ggKbase home page

RTP_082018_0_1um_scaffold_4028_8

Organism: RTP_082018_0_1um_Sphingobacteria_36_342

near complete RP 43 / 55 MC: 1 BSCG 46 / 51 MC: 1 ASCG 13 / 38
Location: 7829..10798

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor plug n=1 Tax=Runella slithyformis (strain ATCC 29530 / DSM 19594 / LMG 11500 / NCIMB 11436 / LSU 4) RepID=F8ELQ8_RUNSL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 64.2
  • Coverage: 994.0
  • Bit_score: 1300
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 64.2
  • Coverage: 994.0
  • Bit_score: 1300
  • Evalue 0.0
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 97.9
  • Coverage: 989.0
  • Bit_score: 1941
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2970
TTGGGTGGCGTAACCGTAAAAGCAAAAGGTACTGCTGTTACTTCTGTAACAGGTGCTGATGGTGCTTACAGCATTAAAGTTACTTCAAGTGTTAAAACATTGGTATTCTCTTATGTAGGATACAGCGATGTAGAAGCTCCTGTAAGAGGAACATCTGTAGATGTTGCCTTAAATTCAGCAGTTTCTAACCTAAGTGAAGTAATTGTTACAGGTTTTGGTGGCGCTCAAATTAAAAGAGAAGTTACCGGTAACATTGCTCGTGTAAAAGGTAAAGACATTGAATACATGCCAACTCCAAGTGTGGATGCAGCGCTTCAAGGTAAAGCTGCAGGTGTATTTGTGAATAGCCAATCTGGTAAATTAGGTCAGGCAGTAACGGTACGTGTAAGAGGTAACTCTTCTATCAGTGCCAATAGCCAGCCTTTATATGTATTAGATGGTATTCCAATGACTTCTAATAGCCAAAGTTCTTATGGTGGTGCAACCAACCCATTGGTTGACCTTAACCCGAACGATATCGAGTCTATTGAAGTGTTAAAAGATGCATCTGCTGGAGCCATTTTTGGTTCTCGTGCCGCAAATGGTGTGGTGTTAATTACCACTAAAAAAGGTCGTGCAGGTAAAACACAAGTTACTTTTAACTACCAAACTGGAGCTGCTGAAGCAACTAAGCGTTTGGCTATGTTGAATTCTGAAGAATATGCAACCCTTATTTTAGAAGGTGCAAAATATCGCGATGATTTAGATGGTACACCAATTACCGATCCTAGTAGCTGGACTTCTTATGTTAGAAATGACGTAATGGACTACTATAGCTATGGTAATTGGTCAAAAGACCCTAAAAAGACCTATGACTGGCAAGATGCGGTTTTCCAAAAAGCACCTTACAGACAGGCTGATTTACAAATCAGAGGTGGTACAGATAAAACCAAGTTTTTCTCTTCATTCCAACATTTAGAGCAAACTGGTACCATGGTAGGTAACGAATTACAAAGAACAACTGGCCGTTTAAATATTGACCAAAAAGTAAACGACTGGTTAGATATGGGGGTTTCTTTAAGCCTATCAAGAACGTATAATAGACGTTTACCAGACGACAACGCATTCTCTAATCCTTTACAAGCAATTGCGTTGATGCCAATGAATCCATTTACCGATCCAAATACAGGTTTGCCTTCTGGTACTCCTCCTGGAGATGTGAATATTCCTTTGTATTACAATCCTATTTTGACTGTTGACTATGCAAAGTATACGCAAGATGTTTACAGAACATTTGGTAATGCTTATATCAAAGCTTATTTAGCAAAAGGGTTAACCTTCCAAACTGAATTTGGAATGGATTACTTAAGCCAAAATGAAGAAGGTTATTTCCAAAACCAAACAGTTAGAAACCAAACCAGAGCAACTGCAGGTTTAGGTACTAATAGAGGTGCTTTTGTAACCAACTACAATACGCAGTCATACTTTAACTATAGCACTGTAATTAAGAAGCACAATATTAGTGCTACATTAGGTACTCAATACCAACAGTCTCAAGCTAAGTACAACTTTACAGAAGGTACTGCATTCCCATCTAACTCTTATCAGAAGATTGCAAGTGCTGCTACCATTTCAAGTGGTAGTTCATCTCAAACAGATTTCAGATTCTTATCTTATTTCTTAAGAGGTAACTATACTTTCGATGAAAAGTATATTGTTGCAGCTAGTGCACGTATTGACCAGTCTTCTAGATTTGGTAAAAACTCAAGATCAGGTTTCTTCCCAGCTGTTTCTGCGGGATGGATCATGAGTAATGAAAAGTTTTTACAAGACAGCAAAATTTTCAGTTTCTTAAAATTACGTGCTAGTTATGGTATCGTAGGTAACGCTGAAATTGGAAACTTCCCTCAATTGGGTCTATTCTCTGGAGACGCTGGTTATGCTGGTGCTGCAGGTCAACGTCCTTCTCAATTGAGAAACGATAACCTTAAGTGGGAAACCACTAAGCAGTTCGATATTGGTATCGACTTTGGTATCTTGAATAACCGAATTACCGGTGAAATTGACTACTATGTTAAGAAAACCGATGGTTTATTGTTGAACGTAAATATTCCTGCTACTACTGGTTTCAATAGCCAAGTTAGAAACGTAGGTAAGTTAGAGAACAAGGGTTTTGAATTTGTATTGAATACACAAAACTTAATAGGTGCATTCAAGTGGAACACCAGCTTTAACATTGCTCGCAATATTGGTAAAGTAACTGATATCCAAGGTCAAATTATTGAAGGTGGCATCAGCAGCATGAACCGTGTACAAGAAGGATATGCAGTGGGTGTGTTCTACACTCCTCAATATGCTGGAGTTGATCCTGCAAACGGAAATGCATTATTCTATTTGAATACCAAAAATGCAGATGGTTCTTTAAATAAAGGAACTACCAGCAACTATGCTTTGGCTCAACGTATAGTAGCAGGAGATCCAAACCCTGATTATATTTTAGGTATTACCAACAGTTTCTCTTACAAAGGATTTGATGCATCTATTTTCTTTAATGGTGTATTAGGTAACGAGAACAATATCTATGGTATGGGTAGATACTCTTCTGCAAGTATGTTATACGAAGACAACAATACTGCAGACCAGTTAAGAAGATGGCAGAAGCCTGGTGATATCACCGATGTTCCTCAAGTACGTTTGTACAGAGTGAATGGTTCTCAGGCAAGCAGCCGTTATATTGTTGACGGTTCTTATATCCGTTTAAGAACAGTTTCTCTGGGTTACACTTTCAATGCAAAGCAATTGTCTAAATTTAAAATCGAGCGTTTAAGATTGTATGTATCGGCTCAGAACTTGTTAACCTTTACCAATTACACTTATTGGGATCCAGAAGTTAATGCTGACTCTTTCGATTCAAACATTGCTAAAGGAAACGATTTCTATACATCACCACAGCCAAGAACTATTTTATTTGGTGTGAACGTAGGTTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 990
LGGVTVKAKGTAVTSVTGADGAYSIKVTSSVKTLVFSYVGYSDVEAPVRGTSVDVALNSAVSNLSEVIVTGFGGAQIKREVTGNIARVKGKDIEYMPTPSVDAALQGKAAGVFVNSQSGKLGQAVTVRVRGNSSISANSQPLYVLDGIPMTSNSQSSYGGATNPLVDLNPNDIESIEVLKDASAGAIFGSRAANGVVLITTKKGRAGKTQVTFNYQTGAAEATKRLAMLNSEEYATLILEGAKYRDDLDGTPITDPSSWTSYVRNDVMDYYSYGNWSKDPKKTYDWQDAVFQKAPYRQADLQIRGGTDKTKFFSSFQHLEQTGTMVGNELQRTTGRLNIDQKVNDWLDMGVSLSLSRTYNRRLPDDNAFSNPLQAIALMPMNPFTDPNTGLPSGTPPGDVNIPLYYNPILTVDYAKYTQDVYRTFGNAYIKAYLAKGLTFQTEFGMDYLSQNEEGYFQNQTVRNQTRATAGLGTNRGAFVTNYNTQSYFNYSTVIKKHNISATLGTQYQQSQAKYNFTEGTAFPSNSYQKIASAATISSGSSSQTDFRFLSYFLRGNYTFDEKYIVAASARIDQSSRFGKNSRSGFFPAVSAGWIMSNEKFLQDSKIFSFLKLRASYGIVGNAEIGNFPQLGLFSGDAGYAGAAGQRPSQLRNDNLKWETTKQFDIGIDFGILNNRITGEIDYYVKKTDGLLLNVNIPATTGFNSQVRNVGKLENKGFEFVLNTQNLIGAFKWNTSFNIARNIGKVTDIQGQIIEGGISSMNRVQEGYAVGVFYTPQYAGVDPANGNALFYLNTKNADGSLNKGTTSNYALAQRIVAGDPNPDYILGITNSFSYKGFDASIFFNGVLGNENNIYGMGRYSSASMLYEDNNTADQLRRWQKPGDITDVPQVRLYRVNGSQASSRYIVDGSYIRLRTVSLGYTFNAKQLSKFKIERLRLYVSAQNLLTFTNYTYWDPEVNADSFDSNIAKGNDFYTSPQPRTILFGVNVGF*