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scnpilot_p_inoc_scaffold_9525_curated_1

Organism: scnpilot_dereplicated_Flavobacteriia_1

near complete RP 53 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: comp(2..4186)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
CHU large protein; uncharacterized n=1 Tax=Cytophaga hutchinsonii (strain ATCC 33406 / NCIMB 9469) RepID=Q11WU1_CYTH3 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 26.5
  • Coverage: 814.0
  • Bit_score: 200
  • Evalue 1.50e-47
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 37.0
  • Coverage: 349.0
  • Bit_score: 172
  • Evalue 8.20e-40
Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_RIF_OD1_02_44_15_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 30.2
  • Coverage: 786.0
  • Bit_score: 229
  • Evalue 3.30e-56

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RLO_RIF_OD1_02_44_15 → RIF-OD1-2 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4185
ATGGAAATATTTTACAAAAAATTTAGAGTAAAAACCAGATTACTGGGCGTTTTAACTTTTGCGCTTTTACTTTTTGGTATAAGTGCGAGGAGCTGGGGACAGTGTACGAACGACGCTTACGGGCAATACCCTACAGGCACATCTACTTGCCCTAACCAAGGCAGCTGGACGAATATAGCTACAAATACATATCGTGGGGAATACTCTTTGGTATCTGTTGTTGAAGGATTTACCTACATGTTTGGAAGTTCTGTAGCTACGGATATAACTACAATTGCACAAACGGACAACACTGTTTTAGCGTACGGAACCCAAAACGCAACATGGACCGCTACTTTTACCGGAAATGTTCGTTTTTGGACGCATGGAGCATCATGTGCTACTGGAAGTGGCAACCGAACAAGGCGTTGGCAGATAACAGGAACACCGACAACTGTTGCTTTCGGCATTAATACATGGAATGTCGCTGCTTATAACGGTGGCACTTGGAATGCAACTAATTTTTTAAATCTGACAGGAGCAACTTATAGAGGGTATTATGTGGATAATACATTGAATATTAATACATCAGGTAGATGGGGGGTAACAGCTTCTCCAAGTGCGGCACCAGGTTATGCAGGTTGTTCCGTCAACAACAATCAGCATATATTTGTTTACAAACGTAAAGGATTCCCTACGGGCTGCTATTCTATATCAGATATTTTATTTGATGATGCTATACGTATTTATGTCAATGGCGCTCAGGTTTATGAAAATACCGGTTGTTGTGCTATGACCGGGCTGGCATGGTCCGGAAATTTAGATGCAAATAGTGAGGTTGAAATTCGCGTAGCAGAAAACTCTGGGGATAGCCGTCTTATTCTTAACTTTGTCCTTAATACACCCATTGCTAATCCAGGCTCTGATCAAACCATTTCTTGTGGGAATAATAGCGTACAACTGGGAACATCCATAGATGTTTTTGATGATTTTGAGACTGGTACTGGGAACTGGACATTCACTTCACCATGGGCACGCAGCACAGGTATTTCAACTATAACAAACCGATCAGGATCATCTTATTTTGCGCTAATGACAGGTGGTAGCGGTAATAACGGCTATTATCTTACATTTAACGGGACCTTACCGGCAGGTACTTCAAGGAAAATTTCATTTTATTTTATTAATCCCGGCAACTCATCTGCTGGATTTGATGAGGCATTTTTAGATTATTACAATGGTTCTTCATGGACAACACTGGCGGATATTGACAATGGTGCTGGCAGTGGTACCTCTACAGACGGATGGATTTATAAAGAGTACACTATTCCTGATAATGCCACAAACCTTCGCTTTCGACCGAATATGTATAGTAATACTTATGACGGGATAGGCATCGATAATATTACTATAACAACCCCTTTAACTTATTCTTGGAGTCCTTCAACGGGGCTCAGCGCAACTAACATTTCTAATCCGGTGGCCAGCCCAACTGCTACAACTACCTACACCTTAACAACAACAGTCAATGGCTGTACTTCTGCACCTGCTTCGGTGACAGTGACAGTGAATCAATTCAATCCCGGTACTATTGCAGCAGACCAAACAATCTGCAACGGCACTAAACCAGTTGCATTCACCCAAACGTCTCCTACAGGAGGAGGAGGTGCTTACGCGTATCAATGGCAATCTGCAGCTAACTTAACCGGTGCATGGACTGATATTTCAGGTGCAACTTCAGCTACATATACGGAAAGTAACAACCTTACAGCAGATAAGTATTACAGACGTAAGGTAACGGATAATGATTGCGGAGTGGCTTATTCCACTCCTATAACACCTACTTCTAATTTAAGATTACATTATAAATTTGATGGGGTGATCCAGCCGAGAACTAATATTGTTACAAATACTGACTTAAATACAGGATGGGCGCAAGGATATCATAAAAGTATTATTTTTAATGAAATAGCTGCGCCATCTGGGATAAATTCTCCAACTGTTGGTTTTAACAGAGGCGATGCGTCCGGGTATTGGTATTCTTACGGAAATTATGCACCAGGACAAACGCCCGGGCAAACGTTCACTGTTTCAATTTATGTAAAGACATTAGATAATAACTTTAGAATAAGATGTTATACAGCTGATAATAGTGAGCTTGGCAGAGTATGGGGTGATTGGATGAGTGTTCCGAATGACGGAGCGTGGCATAGAGTCTCATGGACGATAGATATACCTGGTAATAGTCAATCAGAAAGTTTATCGTTTAATTATTCATATGGTATAAATGACCCTGTCGCTTACGGGAGCGCAGCAGGAGATCCTAATACAAGAACATGGCTTTGCGCTCCTCAAATGGAGATGGGACAGGGTGCAACGGCTTTTCATATTGGTACATTATCCTCCGCTTTAGTAACTGACTACTCCGGCAATGGTAATCGCGGGACGATTTCTTTAGCAACAGCACCTGTATGGGTAGCAGACAATAATAATGGCGTGAACGGAGGAGCATATCAGTTTAATGGAACATCACATATAGATGTAGGGAATTCTTCGTCATTACAAATAACAGGTAATCAGACTATTTCAATGTGGATAAACCCTGCTGTTTTAAATGATGGAGTGAGAAGAAATCCTTATGCAAAAGCATATGGAGGTGAAGGAACAATTACGCAGGAACCAGATGGCACCATCAATTACTATTACGGAACAAGTGGAGGTAACGGAGGAAGTTATCAGGGATTTACAATGTCAAGCCCTATAGCTGTAAATCAATGGGTTCATATTGCTATTGTCAGAGATTTAACAAATTCACAGTTGTACTGGTATAAAAACGGAGTATTAGTAAATCAAACTACAGCATTGTATAATCCAGCGGTAGCGGGAAGTTTACCAGTAACTATCGGGACAGGGTATGCCGGGAACTACAACGGAAAGATTGATGATATCAGAGTATATTCATCTGCACTTTCCGCAACTGATATAAAAGATTTATATGAACACTCGGCAGCATTACATGTAATTGTACAGGCACCTATTAACGAAGGAGCAATAGCTGCTGACCAAACAATATGTTACGGAGGAGATCCGGCTGTATTTACAAGTACAACAGCAGGAAGTGGTGATACCCGGGGCGCAGTTACGTATCGTTGGGAAAAGTCAGTCAGTCCATTTACTGCATGGAGCGCTATATCAGCTGCTACAGCAGCAACTTATGATGCACCTGCAGGTTTAACAGCAACCACCAAATATCGTAGGGTTACTATTGTTACTTTAAACGGTAAGGAATGCGAAAAAGAGTCAGCTCCGGTAACAGTAACAGTACACCCTCAATTCACATCAGGGACTATTGCAAATACAGGCGAAACAATTTGTAATGGTGGTGATCCGGCTGTCATTGGAAGCACAATTGCAGCAAGTGGAGGAGATGGTACAATAACTTATAAGTGGCAAGCTAATGGAATTGATATTGTAGGTAGTAATGCTGCCACATACGATCCTCCATCAGGATTAACTGCAACAACAACCTATACACGTTGGGTAAAAGACGGAACTTGTAACACAACATTTACCGTTTCAGCTAATTCGTGGACAGTTACAGTCGATCAGAAACCCACACTTCCGACTTCAATTACAGTAGATAACAATATGAATAACTGCTGGGGCAGAGAAATTACCTTAACAGCAAACGGTGGTACATTACAAGGTTCTTCCCAATATGTCTGGGGCACAACAAATGGTGGCAGCCAGCTGGGGACAACGGGCAACGGCACAAAAACACTAGTACCAACCGCATCGAATACATATTATGTCGGAGTTACAGCCAACGGCGCGTGTCCTGCTCAGAACTTAGCAACAGGAATCACGTATGCCCTTCCAACAAGAAATGCTTTGCTATCCTCGAACAGTTCCGGTACGTGCTACGTGAGTGGTTCCAATCCGATCCATTTCTATGATGCATCAAATAACTATATTGGTTCCATCAACCCACAAGGCAGAACAGGAATAGTAACCATGAGCACAAGTGTAGGCTCTCCTGCTATCCAGGGAGCTTGTGATCTGCCTTCCGATCCTAAATACAGGACAGCTTATCTGGGCAGAATAGTCCATGTTGATGGCAGCGGCCTGTCCGGCAGTGGTAATGTAGATGTAGTGCTGGCTTACAGTGATGCAGAGCTTTTAGCTTTACAGGTTCAGGCAGGCAAT
PROTEIN sequence
Length: 1395
MEIFYKKFRVKTRLLGVLTFALLLFGISARSWGQCTNDAYGQYPTGTSTCPNQGSWTNIATNTYRGEYSLVSVVEGFTYMFGSSVATDITTIAQTDNTVLAYGTQNATWTATFTGNVRFWTHGASCATGSGNRTRRWQITGTPTTVAFGINTWNVAAYNGGTWNATNFLNLTGATYRGYYVDNTLNINTSGRWGVTASPSAAPGYAGCSVNNNQHIFVYKRKGFPTGCYSISDILFDDAIRIYVNGAQVYENTGCCAMTGLAWSGNLDANSEVEIRVAENSGDSRLILNFVLNTPIANPGSDQTISCGNNSVQLGTSIDVFDDFETGTGNWTFTSPWARSTGISTITNRSGSSYFALMTGGSGNNGYYLTFNGTLPAGTSRKISFYFINPGNSSAGFDEAFLDYYNGSSWTTLADIDNGAGSGTSTDGWIYKEYTIPDNATNLRFRPNMYSNTYDGIGIDNITITTPLTYSWSPSTGLSATNISNPVASPTATTTYTLTTTVNGCTSAPASVTVTVNQFNPGTIAADQTICNGTKPVAFTQTSPTGGGGAYAYQWQSAANLTGAWTDISGATSATYTESNNLTADKYYRRKVTDNDCGVAYSTPITPTSNLRLHYKFDGVIQPRTNIVTNTDLNTGWAQGYHKSIIFNEIAAPSGINSPTVGFNRGDASGYWYSYGNYAPGQTPGQTFTVSIYVKTLDNNFRIRCYTADNSELGRVWGDWMSVPNDGAWHRVSWTIDIPGNSQSESLSFNYSYGINDPVAYGSAAGDPNTRTWLCAPQMEMGQGATAFHIGTLSSALVTDYSGNGNRGTISLATAPVWVADNNNGVNGGAYQFNGTSHIDVGNSSSLQITGNQTISMWINPAVLNDGVRRNPYAKAYGGEGTITQEPDGTINYYYGTSGGNGGSYQGFTMSSPIAVNQWVHIAIVRDLTNSQLYWYKNGVLVNQTTALYNPAVAGSLPVTIGTGYAGNYNGKIDDIRVYSSALSATDIKDLYEHSAALHVIVQAPINEGAIAADQTICYGGDPAVFTSTTAGSGDTRGAVTYRWEKSVSPFTAWSAISAATAATYDAPAGLTATTKYRRVTIVTLNGKECEKESAPVTVTVHPQFTSGTIANTGETICNGGDPAVIGSTIAASGGDGTITYKWQANGIDIVGSNAATYDPPSGLTATTTYTRWVKDGTCNTTFTVSANSWTVTVDQKPTLPTSITVDNNMNNCWGREITLTANGGTLQGSSQYVWGTTNGGSQLGTTGNGTKTLVPTASNTYYVGVTANGACPAQNLATGITYALPTRNALLSSNSSGTCYVSGSNPIHFYDASNNYIGSINPQGRTGIVTMSTSVGSPAIQGACDLPSDPKYRTAYLGRIVHVDGSGLSGSGNVDVVLAYSDAELLALQVQAGN