ggKbase home page

SCNpilot_BF_INOC_scaffold_1410_1

Organism: SCNpilot_BF_INOC_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 16 / 38 MC: 15
Location: comp(160..2640)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Hypothetical chloroplast RF1 n=1 Tax=Parachlorella kessleri RepID=C7BF04_PARKE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 94.4
  • Coverage: 834.0
  • Bit_score: 1592
  • Evalue 0.0
Hypothetical chloroplast RF1 {ECO:0000313|EMBL:ACQ90979.1}; TaxID=3074 species="Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Trebouxiophyceae; Chlorellales; Chlorellales incertae sedis; Parachlorella.;" sou similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 94.4
  • Coverage: 834.0
  • Bit_score: 1592
  • Evalue 0.0
ORF1995; hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.2
  • Coverage: 493.0
  • Bit_score: 195
  • Evalue 5.40e-47

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parachlorella kessleri → Parachlorella → Chlorellales → Trebouxiophyceae → Chlorophyta → Viridiplantae

Sequences

DNA sequence
Length: 2481
ATGTCTATTGTATCTTCTATTCGAGATTACGTTGAATTATTAAATACTCTAAGTGATTCTTTAGGGAATCAATTAACTTCTACTAAATTTATTAGTGCTTCTGTTGTTTATTTTTTAGATACTATTAAATATAGTATTTACTATATATTTAGTTTTCAATGGCTCCGTGATTTTACTTTGTTACCTGTAAATATTCCACAATATTCTCAAGCTATTTTTTCTGAACATTTATTTTTAGAAACTCCTGGAAAAGTTTTTTTTGAATTTTTGGAAATACCCAGTATAAATCAAAATAAATTTTTTTTAGGTTTTTTTAATAGTTTTTTCTTAACACTTCCTATTACAGTAACTCATATTATTACTTTTCGCCGATTAATTATTCAAGGAGTTCCAGCTGCTTTTTTTTCATTTTTTGGTTTTATATTAGGACAAACTTTATTTATTCTTTGTGTAACTTTTGGTATTCGTAGTATTTTAATTCCGTGGTTATCTTTAGAACCACTTAATTATATTCTTGGTTTCATTTTAATTTTTCAAATTGTCTATAGTATGGTGGGTGAAAATTTAACTGTACTGAAATGGAATAATCAATCACATAAACAATTTTTTAAAAAGTTTTTTATCACAAATTTAATTTTATCTTGGTGCGAACAAAGTTGTATTTTTCAATATTTTAGTAATCTTACTTTAACTGGACATCCAACTATTTTAGAAGGTTTTTCCTCAAAAACTGTAATAGCAAGTTTTTTCTGTCATAGTAATTATATTTTAGGTATATTTCTTGGTAGTATTATTTTTTCTCTTTTTTGGATATTTTTTATTTGGCAAATAAAAAATTTAATTCTAAGTTTTACTCGAATTTCTCCAGCTAGTTTTGTACAAACTGTAAATCGAGGAACTTTTGTTATTGTTTTATCATTTACTTTAAGTTCTATACCGTTTTATGGTTTAGATTATTTATTTGCTGGTCCTTTAGGTTTTATATCTCAAGATTATGTTTTTAAAAATACTTTTTTGGATCAAAATGAAATAAAAGATCCTATAGCTTCTGGGCTACCTAGTGATAAAAAAATATCTTTAAACATTGATGTTTCACCTTTTGATCGTGGTCGTTATTTAGTTTTTCCTGAAGATTCTGATCACTATAGTTTTGAAGATTTAAATTATCGTAGTGAAATGGATTGGACTAGAAGATCAGAAAAAGAGTCTAGTATTACTGAATCAAAAGCTGGATTTTTTTCTATAGGCAAAATTTTCAAAAAACAAAAAGATCAATCTGTTAATAACTTGGTTTATCAATCTCCTGAATCTATTAATGAAGCAAAATCTAATTTCTTACTTTCTCAAGAAGAAATCATGAATTATAAAATTGCTGATTCCGCAATACCAGAATATCGTTTTAATGGCTGGTATAATTTAGATTCTGATAATGTACCTGATTTAAAAGATGAAAACATTATTGACACTTATAGGCAATTTAATGAAACTAGTTTTTCTCCTGATTTTTTACGTGAAAATTCATTGATGGAAATAAACATTGAGAAAAAAATCAAACAAAAATACTATTCAAACCCTATTTATAAAAATTTATTGACATTAGATATCGATCTTTTTTTAAATCGTCAACCACCTTCTTGGTTTTTAGGGCCAGAACATGAATTAGATTTACATGAAAAACGACAATTATTGAATTCTTATTATGATTCTTTAAGATGGTACACAAAATTGCCATATGCTGAAAATTTTGAAAATTTTTTTAATGGAACAAAAAGTTTTACTAATAAAATTTACAACCAACAATTTAAAGGTACGTTACGATCTCTTCGACGTCTTTTTTGTTTAACAATAATTTCACCTGATATAATGTCTACAAAATCTAATGATTTTGTTTTAAAATATGATCAACCTTTATATCAAGGAAAGTTGAAATTTTCTCCTTATCATGAAGAAATTGCTGAAATAGAACCTTTTGATAAAAAACAAAATAATTCACCAAATGGAGAAAAAATATTAAATCCATTTTTAAAAGATTTTATTTCAAAACCACTTTATACTGGTTGGGATGATAATTTAAGAAAATTTGTTATAACAAATAAATTATTACCTCGATCCGTTACTGGTTATGAAATGAATAGATCTCCAAATTGGGACACCAAATTTAGTCTTGAAAAATCAAATAAGTTAAAATTTAATGCAGGTAATTCAGAAACAATTTATTTTTCTGTTTGGCCGAAAATCAAAAATAATAAACTTCAAGAAAAAGTACCTTTTACTTTTTTATTTAGTAATAATACTCCAGATTCTGAAATTGACAAAATTGGAGAATATCAAGTTTACAATACCGTTCCATCTAATTTTGAAATTGTTCAAAAACTATCAAAACCAGATTCTGGGTTTAATTTTGTTGATTTAGCACCTAAACGAGGTGGTTTTATTTGGTCAGGAACTATTCCTTTTGATTTTAAAAATATTTTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 827
MSIVSSIRDYVELLNTLSDSLGNQLTSTKFISASVVYFLDTIKYSIYYIFSFQWLRDFTLLPVNIPQYSQAIFSEHLFLETPGKVFFEFLEIPSINQNKFFLGFFNSFFLTLPITVTHIITFRRLIIQGVPAAFFSFFGFILGQTLFILCVTFGIRSILIPWLSLEPLNYILGFILIFQIVYSMVGENLTVLKWNNQSHKQFFKKFFITNLILSWCEQSCIFQYFSNLTLTGHPTILEGFSSKTVIASFFCHSNYILGIFLGSIIFSLFWIFFIWQIKNLILSFTRISPASFVQTVNRGTFVIVLSFTLSSIPFYGLDYLFAGPLGFISQDYVFKNTFLDQNEIKDPIASGLPSDKKISLNIDVSPFDRGRYLVFPEDSDHYSFEDLNYRSEMDWTRRSEKESSITESKAGFFSIGKIFKKQKDQSVNNLVYQSPESINEAKSNFLLSQEEIMNYKIADSAIPEYRFNGWYNLDSDNVPDLKDENIIDTYRQFNETSFSPDFLRENSLMEINIEKKIKQKYYSNPIYKNLLTLDIDLFLNRQPPSWFLGPEHELDLHEKRQLLNSYYDSLRWYTKLPYAENFENFFNGTKSFTNKIYNQQFKGTLRSLRRLFCLTIISPDIMSTKSNDFVLKYDQPLYQGKLKFSPYHEEIAEIEPFDKKQNNSPNGEKILNPFLKDFISKPLYTGWDDNLRKFVITNKLLPRSVTGYEMNRSPNWDTKFSLEKSNKLKFNAGNSETIYFSVWPKIKNNKLQEKVPFTFLFSNNTPDSEIDKIGEYQVYNTVPSNFEIVQKLSKPDSGFNFVDLAPKRGGFIWSGTIPFDFKNIFK*