ggKbase home page

SCNpilot_bf_inoc_scaffold_470_curated_4

Organism: scnpilot_dereplicated_Bacteroidales_1

near complete RP 52 / 55 MC: 4 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: comp(6353..9439)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein n=1 Tax=Bacteroides sp. CAG:189 RepID=R5J6M2_9BACE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 61.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1361
  • Evalue 0.0
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein {ECO:0000313|EMBL:CCY50218.1}; TaxID=1262737 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Bacteroidaceae; Bacteroides; environmental samples.;" source="Bacteroides sp. CAG:189.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 61.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1361
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 36.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 651
  • Evalue 5.80e-184

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Bacteroides sp. CAG:189 → Bacteroides → Bacteroidales → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3087
ATGTCATTTTTACTCCACTTTGGTCTGACAGCGCAGACTCAGGTGACTATATCGGGAGTGGTTGTCGATAGTCAGTCAAATGAACCGCTGATTGGTGCAGCCGCCTTAGAGAAGGGAACTGAAAATGGGGTTACCACTAATTTTGACGGTGAATTCTCGATCAGGATACGACAGGGAGCTACGCTAATAGTCAGTTACCTTGGTTACGAGTCTCAAGAAGTCTTTATCGGAACGGAAAGAAGAGTACAGATTAAATTGGTTGAAAAAACCCGAGAATTGGATGAAGTCATTGTTGTTGGCTATGGTGTTCAGCGTAAAAGTGATATAACCGGTTCTATATCATCCATTGCAGGCGAAGATATAAGTAGTTTACCTATTTCATCTTCGGTTCAAGCATTGCAAGGAAAGGCAGCAGGTGTACAAATCACACAAAACACCGGTGCTCCGGGATCTAAAACTACAATTAAAATTCGAGGTACAGGAACCATCAACGATTCAGATCCCCTGTATGTGGTGGATGGATTTATCGTAGATGATATTGAACACATAAATCCGAACGATATTGCCAATATTGAGATTTTAAAAGATGCTGCTTCGGGCTCTATTTACGGCTCACGAGGTGCTAACGGTGTGGTGCTTATTACAACTAAGAAAGGTGAAGCCGGAAAATTAAGGATAAACTTTGATTCCTACGTGGGTTTCTCGAATCCATGGAGGAGAATCAATGTGATGGGAGTTGAAGATTTTGCTGTTATGCGCGACTATGTTGAAGGGCGTACATCCTACTCAGCCGATGGAAAAGTATATTATTCAAAAAATCCTTCAACAGGTGATTTATACTATGATGCAGATAAGTTCCAACGTATCGATTCTCTGAAAAGAAATTCTCCGGATACTTGGTGGGATGCCATTACTCAAACTGGCATTAAACAGCAATATAATCTTGCATTATCAGGTGGAAACGATATCCATAAATACATGATTAGTGGTAATTACTATCAGGAAAGAGGTATTGTGCAGACTTCGGGTTATCAGCGTTTTTCAACGAGGATTAATTTATCCAATACCCTTACCAAATGGCTCACTATGCAAACCAACATGCTATATACCAATGATAACCGGAATATCGTTCCTGAAGGTCAGAATGGAGTGCTTAAACGTTCGTTACATCAAAGTCCGCTTGTTTTTACCTACAATACTGCCGGCTATTTTTCCGAAGATCATCCTATGGCACAAATTGCTCGCAATCACAACAATGCAGGTAATAACCGCATCGATGTAAACACAGAACTCACTGCCAAAATTAATAAATATCTGACTTATCAGTTTAAAGTTTCGAACTATGCGAATTTCTATTCGAGAAAACGCTTTTACGAGGTGGGTAAATTGGAAGAAAATTTCGTAATGCCTACAGACCTTACTACCATCGAAATTGATCAAACAAGAACTAATAAGTGGGAGATAAACAATATTCTATCTTTTAATTGGAATGATAATCTGCACAGCATCAGTGGCGTTGTGGGTCAAACCGTTGAAGGTTTTCAATTTAACGTGCAGGATATGGTTCGAAAAGGGACCTCCGCTAATACAGATAATTTTTGGTTCCTAACAGCAGGATATACCGGCGACCTTGCCCGCGAAACAGAATATCGTTGGAAAGCTTTAGGTTTATTAAGTAGAATAAATTACAGTTATGCCGATAAATATTTAGTGCAACTTAACTTCAGAGCAGATGCTTCCTCTAAATTCTCTCCTACAAATCGTTGGGGATATTTTCCTTCTGTTTCATTGGGTTGGAAATTTTCCGGTGAATCCTTTATGCAAGATATTGACTGGTTGAGTCTTGGTAAATTGCGAGTTGGTTGGGGACAATTGGGTAATAATCGTATCGGGGAATATGCCCAGTACACATTGGTAAACAACCAGTTTAATTACGTGTATGGTGCTGGAAATCATATAGTCTATCCGGGCGCTACGTCGACTACCTTGGGTAATCCTGATATTCGTTGGGAAAAAACGGAGTCGGCAAATATCGGATTAGATATGAATTTCTTGAATAATCGCTTGGCAACCACTATCGAATTGTTTGATAAATATACAACAGATATGTTGCTACGTGTACCTGTAGTTGCTTCTGCCGGCTTGGTAGATGCTCCTATGATTAATGCCGGATCGGTACGGAACCAAGGTATCGAACTTCAGGTGAATTATAGAGATAGAATTGACAAGCTTAAGTTTGACGTTGGATTTAATGTATCATACATACAGAATAAGGTTGTTAGTTTGGGTTCTGGAAATGAGCCGGTTTGGGGAGCTTACTTAGAAGAAGACAGAATTCTTGATTTTGTAACAAAAACAGAAGTGGGACGTCCTATCGGTAATTTCTACGGATACATTACCGATGGTATTTTCAATACGATGGAAGAAGTTGAGGCAAGTGCTCAGAATGACGGCTTGACCTTTCCTGGCGATTTTCGTTTCAAAGATTTGAATAATGATGGACGTATCACTGCTGAAGACAGAACATTTCTCGGTTCGCCACATCCCGATTTTGTGTTTGGTATTCCGTTATCAGTATCCTATGCCAATTTTGAATTTAACTTATTCTTCCAAGGGCAAACCGGAAATAAAATTTTCAATGTAATGGAGTATTATCTGAATTCAGCACATGGTACAGGTAATGTGTATGCAGACTTACGTGAGAAGCATTGGGCGGGGTCTTATGTAGCCAATCGCTCGTTTTTTCCAGCCAATCCAAACGGAACGGTTCCTGATTTGGATGCTGCTGACCGTCCACGTAATTTTAGAGCATCTAATTTTTATGTGAAAGACGGGTCTTACTTGCGTTTGAAAAATATACAGCTGAGTTATAATGTGCCACAACAGGTATGCAAAACCTTGAAATTAGATCAACTTACCATTTATGTGGGTGCGTATAACCTGTTGACATTCACGAAATACAATGGCTTCGATCCTGAAGTAGGACGTAACGTAGGCTCTGAATCAAACAACCTATACATGGGAGTCGATCATGGTAACTATCCACAGGCAAGAACTATTACTGCTGGAATAAAAGTCGGATTATAA
PROTEIN sequence
Length: 1029
MSFLLHFGLTAQTQVTISGVVVDSQSNEPLIGAAALEKGTENGVTTNFDGEFSIRIRQGATLIVSYLGYESQEVFIGTERRVQIKLVEKTRELDEVIVVGYGVQRKSDITGSISSIAGEDISSLPISSSVQALQGKAAGVQITQNTGAPGSKTTIKIRGTGTINDSDPLYVVDGFIVDDIEHINPNDIANIEILKDAASGSIYGSRGANGVVLITTKKGEAGKLRINFDSYVGFSNPWRRINVMGVEDFAVMRDYVEGRTSYSADGKVYYSKNPSTGDLYYDADKFQRIDSLKRNSPDTWWDAITQTGIKQQYNLALSGGNDIHKYMISGNYYQERGIVQTSGYQRFSTRINLSNTLTKWLTMQTNMLYTNDNRNIVPEGQNGVLKRSLHQSPLVFTYNTAGYFSEDHPMAQIARNHNNAGNNRIDVNTELTAKINKYLTYQFKVSNYANFYSRKRFYEVGKLEENFVMPTDLTTIEIDQTRTNKWEINNILSFNWNDNLHSISGVVGQTVEGFQFNVQDMVRKGTSANTDNFWFLTAGYTGDLARETEYRWKALGLLSRINYSYADKYLVQLNFRADASSKFSPTNRWGYFPSVSLGWKFSGESFMQDIDWLSLGKLRVGWGQLGNNRIGEYAQYTLVNNQFNYVYGAGNHIVYPGATSTTLGNPDIRWEKTESANIGLDMNFLNNRLATTIELFDKYTTDMLLRVPVVASAGLVDAPMINAGSVRNQGIELQVNYRDRIDKLKFDVGFNVSYIQNKVVSLGSGNEPVWGAYLEEDRILDFVTKTEVGRPIGNFYGYITDGIFNTMEEVEASAQNDGLTFPGDFRFKDLNNDGRITAEDRTFLGSPHPDFVFGIPLSVSYANFEFNLFFQGQTGNKIFNVMEYYLNSAHGTGNVYADLREKHWAGSYVANRSFFPANPNGTVPDLDAADRPRNFRASNFYVKDGSYLRLKNIQLSYNVPQQVCKTLKLDQLTIYVGAYNLLTFTKYNGFDPEVGRNVGSESNNLYMGVDHGNYPQARTITAGIKVGL*