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SCNpilot_BF_INOC_scaffold_285_7

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Bacteroidetes_43_41

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 13 / 38
Location: comp(8694..11942)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein n=1 Tax=Coprobacter fastidiosus NSB1 RepID=U5CJV1_9PORP similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 43.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 900
  • Evalue 1.40e-258
TonB-linked outer membrane protein {ECO:0000313|EMBL:ERM90084.1}; TaxID=1349822 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Porphyromonadaceae; Coprobacter.;" source="Coprobacter fas similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 43.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 900
  • Evalue 2.00e-258
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 40.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 810
  • Evalue 4.10e-232

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Coprobacter fastidiosus → Coprobacter → Bacteroidales → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3249
ATGAAAAGGTATATTCTATCAATTTTTTTATTTCTTTTTTGTAATGCAATAATTTATGGACAAACTATTGTAAAAGGAGTCGTATTGGATGAGTTTGGTGTTGAGTTACCCGGTGCCAGCATTACTTTGAAAAATACGACAGTTGGTACTATCACTAATGCAAAAGGTGAATTTCAGTTCAATTTTCCTGAAATAAAGGAAGGAACATTGGTCTTCACCTTTATAGGTTTTGATACACAAGAGGTCGAGTTTAAAGGTAATATGGAGCTGAAAATAACCTTAGTCGAAAGTTCTACACATCTTGAAGAGGTTGTAGTAACAGCTTTAGGTATCTCAAGAGAAGCCAGATCTTTGGGTTATGCTCGGCAAGCTGTAGATGTAGAATCTATGACAGAGGCTCGAAGTGCAAACATGCTCAACATGCTTGAAGGGAAAGCCGCCGGAGTTAATATTATTTCGACAGGTGGACCAACAGCATCTACGAGAGTTGAAATCAGAGGTAATACATCATTAACCGGTAATAATCAACCTTTGTACGTAATTGATGGGGTGATTATTCAAAATGATATGGGTAAAAACGAGACTGGCTATTTTGGTGCACAAGGGACATCTGACATCGACTATGGAAATGTTGCTGCGAATATAAATCCTGATGATATTGAGAGTATCGAAATTCTTAAGGGAGGAAATGCTGCAGCTCTTTATGGTTCTGATGCAGCTAATGGTGTAATACTGATTACAACTAAAAAAGCCAGAAAACATCAAAATATCGGATTAAGTTTTAATTCCAATATGATGTTTAGTACCATTACTGAATATCCCGAATTTCAAAATATCTATGGTGGAGGGAATAGTCATAGATTAGGAGAAACTAATAAATATCGATATATGAGTGAGCCAAATCTAGCTCTTTTGTCACCCTATAATGCTCGCTCTTGGGGATTACCAATGTTAGGGTTTCCTGTTGTTGGAAGAAATGGTGAAATTAAATCCTATTCTCCAAATCCTGATAATGTGAGGGATTATTTCTCCAGTTCGTATCAATTGACTAATAATTTCTCCGTCAGTAAATCAAATGATGTCAGTTCATTCAGATTCTCTTATTCAAATACGATTGCAAATGATGTATTGGAGGGGGCAAATTTGAGAAATAGACACAACTTTTCCTTGAGATCTGACTACAACCTGACTAATTATCTAAAAATAGAAGGTAATGTAAGATACTCGATTGATAAGTTGAAAAACAGATCTTATAGTGGGTGGAGCGTGAGGAATCCTTTGATGGCTTATCTTTTTTTCCCAAGGGATTTAAGTATAGACGAATTGATACCATGGAAGGATGATAATGGTAATGCCATAAGGCTTAGCAGCGAGAATGTCTCTGAATATTATAATCCATATTGGGCAATTAATGAAAACAAAAACGAAGACGAGAAAAATTGGTTTTTAGCTGATGTTACAGTTAATGCAGATATAACAAAGAATATAAAGTTAAGGATTAAAACGGCTGCTGATATTCAAAATACCTTGGGGTTTGATTTTACAAACAAAGGGACTATAGGGAAAGAAAACGGCAGTTACAGCACTTTTTATAGAAATGTGAAAAACTATCAGCACGAGGCACTATTGAGTTATTATCAGAGATTTAATCTCTTTTCGTTGAATGCATATTTGGGGGCTAGTTGGAGAGATAACTACTTGTATAAAAACACCTCATACACATCAAGCCTTATCTTGCATGATGTAGCGAGCCTGTCTAACAGTGCTGAGCCAGTGCAGACATTTGAATCTCTTGAACGGATTCGTCGCGAAAGTATTTACGGTGCGGCAACACTTGGATATAAAGATTGGTTATTTATTGATGCTACTGTAAGAAATGATTGGAATTCGACTTTACCAATTAAAAACTGTTCGTTCTTCTATCCATCCATAAGTACAAGTGTAATCTTTTCAGAAGTCTTAGATATTCCTCAAAATATTTTGACATTGGGTAAGTTAAGAGGGTCTTGGGCAAAAGTGGGAAATGGAACATCGTTTAATCAATTATATAATAATTATAGCTATAGTGGTATTTTCAATACGATTCCGACTTTTGAGCTGGGGTCGCGTTTAAAAAGCTCCGTGCTTAAACCTGAGACTACATTTACAACTGAATTGGGTGTTGATCTGAAGCTATTTAATAATAGAGCTGCCTTTGATGCAACTTATTACTATATGAAATCGGTTGATCAAATTATGAATCCTCGAATTTCACCAAGTACCGGTTATGTGGAAGGGACATTTAATTCAGGAGAAATTCAAAATAGAGGGATAGAACTAACGCTAAATGTTACACCTGTAAAAACGAATAATTTTGATTGGGACGTAACTATGAACTGGTCTAAAAACAACAGTAAAGTGGTTTCAATTATGGATAGCTTGAAAGTTTATACCCTAATGGAAGTAAGTTCAAACTTAAGAATTACTGTTGAAGAAAATGAGCCATACGGAATATTAAGAGGATCAAGACAAATGCGTGATGAGGATGGCAATTTAATGGTTGATGAAGCCAACAATAGAGCCATAGTTGAATCCGATGCTTATCTTGGAAAGATTAGCCCCGACTTTATGGGATCTGTTAAATCTTCTTTTAAATATAAAAGAGTAAACTTATCTGTCCTTATGGACTACAAAGTTGGGGGAAAATTATTTTCAAGATCTTCGCTCCACGGAGTTAGAGAAGGAAACTGGTTACGTACCCTCGCTAATAGAGATGATTATACTTTCAGTTATTCTGTATTGAACGAATCGAATGAGGAAAGGTATGGAGTTAATAAAGATGATCCTTATATACCCTACACGGATACCGATCGGATTAAAGGAGCAAGATTTGAGGGAATATTATATAAGTTTAATGAAGAAACCGGGACTTATACCAAAATGGGTCCGAATATGGCATTTATTCAACCGCAGCAATACTGGCAGCATGCAGGTAATTATTTGATGGATTGGTTCATTTATGATGCCTCTTTTGTTAAATTACGTGAGATCTCGTTCAGTTATAATATGCCATCGTCACTACTTAAAAATTTACCCTTAAAATCCGTTACTATTGCATTAGTTGGTAGAGATCTTCTTACAATTTATAAGAATACTCCAAAAGGTATAGATCCCCAGGCAACAGTATCTTCAGGTAATGCACAAGGTATAGAGTCGGGTTTTACGCTGCCTACTGCATATTACGGATTTGATCTAAAAGTTTCATTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1083
MKRYILSIFLFLFCNAIIYGQTIVKGVVLDEFGVELPGASITLKNTTVGTITNAKGEFQFNFPEIKEGTLVFTFIGFDTQEVEFKGNMELKITLVESSTHLEEVVVTALGISREARSLGYARQAVDVESMTEARSANMLNMLEGKAAGVNIISTGGPTASTRVEIRGNTSLTGNNQPLYVIDGVIIQNDMGKNETGYFGAQGTSDIDYGNVAANINPDDIESIEILKGGNAAALYGSDAANGVILITTKKARKHQNIGLSFNSNMMFSTITEYPEFQNIYGGGNSHRLGETNKYRYMSEPNLALLSPYNARSWGLPMLGFPVVGRNGEIKSYSPNPDNVRDYFSSSYQLTNNFSVSKSNDVSSFRFSYSNTIANDVLEGANLRNRHNFSLRSDYNLTNYLKIEGNVRYSIDKLKNRSYSGWSVRNPLMAYLFFPRDLSIDELIPWKDDNGNAIRLSSENVSEYYNPYWAINENKNEDEKNWFLADVTVNADITKNIKLRIKTAADIQNTLGFDFTNKGTIGKENGSYSTFYRNVKNYQHEALLSYYQRFNLFSLNAYLGASWRDNYLYKNTSYTSSLILHDVASLSNSAEPVQTFESLERIRRESIYGAATLGYKDWLFIDATVRNDWNSTLPIKNCSFFYPSISTSVIFSEVLDIPQNILTLGKLRGSWAKVGNGTSFNQLYNNYSYSGIFNTIPTFELGSRLKSSVLKPETTFTTELGVDLKLFNNRAAFDATYYYMKSVDQIMNPRISPSTGYVEGTFNSGEIQNRGIELTLNVTPVKTNNFDWDVTMNWSKNNSKVVSIMDSLKVYTLMEVSSNLRITVEENEPYGILRGSRQMRDEDGNLMVDEANNRAIVESDAYLGKISPDFMGSVKSSFKYKRVNLSVLMDYKVGGKLFSRSSLHGVREGNWLRTLANRDDYTFSYSVLNESNEERYGVNKDDPYIPYTDTDRIKGARFEGILYKFNEETGTYTKMGPNMAFIQPQQYWQHAGNYLMDWFIYDASFVKLREISFSYNMPSSLLKNLPLKSVTIALVGRDLLTIYKNTPKGIDPQATVSSGNAQGIESGFTLPTAYYGFDLKVSF*