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SCNpilot_bf_inoc_scaffold_171_curated_215

Organism: scnpilot_dereplicated_Chryseobacterium_1

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: comp(235648..238635)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family n=1 Tax=Chryseobacterium sp. CF314 RepID=J2SUU2_9FLAO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 65.2
  • Coverage: 983.0
  • Bit_score: 1352
  • Evalue 0.0
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family {ECO:0000313|EMBL:EJL69392.1}; Flags: Precursor;; TaxID=1144316 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Chryseobacterium.;" source="Chryseobacterium sp. CF314.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 65.2
  • Coverage: 983.0
  • Bit_score: 1352
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 52.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1069
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Chryseobacterium sp. CF314 → Chryseobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2988
ATGTTTTGCAGCCGTGGCCCTATAGGATGGGCCATGGGTTGTACGGTACTGGTCTCGGGCGTGGCTCTGGGGCAGGTACGAACCATTAGCGGTACCATTACCGCCGATCAGAAGCCCCTGCAGGGCGTAACCGTGTTTGAGGAGGGTAGTGCCACGGCAACGGCCACGAATGCCCAAGGGCACTACCAGCTTCGTCTCTCGGGCAAGGCGCCCACGGTGGTGATGCGTCACCCCGACTATCCTGAGCGTCGGTTGAAAGTGGGTGCCACGGCGGTACTGGACACTGATTTGGTGCTGAAGGAAAACCGGATTGAGGAGGTGGTGCTGAATGCGGGGTACTACAAGGTGAAAGAGCGGGAGAGCACGGGGAGTATTTCCCGCATTACGGCAAAGGATATTGAAAACCAACCGGTGAGCAATGTTTTGCAGGCGGCACAGGGAAGGATGGCTGGGGTGAGCATTGTGCAGAATAGCGGGGTAGCGGGTTCGGGATTTACCGTTAATATTCGCGGAAGAAACAGTTTGCGAACTCGCGCAAACTCTGAAATTGATGGTAGTCAGCCCTTGTATATAGTTGACGGCATCCCCATCATAGGGGGATTTACTTCACGATATGGCGGTGGTGTACTTCCGGAAGCCAGCATTAATCCTCTCAATTTTTTGGATCCCAATGACATAGAAAGTATGGATGTTTTAAGGGATGCCGATGCGACGGCCATTTACGGCTCGAGAGGAGCCAATGGTGTAGTGTTGATTACTACCAGAAAGGGTAGAAGTGGAGCTGTGACAGTAAATTTAAATTCGTCGTATGGATTAAGTGAAGCAGTATCCAACCTAACGATGATGAATACTGAGCAATACATCAGTATGCGAAAGCAGGCTTTTGCGAATGACGGCATTGTAAATTATCCTGCTAATGCATATGATGTAAATGGGAGCTGGGACCAAAAGCGCTATACCAACTGGCGAGATAAGTTAATTGGTAACTTTGCCTCTACTTCCACAACTCGTCTTTCAGTAAACGGTGGTAGTGATACTACCAATTTTTTACTTAGTTTGGGACATACTGACCAAACAACGGTTTTCGGCGAGGATTTTCGGTACAAGACGAATACGCTCTCGAGTAATGTTAACCATCGATCTGCGGATCGAAAGCTCAGCATCCAAATGCGGAACCATATGTCTTGGATGACGCACAATTTAATCAGTTCGGATGTGACCCGTTTATCTTACACACTACCTCCGAATGCTCCTGCACTTTATGATGAAGCTGGGCATCTTAATTGGGAAAATAATACGTTCAGCAATCCTGTAGCTGCCTATGAAAATAGCTACTCCAACAAGAATGTTCAGTTTCTGACGAGTTTAAATGCTGACTACGAGCTGGCAAAGAATCTAAAGATTGCCCTAAACGGGGGGTTCACCTACCAGATGATAGAGGAATGGTCACTACGGCCAAGCACTGCCTATAGTCCTTCTACAGGAGTAACTTCGCTGAACTCTCAATCATCAAGGGGAATTCAGAGTCATTTGTCATTGGTTTTTGAGCCCCAAATACAATGGGTGTATCATATGAATCGGCATAAGTTTGACATTATGGTGGGCGGTACGTATCAAGAAGATACTTCTGGTTCGGAAGCGATTCAAGGAACTGGTTATGAAAGTAATTCATTTATACATAATATTGGAGCAGCACGTACCAAAACTATATTGGACCGTCTTACGACCGAGTATAGATATGCGGCATTTTTTGGCAGGATTAATTATAGTTTTGACACAAAGTACCTTTTTAATACAACAGCGAGGCGAGACGGAAGTAGTCGATTTGGACCTAACAAAAAATTTGGCAGCTTTGGTGCTATTGGTGTTGCTTGGCTATTTTCTAATGAGAATTTTCTGAGAGATGTTTCGTGGCTAAGTTTTGGAAAAGTGAGAGGGAGCTACGGTTCTTCGGGTAGTGATGCAATTGGTGACTACCAGTATCACAACACGTTTGAAACCGCAACATTGGGGTATAACGGAATAACGGGACTGGTGCCTTCTAGACTGTATAATCCGGATTTTAGCTGGGAGAAGACTGTTAAGACAGAGGCGGCAATTGAATTGGGACTTTTTAATAATAGGATTCACCTTAATGCAGCTTGGTATCGTAATCGGTCAGGAAATCAGCTTGTGGGCTACCAGCTCCCGTCGATTACAGGGTTTAGTAGTGTATTGGCTAATCTGGACGCAGTTATAGAGAATACGGGTGTAGAGTTTGAATTCCATGGTGAGATTATGAGGAAGCGACAGTTTAATTGGAGTACATCATTAAATCTAACTGTACCTCGTAATAAGCTGCTATCATTTCCAGGTCTTGAGGGTTCTAGCTACGCCAACAGCTATGTAGTGGGTGAGCCCATTTCTATTATAAAGCTTTATGAGCTTAATGGTGTTAATCCCAAAACCGGTCTTTATGATTTTACGGATTTTAATGGAGACGGAAAAATTTCATCATTAAATGACAGGATGGTTATCAAAGACATTTCGCAAAAGTTCTACGGTGGTTTTACAAACGATGTGACTTACAAGAATTGGAATTTTTCATTTTTGATACAGTTTGTGAAGCAGCAAGCACGGAATTACAATTCGATTATTCCATCTCCAGGGATCATTAATAATTTGCCTGCTAGTGCGTTGGATGTATGGTCGGCCAACAACCCGACTGGTTTATATATGCCCTACAGTTCGATTGCCTCATCTTACAACACTCTTTTTCAGACCAGTACTGCCAGCGTTTCAGATGCATCGTACATAAGACTAAAAAATTTGCAACTTACGTACAAGATTCCTGTGAAGGGTACGGGCTTGCGTCAGGCGAGTGTTTATTTTCAGGGACAAAATCTTATTACCCTAACCAACTACTTCGGTATTGACCCGGAATTTACCTCTATCGGCTTTTTGCCACCTCTTCGAACCTACTCATTTGGTATTCAGCTAACGCTTTAG
PROTEIN sequence
Length: 996
MFCSRGPIGWAMGCTVLVSGVALGQVRTISGTITADQKPLQGVTVFEEGSATATATNAQGHYQLRLSGKAPTVVMRHPDYPERRLKVGATAVLDTDLVLKENRIEEVVLNAGYYKVKERESTGSISRITAKDIENQPVSNVLQAAQGRMAGVSIVQNSGVAGSGFTVNIRGRNSLRTRANSEIDGSQPLYIVDGIPIIGGFTSRYGGGVLPEASINPLNFLDPNDIESMDVLRDADATAIYGSRGANGVVLITTRKGRSGAVTVNLNSSYGLSEAVSNLTMMNTEQYISMRKQAFANDGIVNYPANAYDVNGSWDQKRYTNWRDKLIGNFASTSTTRLSVNGGSDTTNFLLSLGHTDQTTVFGEDFRYKTNTLSSNVNHRSADRKLSIQMRNHMSWMTHNLISSDVTRLSYTLPPNAPALYDEAGHLNWENNTFSNPVAAYENSYSNKNVQFLTSLNADYELAKNLKIALNGGFTYQMIEEWSLRPSTAYSPSTGVTSLNSQSSRGIQSHLSLVFEPQIQWVYHMNRHKFDIMVGGTYQEDTSGSEAIQGTGYESNSFIHNIGAARTKTILDRLTTEYRYAAFFGRINYSFDTKYLFNTTARRDGSSRFGPNKKFGSFGAIGVAWLFSNENFLRDVSWLSFGKVRGSYGSSGSDAIGDYQYHNTFETATLGYNGITGLVPSRLYNPDFSWEKTVKTEAAIELGLFNNRIHLNAAWYRNRSGNQLVGYQLPSITGFSSVLANLDAVIENTGVEFEFHGEIMRKRQFNWSTSLNLTVPRNKLLSFPGLEGSSYANSYVVGEPISIIKLYELNGVNPKTGLYDFTDFNGDGKISSLNDRMVIKDISQKFYGGFTNDVTYKNWNFSFLIQFVKQQARNYNSIIPSPGIINNLPASALDVWSANNPTGLYMPYSSIASSYNTLFQTSTASVSDASYIRLKNLQLTYKIPVKGTGLRQASVYFQGQNLITLTNYFGIDPEFTSIGFLPPLRTYSFGIQLTL*