ggKbase home page

OR_08142018_2_5m_0_1um_scaffold_1291_3

Organism: OR_08142018_2_5m_0_1um_Sphingobacteria_36_89

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: comp(1714..4542)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor n=1 Tax=Spirosoma spitsbergense RepID=UPI0003705E21 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 40.2
  • Coverage: 979.0
  • Bit_score: 713
  • Evalue 1.60e-202
TonB-dependent receptor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 39.9
  • Coverage: 973.0
  • Bit_score: 719
  • Evalue 8.40e-205
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.3
  • Coverage: 945.0
  • Bit_score: 1868
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2829
ATGCGTTTACTATTATTGGTGTTGAGTATTTTCTCTGGTGTTGCTTTAATGGCACAAAGTACAGCTACCCTAAAGGGGAAGTTGGTAGACAGTGTTGGCAAGCAAGCACTTAAAGATGCTTCCATTACCGTTTTAGAAGCCAAAGATTCTACATTGGATGTATTTGGATTAGCCAAAGCAGATGGAAGTTTTGTAGTTGAAAAAATTTCCTTTGGCGAAATGATTGTAATGATCAAATTTCAGGGGTATGAAGCTTATTCAAAAAAGATCAACTTCTCTAGGACTAATGCATCGGTAGATTTGGGTACTATATATTTACGATTGGCTGCAAATGATTTAGGTGAAGTTACTGTTACACAATCTCCCATTTCTATAAAAAAAGATACCGTTCAATTTAATGCTTCCAGTTTTAAAACTAAGCCCAATGCAGTTTTAGAAGATTTATTAAAAAAATTGCCTGGTGTTCAGGTTGAAGCAGATGGAACCGTTAAAGCACAAGGTGAAAATGTACAAAGAGTATTAGTGGATGGTAAACGATTTTTTGGAGATGATCCAAAATTGGCCACCAAGAACTTGCCTCCTGATATGATTGATAAAATTCAAGTTTTTGATGCGCTCAATGACCAAAGTGCTTTTACGGGTTTTGATGATGGAAAAAGAATAAAGACCATCAATATCACTACTAAAAAAGATAAGCGCAAAGGATATTTCGGAAGAGCTGTATTGGGTGGAGGATCAGATTCAGAAGAAGGCCGTTATGATAATAGTGTAAACTTGAGTTATTTTAATGGGGATCGTCAACTTACGTTTACAGGTCAGGCCAATAATGTAAACAAGCAAAATTTTGGTGCACAAGATTTGTTTGGCGGAGGTGGTGGTGGAGGCGGAAGAACCATCGTGGTTGCAGGTGGCGGTAGAGGTGGAGCTACTAATAATAGCGGAGGCATAATTAGAACTTTAGCTGCTGGTTTAAACTATAAAGATATTTGGGGTAAAAAAACAGAAGTGTCTGGTAGTTATTTCTTTAACGACATGCAAACAGTTCGAGAACAAAATAGCTATACCCAAAATTTGATTCCAGGAAATCCTGATTCATCCATCTTCAATTCTCAACTAAATAATTCTATTACAAAAAATCAGAACCATCGGATCAATTTCAATATTGAACACCAATTTGATTCTTCTAATTCTTTAATTATAAGACCCAATATTAGTTTTCAAGAAACATCATCCGCCACAGACGTAACTACTTTTTCTACAAGAGGTACCAGTAAGAATTTGAATAATTCTATTGCATCTACTGATAGAAACAATAGTGGCTACAATGCTAGCTTGGAAGCAACATTTAGACACCGATTTAAGAAGAAAGGAAGAACCTATTCAATTGCTTTTAATCCTGGCCAAAGTGTTAATGATGGAACAACTTCTAACTATTCCATCAATAACTTCTTTAATACAGCTACTCCTTATGCGGATACCATTAATCAAGTTGGTATAACTAATAGAGATAGCAAAACCATGAATGCTACATTCTCTTATACAGAACCCATAGGTAAAAATCAGATTATTGAATTTAACTACAACTATAATTCGAACGTAAATAATTCAGGCACGCAAACATTTGCCTACAATAAAGCGAATGGTCAATATGATATTGTAGTTCCTAATTTGACCAACGTTTTTGAAAATACATTTAATTCAAATAGAATCACATTGAATTATCGTTTGCAAAATGCGAAGTATAATTTCAGTATAGGTTCAGGAGTTCAAGCTGGAGATTTAATTAGTAAAAACTTAAGTAAAGACAGTTCTATTACACAGAACTTTGTCAATTTCTTTCCTACCATGAATTTTCGCTACGACTTCTCTAGAACCAAGAATTTAAGAATTTTTTATAATGGAAGAACCGGTCAACCTACTGCACAACAGTTGCAGCCTGTAGTTGACAATTCAAATCCTTTGAACATTACAACGGGTAATCCAAATTTGAAGCAACAATTCATTCATACTTTCCGCATATTATTCAATTCATTTGATGTTGTTTCTCAGAAATTATTTTTTGCAACTATCAATGCAAACTTTACCGCAAACGACATTCAAAATTCAACTACTTACTTGCCAAATGGTGCACAGTTTACCAGACCGGTTAATTTAAGTGGAACCTATAATATCAATGGATTTTTGAATTATGGATTCCCTTTAAAGAAACCTAAGAGCAATATCAATTTAGGTGTTAATTTAAGCAACAGTCAAAGTCAAACCCTAGTGAATAACTTGAGTAATTATACCCGAAATACTACTGCTGGTTTTAACGCATCTTGGACAACCAATATCAAAGAGGGCTTCGACATGAACTTCTCGTCTAATTCTAGTTTTAGTTTTGCACGATACACTTTACAGCCACAGCAAAACGGTGATTTCTTTACCCAAACTTTTGTTGCAGAACCAACCATTTATACTAAGTCTGGTTGGGTGTTTTCAACTGATTTCAGATATATCAAAAATACAGGTAGAGCAGAAGGCTTCAATACGAATATTCCATTATGGAGTGCAAGTATTGCCAAGCAATTATTCAAGAAAAAAGAGGGCGAATTGAAGTTCTATGTATTTGACTTGCTGAACCAAAACCAGAGTTTAACTAGGAACGTTACTGGTAATACCATACAAGACGTTTCTACTGTTGTTTTGAAAAGATACTTCATGATCAGCTTTACCTATAACCTGAGAAGTTTTGGTGCTCCTGCTGCCAATCAACAAAGAGGGCCAATGCAAATTTTTAGAGGTGCTCCTGGCCAAGGAATGCAAATGATGCGGAATTTCAGGCAGTAA
PROTEIN sequence
Length: 943
MRLLLLVLSIFSGVALMAQSTATLKGKLVDSVGKQALKDASITVLEAKDSTLDVFGLAKADGSFVVEKISFGEMIVMIKFQGYEAYSKKINFSRTNASVDLGTIYLRLAANDLGEVTVTQSPISIKKDTVQFNASSFKTKPNAVLEDLLKKLPGVQVEADGTVKAQGENVQRVLVDGKRFFGDDPKLATKNLPPDMIDKIQVFDALNDQSAFTGFDDGKRIKTINITTKKDKRKGYFGRAVLGGGSDSEEGRYDNSVNLSYFNGDRQLTFTGQANNVNKQNFGAQDLFGGGGGGGGRTIVVAGGGRGGATNNSGGIIRTLAAGLNYKDIWGKKTEVSGSYFFNDMQTVREQNSYTQNLIPGNPDSSIFNSQLNNSITKNQNHRINFNIEHQFDSSNSLIIRPNISFQETSSATDVTTFSTRGTSKNLNNSIASTDRNNSGYNASLEATFRHRFKKKGRTYSIAFNPGQSVNDGTTSNYSINNFFNTATPYADTINQVGITNRDSKTMNATFSYTEPIGKNQIIEFNYNYNSNVNNSGTQTFAYNKANGQYDIVVPNLTNVFENTFNSNRITLNYRLQNAKYNFSIGSGVQAGDLISKNLSKDSSITQNFVNFFPTMNFRYDFSRTKNLRIFYNGRTGQPTAQQLQPVVDNSNPLNITTGNPNLKQQFIHTFRILFNSFDVVSQKLFFATINANFTANDIQNSTTYLPNGAQFTRPVNLSGTYNINGFLNYGFPLKKPKSNINLGVNLSNSQSQTLVNNLSNYTRNTTAGFNASWTTNIKEGFDMNFSSNSSFSFARYTLQPQQNGDFFTQTFVAEPTIYTKSGWVFSTDFRYIKNTGRAEGFNTNIPLWSASIAKQLFKKKEGELKFYVFDLLNQNQSLTRNVTGNTIQDVSTVVLKRYFMISFTYNLRSFGAPAANQQRGPMQIFRGAPGQGMQMMRNFRQ*