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OR_07102018_0_5m_scaffold_102_23

Organism: OR_07102018_0_5m_Sphingobacteria_36_169

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: comp(26854..29991)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family n=1 Tax=Solitalea canadensis (strain ATCC 29591 / DSM 3403 / NBRC 15130 / NCIMB 12057 / USAM 9D) RepID=H8KXI7_SOLCM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 54.3
  • Coverage: 1039.0
  • Bit_score: 1143
  • Evalue 0.0
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 54.3
  • Coverage: 1039.0
  • Bit_score: 1143
  • Evalue 0.0
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.7
  • Coverage: 1045.0
  • Bit_score: 2070
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3138
ATGAATGTTAACTATGGCAAGGCCAATGTTATCTCGAAGTTGTGCTTCCTTCTCTTCGGTATTACATTGACAATTGGCTTGCAAGCTCAAACAACCATTAAAGGAAAAGTAACAGACAGTAAAGGACTACCAATTCCTGGTGCTTCTATTACCATCAAAAACTCGGGAGCAGGAACTGCTTCAAACATCGATGGTACTTATCAGTTTATTGCCAATTTAAAGCAAGGCAAGTATGATGTGGTTATTTCTTCTGTTGGATTTAGGTCTGCAGAAAAGAATTTGACCATCAGTGCCACTACTGGCAGCTTCACTTTCGATGCTTCTTTAAAAGAGGATGCGACCGGTTTAGATGAAGTGGTGGTTACAGGTACTTCACAAGGAACCACCAAAAAGCAATTGGGTAATTTTATTGGTACTGTTAAAGGAAGCCAAATCAACAATGCAGGATCACCCAATGCCATTGCCTCTTTACAAGGTAAAGTACCAGGCGCACAAATCACACAAAACTCAGGAGACCCTGCAGGTGGAATGAGTGTAAAATTGCGTGGCGTGAGTTCTATCTCTGGTTCTTCTGACCCATTGTATATTATTGACGGAGTAATTTTAAATAACTCCAATGCAAGAGTAACCAATGCGCAGAGTGATTACGATACTTATGGTAGCGTAGGACAAAACAGAATGGTAGATATTAACCCCAATGATATTGATAGAATTGAAGTGTTGAACGGTGCTGCTGCAGCTGCTATTTATGGTAGCCGTGCAAATGCAGGGGTAATACAAATCTTTACAAAAAGAGGTTCTACAGGTGCACCAAAAATCACATTTAGTTCTAAAGTAAGTACCAATTCATTAAGAAAGCGTTTGGTATTTAATAACGCAACTACAAAGTTCGGAGGACCTACTGATGGACCAGGTGCGGTTACACAAGATATATTGTTAACTAATTTAACCACCACTTCACCTGTTAATCGTTATGATTACCAAGACGATATTTTTAGAACTGGTTATGGTACAGACAACAACGTTTCTATTACAGGTGGACAAGACAAAATGCGCTATTTCGCTTCATTAAATTACAATAGCAACCAAGGTATTATTAGAGGTACAGACAATACCCGTTTTGGTTTCAGATTAAATTTAGACAACAAAGTAAACAACTGGTTTAGCTGGAATGCAGGTATCAACTATACCAATAACGCTACCAACGAAAAGCCAGATGGCAATAGCTTCTTCTCTCCTATTAACTCTATGACCATTATTGGAAATTTCCATAATATTGGTGTAAGAGATGCTAATGGAAATTTACAAGCAGTGGGTGAAAGAGGTCGTGTGAATCCATTAACGATTATCAACGATATCAAACAAAGAAACGTTACTAATAGAACTGTTTCTAATGTAGGATTTAAGTTGTTCCCAGTTAAAGGATTGGTGATAGATTACACAGCAGGTTTAGATAATATTGCACAAAACGGAACTACATTTATTCCTCCATTCCCCTACAATGCTAGCCCAGGATTTTATGGCGGTGGTGCCACTTTAGACCCAACATTAAATGGTTATGCAAGTGCAGCAAGCTTTAATTCTACGTTCTTTAACCACGATTTAAACTTTACCTACACTACACAGTTAACCAACAAATTGTCTTCAGTAACACAATTCGGTTATTCTGAGCAGTATGAAAAAGCCAATTATATTCTAGCACAAAGCCGTGGTTTATTGCCAGGTATTTCAACTGCAACTGGTGGTAGTACTTTATTGCCTAACTCAGATGGAAGAAGTGAAAGAACCATTCGTGGATTTTTCTTACAACAGAATTTTAAATTCAACAACCAATTGTTTGTAACAGTTGCAGGAAGAATTGATGGATCATCTGTATTTGATAAAAACAATAGAAACTTCTTCTACCCTAAAGTAAGTGGTAACTATATTTTGTCTGAAACAGAATTTTTCAAGAAATCTGCTTTAGCAAATACCGTAGATGTATTTAAGATTCGTGCTGCCTATGGAGAAAGCGGAAACCTTACTGGTATTGGAGCGTATGACCGTTTCAATATTTACAATATCTCTCCTTTCTTGGGCAGAACCAGTTTAACATCTCCTTCTGCAACCATTAGCTCTGATTTAAAACCAGAGCGTCAGAAAGAATTAGAAATTGGTACAGACATTGCTTTATTGGGTAATAGATTACAATTCACCTTTAACTATTACAACAAAAAAGTAACAGACTTATTGGTGCCCAATATTACCAATGCGCCAAGTTCTGGTTTCCCTACAGCTACTAAGAACGTAGGTTCTTTAAGCAACAAAGGTTTTGAAATTATGGTTACTGCCGTTCCTATTAAGAATAAAAACTTTACATGGGAAATCACCGGTAACTTTAATAAGAACAAAAACAGAATTGAAAACTTAGGTGTTCCATTCATTTCATTTGCAGCTCCTACAGGTGCAGTATTTGCTTTGATTCCAGGATATGATGCACCGGTATTCTATTCTACTTTCTTTGCTAGAAACGCCAATGGAACAGAAGTGAAGAATGCGGCAGGTATTCCAGTAACAGCAAGAGGCCCTATTGCTAATGGTCAACCATTTGGTACACCTACTTTAGATCCAGCAACTGGATTACCTTTTACTACAGGACCTAACTCTTCCATTCTAAGATCTGTTTTAGGCTCACCAAACCCAACTTATACTGCTACTTTAATCAACAGCTTTACTTATAAGAAATGGACATTTGGTTTCCAATTAGACAGAGTAGCTGGAGCAGAAGTATTTAATGCAGATTTCAGAACCAGACAAGGTGTTGGTAACGGAAGTGAGTTTGCACAAAAAGAACATAAAGGAGAAATTCCTAGAGGATATATCAGTGGAATTTACGGTATTGAAGAGTGGAGAGTAGATGATGGCTCATTCACCAAATTACGCGAATTGTCTGTTGGGTATGCATTTGGAAAAGTGAGCAACCTTTTCAGCAATTTAACCGTTACACTTACTGGTAGAAACCTAATCTCATGGGACAACTACAGAGGATACGATCCTGAAACCAATTCAACCGGACAAAGTAGTTTGTTCAGAGGAGTTGATTTTGGTAACGTACCTATTCCGAAAACATTCCAATTCGGTGTTGTAGCAAATTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1046
MNVNYGKANVISKLCFLLFGITLTIGLQAQTTIKGKVTDSKGLPIPGASITIKNSGAGTASNIDGTYQFIANLKQGKYDVVISSVGFRSAEKNLTISATTGSFTFDASLKEDATGLDEVVVTGTSQGTTKKQLGNFIGTVKGSQINNAGSPNAIASLQGKVPGAQITQNSGDPAGGMSVKLRGVSSISGSSDPLYIIDGVILNNSNARVTNAQSDYDTYGSVGQNRMVDINPNDIDRIEVLNGAAAAAIYGSRANAGVIQIFTKRGSTGAPKITFSSKVSTNSLRKRLVFNNATTKFGGPTDGPGAVTQDILLTNLTTTSPVNRYDYQDDIFRTGYGTDNNVSITGGQDKMRYFASLNYNSNQGIIRGTDNTRFGFRLNLDNKVNNWFSWNAGINYTNNATNEKPDGNSFFSPINSMTIIGNFHNIGVRDANGNLQAVGERGRVNPLTIINDIKQRNVTNRTVSNVGFKLFPVKGLVIDYTAGLDNIAQNGTTFIPPFPYNASPGFYGGGATLDPTLNGYASAASFNSTFFNHDLNFTYTTQLTNKLSSVTQFGYSEQYEKANYILAQSRGLLPGISTATGGSTLLPNSDGRSERTIRGFFLQQNFKFNNQLFVTVAGRIDGSSVFDKNNRNFFYPKVSGNYILSETEFFKKSALANTVDVFKIRAAYGESGNLTGIGAYDRFNIYNISPFLGRTSLTSPSATISSDLKPERQKELEIGTDIALLGNRLQFTFNYYNKKVTDLLVPNITNAPSSGFPTATKNVGSLSNKGFEIMVTAVPIKNKNFTWEITGNFNKNKNRIENLGVPFISFAAPTGAVFALIPGYDAPVFYSTFFARNANGTEVKNAAGIPVTARGPIANGQPFGTPTLDPATGLPFTTGPNSSILRSVLGSPNPTYTATLINSFTYKKWTFGFQLDRVAGAEVFNADFRTRQGVGNGSEFAQKEHKGEIPRGYISGIYGIEEWRVDDGSFTKLRELSVGYAFGKVSNLFSNLTVTLTGRNLISWDNYRGYDPETNSTGQSSLFRGVDFGNVPIPKTFQFGVVANF*