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OR_07182017_23_scaffold_259_2

Organism: OR_07182017_23_Bacteroidetes_38_5

near complete RP 49 / 55 MC: 3 BSCG 48 / 51 MC: 4 ASCG 12 / 38
Location: comp(1101..4370)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor plug Tax=Sphingobacterium sp. (strain 21) RepID=F4CB91_SPHS2 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 52.4
  • Coverage: 1076.0
  • Bit_score: 1133
  • Evalue 0.0
Contig34, whole genome shotgun sequence {ECO:0000313|EMBL:KIO77451.1}; species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter sp. NL19.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 55.8
  • Coverage: 1092.0
  • Bit_score: 1233
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 52.4
  • Coverage: 1076.0
  • Bit_score: 1133
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Pedobacter sp. NL19 → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3270
ATGCGATTAGCCCTCCAAATTGGGAAATCCTGTAGTATGATGCGAATCATGGCAGTATTTCTATTACTATCAGTTATGCCAACACTATTATTGGCTCAAAACCGGAAAATCAGTGGTATTGTAACGGATGAAAGCGGAAAACCGGTTCCAGAAGTTTCAATTACCATTAAAAACAAGTCCACTGGTACAAAAACGGACGATGCCGGTATGTTTTCCATTGACGCACAGACGGGTCAAACCTTAGTCATTAATTCAATTAACCATGAAGTGATAGAGCTAATGGTTGGTGAGGGCAATACTGTAAATGCCGAATTAAAAGCCAAAGTGAATAACCTAAACGATGTAGTTGTAGTAGGTTATGCCACCCAGAAGAAAGTTAATATGACAGGGTCTGTTGCAACCATTTCTGCCAAACAGATTGAGGATAGGCCTATTACCAACCTTTCCTCTTCCTTAGCGGGTTTGAGTTCAGGGGTATATGTAAGACAGGGTTCTGGTCAGCCCGGTTCTGATGGGGCTAGTATCCTAATTAGGGGTACCGGAACACTTAGTAGTAACTCACCCTTGGTAGTCATTGATGGAATCATTGGTAGCATGGATGCGGTTAACCCGCTTGATGTTGAAACTATTTCCGTTTTAAAAGACGCGGCATCTGCTAGTATATATGGTAGTTTAGCTGCCAACGGTGTTATCCTGATTACAACCAAAAAAGGACAACGTAATAAAACTACCGTTACCTACAATGGGATCTTTTCTACTACTAATCCCATGAATATGCCCAAATACAATTCTAATTACTCTAGACATATGCAAATGATCAATGAAGGAACAACCAATATTGGACAGCCTTCTATTTTTGCAGCGTCAACAATTAGAGCATGGGATTCTACCAGTTTAATACCTGATCAATTAAATGCCATTGGCGTACCTAATAGAATTGCCTATCCAAACACAGACTGGGGTGATGCTTTATTTGATAATAAAGTGGTACAAAACCATAATATCAGCATCAATGGAGGTAGTGATAAAGTAAATTATTTACTATCTGTTGGCTATTTAGATAACAAAGGGGTTATGCAAAATACTGGCACTAAGCGTTATCAAATTAGGGCCAACTTAGATGCAAGGGTAGCCAAATGGTTAACCATGGGCACTCAAACATTTGCTAGTACGCAAACCTATGATATGGGTAATACGGCGTCTGCATTTAACTTTTTAGGACAAACTACTCCAGGTGTTGTACCCTCTTATAATGGAAAATATGGTTTTCCTCATGCACAAGAGGAGTCTTCTACAGCTAATGCCATTTTAGCATTTCTAAATAACACTGATGGTAGCAATGTGCAAAGCCGATTTAATACCACATTATATGCTATACTCAATTTATATAAAGGGTTAACCCTAGAATCTAGGTTCAACTATCAAATTAGATTTGGTGAAAACAATAGACATTCTGTTCCACAAGAACGATGGAATTTTGCCACAAATGAAGTGAAAACTTTTCCCGGAGACCCTTCTACTTTCTCTACTTATTATTCATTTGATAAAGCCACACAAACTACTATTGATAATGTGTTGCGTTATACCACCAAAATTGGATCTGACCATGAAATTAGTGCCTTAGCTGGTTACAATCAAATGTATAGTAACTCCTATAATTTTAATGCAAGTAAACAAGGCTTAATTGATTATAGTATTACCACTTTAGGTTCTGCTTTATTACCTACAACTACAAATGGTGGAGAATCTGATTTTGCTATGCGTTCATGGTTTGGTAGGGTTAACTATGCTTTTAGAAATAAGTACTTATTAGAAGCTAACCTGCGCTATGATGGTTCTTCGCGTTTTTCACCAAACACTCGATGGGGTTTGTTCCCTTCAGTTTCTGCAGGTTGGAGAATCATAGATGAGAAATTTATGGAAGGCACCAAGTCTTGGTTGAGTAATTTGAAAATTAGGGGTTCATGGGGTAAATTAGGAAATAATGCTTCTGGTGTTTACGATTGGCAGTCTACTTACTCTACAAGATTATATTCATTTAATAATGTTCAGTCTTCAGGTTTGGCAGTTGGTAGAATTGCTAACCCAGAATTACAGTGGGAAACCACTACTACTACAAACTTTGGTCTAGACGGAGCTTTACTAAATAACAAACTCTTTTTTGAATTTGATTTATATCAACGCTTAACAGATGGAATTCTTTCTACTGTTCCTGTTCCACTCACTGTTGGTACTGCTTCTTCCCCAATTGTAAATGCAGCTGAAGTTAAAAACAATGGTTATGAGATTACCCTTGGTTATAGAGGTAAGTCGGGAGAATTTAATTATCGTATATCTGGCAACTATGCTTATAATACCAATGAAGTAACCAAGTACAAAGGTCAGTTAATAGAAGGATATGTTACAGATGCTACTGGCACACAAGTGTATCAATCTAATATTGGTTTGGTTTCTGCAGGTGGTACAAATAGAATTCTAGAAGGTAAAAAAATTAATGAATTCAGAATTTATGAAGTGTACAAAGGATCTGGTACTTATAATAATGCAGATGGTACTGTAAACATTAATGGGGGGCCAAGAGATGGTATGATTCGCACCCCAGAAGATTTGGCTTGGGCACAAGCTATGATTACAGCGGGTTATAGATTGCTTCCTTCAAATGCAATAAGAAATAATGCTATTTATTATGGTGATTTAATTTATGCCGATTTAAATGGAGACGGTCAATATGGTAATAGCTTTGACCAGAAATTCACTGGCACTTCTACCTTGCCTAAATATATTTTTGGATTTAATGCAGAATTTTCTTGGAAGTCTTTTGACCTATCAATGATTTGGGCTGGAGCAGCAGGTTTCCAGTACTATTGGAATGATACTTATATTAATAGCACAGTAAGAAATGGTTTTGCTTTTTCAAATACAGTATTGGATAACCACTATTTTTATAATCCATTAGACGCTAAAGATCCAAGAAATAATATTAATGCCAAATACACAAGGCTTAAATCTAGTGATCCTCAAAACATTGCCTTGGCAAGTGATTGGTGGATGCAGAATGGATCTTGGATCAAACTTAAGAACCTACAAATTGGCTATAATATTCCAGAAAAATTGGCCAAGAAAATGTTGATGAGTAGGGCAAGGGTGTATGTTTCAGGCGAAAACTTATTAATGATTACCAAGTATCCTGGATTGGATCCTGAAATTGGTGCAGGTATTGGATATCCAACCATGCGTCAGTATGCACTTGGCATCAATGTTAACTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1090
MRLALQIGKSCSMMRIMAVFLLLSVMPTLLLAQNRKISGIVTDESGKPVPEVSITIKNKSTGTKTDDAGMFSIDAQTGQTLVINSINHEVIELMVGEGNTVNAELKAKVNNLNDVVVVGYATQKKVNMTGSVATISAKQIEDRPITNLSSSLAGLSSGVYVRQGSGQPGSDGASILIRGTGTLSSNSPLVVIDGIIGSMDAVNPLDVETISVLKDAASASIYGSLAANGVILITTKKGQRNKTTVTYNGIFSTTNPMNMPKYNSNYSRHMQMINEGTTNIGQPSIFAASTIRAWDSTSLIPDQLNAIGVPNRIAYPNTDWGDALFDNKVVQNHNISINGGSDKVNYLLSVGYLDNKGVMQNTGTKRYQIRANLDARVAKWLTMGTQTFASTQTYDMGNTASAFNFLGQTTPGVVPSYNGKYGFPHAQEESSTANAILAFLNNTDGSNVQSRFNTTLYAILNLYKGLTLESRFNYQIRFGENNRHSVPQERWNFATNEVKTFPGDPSTFSTYYSFDKATQTTIDNVLRYTTKIGSDHEISALAGYNQMYSNSYNFNASKQGLIDYSITTLGSALLPTTTNGGESDFAMRSWFGRVNYAFRNKYLLEANLRYDGSSRFSPNTRWGLFPSVSAGWRIIDEKFMEGTKSWLSNLKIRGSWGKLGNNASGVYDWQSTYSTRLYSFNNVQSSGLAVGRIANPELQWETTTTTNFGLDGALLNNKLFFEFDLYQRLTDGILSTVPVPLTVGTASSPIVNAAEVKNNGYEITLGYRGKSGEFNYRISGNYAYNTNEVTKYKGQLIEGYVTDATGTQVYQSNIGLVSAGGTNRILEGKKINEFRIYEVYKGSGTYNNADGTVNINGGPRDGMIRTPEDLAWAQAMITAGYRLLPSNAIRNNAIYYGDLIYADLNGDGQYGNSFDQKFTGTSTLPKYIFGFNAEFSWKSFDLSMIWAGAAGFQYYWNDTYINSTVRNGFAFSNTVLDNHYFYNPLDAKDPRNNINAKYTRLKSSDPQNIALASDWWMQNGSWIKLKNLQIGYNIPEKLAKKMLMSRARVYVSGENLLMITKYPGLDPEIGAGIGYPTMRQYALGINVNF*