ggKbase home page

SCNpilot_BF_INOC_scaffold_774_4

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Clostridium_37_18

near complete RP 48 / 55 MC: 5 BSCG 50 / 51 MC: 4 ASCG 14 / 38 MC: 4
Location: comp(2211..5012)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein (Fragment) n=1 Tax=uncultured bacterium (gcode 4) RepID=K2F7B0_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 51.2
  • Coverage: 562.0
  • Bit_score: 581
  • Evalue 2.10e-162
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:EKE27036.1}; Flags: Fragment;; TaxID=1234023 species="Bacteria; environmental samples.;" source="uncultured bacterium (gcode 4).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 51.2
  • Coverage: 562.0
  • Bit_score: 581
  • Evalue 3.00e-162
PAS domain S-box/diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.2
  • Coverage: 940.0
  • Bit_score: 443
  • Evalue 2.00e-121

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

uncultured bacterium (gcode 4) → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2802
ATGATTAGTGGCAATGGTATTCAAGATAAACTAAAGCAGCTGTTGAAAAGAACAATTATTTCATTTGCAATAATAAGTGGTTTATTATTTTATCTGTTCACTTATTATCAAATAAATGATAAATATACAAACGATGCATTTAGTGTTATTAAATTAACAAATATTGTTTTAGAAAATACTTTTTCGGATGCAGAAAATAGTCTAAATGCTTTAGAAATATTTGTTCAGAACGAAGACAAAGCCATTGATATGACAAAAACCTTGAATATTTTCATAACCAACGTAAAAGATGCTAGCACTATGTACGTTGGTTATTCTGATGGTCGCTTTTCACTTTATCCGGCAAGATTTGTTGCATCGGATTATGATCCACGCTCAAGAAGTTGGTATATTAATGCTGAAGAAAACGAAGGTAGTATCGTCTGGACAGATCCTTATGTAGATCATGGTACGGGAGAATATGCTATCACAGCTTCTAAGAAAATTAATGACCAAATGACTATTGGCGTGGATATTTTATTGTCCGAAATCACCAATATCGTTGAAAATGAGAAGATTGGAAAAAATGGTTTTATCACCATCCTAAATACATCGGGAACGATTATTGCGACTAAAAATCAAAATTTATTGGCAAAAAATTGGGATGAACAGGCAGGATCACACATTAGGTTTTCTGAATTTAAAAATGGTCAAGTCTCGCATGATATGAAGAACATTTATTATTCAGTAAAAGTAAAAGATAAAGATCTTATTATAATTGGTCAAATTAGTATTGACGAAATTCTACAATCAATGCTATGGATTTTTATCTTGATTACGTTCATCACTTTTATTATTATTTATATTGCTGAAAAAATAACGATTAGATATGGTAATCAAATTGTACAGCCTGTTATAGCGCTTTCAAAGTCAATTGAAAAAGTAACAGACGGTGATATGAACATTCAATGTGAAGTAGAATCTGATGATGTTGAAATTAGAACTCTAATAGATGGCTTTAATTCAATGATACAAAGTATAAATGAAAAAAATTTGGAAATGCAAGCATTGTATGAAGAATTATATGCATCTGAGGAAACACTTCAAGAGCAATATGATCTTTTATATGAAAATAAAATATTTATTGAAAAAAGTGAACAACGCTATCGTTCAATTTTTGATGCATCTGAAGAAGGCCTATGGGATATGGATAAGAATTATTTTATTTCTTATTTAACTCCTAATTGGTATGATAATTTCAACTTAAATCTTGATAATTCAGAATTAAACGAATGGGTTAATTTAATCCATGAAGAGGACCGTAAAAGGGTACATGATGCTATAAAGAATTATATTGCTAAGCAAATAGAAAGCTATAGAATTGAATACCGTGTTTTAAATAAAAATGGCGAATATGTTTGGATTGAAGCAGTAGGGATTTCTAAGTATGAAAATGAAGAGTTTATAAGTATGTCTGGGTCACATCAAGACATAACAGCAAGAAAAAAATATGAGCTTCATATTCAAAATATGGCATATACAGATTCATTAATACGCCTTAAAAATAGAGCATATTTTGAAGAAAAGCACCGTGAATTTATTGAAAGTGGCAGTGATGGAACTTTACTTTTAATTGATATCAATAATTTTAAATATATTAATGATTTATATGGTCATACATTTGGTGATGAAATATTAAAGCAGGTAGCAAATCGATTGAGCTCATTCTCAGATCATATCGATGGTAATTTAGCTAGATTTAGTGGAAATGAATTTGTGTTTTTATTAAAGAACACTAGTGATTATCATAAAATAGTAGCTATCGTAAAAGAAATTTGCGATATTATTGAAACACCACTAATCAATGGTACAACCGTTCTTAAAATTAACTCAAGTATGGGCGTAACTATTTTTCCAAAGGATGGGACGTCATTTGAGCAGATTATTCAAAATGCAGATATAGCAATGTTTCACGCTAGAAAAGTGGTCAAAAAGAGCTTCTATTTCTTTAACGAGGAAATAAAAAATAGTGCTATCACAGAGATGAATTACGAGCATCTACTTAGAAAAGCTATAGAAGAGGATGAGTTTGAAGTATACTATCAGCCTATAATGAGTATTCAAAATAAAAACATTAAAGGGTTTGAAGCACTTGTCAGATGGCAATCTAAGGATCTTGGGTTCATAATGCCAGATAGGTTTATCCCTATTGCAGAAAAAACAAGATTAATTAATGAGATAGGCTTAATTGTTCTTGAGAAAGCATGTCATTTTTTAGAAGATATATCTTCCCTATCTGATCACGAGCTAGACATGTCAGTTAATATATCGGTTATACAATTGCTTGAGGATAATATCGTTGAAAAGATTATTAAAATAGTAGAACGATATAAGCTTGAACATCATCGTATTAAGCTAGAAATAACAGAAAGTATTACATTAGAATCAAACGAATCAGCTATCGATAAGCTGGTACAGCTTAGAAATCAAGGTTTTGGAATCGCTTTGGATGATTTTGGTACAGGTTATTCTACTTTTAAGAATTTAATTAGGTTACCATTAACAGGTATTAAAATTGATAAAGCTATAATGAAAGAATCAATTTCAAGCGAACACGTTTATAATTTACTTGAATCAGTTGTAGATTTTGCTCATAAGATTAATATTGATGTTGTCGCTGAAGGGATTGAGAATTTAGAGTACTTAGATAAGTCACAGAAAATGGATGTTGATTATGTACAAGGCTTTCATTTTAGTAAACCTGTTCCAGAATCACAGATTATCAGTCTTATAGATAGCTTAGATCAGCTGTGCCTGGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 934
MISGNGIQDKLKQLLKRTIISFAIISGLLFYLFTYYQINDKYTNDAFSVIKLTNIVLENTFSDAENSLNALEIFVQNEDKAIDMTKTLNIFITNVKDASTMYVGYSDGRFSLYPARFVASDYDPRSRSWYINAEENEGSIVWTDPYVDHGTGEYAITASKKINDQMTIGVDILLSEITNIVENEKIGKNGFITILNTSGTIIATKNQNLLAKNWDEQAGSHIRFSEFKNGQVSHDMKNIYYSVKVKDKDLIIIGQISIDEILQSMLWIFILITFITFIIIYIAEKITIRYGNQIVQPVIALSKSIEKVTDGDMNIQCEVESDDVEIRTLIDGFNSMIQSINEKNLEMQALYEELYASEETLQEQYDLLYENKIFIEKSEQRYRSIFDASEEGLWDMDKNYFISYLTPNWYDNFNLNLDNSELNEWVNLIHEEDRKRVHDAIKNYIAKQIESYRIEYRVLNKNGEYVWIEAVGISKYENEEFISMSGSHQDITARKKYELHIQNMAYTDSLIRLKNRAYFEEKHREFIESGSDGTLLLIDINNFKYINDLYGHTFGDEILKQVANRLSSFSDHIDGNLARFSGNEFVFLLKNTSDYHKIVAIVKEICDIIETPLINGTTVLKINSSMGVTIFPKDGTSFEQIIQNADIAMFHARKVVKKSFYFFNEEIKNSAITEMNYEHLLRKAIEEDEFEVYYQPIMSIQNKNIKGFEALVRWQSKDLGFIMPDRFIPIAEKTRLINEIGLIVLEKACHFLEDISSLSDHELDMSVNISVIQLLEDNIVEKIIKIVERYKLEHHRIKLEITESITLESNESAIDKLVQLRNQGFGIALDDFGTGYSTFKNLIRLPLTGIKIDKAIMKESISSEHVYNLLESVVDFAHKINIDVVAEGIENLEYLDKSQKMDVDYVQGFHFSKPVPESQIISLIDSLDQLCLE*