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FFSP_072018_mid_0_1um_scaffold_1163_5

Organism: FFSP_072018_mid_0_1um_Sphingobacteria_36_79

near complete RP 45 / 55 MC: 2 BSCG 48 / 51 MC: 5 ASCG 12 / 38 MC: 1
Location: 3787..7158

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
pgdA; Peptidoglycan-N-acetylglucosamine deacetylase (EC:3.5.1.104) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 58.6
  • Coverage: 1133.0
  • Bit_score: 1323
  • Evalue 0.0
hypothetical protein n=1 Tax=Segetibacter koreensis RepID=UPI0003645262 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 61.0
  • Coverage: 1130.0
  • Bit_score: 1401
  • Evalue 0.0
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 94.2
  • Coverage: 1123.0
  • Bit_score: 2142
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3372
ATGGCCAAGGGGTTCAAACAGGTTTTTCAAACAAGCAATCCTACCAGATGGCAACGTTTTAAGTGGACGTTTCGTTTGTTGCTATTCCTATTAATTATTACGGTCATTGCAATTATTATTGCTATTCGAACAGCGTATGTACCTACTGTACCTATACTACAAAGTAGTGTTTTCAAAAAAATTTTAGTATCAGATGAAAACCCTGATTCTCTTGCCAAAAAATACCAAGGGTTTAGAAAATTTATAGATGATAAATGGTCAGCCGGTAATGGATGTGGACAAAATGATAGTGCAATTCGGCTTTCAAACTCTAAACTATTTAGTGATTCATTGGGCATCAGGGCTGCTTTTTATGTTGATTGGGACCCTCAAGCATTCTTTTCTTTAAGAAGAAATATTAACAAGCTCAATTTAATATTACCTGAATGGATGTTTTTTGATCCAAAGGGAGATTCAATGATTATAAGAAAAGACAAACGAGGGTACGACTTAATTAAACAGGCAAAAGGACTTAGGGTAATGCCCATGCTCACCAATAATATTAATGGAAAATGGGATGGCGCAGTGGTGAGCAGAATATTAAACAACCCCACTAAAAGTGAAAAATTAATTAATGATTTATTTAAATGGATTAAGACAGAAGGCTTCGCTGGTATTAATATTGACTTTGAAGAATTAGTTGAAAAAGACAATAGAATACTAACGCAATTCTTAAAAAAATTATCCGATCGGTTTCATGCAGGTGGCCTTCTCACTTCAATTGATGTAATGCCATTTAATGAGGATTATGATTACAAGGCATTGGCAGCTCATACAGATTATATTTTCTTAATGGCCTACGATCAATATACATCTAGCACTAAACCAGGACCTATTAGTGGTCAAAAATGGATTGAGGCCGCCGTTGATCAAATTGTACAAAAAGTTCCAATACCCAAATTGGTTTTATGTATTGCAGGATTTGGATATGATTGGCCCAAAGGAGGTGAGGGCTCTGATGTTACTTATCAGCAAGCATTGAGTATTGCAAAAGAAAACAATAGTAAAATTACCTACGATAATGATTCTTATAATTTATACTTCACATATAAAGACAAAGTAGGTCACGAGCGAGAAGTGCATTTTACAGATGCTGCTACTAACTTTAATTCAATTCGATTTTCAACAGAATATGGTTTTGCAGGAACTGCTTTGTGGCGGATGGGAAGTGAAGACAGCAGGCTTTGGGATTTTTATCATTTGCCTATGAACAAAGCATCTGTTCAAAAATTCAATTTTGAAGAATTTACAAAAGTTGAAACAAGCAACGATGTAGATTTTATGGGTGAAGGAGAAATTTTAGATGTTATTTCTACACCTACGCCTGGTCATATAAGAACAGAGTTAGATACCGAATGGATGTTGATTTCAGAAGAATTCTACGATACACTTCCATCAATGTTTGTAGTAAAACAATTTGGCAAGTCTACAGAGAAAAAAATGGTTTTGACATTCGATGATGGACCTCATCCAGTTTATACACGACAAATTTTAGACATACTTGATAAATATAATGTAGTAGCTAATTTTTTTATTGTTGGAATTGAAGCTGAGAAAAATATTCCTTTAGTAAAAAGAATTTATAACTCAGGACATGAAATAAGCAATCATACATTTACCCATCCAAATATGGCAACCGTTAGTAAGCAAAGGGCTTACTTAGAAATGGATGCAACCAAATTATTGATTGAAGCAATTACTGGTAGAAGTACCATTATGTTTAGGGCTCCTTTTAATGCAGATAGTAGGCCTGAAACTATGGAAGAACTTGTTCCTGTAGCATTAAGCAGGGAAAAAAACTATTTAACTATTGGCGAAAATATAGATCCTTTAGATTGGCAAATTGATGAGGATAAAAATTTTAATGGAGACAGTATTTTTAATAGAGTGGTAAGAATGAAAGATAGGGGAAATATTATTCTGCTGCATGATGCCGGTGGAGACAGAAGTGCTACAGTAGATGCATTACCAAAAATTATTGAATACTTTCATAAGCAGGGATATAAATTTACCACAGTTGCAGACTTAATGGGAAAAACAAGGGATGATGTAATGCCCCCAGTTCCCAACTACCAAGAGAATTATTTATTAAGATTCAATTATTTTCTTGCAGAAGCTGGCTATTATTTGGGTAAAACTTTTAATGCATTATTCCTTTTGTTTTTAACACTAGGTAGTATCCGTTTACTCATTGTTTTGATTTCATCAATACTTGCAAGAAAAAAGGAAAAGAAAAAAGATCTTCAACCATTCAACAACCACCCGCTTGTTTCAATTATAGTTCCAGCATATAATGAAGAAGTAAATGCAGTTAGTTCATTAAACAACTTGCTTCGATGCGATTATCCATCATTCAATATCATATTTGTAAATGATGGAAGTACAGACAATACCTTAGAAGTAGTTAAAGCTGCATTTAAAAATAATCACCTAATAACCATTTTAGATAAATCAAATGGAGGGAAAGCTTCTGCATTAAACTATGGTATTGAAGCAACCAATGCCAATTATGTTGTTTGCATAGATGCAGATACAAAATTAAAAACAGACGCAGTAAGTAAGCTGATGATGCACTTTAATGACTCTTCTATTGGAGCTGTAGCTGGTAATGTAAAAGTGGGAAATGAGGTAAACTTAATTACCCGTTGGCAAAGCATTGAATACACAACCAGTCAGAACATTGATAGAAAAGCATTTGGATATTTTAATGCTATTACTGTAGTGCCTGGAGCTATTGGGGCATTTAGAAAGATTGCAATAGAAGAAGCCGGAGGATTTACATCTGATACCTTAGCTGAAGATTGTGATTTAACCATCCGTATCTTACGCTGTGGATATAGTATTGCAAATGAAAATGGTGCAATAGCGCTAACAGAAGCCCCTGAAACACTTAAACAGTTTATGAGCCAGAGATTCAGGTGGACTTTTGGTGTATTGCAAACTTTTTGGAAAAATAGAGATGCATTATTTAATACTAATTATCCTAAGTTGGGTTTTATTGCTTTACCCGATATTTTGCTTTTCAAATATATTATACCATTATTTGCTCCATTTGCAGACTTTTTAATGTTAATAGGTTTAATTACAGGTAGTGCTAGTGAAATTGGTATTTACTATGCCATTTTTCTAGGAATCGACCTATTATTGGCCTTATTTGCATTTAGCTTTGAAAAGGAATCTGTCTGGAAGATTTTCTGGTTAATTCCTCAACGAGTGATTTATCGTTGGTTATTATTAATTGTACTTTTTAAAACCCTTAGAAAAGCTGTTAAAGGAGAACTCCAACATTGGGGTGTTCTTAAAAGAACAGGAAATGTACAGGAAGCCATATAA
PROTEIN sequence
Length: 1124
MAKGFKQVFQTSNPTRWQRFKWTFRLLLFLLIITVIAIIIAIRTAYVPTVPILQSSVFKKILVSDENPDSLAKKYQGFRKFIDDKWSAGNGCGQNDSAIRLSNSKLFSDSLGIRAAFYVDWDPQAFFSLRRNINKLNLILPEWMFFDPKGDSMIIRKDKRGYDLIKQAKGLRVMPMLTNNINGKWDGAVVSRILNNPTKSEKLINDLFKWIKTEGFAGINIDFEELVEKDNRILTQFLKKLSDRFHAGGLLTSIDVMPFNEDYDYKALAAHTDYIFLMAYDQYTSSTKPGPISGQKWIEAAVDQIVQKVPIPKLVLCIAGFGYDWPKGGEGSDVTYQQALSIAKENNSKITYDNDSYNLYFTYKDKVGHEREVHFTDAATNFNSIRFSTEYGFAGTALWRMGSEDSRLWDFYHLPMNKASVQKFNFEEFTKVETSNDVDFMGEGEILDVISTPTPGHIRTELDTEWMLISEEFYDTLPSMFVVKQFGKSTEKKMVLTFDDGPHPVYTRQILDILDKYNVVANFFIVGIEAEKNIPLVKRIYNSGHEISNHTFTHPNMATVSKQRAYLEMDATKLLIEAITGRSTIMFRAPFNADSRPETMEELVPVALSREKNYLTIGENIDPLDWQIDEDKNFNGDSIFNRVVRMKDRGNIILLHDAGGDRSATVDALPKIIEYFHKQGYKFTTVADLMGKTRDDVMPPVPNYQENYLLRFNYFLAEAGYYLGKTFNALFLLFLTLGSIRLLIVLISSILARKKEKKKDLQPFNNHPLVSIIVPAYNEEVNAVSSLNNLLRCDYPSFNIIFVNDGSTDNTLEVVKAAFKNNHLITILDKSNGGKASALNYGIEATNANYVVCIDADTKLKTDAVSKLMMHFNDSSIGAVAGNVKVGNEVNLITRWQSIEYTTSQNIDRKAFGYFNAITVVPGAIGAFRKIAIEEAGGFTSDTLAEDCDLTIRILRCGYSIANENGAIALTEAPETLKQFMSQRFRWTFGVLQTFWKNRDALFNTNYPKLGFIALPDILLFKYIIPLFAPFADFLMLIGLITGSASEIGIYYAIFLGIDLLLALFAFSFEKESVWKIFWLIPQRVIYRWLLLIVLFKTLRKAVKGELQHWGVLKRTGNVQEAI*