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SCNpilot_bf_inoc_scaffold_852_curated_8

Organism: scnpilot_dereplicated_Bacteroidales_1

near complete RP 52 / 55 MC: 4 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: 9852..12980

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane , SusC/RagA family protein {ECO:0000313|EMBL:KDS23555.1}; TaxID=1339346 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Bacteroidaceae; Bacteroides.;" source="Bacteroides ovatus str. 3725 D1 iv.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 55.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1230
  • Evalue 0.0
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein id=1809502 bin=GWD2_Bacteroidales_45_23 species=unknown genus=Bacteroides taxon_order=Bacteroidales taxon_class=Bacteroidia phylum=Bacteroidetes tax=GWD2_Bacteroidales_45_23 organism_group=Bacteroidetes similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 55.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1189
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 54.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1176
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

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Taxonomy

Bacteroides ovatus → Bacteroides → Bacteroidales → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3129
ATGTATAAAAATCAAATTAATAATAAATTAGGATTTTATTTTTTATTCATAAGTTTTTTTCTACTTATGATTGTAAATCCAACAGTCTTGCATGCTCAAGATAATAATCAAAAGTCTTCACAGAATGTGGTTCAGGATTTACATGGAAATCCTATCTCAAATGTAAACGTGTTGATCAAAGGAACCAGTAAGTCAGTTCAAACATCAGATAATGGCATATTCGTATTGGATTTTAAATCTGGAGATGTTCTGATATTTACGCACAAAGATTTTTTAATCAATGAATCTACCATGTCTGAAAGAGACCAAAAGAAGGGTGTCCTGATCAGAATGCAGGATAAACTTGTGAAAAGCTCAACATTAATTCCTCATCCTTATTCGGAAGAGAGAGATTCAGAGAGTTATATAGGATCTGCATCTACTGTTTATTCAGATAAATTAACTTCCATGATGGGAACAACCATTATACCTGCTTTGCAGGCGCGTATTGCGGGTTTGAATATTTTTCAAGTTCGCGGTGCCAGAGAACGCCATACTTCAGCTAACTATTCGGGTAGCTTAGGAGGAGATGTGCCTGTATTTGGAAGAGGTTTGTATAGTGATAATTCTGAGTTTGCTATTAGTTCTCGAGGCTTAGCACCTGTAGTGGTGATTGATGGAGTTCAAAGAGAATTTTACGCAATTGATCCGGATGTGATAGAGTCGGTGTCTTTGCAGAAGGATGCTCTTTCATCTATGTTTTTGGGTATGCAAAGTTCGAGAGGCGCACTTATAGTTACAACTAAAGAGCCTACAAAAGGTCCTTTGCAGGTTTCATTTACTGGTAAGATGGGCGTTAATTCACCTGTCATAATGCCCAAACCTTTAAATTCATATCAGTATGCATATCTCTTGAATGAGGCATTGGAAAATGATGGTAAACTACCATTCTATTCTAATGAAGATTTTGCTAAGTTTAGACTTGAAGATAATCCTTACACACACCCTAATGTAAACTGGTATGATGAGTTGTTTAATGAAAATTCAGTATCCCAGTATTATAATTTGAATGTGTCGGGTGGAAATAATGTAGCACAGTATTTTGTTGGTTTAGGTTATACAAGTGAAGAAGGTTTGTTTAAAACTTCAAATGACAATCCTTATAATACCAACTTAAACTATCAGCGTTATATGATAACTTCCAAAGTAAATGTAAATGTAACTTCGGATTTTACTGCGAATATATTATTGATAGGAAGAATAGAGTCAGGTAATCAACCTGGTGGTACGGGTACCGGTTATAATGATTTGTTAAATGCAATCTATTCTACGCCTAACTCTGCTTATCCTGTTAAAAATAAGAATAATTCGTGGGGTGGAAATATCTCGTTCACAAATAATTTGATGTCACAAACTTTAAATTCAGGTTATCTTTTAGATAATAGTCGGGATGTTTTGGGTACTATCAACTTAAATTATGATTTTAGTAAAATTGTCAAAGGTCTTTCTGCATCAGCAAAAGGCAGTATAACTACACAAACACGCTCTTATACAGATAGAACAAAACGATCTGCTGTGTATGCCTTCAAAGAAGATGATTTTGGTCAACCTGTTTATACTATGTATAGTACACCTACTCCGCAAGTCAGTAAATTTTATTCAGTAGGAAATTATCAAAGTATGTACGGACAGTTTGCTGTGAATTATAAACGTCTCTTCGATAATCATTCAGTGCAAGCAGGTGTGAAAGCTGATACACGTACAGTGTTGAATAACTACGACTTACCGGAAATACCATCCAATATTATTGCAGATTTGTCTTATGACTATGCTAAAAAGTATTTTATTCAGGCATCCATAGCCGAAAGTTATTATAATCGATATGCACCGGGTAAACGCTGGGGTAATTTCCAAGCCGTAGGGGTAGGATGGTATGTTAGTAATGAAAACTTTATGGATGAGATTGATTTTGTAGATAAGTTTAAACTGCGTGCAGTCTATGGTAATACAGGTAATGGAGTTTCTAATTCAGGATATTATTTATGGAGCCAAACTTATTCTTATCATGGTGCAGCATGGTATTCTTTGGGTAGCAGTCAGTCAAGCGGACATTTTACTACGGAAAACTTTCCACTTGCCAATCCTAATATAACTTGGGAGAAAGCACATAAGGTAAATTTGGGTGTTGATATTTCAATGTTAAAAGACAGATTACAGTTTACTGTTGATTATTATAACGATAATTATCATGATTTACTGCAAAACCGTGGTAAAAATATCGAATTGATGGGAGCACAATATCCTCCGGAAAATATAGGTAAGATTCTTCGTACCGGTGTAGAGTTAACTGCTATTTATCAAAATCGTATTGGAAGTTTTAATTATTATGTGTCAGCTAATTGGAATATAGAAAATAGTAAAGTATTATTTATAGATGAACAAGAGATGCCACATGATTATCTATACCGAACAGGTCGCCCGCAAGGAGTGATGTTTGGATTGATGTCAGATGGTTTCTTAACTGCTGAAGACATAACTGCCGGATATCCTGTGATGCAAGGATTCACAGATATTCAACCAGGAGACATAAAATATATTGATAAAAATGAAGATGGTGTTATTGATGAGTTTGATGCATCCATTATCGGAGGAGACAAACCACTTTCTTTCTTTGGAGTTGATTTAGGTGTTGAGTATAAAGGATTTGAATTATCTATGTTGCTACAAGGAGTGTACAATAGAGATATATATTTAGGTAATCGTGATTTTACAGAAGGTTTCATGTCTAATAATCAGCATTTTGGACAAGCATACGAGCATCTTCTAAATAGATGGACACCTGAAAACGCTGAAAATGCTACATTTCCACGTCTTTCTGCGGGTGGTAATAATTATAATCAGGGAAATGGTTGGGGGTCTTCTTTTTGGGTAAAATCAGGGAATTTCATACGTTTGAAATCTATTAATGTTGCTTATACACTTCCTCAATCTTTTTCTAAAAATTATTTAGGAAATATGAGGGTTAAAGTGTTTGCAACCGGTCAGAATTTGTTTACTCTGTCTGCTTATAGCTTACTCGACCCTGAGGTGCAGTTTACAGAGTATCCTATTCAAAAGAATATCAATTTTGGTGTTAATGTTAAATTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1043
MYKNQINNKLGFYFLFISFFLLMIVNPTVLHAQDNNQKSSQNVVQDLHGNPISNVNVLIKGTSKSVQTSDNGIFVLDFKSGDVLIFTHKDFLINESTMSERDQKKGVLIRMQDKLVKSSTLIPHPYSEERDSESYIGSASTVYSDKLTSMMGTTIIPALQARIAGLNIFQVRGARERHTSANYSGSLGGDVPVFGRGLYSDNSEFAISSRGLAPVVVIDGVQREFYAIDPDVIESVSLQKDALSSMFLGMQSSRGALIVTTKEPTKGPLQVSFTGKMGVNSPVIMPKPLNSYQYAYLLNEALENDGKLPFYSNEDFAKFRLEDNPYTHPNVNWYDELFNENSVSQYYNLNVSGGNNVAQYFVGLGYTSEEGLFKTSNDNPYNTNLNYQRYMITSKVNVNVTSDFTANILLIGRIESGNQPGGTGTGYNDLLNAIYSTPNSAYPVKNKNNSWGGNISFTNNLMSQTLNSGYLLDNSRDVLGTINLNYDFSKIVKGLSASAKGSITTQTRSYTDRTKRSAVYAFKEDDFGQPVYTMYSTPTPQVSKFYSVGNYQSMYGQFAVNYKRLFDNHSVQAGVKADTRTVLNNYDLPEIPSNIIADLSYDYAKKYFIQASIAESYYNRYAPGKRWGNFQAVGVGWYVSNENFMDEIDFVDKFKLRAVYGNTGNGVSNSGYYLWSQTYSYHGAAWYSLGSSQSSGHFTTENFPLANPNITWEKAHKVNLGVDISMLKDRLQFTVDYYNDNYHDLLQNRGKNIELMGAQYPPENIGKILRTGVELTAIYQNRIGSFNYYVSANWNIENSKVLFIDEQEMPHDYLYRTGRPQGVMFGLMSDGFLTAEDITAGYPVMQGFTDIQPGDIKYIDKNEDGVIDEFDASIIGGDKPLSFFGVDLGVEYKGFELSMLLQGVYNRDIYLGNRDFTEGFMSNNQHFGQAYEHLLNRWTPENAENATFPRLSAGGNNYNQGNGWGSSFWVKSGNFIRLKSINVAYTLPQSFSKNYLGNMRVKVFATGQNLFTLSAYSLLDPEVQFTEYPIQKNINFGVNVKF*