ggKbase home page

OR_08142018_0_5m_0_1um_scaffold_81_36

Organism: OR_08142018_0_5m_0_1um_Sphingobacteria_36_172

near complete RP 48 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: comp(31686..34898)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family n=1 Tax=Echinicola vietnamensis (strain DSM 17526 / LMG 23754 / KMM 6221) RepID=L0FT44_ECHVK similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 41.2
  • Coverage: 1098.0
  • Bit_score: 825
  • Evalue 5.70e-236
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 41.2
  • Coverage: 1098.0
  • Bit_score: 825
  • Evalue 1.60e-236
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 96.7
  • Coverage: 1063.0
  • Bit_score: 2095
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3213
ATGAGAAAAATTTTGTTGTTAATGCTGGGTTTTATTCTTTTTACGAATATTACTTATGCGCAAAAAACAACAGTGAAGGGAAGGGTTACCGACACCAATGGTGTAGGGGTACCTTCTGCAACTGTTAAAGAAAAGGGCACAAAAAATGCAGTAAGTGCCGATGGAGAGGGCAATTTTACTATTTCTGTTTCTCCTAATGCAACCCTGCAGTTTACTGCCACTGGTTTTGGGATGATTGAGCTACCCGCAGACAAAGCCTCTTCAGTAAGAATGAAAGAAGAAGTAGATAACCTAAGCGAAGTAGTTGTGACGGCTTTAGGTGTAAAAAGAGAAAAGAAAGCACTGGGTTACGCGGTTCAAGAAGTAAAAGGCGAAAACTTGACTGTTGCTAAGTCTTTAGACATCAGTACTTCTTTGGCTGGTAAAGTAGCAGGTGTTCAATTAGTAGGATCACCTAGCTCTTCATTTGATAACGCGGATATCTTGATAAGAGGCGTAACAGGTTTAGGACCTCAAGCGCCAATTTTTGTGGTCGATGGAACAATTACCAATCAGTCTGCTGTTATTTTAGATAATATTGAAAGTGTTTCTGTTTTAAAAGGACCTGCATCTACTGCTTTATATGGCCAACGTGCTGCAAATGGTGCGGTAGTAATTACAACTAAAAAAGGAAGTCGCAAAAAATTCACCAGTGTAGATGTAAACCTAGGTTTAACATTTGAAAAGTTAGCCTTACTTCCTCCATATCAAAATGATTATGCAGGTGGATATTCTTCTTCATTAACTTCTGCAGGAACTTCATTTGATGCACAAGGGTTTTATTTATTTAAATATAACCCAGCTATACATCCTGCATCTTGGGCTGCTTTTAATGGTCAACGTATGTTAGAGTACGGTGCCGATGAAAGTTGGGGTCCTAAAATGAATGGAGATAATTACCGTGCTTATTGGAGCTGGTACCCAGGTGCAGAGTTTGGTCAACAAACACCATTAACTGCACAGCCGAATAACGTAAAAGACTTCTTTAGAACCGGTGTAAATAAAAACAACTCTGTTTCATTTTCATCAGGCGGTGAAGGCTATAATTTCAGAATGACTTATGCCAATCAGAATAGAACTTTAATGATTCCAAATGCAAACAGAGATCAGCACCAGTTAGCATTGAATGGTTCATTCGATATTGGTAAGTACATTACCATTTCTACAGATCTTACCTATACCACTAATAGTACTAAAGGAAAGCCAGCTGAAGGGTATCGTTTAGATGGATTAAATATCACTCAGAACTTTAACCAATGGTTTCAGCGTCAATTAGACATGAAGCGTATGGTAAATTATAGAGAACCAGATGGTAGTTTAAATTCATGGAATATAGGCGATCCAAATGCAAGTTCAGATATCAAAGTATATGGAAGACCTCAGTATTGGGACAATCCTTACTTCATGGTAAACGAAGCATTCTCTACACAAGCTCAAAACAGATTGGTAGGAAACATTGGAATGAATATTAAAATCAATAATCATTTAAATATCGTTTCTTATGTTAGAGCAAACACTTATAACAATGAGAATACCGGTAGAATGCCTACCGGAGCTTTAACATTAGACTACTTTGATATTTCACAGGATCGTTATTCAGAAATGAACTACGAAACGAATATTATGTACAAGAATAAATTTGGTGATTTTTCTGTAGATGGTATGGTTGGTGGCAACGTTCGTAAGAACAGCTACAGTGCATTATCTATGGGTACACAAGGTGGATTAAGCTCTCCTAATTATTTTGATATTGCTGCTTCTATTTCACGTCCTACGGTTGGAAGGTCTTATGAAAAGAAAACAGTTAATTCTGTTTTAGGAAAAGCATCTATTGGATGGAGAGATTTATTATTTGTTGAAGGTACTTTGCGTAATGATTGGTCATCAGCATTACCATCACAAAGCAATTCTTATTTATATCCTTCATTAAGCACCAGCTTTATTTTCACTGAATTGGTTAAAACCAACTGGCTTACTTATGGTAAATTAAGAGCTTCTTTCGCTAGCGTAGGTTCAGACTTAGGTGCACATGCGCTTAACCTTGCTATTGGTAATGGTTCATTCTACGGAACAAACCCATCTGCAACTATCGGAAACCAGTTTAAAGGTGGTGGAATTAAACCAGCGTTAACGAAGGCGTATGAGTTTGGTGTTGAACTACGTTTATTCAAGAAGATTGGTCTAGATGTTACCTATTACCAAAACAACAATACCGATCAAATTTTGGGTATAGATGTAACACCTGCAAGTGGATTCTCTACAGCACAAATTAATGCAGGAAATATTCAAAGTAAGGGTATTGAAATCACGCTTAGTGGTAAACCAATTGAAACCAAAAACTTTAGCTGGGATGTTACTTTAAACTGGGCTAAAAACCAGAACAGCATTAAAGAATTGGCTCCTGGAATTAATACTTATTTATATGCAACCAATCGTTACGATACTCGTTTAGAGCATAGAGTAGGAGGCGAGTGGGGAACTTATTATGGTAGAAAATGGAGAACAGATCCAACAACTGGTCAAACTTTAATTGATGCAACCGGTCAGCCATTGTATGATATTAACGTGCCAATTGGAAATGTACTTCCTAAGTTTACGGGTGGTATGTTTAACTCATTCAAATACAAATCATTTGATCTTACTTTTGGAATTGATTTCCAAAGTGGTGGTTTATTCTATTCTGAAACTAGAAACTTTAATACAGGTGCTGGTTTATCTCAAGAAACAGTTGGTAAGAATGATAAAGGGAATGATTGGAGAGATTATCCAGGTGCTTATACCACAGCAGGTGGTAACACAGGTGCTGGAGGTATTCGTATTCCAGGAATTTTTGCTAATGGTGCTTTAGCGGGTAAAGAGAACAACCGTTATATTTCTGCAAGAGCTTATTGGTATACTGCTCGTCAACGTGACGCAAGCAATGTTTTATTGGATGGTTCTTATGTTAAATTAAGAGAAATTAGGTTTGGATACACCATTCCAAGTTCAGCGCTAAAATCATTGCCTTTTGTAAAGTCTGCTAATATTGGCTTCATGGTTCAGAATGCCTGGTTAATTTGGGCTACTACCAAAAAGTGGGGTGTTGATCCATCTGAGTTAGAAACTTTCTATCGTGAAGGTGGTCAGTTATCTTCTACTAGACAATTTGGTATCAACTTAAGAGCATCATTTTAG
PROTEIN sequence
Length: 1071
MRKILLLMLGFILFTNITYAQKTTVKGRVTDTNGVGVPSATVKEKGTKNAVSADGEGNFTISVSPNATLQFTATGFGMIELPADKASSVRMKEEVDNLSEVVVTALGVKREKKALGYAVQEVKGENLTVAKSLDISTSLAGKVAGVQLVGSPSSSFDNADILIRGVTGLGPQAPIFVVDGTITNQSAVILDNIESVSVLKGPASTALYGQRAANGAVVITTKKGSRKKFTSVDVNLGLTFEKLALLPPYQNDYAGGYSSSLTSAGTSFDAQGFYLFKYNPAIHPASWAAFNGQRMLEYGADESWGPKMNGDNYRAYWSWYPGAEFGQQTPLTAQPNNVKDFFRTGVNKNNSVSFSSGGEGYNFRMTYANQNRTLMIPNANRDQHQLALNGSFDIGKYITISTDLTYTTNSTKGKPAEGYRLDGLNITQNFNQWFQRQLDMKRMVNYREPDGSLNSWNIGDPNASSDIKVYGRPQYWDNPYFMVNEAFSTQAQNRLVGNIGMNIKINNHLNIVSYVRANTYNNENTGRMPTGALTLDYFDISQDRYSEMNYETNIMYKNKFGDFSVDGMVGGNVRKNSYSALSMGTQGGLSSPNYFDIAASISRPTVGRSYEKKTVNSVLGKASIGWRDLLFVEGTLRNDWSSALPSQSNSYLYPSLSTSFIFTELVKTNWLTYGKLRASFASVGSDLGAHALNLAIGNGSFYGTNPSATIGNQFKGGGIKPALTKAYEFGVELRLFKKIGLDVTYYQNNNTDQILGIDVTPASGFSTAQINAGNIQSKGIEITLSGKPIETKNFSWDVTLNWAKNQNSIKELAPGINTYLYATNRYDTRLEHRVGGEWGTYYGRKWRTDPTTGQTLIDATGQPLYDINVPIGNVLPKFTGGMFNSFKYKSFDLTFGIDFQSGGLFYSETRNFNTGAGLSQETVGKNDKGNDWRDYPGAYTTAGGNTGAGGIRIPGIFANGALAGKENNRYISARAYWYTARQRDASNVLLDGSYVKLREIRFGYTIPSSALKSLPFVKSANIGFMVQNAWLIWATTKKWGVDPSELETFYREGGQLSSTRQFGINLRASF*