ggKbase home page

SCNpilot_BF_INOC_scaffold_2848_4

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Clostridium_42_5_partial

partial RP 46 / 55 MC: 1 BSCG 40 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38 MC: 3
Location: 4740..6926

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Flavobacterium sp. SCGC AAA160-P02 RepID=UPI0003789912 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 26.5
  • Coverage: 490.0
  • Bit_score: 124
  • Evalue 4.20e-25
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.3
  • Coverage: 456.0
  • Bit_score: 101
  • Evalue 8.30e-19
Tax=BJP_IG2157_CP_49_12 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 31.1
  • Coverage: 373.0
  • Bit_score: 149
  • Evalue 1.30e-32

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

BJP_IG2157_CP_49_12 → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2187
TTGATTCCGCAAGTAAATGTAAATAAGAATAGCGGAAGCTATTATGATACATTTGTTTTAGATTTAACAGCAAGTTTTCCTAATTGTGAGATATACTATACAATTGACGGAACAATTCCTTCGGTAAACAGCAATTTATATACAGCTCCAATAGAGATTTATAAAACCATGACTGTTAATGCAATTGCAAAAAAAGATTCAGCAATATCATCAGTATATTCTTTTAACTATTACCTTCCACAGCCACAAATTGCAGCAGACAAGATCACAGGACTATATGATGATCCAACAGTTTTAAAACTTAGCACCAACCTGACAGGATATGATATTTTTTATACTGATGATGGTACGATACCTACTATAAAAAGCAAAAAATATACAAATTCAATAAAAATTGATAATAGTACTAAAATCAAAGCAATTTCTATTAAAAAGGATTCTTCAAGTAACGTACTTTCTGAAATATACATAATAAATGATAATAATATACCTGTAGGAAGTGGTACAAATATTCAAGGTGCATCAGCAATAGTTGAAGGTGATGTTATTTGGAAAAGGGCTAATTCGCCATATAATATAAATTCTAACATACTTATAAGTGAAGGGGCAAGACTGTTTATTGAGCCGGGTGTTCAAATCAAAATTTCGGAAAATTGTTTTATTAGGGTAAATGGCAGCTTATTCAGCTACGGAAATGATAAAAACAAAGTTTTTTTCACTGGAAAAACTACAGCTCTCTGGGATGCGATTCAGATAAATTCACCATATTACATTGGAAAAACGCTATTGTCATACACTAATATTTCTGGTGCTAAAATTGGAATTAACACTACACAAAATTGTGATTTGAATATAAATAATTCCATTATATCAAATAATAGTTCAGGAATTAACTCGCAATATGATGGAGTAACAATTAATGATTCTACTATTAGTTATAATTCAACATATGGTGTCAATGGTAAAGCCAATATAAATGGCTGTATTATTAAGAATAACGGCACAGACGGGATTGTTTTTCTTGGCGGGAATATAAACAATTCCACTATATCAAATAATAGTTCAGGTATTAACTCACAATATGACGGAGTAACAATTAACAATTCTACTGTTAGCTATAATTCAACATATGGTATCAACGGTAAAGCCGATATAAATGGCTGTATTATTAAGAATAACGGTACAGATGGAATTATTTTTGTTGGCGGAACAGTTAATAAATGTGAAGTCATAAATAATTTAAATGCAGGTATCAATATAAAAACTAATTATTTGAGTGTTTTAGGTAGTAAAATCCTTGGAAATAAAATCGGTATTTTGAATGACAATTCTTTTTATACTAATGTAAACGGCAACAGTATCTACAATAATACTGATTATAATGTAAAGATAAATGCTAATAAAGCAACAAATATGACCTTGGATTTCAAAAATAATTATTGGGGTACAACTGACATTTCAGCCATTAGAGATAATATCTGTGACTATTATTTTGACTTTGATAATCTGCCAAAGGCATTAATTGAACCATTATTAACAACTGAACCGGAAATATATAATAAGATTATATTTGTTGAAATGCCAAAAAATCAAGATGATATTGTAATTACTAAAGATAATTTAAAGTCAATATCAACTATAAAATTAAATGTTTTTGCACAAGAAAGCTTAAATACAGCTATATATGCAAGCTTTTATAAAAACAAAAAACTTTTAGGCGTAAAATGTTTGAATGTATACATACCTTATGGTAATTCCGAGTACATTATACCGATCGGAAGCAATTATACAAATGAAAGTGATGAGGTTAAATTATTACTTTGGAACGAAAATTTAGTACCATATGCAAAATTTGAAACAGGTCAACAAGAGTCAAATATAGTTGAAATTGTTGGCAATATAATAAATCAAAATGATGCAGTGGTTACTAAGAGTAATTTAAACTCATTAAGAAATGTAAAATTTAATATCGTTACTGCTGAAAATATAAGTGCAACAATATATGTAGGCTTTTATAACGAAAACAAGTTGCTGGGAATCGAAAAATTCAATAATAATATTTTAAGCGGCACCACACAACAAAATTTAGCATTTAATAATATTGTACCGACAAATACAAATAAACTTAAATTATTTATTTGGAATAATAATTTGATGCCTTATGTGAAAGAAGTAGAAATAAAGTAA
PROTEIN sequence
Length: 729
LIPQVNVNKNSGSYYDTFVLDLTASFPNCEIYYTIDGTIPSVNSNLYTAPIEIYKTMTVNAIAKKDSAISSVYSFNYYLPQPQIAADKITGLYDDPTVLKLSTNLTGYDIFYTDDGTIPTIKSKKYTNSIKIDNSTKIKAISIKKDSSSNVLSEIYIINDNNIPVGSGTNIQGASAIVEGDVIWKRANSPYNINSNILISEGARLFIEPGVQIKISENCFIRVNGSLFSYGNDKNKVFFTGKTTALWDAIQINSPYYIGKTLLSYTNISGAKIGINTTQNCDLNINNSIISNNSSGINSQYDGVTINDSTISYNSTYGVNGKANINGCIIKNNGTDGIVFLGGNINNSTISNNSSGINSQYDGVTINNSTVSYNSTYGINGKADINGCIIKNNGTDGIIFVGGTVNKCEVINNLNAGINIKTNYLSVLGSKILGNKIGILNDNSFYTNVNGNSIYNNTDYNVKINANKATNMTLDFKNNYWGTTDISAIRDNICDYYFDFDNLPKALIEPLLTTEPEIYNKIIFVEMPKNQDDIVITKDNLKSISTIKLNVFAQESLNTAIYASFYKNKKLLGVKCLNVYIPYGNSEYIIPIGSNYTNESDEVKLLLWNENLVPYAKFETGQQESNIVEIVGNIINQNDAVVTKSNLNSLRNVKFNIVTAENISATIYVGFYNENKLLGIEKFNNNILSGTTQQNLAFNNIVPTNTNKLKLFIWNNNLMPYVKEVEIK*