymerase subun similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 94.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2800
  • Evalue 0.0
rpoC2; DNA-directed RNA polymerase delta subunit RpoC2 (EC:2.7.7.6) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 44.2
  • Coverage: 539.0
  • Bit_score: 424
  • Evalue 1.50e-115
DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' n=1 Tax=Parachlorella kessleri RepID=C7BEV3_PARKE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 94.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2800
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parachlorella kessleri → Parachlorella → Chlorellales → Trebouxiophyceae → Chlorophyta → Viridiplantae

Sequences

DNA sequence
Length: 4485
ATGTCAAAATTCACGTTTAGAAATTCTTCAAAAACTTATTTTTTTAATGCGTGTTTTGATAAAAATCAATTAAAAAATCTTATTAGTTGGTTTATTAAAAATTCTGGTGAAAAAATTACTGTCGATTTTTTAGAAACAATAAAACAAATAGGTTTTCATCAAGCAACTGTAGCTGGTGTTTCATTAGGATTAGATGATCTTCAAATTCCATCGCAAAAATCTTTATTAATTTCTCAAGCAAAAGCGGAAATTTCTTTATTTAAACAACAAAATAGTAGTGGAAATTTAACCAGTGTAGAAAAATCTCAACAAATGATTTCAACGTGGAATCAAACTAGTGAAGTTCTGAGAAAAACTACCGTACAACAATTTAAAAATAATAATCCAGTAAATCCTGTTTACATGATGGCATTTTCTGGAGCACGAGGAAATATTTCTCAAGTTCGTCAACTTGTTGCTATGCGAGGATTAATGGCAGATCCTCAAGGTGCTATATTAGAATTTCCCATTCAAAGTAATTTTCGTGAAGGCCTTACACTAACCGAATATCTTATTTCATGTTATGGTGCACGAAAAGGTTTAGTGGATACTGCATTAAGAACCGCTACTTCAGGATATTTAACAAGACGTTTAGTGGATGCAGCTCAACATGTTATTGTTTCAACAAAAGATTGTGGTACAACTCAAGGGTTGAGGTTAAAAAATAAAGATTTAGAACAACATTTAGTAGGCCGTGTTTTATCAAAAGATTTAGTATTAAAACAAATTTTTCATTTAAACACAAATCAAATAATTACCCCTACTCTAGCTAAATTAATATCAAAAAACGTTAAAGAAGTTTTTGTAAGATCTCCTTTAACTTGTCAAGCAGAAAATTCAATATGTCAATTATGTTATGGTTGGAATTTAGCACATGGCAATTTAGTTAGCATAGGTGAAGCTGTTGGAGTTATTGCTGCTCAATCTATTGGAGAACCCGGTACCCAATTAACTATGCGTACTTTTCATACAGGGGGTGTTGGAATTTTTTCAGATCAAGCTATGAAATATTTTATAGCTCCTTATGATGGAATAATCGAATATACTGCAGGATTACCAGGTCATTTTGTTAGAACGCCACATGGTAAAATTGTTTATATGTTAAAAAATACTGGTAATACTACTCAGAACATTATTTTAAAACTTAAATCATTTGATACAAAACAACCACAATATTTAATAAAAAAACAAGAATTACCTGCAGGTAGCATATTATTAGTACGACATGGTGAAACTGTTCAAACTGGAAAAGTGTTGGCTCAATCATCACAATTTAAAAAATCTAAACAAAAAATGCCGGAATCTACCTATCCTGTTTTTTCGCCAATTGATGGACAAATTTATTTTGAATCAATGACTATTTTAAAACAAAAACAATTTCCACCAAAAACTAAAAAAACAAAAAAAATACAAAAAAAACAAAATGAAATAGGCCCTTATATTCGAACATTAAAAGGATTAGGTGCTTTTTGGGTTTTTTCCTCTGAAAATCAGCACGAATTTCATATTGCAAAAACTATACTTCGACCTGGAGATTTAGTTTCCATTAATAGTTCATTATTTCAATATGATTTTTACGTAGCTAATAGAAGTAATTTTTATACTATTTTAAAGAAACGTTGTTTAGGTTTAAATCTTGTTTCATTATCACTGCAAAAAATAAATTTTCATAAAGTAGCTTATTCCATGCTATTAAAAAATTATTCAGGGTTTACTACACTTTCCAAAAAGTTTGAAAACAAACTAGGTTCCAAAAACAAAGTTTTTGGAAAAGAAAATCGATCTAATCAAAAAGAATTTTTATTTTTTAATAAAAAAGGACTTCAAAATTTTTTAATTTGGTTTCCAAAAACATCAGTTATACCTACTTCTGGATATTTTTTTAATTTTTTGTTTTATTCTGCAATAAAAAATAATATATCCAGTTTGTCTATATTTTCAAGTAAAGGTCAAAAAATTCTTCAGAATAATTGGTTTAACGGTAGTTTTTTTTATCTTCCAACTAAAATTCAAAAATGGTGTTTTGTACATTCTTTATTTTTACACAGTAAAAATGAAAATAAAAATGAATATAAAAAACCCCGTTTTCTAGTTTGTTTAAAAAATACTGGAATGACTTTTTTTTTAAAAAATCATTTCAAACAATCTTTATTATTACAATACCATCCTACACAGATAGGAATTTCAAGCAAAATTTCGTCACAAAACTTAAAAATAAAATTTTTCTATTCCAAGCAAAAAAATTATATTATTGAAGTTACTCCTAACATTGTCGATAACGGGATTTGCGTCCCTTCCATTAATGTAAAAGAAACTAAAGCACAAAATACTATTGCGTTAGCTACTAGCCTTTCGATTAACCATACTGATTTTTTAAAAACTGCTTTAAATAAAGTTAAATCTTCAATATCAGTTATATATAATACTTCTTCGATATTTTTTCAAGAAAAAAAAGGTTGGATTTATATTCCTTTTTCTAAAACCTCTGTGCTTCCTTTTTCTTTTCCTGTTTTAAAAGAACAGGAACCAACTTTGTTTTTAGAAAAGCAAAAGGGAAAGGAAAAAGAAACAAGAAAAAAAGTAATTAATAAATTTAAAACAAATAAAAAATCATTTATTTTGGAACAAGGAAAAAGATTTGATAATTTATCATTTTTCAATTCCAAAACATCTATTACATATATTCCTACAAATAAAATTGGATTAATTAAATCATTTAAAAACAAAAAGTCAAATAGATATTACCAAAATATTTGGTATTCTAAAGAACATTTTTTAACAAACAATTCTTTTTGTTCTGAAAAAGCAAATTATTCAGAAAAAATTTACCAAAATACTAGTAACTTTAATTTTTCTCAAAATAAAAGAAATTCTATTGAATGTTTTTTATACTATAAACTACAAAATGGAGATTTTAATTTAAATAACAATAAACCAAATATAAATATGAGACCTGTGGTAAGAAAAACTCAACAAGTTAATTCAAATACAACAAAATGTTTTTTCTTTGTTTCTCGAATAAATGAATTTTCTTTACCACAAAAACAACATTTAATTAACCAATGGAATAGTATGAAAAAAATTAATACTATTTGTTTAACAAATTCACCTTTATTTACAAAACAACAATCTACCATTTTTCAAAACAATCCACAACTAAGAAAAAAATTCCAATTGGTACTATCTGTATCTCGAGGTTGGTTTTTGTCCAAAAATATTTTTAAACTATTAATTAATTTAAATGCCCCTTTGTTATTTAAAGGAGTAAATCAAAGTTATTTTTTATCAAATTATGTAAAAAAACATAAACTACCTGTTCTAGGTTTAAATTTATTTTTCTACAATTTTCTCTCATTACCTGAAAATATTTCATTTTATTTTGAAATATTTGAAAATAGTTGGGTGATTCCCAATAATAAAATAACTACAAGTTTTGTTAAAATAACAAAAGATGGCGAATTTCGAAGTTTGAAATCAAAACAAAATACCAGTGTTATATGTATTTTGACAAGAAAAAATCTTGTCACATTAAATTTATTTGATACAAAAAACTTTAATAAAAATAAACAAGTTCAAATAGGTAGTATTCTTCGTTTGGGAACAGAAATTTTTCCTGGTATTGCATCTTCAACTAGTGGTTTTATTTTAAACAAAAATTTCACTCAATTTACCATTCGTTTAGGTATTCCTTTTTTAGCATCTGCTCGTGGAATTATTCATATCTTTCAACATGATTTAATCAAAAAAAATGATCTTTTAGTTACATTAAAATCACGACGTTTACAAACGGAAGATATTGTACAAGGTATTCCAAAAATTGAACAGCTTTTTGAAGCACGAGAGACTCATGGTGGTACGCTTATTCGAAATAGTGTACATAATCGTTTGAAAAAATATTTTATATCATCATTAAAATACAAAAAAGTATCAATTCACAATCTCCATACTAATTTATCAGAAGCTGTAGCTGATAGTTTAAATAAAATCCAGTTTTATTTAGTCCAAAGTATTTTACAAGCTTATTCTTCACAAGGAGTAAAACTTTCTCAAAAACACATTGAGATTATTGTTCGCCAAATGACCACTCGAGTACGTATATTAGCTGGTGGGGATAGTGGTTTATTACCTGGTGAACTTATCCCATTTATAAGAATACAAAAATTAAACAATCAACTTTGTTCTCTAGGTAAACGTCCAGCTATTTATGAACCTATTATTCTTGGAATTACAAAAAGTGTTTTACAATCAGAAAGTTTTCTTTTATCAGCTAGTTTTCAAGAAGTTAGTAGAGTTTTAGTTCGAAGTGCTTTAACTAAAAAAACAGATTTTTTACGAGGATTGCATGAAAATGTAATTTTAGGACAATTGATTCCAACAGGAACAGGATTAGTTTCCTTTTCTACAAACAAAGTTGGTTCCGCTTCGATTTCTTTTTCAAAAACTTAG
PROTEIN sequence
Length: 1495
MSKFTFRNSSKTYFFNACFDKNQLKNLISWFIKNSGEKITVDFLETIKQIGFHQATVAGVSLGLDDLQIPSQKSLLISQAKAEISLFKQQNSSGNLTSVEKSQQMISTWNQTSEVLRKTTVQQFKNNNPVNPVYMMAFSGARGNISQVRQLVAMRGLMADPQGAILEFPIQSNFREGLTLTEYLISCYGARKGLVDTALRTATSGYLTRRLVDAAQHVIVSTKDCGTTQGLRLKNKDLEQHLVGRVLSKDLVLKQIFHLNTNQIITPTLAKLISKNVKEVFVRSPLTCQAENSICQLCYGWNLAHGNLVSIGEAVGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVGIFSDQAMKYFIAPYDGIIEYTAGLPGHFVRTPHGKIVYMLKNTGNTTQNIILKLKSFDTKQPQYLIKKQELPAGSILLVRHGETVQTGKVLAQSSQFKKSKQKMPESTYPVFSPIDGQIYFESMTILKQKQFPPKTKKTKKIQKKQNEIGPYIRTLKGLGAFWVFSSENQHEFHIAKTILRPGDLVSINSSLFQYDFYVANRSNFYTILKKRCLGLNLVSLSLQKINFHKVAYSMLLKNYSGFTTLSKKFENKLGSKNKVFGKENRSNQKEFLFFNKKGLQNFLIWFPKTSVIPTSGYFFNFLFYSAIKNNISSLSIFSSKGQKILQNNWFNGSFFYLPTKIQKWCFVHSLFLHSKNENKNEYKKPRFLVCLKNTGMTFFLKNHFKQSLLLQYHPTQIGISSKISSQNLKIKFFYSKQKNYIIEVTPNIVDNGICVPSINVKETKAQNTIALATSLSINHTDFLKTALNKVKSSISVIYNTSSIFFQEKKGWIYIPFSKTSVLPFSFPVLKEQEPTLFLEKQKGKEKETRKKVINKFKTNKKSFILEQGKRFDNLSFFNSKTSITYIPTNKIGLIKSFKNKKSNRYYQNIWYSKEHFLTNNSFCSEKANYSEKIYQNTSNFNFSQNKRNSIECFLYYKLQNGDFNLNNNKPNINMRPVVRKTQQVNSNTTKCFFFVSRINEFSLPQKQHLINQWNSMKKINTICLTNSPLFTKQQSTIFQNNPQLRKKFQLVLSVSRGWFLSKNIFKLLINLNAPLLFKGVNQSYFLSNYVKKHKLPVLGLNLFFYNFLSLPENISFYFEIFENSWVIPNNKITTSFVKITKDGEFRSLKSKQNTSVICILTRKNLVTLNLFDTKNFNKNKQVQIGSILRLGTEIFPGIASSTSGFILNKNFTQFTIRLGIPFLASARGIIHIFQHDLIKKNDLLVTLKSRRLQTEDIVQGIPKIEQLFEARETHGGTLIRNSVHNRLKKYFISSLKYKKVSIHNLHTNLSEAVADSLNKIQFYLVQSILQAYSSQGVKLSQKHIEIIVRQMTTRVRILAGGDSGLLPGELIPFIRIQKLNNQLCSLGKRPAIYEPIILGITKSVLQSESFLLSASFQEVSRVLVRSALTKKTDFLRGLHENVILGQLIPTGTGLVSFSTNKVGSASISFSKT*