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FFSP_072018_mid_0_1um_scaffold_2391_1

Organism: FFSP_072018_mid_0_1um_Sphingobacteria_36_79

near complete RP 45 / 55 MC: 2 BSCG 48 / 51 MC: 5 ASCG 12 / 38 MC: 1
Location: 2..2896

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
membrane protein n=1 Tax=Pedobacter agri RepID=UPI00029AD74A similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 37.9
  • Coverage: 987.0
  • Bit_score: 642
  • Evalue 4.70e-181
TonB-dependent receptor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.5
  • Coverage: 942.0
  • Bit_score: 488
  • Evalue 3.20e-135
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 89.6
  • Coverage: 964.0
  • Bit_score: 1758
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2895
CCGTCAACCGCAACAGCCTTAGTTATTTCTGGCTTAAACTTAGCGCCAAAAGAAATAAAATTAGGGAAAGGTAACACAGTTAATGTATCGTTAAGTTCAACTGTAGAAAATTTGGACGAAGTGGTTGTAACTGGTTATTCAAGGGAAAAGAAAACCCAGTTTGCTGGTGCTGCAGCAGTATTAAGTAGCAAAGTAGTTGAAACCGTTCCTGTAGGTTCATTTGATCAAGCTCTACAAGGACGTGTTCCTGGTATGTTGGTTAATTCTGCATCTGGTCAACCAGGTAGTTCTGCTTCCATTACCATTAGAGGGATTCAATCAATTGAAGGTGCTGGTGCACAACCTTTATATGTAATTGATGGAGTACCATTGCCTGCATTTGATATGCAAACAATTAACCCGAACGACTTCGAATCTATTACTGTATTAAAAGATGCAAACTCTGCAGCTTTATATGGTGCTAGGGGTGGTACAGGTGTAATTGTAATTACTACTAAAAAAGGTAAAGCAGGTCCTACTAGATTAACTTATAGAGGCCAATTTGGATTTACTCAAGCTCCTGATTTTAGTCGATTGAATTTAATGAGTACGGCAGAAATGTTTGCTTATGAAGAACGTCAAAAATTTAATAATAACCCAGGATGGACGTACTCTCCAAATAACCCAGCTATACCTGTTGGTATGACCGCTGCAAGAAAGCAATTCTTGTATGACAGTATTAAAAGTATTGATACTTTTTGGCCAGATGTTTTGTATAGAACTGGTGCTTCAAAAACACATGAATTTAATTTATCAGGAGGTAACGATAAGACCAACTTTTTCTTATCTGCTGGTTTGTTCGATCAACAAGGCATTGACTTGGGTTCCAGTTTAACAAGATATACTGTAAGATTGAACGTTGAACACAAAAATAATAATTTGACAGTCCGTTTCAATAATCAAATTGGATATTCAATTTCTAAATTTGCTGATTTCGAAGGTGCTAATACTCCTAGAAACCCTTTCCAGATGACTTATCGAGCCAAAACCTATGAAAATCCATTCAGAGCGGATGGTTCAATAATTACTGGAGCAAGTACACCATTGGCTTTGCGTCAGGTGGGTAACTTATTAGATGGTATTGCAAATACAAAAAGTTCATTAAATCAGATTAAAGTAAATTCAGGGCTTACCATTGCCTATAAAATTTTACCTAGCTTAACTTTACAAAACACCTTCGGAATTGACGTTTCAAATGATGATCGTTCTCGATATATTAACCCTGCTTCTTATTGGGGAACATTGCAACAGTTTCAGAATGGATTAACACAAGAAGGTCATCGTTTAACTTCTCAAATCATCAACACCAGCAGTTTAGTATTCTCTAAGCGAATTTCTAATATTCATGAAGTGGAAGCAGGTGCATATTTTGAAGTAGTTAGAGGTTGGTCTAAAGCTATCGGATTAACTCTGTTCAACTTAGACCCACGCTTAACGGAAACTGGTCAAGGTGCTGGTGATTTACCTGTTGGAACTGGTCAAACAACTTACCCTCAGAACTCCTCTTCAGCTAAGTCTGGATTTGGTATTCGCTCTTATTTTGCTACTGCACGTTATACTTATGATGGTAAATATTCTATCAATGCAAACGTAAGACGTGATGGTACTTCTAGAATTGTAAACCAAGCTAATCGTGAAATTACTACCTGGTCAGCAGGTTTTGTTTGGAATGCTTTGAAAGAAAATTTTCTTGCAAACCAAAGAATCTTTACAGATTTAAAAGTTCGTGCTAGTTATGGTATTGTTCCAAATATTGGATCTATTGCAACTGGGGCTTATGGTGTTCCTTTGAATGGTGTACCCAATTACCAAGGACCCCAAGTACCTACCTTCGGAACTGCATCATATGCAGGTTCTGCTGTGGTTGGATTGGTACCGCGCAATCCAGGTAATCCAGATTTAAAAATTGAAAGAATTCAAAAAACTAATATTGGTATAGATTTTGCTATTTGGCAAAATCGTGCAAGATTCACAGTGGACATTTACAAAAACAAAACGATTGACTTGTTTGTAAATCAACCATTATCCGGAACAACGGGGTTTGCGTCTTTAAGTATTAATGCTGGTGTTATGACAAACCAAGGGATTGAGTTCACAGGTTCAGTTGATGTGTTAAAAAAGAAAGATTTCGGTTTAACAGTTGGGATGAATCATTCAATCCAAAAAAATAATATCGAAGATTTAGGTTTAGTGAATGAATATGTTGTTGGAACTTTTATAATTAGAAAAGGACTTCCTTTTGGCTCTCACTATACGAGAAAGTATTTAGGAGCTGATCCAGCTACAGGGCGCCCAACCTTTGAAGGCCCAAATGGCACTAAAGTACTTTCAGAGGCACAAGGCGTTCAGTTAGCGGAATTTGGTACTTACTTACCTAAGCATCAAGGTGGTTTTAATTTAGATCTTCGTTTTAAAGCGATTACAGTATCTGCATTTTTCTCTTATCAGTTTGATGTTACACGATACAACAATACTGGTAACTGGATTACCAGAGGCACCATTGGATACCATACTGCAGTAAGAGGTTCAAGAGAATTAATTGATGGTCAGTGGCAGAAACCTGGAGATGTTAAGCCAATTCAAGCTTCAATCTATGATAGAGGCTTTAATTCTTCAGATGTTCAAGATGCCAAATTTCTCCGATTTAGAAATTTAATGGTATCCTATGCTATACCCGAAATCAAAACTCCTAGTGGTGTTACCTTAATTAAAGGCGCGCGTTTTTATGTACAAGGTCAAAACTTAGCTATTTGGAGTCCATGGAAAGGGCTTGATCCTGAAGATAGCAACAATATTAGTTTAAATGAGTATCCAAACCCTAGAGCATTTGTTGCTGGTATTGATATAAATTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 965
PSTATALVISGLNLAPKEIKLGKGNTVNVSLSSTVENLDEVVVTGYSREKKTQFAGAAAVLSSKVVETVPVGSFDQALQGRVPGMLVNSASGQPGSSASITIRGIQSIEGAGAQPLYVIDGVPLPAFDMQTINPNDFESITVLKDANSAALYGARGGTGVIVITTKKGKAGPTRLTYRGQFGFTQAPDFSRLNLMSTAEMFAYEERQKFNNNPGWTYSPNNPAIPVGMTAARKQFLYDSIKSIDTFWPDVLYRTGASKTHEFNLSGGNDKTNFFLSAGLFDQQGIDLGSSLTRYTVRLNVEHKNNNLTVRFNNQIGYSISKFADFEGANTPRNPFQMTYRAKTYENPFRADGSIITGASTPLALRQVGNLLDGIANTKSSLNQIKVNSGLTIAYKILPSLTLQNTFGIDVSNDDRSRYINPASYWGTLQQFQNGLTQEGHRLTSQIINTSSLVFSKRISNIHEVEAGAYFEVVRGWSKAIGLTLFNLDPRLTETGQGAGDLPVGTGQTTYPQNSSSAKSGFGIRSYFATARYTYDGKYSINANVRRDGTSRIVNQANREITTWSAGFVWNALKENFLANQRIFTDLKVRASYGIVPNIGSIATGAYGVPLNGVPNYQGPQVPTFGTASYAGSAVVGLVPRNPGNPDLKIERIQKTNIGIDFAIWQNRARFTVDIYKNKTIDLFVNQPLSGTTGFASLSINAGVMTNQGIEFTGSVDVLKKKDFGLTVGMNHSIQKNNIEDLGLVNEYVVGTFIIRKGLPFGSHYTRKYLGADPATGRPTFEGPNGTKVLSEAQGVQLAEFGTYLPKHQGGFNLDLRFKAITVSAFFSYQFDVTRYNNTGNWITRGTIGYHTAVRGSRELIDGQWQKPGDVKPIQASIYDRGFNSSDVQDAKFLRFRNLMVSYAIPEIKTPSGVTLIKGARFYVQGQNLAIWSPWKGLDPEDSNNISLNEYPNPRAFVAGIDINF*