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scnpilot_p_inoc_scaffold_178_curated_1

Organism: scnpilot_dereplicated_Flavobacterium_2

near complete RP 53 / 55 MC: 3 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(1..9903)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
YD repeat protein n=1 Tax=Flavobacterium johnsoniae (strain ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101) RepID=A5FMC0_FLAJ1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 46.1
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  • Bit_score: 1450
  • Evalue 0.0
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:KGO78770.1}; Flags: Fragment;; TaxID=1406840 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium.;" source="Flavobacterium beibuense F44-8.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 42.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2499
  • Evalue 0.0
YD repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 46.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1450
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Flavobacterium beibuense → Flavobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 9903
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PROTEIN sequence
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MYIPKRLFILVFTLFTAFVFGQQEETMGGHSSGSQLHSLPMLQVTDPKYAFLSQQNVFTSVDPAVYVHFGFQDDLINMGANLAIYSCEVRLKIMPFNNSNGSLSAYNITLKIKRDNVNEAAKMNDYVVYKLPGIHKANVAVEDIRYMDAMDQAIPLVSNSAAYLRLSFKTDRYYNIKNTTVNPVTRRLIKYNGMSEMVVNNVSDGAEELEINWTRYNDAPATEYELEWTWVDNFGPNGTKLLPNQIALTEQDFKLNSTRVQTKELKYRIPLVFSKGYLVYRVRPVGRFLDDTKKSYFGTWSSGLAGAFQNVASWGTFLEIDADHEVGKKNWQYQASFAEDGKKKEVVSYFDGTLRSRQTVTKTNTNNKTIVGESVYDNQGRVAIEVLPTPIEASGIRYYRDLNKNDNGKVFTHHDFDWDRLNGLICEPIVPPGMSKSSGASKYYSEENTILGNYQDYVPNANKYPFSQIEYTPDNTGRIRRKGSVGQELQLGTGHEMSYFYLQPDQEELNRLFGYKVGDFKRYKKNVVVDPNKQISISYMDPQGRTIATALAGDNQEEPMVSLEDETNTALHQKTTTNVLSNNDAYATGLNGILLDGVRLNKQIGVVKDEALTFNYGFTHLTNSYTDYCMGGKHYPFVFDWIIRLMDDCGNDLLLRRGGGPPSYMRLGVVNLNLFTPAPPMAFSTVAGTGVLKIGSYTLNKDIRVNQAALEQYADDYITLLKQETNVCYPDLGAFTVDINEEDCHVTCRSCEEALICTYLTPQECAAYRTTFPAGTDESVLGDINVREYYVLLAERKYVIDNLNTNFGGSSFAYNGSLFVDQNGLVSQYTINIYVTRFKKELRAMLDGCRELCIQPGDTCNINTSILLSDVSPHGQYGSISGIDFPTAQPGGTTTPATSVDDTLSLFNEDNQLLYGGSSTQTYVDLDTGLTVTQNVSNYNWRRPATPYMDDNGDFAKVKVERINYNTYIPEVMPSASVEDDPLDPTSNNKYVRPQYLRNVTDFVNNWQASWAEALLPYHPEYQYLKYNKAICAKTNSAGDNSDSFDEKLKGMDYTNVFTTNGIVQNLVNITANDPFYNSQITTMPAQGISYEVETAADFNLRRNLLQEAMNTNYEGIKLANNARLNMLQMAYYTTVFGNGIAPASVYQSLVTTPVNQLLPILNALNPSEKERVWKSFMNNYIAFKQKTRTVYSHMFALRNSGYNGCIGDVQNVDTFVTLFEKYNTTSNYTNLLQRINQAFATPVPTTPAGTILACSTTTVGYYKNKEKRFISADYGFNSGVPGAQAIADATADADAHTYQQTGKCPLLVDTESLLKGLINPSFQSQGLLLYGFNAYSMPMLTPDLFNSVLLDPAAYAANPQNVTINGNIVNGGASLNLTFNTASGSIAQPIELRILTQSLAIGYYMNGCNETLPAPTWTAYNTNFKIVDFKNIYYVPGSFNPANNTYKFQIVAVLKRLTGTSCPALEEIVLEGTIKAAIGQCSFGDSAGETGENCDKRVRFEKALVRVMNALKGTNPNIPGQLFTSGVALNGAPNDKYTYGSSVMPEVLSDLALNSTWSCSVNTSFTVNGPTPFTIYNLVNESGNPSFLPGSFYRVTGIKIEKNMVNGVASGDDKIAISYLDLKDQVFTLNGRITPLNYSCICTEEVSQMQVAGANFLNLTNHLWSVGGNSGPFLPSIIADGYNPVEMQAVAPYIIGNNPTVNQYTTSWSNGLSTQSGIKFNFFAGSSACQFELPLYTYPKRGGTFNTYVQSITHFSNFKILQDLGNNTYAFSVFVHHGPFSDGDRFGSTFPAGIQEAYGTISCLQQAFCEEEFGVTNALTSVLKDLIQKQTVADGSTANGLPALNTYVQLSGAAPSASINNFYKVENSATSQIGFTFAKESECEVVFTVPGASFANVTNISGLSFTNTQSGNFTATVTTNTGAQIVANGTSKCITARKCNSVIQVPCTSCIPSTVPPMACVDKWFQFRDIMDIVQGYQMPDHLAQDAKYFCEANLGYLVTDYIHYLNITGAYDVSMPSFITISEFGATNLNYGYNGTQMVINAYGTYLMSHPFIEWSEFVNQYVTENKICPPAPMVPTINLEVDNIPTPCEIFVHSVQQTYLQELMEQYFATKREEFKQKYIQAAISGLQESMTKVSYDKEYQYTLYYYDQAGNLVQTVPPQGVSRLAPGADSTINTVRNATPEEEQQVVNGIVVDPNHTMKTAYRYNSLNQLVWQKTPDGGETRFAYDQLGRIIASQNAKQAAMPKPRFSYTRYDGLGRIVEAGEYEPQQAYINEEGNVIIGGSPVSDLETYNYKRYEVNRTLYDTPVVNSTSWFESYSDNNNHKRVTAILTYNIMEDGVNFDEQEIIANDRYDNAVLYDYDIHGNVKELIYHTNKEILKSLNQDVKKVIYDYDLVSGNVNSVTYQPKKADQFIHRYEYDADNRITQVYTSKDKVVWEKEAKYDYYEHGPLARLVIGDKQVQGLDYFYTLQGWLKGVNSEKLGTVIKSYYSTSDIGHDGSTQNGTGKDAFAFALHYFRGDYASRHHVVNGVDNSLLYYTNTLNLGGDNNLYNGNIKAMVTSLMNPTQANLLSQYNYYRYDQLNRLKEMNSFSVSDFYNESSYRSNYSYDRNGNIMTLNRWAPRSVGLGAVDLMDELTYHYQDGTNKLTQINDTVPNDAFTNDISNPNDTSLDIDNQDKNNYQYDEIGQLTRDEKEGLSISWRVDGKVKSVTKANGTVIDFEYDGLGKRIAKIVTNGNDVTTTFYQRDAQGNTLSTYEMIKRWGQPIKYYLIEQEIYGSSRLGVEKGRKELNADTGRGIALRMDALVATAQIADNVSQALLTTPSSIWGLSFSGNNNVTWGDGDKSINFFDQGGKTQEFEIRTNFKIVGGSAMTVNQNHALVTLDGARRPEYKQWDNSIARIVIKRNANGAYVPALEVEKYTKRFHRYKPFFVFHRRWNYRNYKTVWTYELRNAIPETEWNFHAKVSVSGDSFSPQFTINGNVYTSRDFITNVNQELNGPESGDTREFPEPDPVSNTLGKTAKTYGNVDGNYFGNSFQGVPVEMCDFTYTVNNGQGSDNTPVYVFPFDEGPVGQPTATNNLLTMTRNGVPYTQSYCGPTALDSDGDGIPDSMDNCPNKFNPDQKDSDGDGVGDVCDNCVNTYNPNQADTDGDGRGDVCDNCINNPNYNQIDTDGDGRGDACDNCRTIYNPGQEDADGDGIGDVCEGLDQGQGTSAAIGTPVTAYRFVGDKNYELSNHLGNVLSVITDRKLIGRYNTSYLFLPDVISYNNYYPFGMLVPNRHEASESYRYGFNGMEKDDEL