ggKbase home page

SCNpilot_BF_INOC_scaffold_4743_2

Organism: SCNpilot_BF_INOC_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 16 / 38 MC: 15
Location: 649..4569

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
CHU large protein; uncharacterized n=1 Tax=Cytophaga hutchinsonii (strain ATCC 33406 / NCIMB 9469) RepID=Q11WU1_CYTH3 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 26.5
  • Coverage: 814.0
  • Bit_score: 200
  • Evalue 1.40e-47
VCBS Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_RIF_OD1_02_44_15_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 30.2
  • Coverage: 786.0
  • Bit_score: 229
  • Evalue 3.10e-56
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 39.1
  • Coverage: 307.0
  • Bit_score: 171
  • Evalue 2.00e-39

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RLO_RIF_OD1_02_44_15 → RIF-OD1-2 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3921
ATGGAAATATTTTACAAAAAATTTAGAGTAAAAACCAGATTACTGGGCGTTTTAACTTTTGCGCTTTTACTTTTTGGTATAAGTGCGAGGAGCTGGGGACAGTGTACGAACGACGCTTACGGGCAATACCCTACAGGCACATCTACTTGCCCTAACCAAGGCAGCTGGACGAATATAGCTACAAATACATATCGTGGGGAATACTCTTTGGTATCTGTTGTTGAAGGATTTACCTACATGTTTGGAAGTTCTGTAGCTACGGATATAACTACAATTGCACAAACGGACAACACTGTTTTAGCGTACGGAACCCAAAACGCAACATGGACCGCTACTTTTACCGGAAATGTTCGTTTTTGGACGCATGGAGCATCATGTGCTACTGGAAGTGGCAACCGAACAAGGCGTTGGCAGATAACAGGAACACCGACAACTGTTGCTTTCGGCATTAATACATGGAATGTCGCTGCTTATAACGGTGGCACTTGGAATGCAACTAATTTTTTAAATCTGACAGGAGCAACTTATAGAGGGTATTATGTGGATAATACATTGAATATTAATACATCAGGTAGATGGGGGGTAACAGCTTCTCCAAGTGCGGCACCAGGTTATGCAGGTTGTTCCGTCAACAACAATCAGCATATATTTGTTTACAAACGTAAAGGATTCCCTACGGGCTGCTATTCTATATCAGATATTTTATTTGATGATGCTATACGTATTTATGTCAATGGCGCTCAGGTTTATGAAAATACCGGTTGTTGTGCTATGACCGGGCTGGCATGGTCCGGAAATTTAGATGCAAATAGTGAGGTTGAAATTCGCGTAGCAGAAAACTCTGGGGATAGCCGTCTTATTCTTAACTTTGTCCTTAATACACCCATTGCTAATCCAGGCTCTGATCAAACCATTTCTTGTGGGAATAATAGCGTACAACTGGGAACATCCATAGATGTTTTTGATGATTTTGAGACTGGTACTGGGAACTGGACATTCACTTCACCATGGGCACGCAGCACAGGTATTTCAACTATAACAAACCGATCAGGATCATCTTATTTTGCGCTAATGACAGGTGGTAGCGGTAATAACGGCTATTATCTTACATTTAACGGGACCTTACCGGCAGGTACTTCAAGGAAAATTTCATTTTATTTTATTAATCCCGGCAACTCATCTGCTGGATTTGATGAGGCATTTTTAGATTATTACAATGGTTCTTCATGGACAACACTGGCGGATATTGACAATGGTGCTGGCAGTGGTACCTCTACAGACGGATGGATTTATAAAGAGTACACTATTCCTGATAATGCCACAAACCTTCGCTTTCGACCGAATATGTATAGTAATACTTATGACGGGATAGGCATCGATAATATTACTATAACAACCCCTTTAACTTATTCTTGGAGTCCTTCAACGGGGCTCAGCGCAACTAACATTTCTAATCCGGTGGCCAGCCCAACTGCTACAACTACCTACACCTTAACAACAACAGTCAATGGCTGTACTTCTGCACCTGCTTCGGTGACAGTGACAGTGAATCAATTCAATCCCGGTACTATTGCAGCAGACCAAACAATCTGCAACGGCACTAAACCAGTTGCATTCACCCAAACGTCTCCTACAGGAGGAGGAGGTGCTTACGCGTATCAATGGCAATCTGCAGCTAACTTAACCGGTGCATGGACTGATATTTCAGGTGCAACTTCAGCTACATATACGGAAAGTAACAACCTTACAGCAGATAAGTATTACAGACGTAAGGTAACGGATAATGATTGCGGAGTGGCTTATTCCACTCCTATAACACCTACTTCTAATTTAAGATTACATTATAAATTTGATGGGGTGATCCAGCCGAGAACTAATATTGTTACAAATACTGACTTAAATACAGGATGGGCGCAAGGATATCATAAAAGTATTATTTTTAATGAAATAGCTGCGCCATCTGGGATAAATTCTCCAACTGTTGGTTTTAACAGAGGCGATGCGTCCGGGTATTGGTATTCTTACGGAAATTATGCACCAGGACAAACGCCCGGGCAAACGTTCACTGTTTCAATTTATGTAAAGACATTAGATAATAACTTTAGAATAAGATGTTATACAGCTGATAATAGTGAGCTTGGCAGAGTATGGGGTGATTGGATGAGTGTTCCGAATGACGGAGCGTGGCATAGAGTCTCATGGACGATAGATATACCTGGTAATAGTCAATCAGAAAGTTTATCGTTTAATTATTCATATGGTATAAATGACCCTGTCGCTTACGGGAGCGCAGCAGGAGATCCTAATACAAGAACATGGCTTTGCGCTCCTCAAATGGAGATGGGACAGGGTGCAACGGCTTTTCATATTGGTACATTATCCTCCGCTTTAGTAACTGACTACTCCGGCAATGGTAATCGCGGGACGATTTCTTTAGCAACAGCACCTGTATGGGTAGCAGACAATAATAATGGCGTGAACGGAGGAGCATATCAGTTTAATGGAACATCACATATAGATGTAGGGAATTCTTCGTCATTACAAATAACAGGTAATCAGACTATTTCAATGTGGATAAACCCTGCTGTTTTAAATGATGGAGTGAGAAGAAATCCTTATGCAAAAGCATATGGAGGTGAAGGAACAATTACGCAGGAACCAGATGGCACCATCAATTACTATTACGGAACAAGTGGAGGTAACGGAGGAAGTTATCAGGGATTTACAATGTCAAGCCCTATAGCTGTAAATCAATGGGTTCATATTGCTATTGTCAGAGATTTAACAAATTCACAGTTGTACTGGTATAAAAACGGAGTATTAGTAAATCAAACTACAGCATTGTATAATCCAGCGGTAGCGGGAAGTTTACCAGTAACTATCGGGACAGGGTATGCCGGGAACTACAACGGAAAGATTGATGATATCAGAGTATATTCATCTGCACTTTCCGCAACTGATATAAAAGATTTATATGAACACTCGGCAGCATTACATGTAATTGTACAGGCACCTATTAACGAAGGAGCAATAGCTGCTGACCAAACAATATGTTACGGAGGAGATCCGGCTGTATTTACAAGTACAACAGCAGGAAGTGGTGATACCCGGGGCGCAGTTACGTATCGTTGGGAAAAGTCAGTCAGTCCATTTACTGCATGGAGCGCTATATCAGCTGCTACAGCAGCAACTTATGATGCACCTGCAGGTTTAACAGCAACCACCAAATATCGTAGGGTTACTATTGTTACTTTAAACGGTAAGGAATGCGAAAAAGAGTCAGCTCCGGTAACAGTAACAGTACACCCTCAATTCACATCAGGGACTATTGCAAATACAGGCGAAACAATTTGTAATGGTGGTGATCCGGCTGTCATTGGAAGCACAATTGCAGCAAGTGGAGGAGATGGTACAATAACTTATAAGTGGCAAGCTAATGGAATTGATATTGTAGGTAGTAATGCTGCCACATACGATCCTCCATCAGGATTAACTGCAACAACAACCTATACACGTTGGGTAAAAGACGGAACTTGTAACACAACATTTACCGTTTCAGCTAATTCGTGGACAGTTACAGTCGATCAGAAACCCACACTTCCGACTTCAATTACAGTAGATAACAATATGAATAACTGCTGGGGCAGAGAAATTACCTTAACAGCAAACGGTGGTACATTACAAGGTTCTTCCCAATATGTCTGGGGCACAACAAATGGTGGCAGCCAGCTGGGGACAACGGGCAACGGCACAAAAACACTAGTACCAACCGCATCGAATACATATTATGTCGGAGTTACAGCCAACGGCGCGTGTCCTGCTCAGAACTTAGCAACAGGAATCACGTATGCCCTTCCAACAAGAAATGCTTTGCTATCCTCGAACAGTTCCGGTACGTGCTACGTGAGTGGTTCCAATCCG
PROTEIN sequence
Length: 1307
MEIFYKKFRVKTRLLGVLTFALLLFGISARSWGQCTNDAYGQYPTGTSTCPNQGSWTNIATNTYRGEYSLVSVVEGFTYMFGSSVATDITTIAQTDNTVLAYGTQNATWTATFTGNVRFWTHGASCATGSGNRTRRWQITGTPTTVAFGINTWNVAAYNGGTWNATNFLNLTGATYRGYYVDNTLNINTSGRWGVTASPSAAPGYAGCSVNNNQHIFVYKRKGFPTGCYSISDILFDDAIRIYVNGAQVYENTGCCAMTGLAWSGNLDANSEVEIRVAENSGDSRLILNFVLNTPIANPGSDQTISCGNNSVQLGTSIDVFDDFETGTGNWTFTSPWARSTGISTITNRSGSSYFALMTGGSGNNGYYLTFNGTLPAGTSRKISFYFINPGNSSAGFDEAFLDYYNGSSWTTLADIDNGAGSGTSTDGWIYKEYTIPDNATNLRFRPNMYSNTYDGIGIDNITITTPLTYSWSPSTGLSATNISNPVASPTATTTYTLTTTVNGCTSAPASVTVTVNQFNPGTIAADQTICNGTKPVAFTQTSPTGGGGAYAYQWQSAANLTGAWTDISGATSATYTESNNLTADKYYRRKVTDNDCGVAYSTPITPTSNLRLHYKFDGVIQPRTNIVTNTDLNTGWAQGYHKSIIFNEIAAPSGINSPTVGFNRGDASGYWYSYGNYAPGQTPGQTFTVSIYVKTLDNNFRIRCYTADNSELGRVWGDWMSVPNDGAWHRVSWTIDIPGNSQSESLSFNYSYGINDPVAYGSAAGDPNTRTWLCAPQMEMGQGATAFHIGTLSSALVTDYSGNGNRGTISLATAPVWVADNNNGVNGGAYQFNGTSHIDVGNSSSLQITGNQTISMWINPAVLNDGVRRNPYAKAYGGEGTITQEPDGTINYYYGTSGGNGGSYQGFTMSSPIAVNQWVHIAIVRDLTNSQLYWYKNGVLVNQTTALYNPAVAGSLPVTIGTGYAGNYNGKIDDIRVYSSALSATDIKDLYEHSAALHVIVQAPINEGAIAADQTICYGGDPAVFTSTTAGSGDTRGAVTYRWEKSVSPFTAWSAISAATAATYDAPAGLTATTKYRRVTIVTLNGKECEKESAPVTVTVHPQFTSGTIANTGETICNGGDPAVIGSTIAASGGDGTITYKWQANGIDIVGSNAATYDPPSGLTATTTYTRWVKDGTCNTTFTVSANSWTVTVDQKPTLPTSITVDNNMNNCWGREITLTANGGTLQGSSQYVWGTTNGGSQLGTTGNGTKTLVPTASNTYYVGVTANGACPAQNLATGITYALPTRNALLSSNSSGTCYVSGSNP