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FFSP_09252017_12_scaffold_1083_1

Organism: FFSP_09252017_12_Sphingobacteria_36_66

partial RP 32 / 55 MC: 2 BSCG 35 / 51 MC: 3 ASCG 9 / 38
Location: 175..4662

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase n=1 Tax=Shewanella denitrificans (strain OS217 / ATCC BAA-1090 / DSM 15013) RepID=Q12MX5_SHEDO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 33.5
  • Coverage: 853.0
  • Bit_score: 388
  • Evalue 2.50e-104
ATP-binding region, ATPase-like protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 33.5
  • Coverage: 853.0
  • Bit_score: 388
  • Evalue 7.00e-105
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 90.9
  • Coverage: 1495.0
  • Bit_score: 2711
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4488
ATGAGTAAAAGTGACAATAGAAAAGATATTGAACAGGATTTCATCTTGCTTTTCGAGAATGTTGCTCAAGGTGTTATTTATCTGAATAAAGACGGCAAAATTGCAGAAGCAAATCCAGCTGCTATAGATTTATTAGGGTTATCAGAAAATCAAATAATTGGAATAGAATCTGTTGATGCACGTTGGGCTACAATAAAGCCTGATTTTTCTATTTTCCCGGGCGATGAACACCCTGCAATAGTAGCATTGAGAACGGGAAAGCCGGTTTTTAATGTTGTAATGGGCGTGAAGCAGGCTGTTAAAAATAAATATGTATGGATTTTAATAAATGCAGTTCCAGAATTTAAGGAGGGAGAAACAGAGCCTTATCGAGTATTTACCACATTTACAGATATTACCGATCAAATTGAATTAGAATCAAAGCTAAGACAGCGGAATAAGTTGTTGCATTTAATTTCAAACATTTCACAGCGGTTTATTAATATCCCTTTAAAACATTTGAATAATGAAATTAATGCTGCAATAAAAGAATTAGGTGAGTTTGCCAAAGCGGATAGATTGGCCATTTTAGAGTATGATTATAAAAATGGTTTTGCTTATTATACACATGAATGGTGTGCCCATGGAATCGAATCTAAAAAAGAGGAATTGGCTAAAATTCCTTTGAATGAATTTGCGTCTTGGATTGAAATCTTACAAAAAGGAAATCCAATTAACATCCCCAATTCAGATCAATTAGAAATAAATAGCCCAATTCGTAATTTATTAGATGCAGGAAAAGTAATCAGCTTATTGGCAATACCATTAATGGATGGTAACGATTGCATTGGTGTAATAGGATTAGAGTCTGTTAATCAGCCACACTATTTTACTACTGTTGAACAAGACCTCTTAGGAATTTTTGCAGAGTTACTAGTGAATGTAAAAAACCGAATTTCAAATGAGCTGAAAATAAAAGAGAGTGAGATAAAGTACAAAGAAATTACAGAGAATATGTCTGATATGGTATGGACCATGGACTTAGACTTTAATATTACTTTTTGTAGCGCTTCCATTATCAAGATATTTGGGTACACATCCCAAGAGTTTATTCAACTTAGTTATGACAAAATCTATACATCTGAAACAATTCAAAAAATTGAAACACTCTTAACAGAAATAAACCAGTGTCGAGTTAATGGTTCTATTAATGTAAATCAGGCCTGGACAATTGAAGGGGACTCTTTTAAAAAAGATGGCACTTACGCATGGTTTATTACTGAAATAAAACCACATTTTTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGGATTTATAGCAACAACTCGCGATGAAACAATTCGAAAAAAGGCAAATGATGAATTAAGAAAGTCAAGATTTGATTTAGGAGAGCGATTGAAAGAACAAAAAGTAGTTTATGCTGTATCTACCTTAAGTCAAAATGAAGAATTAACACCGGAAGAATATTTTAATGAGATTGCTAATATTATTGTAGCTGGATTTCAAGATACCATACAAACGTATGTTCATATAGAATATAATGGAATTGATTATTTTTCAAATCAATTTAAAGTCACAGAAAACTTTCGAGAATTTAATATTCATGTTTCTACCAAAAATCAGGGATGTATTAAAATATATATACCAGGAACTTTAGACTTTCTTAATGAAGAAATGGTAATGATTAATACCATTGTTGGTATAATAGAAAAGTATAAGCAAATCAAACTAACCAAACGGGATATTATTGCTTCTGAAGAAAAGTTCAGAATTATTGCCAATAACACCTATAACTGGGAATTTTGGGAAGCGCCAGATGGGTATTTTATTTATCACTCTCCTTCTTGTGAACGTATTACTGGTTATACGGCAGAAGAACTTCTTACAGATTCAGCAATTACCCAAAAACTAATTCACCCAGACGACCTTACTAAATATATTGAGCATAGAAATAAAGTTGTTGAAGAAAAGAAATCCGAAAAAGTTATTTTCAGAATTATCAATAGAAGTAATGAAACAAGAATTATTGAACATGTATGCCAACCCATATTTAATGATCAAGGTATTTTTTTAGGAACTAGAGGAACTAATTTAGATATTACTGAAAATAAATTAGCCGAGGAAGCATTACTAGAGAGTAAAGAAAAATATAGAAGTTTAATTGAGAGTTCTGATGCTTCTATTTTCATGTTAGATTTAGAAGGAAGGTTTTTATATGTGAATGATAAAACAGCAGAAACATTTGGATTGCCCAAAGAATCTTTCATTAATAATGGACTCACTATTTATGATTTATCTTCTCCAGAATTGGCCAGTCAAAATATGGCAGAAGTAGAACATGTTTTTTTTTCAGGAAAGGGTAAGATAAAAGAATCTTCAAGAGTGATCAATGGCCAAATGTTTTGGTTTAGAAGTAGTATTCAGCCGGTAAAAAATAGTCAGGGTAATATATATGCTGTTTTTGTAAACGCTACCAATATCACGGAGAAAAAACTAGCAGAAGAACGTGTATTACAAAGTGAATTAAAATATCGAACTCTTTTTGCCGATTCACCCGACGGTTATTTAATTGTAAAAGATGGAATTTTTATTGATTGTAATAAAGCAAGTGAATTAATACTAGGAACAAATAGAGAAGGCATTATTGGCAAAGAACCGAAAGATATTTCACCAGAATACCAACCAAATGGTCGCAAGTCGGATGAGTTGGTACAAGAAGTAGTAGCTGAAGCTTTTGCTAATAAAACGACACAGTTTGAGTGGGTTCATTTAAAGCCTGATGGAACTCCTGTTTACATAGATATTAAACTCTCTGCAATTGACACATTAGATGAAAAATTTCTTCTTACTACTTGGAGAGATATTACTTCACAAAGGGAAGCAAAAGAGCTGATTAATAAATTGAGTAGTGCGGTTGAACAGAGCCCAATCAGTATTTTTATTACAGACCTTGATGGAAATATTGAATACGTAAATCCATTTACGATAACTACAACAGGCTATCAACAAGAAGAGTTGATTGGGCAGAATCCAAGAATTTTGAAATCGAGCTTTACCAATCCTAAAGTGTATGACGAGCTTTGGAGTACAATCACTAATGGTAAAGTATGGAGAGGGGTTTTAAATAATAGAAGGAAAAATGGTTCATTGTATTGGGAGTCTACTACAATTACACCTATTATTAACGAAGTTGGGGCAATTACTAGTTTCATTGCTATTAAGGAAGATATTACAGAACGAATTAAAATTGAGCATGAGATAAAGCAACTCAATACCAATCTAGAAAAGAAAATTGTAGAAAGGACCATCGAATTGCAAAACAGTAATGAAGAGTTAACAAAAGCCAAAATTGAAGCAGAAGAAGCCAATCATGCTAAAAGTGAGTTCTTATCTAGAATGAGTCATGAACTTAGAACTCCTATGAATGCCATTCTTGGATTTGCACAGTTGCTAGAGATGGGGTCATTAGATTCCAAACAAGAAAAAGCAGTACACCATATTTTAAACAGTGGACAACACCTGTTGAACTTAATTAATGAAGTACTTGAAATATCAAGAATTGAAGCAGGTAAAATTTCTATCACTGTTGAAGCGGTAAAACTAAATAATGTTTTTAGAGATGTATTAGAAACATTAACTCCAACGGCTGATGCTTATGGAGTAAAATTGATTAATGAGCTTGAAGATAAAGCAGATATCTTTATAAGTGCTGATAAGCAGCGGATTAAACAAGTTTTACTTAATTTATTAAATAATGCTATAAAATACCATGATAAAAGAGGGTGGGTAAAATTATTCGCAACCGAAGTTATAAGAGATAATAAAACCATTATTCGTATTTGTGTATCAGATAATGGTCCGGGAATTGATGCCAATAATGTAAAAAAATTATTTACCCCATTTGAAAGATTAGGAGCAGAAAATAGTACAGTTGAGGGAACAGGATTGGGGTTATCGGTAGTTCAGCAATATGCATCTTTGATGGGAGGCACATGTGGTGTAGAGAGCAAGTTAAATGAAGGAAGCACATTCTGGGTAGAACTTCCTAGAACAAGCTCTTTTGTAGAATCCCTAAATGTTCGTGCTCAATTAGAGCAAGTAGCGCTTAAAGAAAAGACCATCGAAGAGGCAGTAGTATTATATATTGAAGATAACAGTTCGAATATTGAATTGGTAACCCAAATTTTATTAGCAAAGCGTCCCAACGTAAAATTAATAACTGCAGTTTACGGTAAACAAACTTTGGAATTGGCACTTAAACATCAGCCCAATCTAATATTGTTAGATTTAAATCTGCCTGATATTCATGGATCTGAAGTATTTGAATTATTAAAGCAACATGAAATAGCTAGGCAAATTCCCGTAATAATAGTAAGCGCAGATGCCATGCCTGCTCAGGTAAATAAATTATTGGAAGCTGGTGTTAAGCAATACTTAACCAAGCCTTTTGATGTCCCTGCTTTTTTACAAATGATTGATCAATATACTAACCATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1496
MSKSDNRKDIEQDFILLFENVAQGVIYLNKDGKIAEANPAAIDLLGLSENQIIGIESVDARWATIKPDFSIFPGDEHPAIVALRTGKPVFNVVMGVKQAVKNKYVWILINAVPEFKEGETEPYRVFTTFTDITDQIELESKLRQRNKLLHLISNISQRFINIPLKHLNNEINAAIKELGEFAKADRLAILEYDYKNGFAYYTHEWCAHGIESKKEELAKIPLNEFASWIEILQKGNPINIPNSDQLEINSPIRNLLDAGKVISLLAIPLMDGNDCIGVIGLESVNQPHYFTTVEQDLLGIFAELLVNVKNRISNELKIKESEIKYKEITENMSDMVWTMDLDFNITFCSASIIKIFGYTSQEFIQLSYDKIYTSETIQKIETLLTEINQCRVNGSINVNQAWTIEGDSFKKDGTYAWFITEIKPHFSEDGILKGFIATTRDETIRKKANDELRKSRFDLGERLKEQKVVYAVSTLSQNEELTPEEYFNEIANIIVAGFQDTIQTYVHIEYNGIDYFSNQFKVTENFREFNIHVSTKNQGCIKIYIPGTLDFLNEEMVMINTIVGIIEKYKQIKLTKRDIIASEEKFRIIANNTYNWEFWEAPDGYFIYHSPSCERITGYTAEELLTDSAITQKLIHPDDLTKYIEHRNKVVEEKKSEKVIFRIINRSNETRIIEHVCQPIFNDQGIFLGTRGTNLDITENKLAEEALLESKEKYRSLIESSDASIFMLDLEGRFLYVNDKTAETFGLPKESFINNGLTIYDLSSPELASQNMAEVEHVFFSGKGKIKESSRVINGQMFWFRSSIQPVKNSQGNIYAVFVNATNITEKKLAEERVLQSELKYRTLFADSPDGYLIVKDGIFIDCNKASELILGTNREGIIGKEPKDISPEYQPNGRKSDELVQEVVAEAFANKTTQFEWVHLKPDGTPVYIDIKLSAIDTLDEKFLLTTWRDITSQREAKELINKLSSAVEQSPISIFITDLDGNIEYVNPFTITTTGYQQEELIGQNPRILKSSFTNPKVYDELWSTITNGKVWRGVLNNRRKNGSLYWESTTITPIINEVGAITSFIAIKEDITERIKIEHEIKQLNTNLEKKIVERTIELQNSNEELTKAKIEAEEANHAKSEFLSRMSHELRTPMNAILGFAQLLEMGSLDSKQEKAVHHILNSGQHLLNLINEVLEISRIEAGKISITVEAVKLNNVFRDVLETLTPTADAYGVKLINELEDKADIFISADKQRIKQVLLNLLNNAIKYHDKRGWVKLFATEVIRDNKTIIRICVSDNGPGIDANNVKKLFTPFERLGAENSTVEGTGLGLSVVQQYASLMGGTCGVESKLNEGSTFWVELPRTSSFVESLNVRAQLEQVALKEKTIEEAVVLYIEDNSSNIELVTQILLAKRPNVKLITAVYGKQTLELALKHQPNLILLDLNLPDIHGSEVFELLKQHEIARQIPVIIVSADAMPAQVNKLLEAGVKQYLTKPFDVPAFLQMIDQYTNH*