ggKbase home page

SCNpilot_BF_INOC_scaffold_97_163

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Bacteroidetes_37_82

near complete RP 52 / 55 BSCG 49 / 51 ASCG 14 / 38
Location: comp(214037..216079)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PMT family glycosyltransferase, 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_RIF03_38_15_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 26.8
  • Coverage: 421.0
  • Bit_score: 135
  • Evalue 2.40e-28
Putative uncharacterized protein id=2012015 bin=GWA2_Bacteroidetes_32_17 species=unknown genus=unknown taxon_order=unknown taxon_class=unknown phylum=unknown tax=GWA2_Bacteroidetes_32_17 organism_group=Bacteroidetes similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 25.4
  • Coverage: 370.0
  • Bit_score: 101
  • Evalue 2.80e-18
PMT family glycosyltransferase, 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 25.7
  • Coverage: 393.0
  • Bit_score: 87
  • Evalue 1.20e-14

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RLO_RIF03_38_15 → RIF3 → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2043
ATGATACACACACTATTCAAATTGGAACAATATCTTTATTCCAGGTCAACGAAACAGGGCTTTGTGTTTTTTCTATTGTGCACTGTGCTTTTATCTACTTTGGTTGTATTGTTTCATTATGTGGGGTATTCGTTTCTTTTTAGCTCGCCAATTAATGAACTTCAACAGTATTATCCTAGATGGTATTGGTTGGTTTATACGATGCTTAAAATCATTGAATTGTTTTATTACACAGTAGTAGTAATTCAACTATATATATTGTCATCTCGGCTATTTGCAAATAGAACAATTAAATGGGTAGTGATAATTTCAGGAATTAGTGGAGTGTATTTTTGGGAAATACCTCTTTTGCCACTCTCTGTGTCTTTGGTTTTCCTCTATGCGTTATTGGTTTTTATGGATTGGGAATTGTTTATTGCAAGGTGGAATTTTTTAAGCAAGCATAAAATTCTTGAACCAAGCATAAAATTGATTGATGTTCGAGAAAAATGGATTGTGCTTGCATTGGTAGTGCTTGCGTTTTTATTGAGGTTATTATGGATTTTACTTACCGATAATTCAGGTAATGGCGATGCGGGTATGCGTTTATTCGGAACGCAAAATTGGATATTTAGATGTTCAATATTAAATGAAAGTAGAATTGGTATTTTAGACCTTCCTGTAGTATATCTGTTTCCTTCTCGCGATTGGCTGCCTTTGCATTACTACTTAATGTATGCTGCAAAATTAGTTAGTGGTGAGTTGATATATTCTTCGCGTATTCTTACTGCACTTTTTGGAGCTCTTTCTGTTATACCGATTTACAAGTTGGCAGGGCTAAAGTTTAATCGAACTACTGCTTTAATTTCTGCGCTTATCCTAACTTTTTATCTTTTTCATATCTATTTGTCTTCTTTAGTACTTAGCGAGCCATTTTACATATTCTTCCTACTATGGGCTTATTATTTCATCGAAAATTGGAGGGTCTCCAATAATAATATTGGGTTGGTTTATATTGGACTGATGCTGGCTTGCCTTAACTTATTGCGGTTTGAGGGTTGGTTTTTCAGCGCTTGTTGTGTGGTGTTGCTTCCATTATTAAAAAATATTACTGAGTGGCGTAAATACTTATACTTTTTGGCTATTGTATTTACTTCAATTATTTTTGTAATGTATTGTGAGGTTACATTAGGTGAACACCCTTTACGGGGTATTCTTTATAGTGATTATGAGGTTAAAGCAACTTTAACAAGTAATCCAATTTCTATTTTGGGGATAATAACTACATATCGAAATTCTTGGCTGCCATTGAGTTTCTTGGGTTTGTTATTTTTTTCTGCATACTATACTTGGAAGTATAACAATAAATTATTGTTATGTCATATTTTATATGTAATTCCACTATTCCCTTTCATTTATAAGCTTTTTAATGGCACACTAACTGCACAGCCCAGATATATGCTATTGTATATGGTGCCACTAATTCCTTTTGTTGCTTATTTTTTTTATTTATTGTACCGTATTCTTCGGTTAAAATTATTCTTCGGTTTCTTTATATTTTATTTAGTGTTGTTCAATGTTGTATTTTACAAACAATTGCAAAGTGGTTATCCGATATTAAAATACCCAAGTGGATTTCATAAAAGTGCTACTTTCGTTAGAAAAATTGAACAATGTAGTTTTTACATTGATGCCGATGTGGACTATGCCCATTTTAATTGGAATGCAATAAATGGCTTTAATTCAGTAGGAATTGATGGTGAAGAATATAGGAGAATCAAGGCAAAGTTGAAATTACCTGATAAGGTAGATATTGTTATATCATCAAGAGAAAGAAGAATAGCATCTTCGGTAGAAAGTAATATGGATATATGGAGAGTTTGGAACAGTAAAAAACTTGATACACTTCTATACAATAAGAGCATTTCCCATATTGTAATTTTTCCTAACGGCACACTAAATGGCTACTTGAAATTCAGTAGAGATACAGAAAAATTTAATGGATACACTTTTATTAGACTATGTAACTTTGATGGTTACATGGTATATGAAGTAATAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 681
MIHTLFKLEQYLYSRSTKQGFVFFLLCTVLLSTLVVLFHYVGYSFLFSSPINELQQYYPRWYWLVYTMLKIIELFYYTVVVIQLYILSSRLFANRTIKWVVIISGISGVYFWEIPLLPLSVSLVFLYALLVFMDWELFIARWNFLSKHKILEPSIKLIDVREKWIVLALVVLAFLLRLLWILLTDNSGNGDAGMRLFGTQNWIFRCSILNESRIGILDLPVVYLFPSRDWLPLHYYLMYAAKLVSGELIYSSRILTALFGALSVIPIYKLAGLKFNRTTALISALILTFYLFHIYLSSLVLSEPFYIFFLLWAYYFIENWRVSNNNIGLVYIGLMLACLNLLRFEGWFFSACCVVLLPLLKNITEWRKYLYFLAIVFTSIIFVMYCEVTLGEHPLRGILYSDYEVKATLTSNPISILGIITTYRNSWLPLSFLGLLFFSAYYTWKYNNKLLLCHILYVIPLFPFIYKLFNGTLTAQPRYMLLYMVPLIPFVAYFFYLLYRILRLKLFFGFFIFYLVLFNVVFYKQLQSGYPILKYPSGFHKSATFVRKIEQCSFYIDADVDYAHFNWNAINGFNSVGIDGEEYRRIKAKLKLPDKVDIVISSRERRIASSVESNMDIWRVWNSKKLDTLLYNKSISHIVIFPNGTLNGYLKFSRDTEKFNGYTFIRLCNFDGYMVYEVIK*