ggKbase home page

FFSP_09252017_12_scaffold_2680_9

Organism: FFSP_09252017_12_Sphingobacteria_36_66

partial RP 32 / 55 MC: 2 BSCG 35 / 51 MC: 3 ASCG 9 / 38
Location: 3737..8089

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Heavy metal efflux pump, CzcA family n=1 Tax=Chryseobacterium gleum ATCC 35910 RepID=D7W2V9_9FLAO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 77.1
  • Coverage: 1455.0
  • Bit_score: 2197
  • Evalue 0.0
Heavy metal efflux pump, CzcA family {ECO:0000313|EMBL:EFK34670.1}; TaxID=525257 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Chryseobacterium.;" source="Chryseobacterium gleum ATCC 35910.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 77.1
  • Coverage: 1455.0
  • Bit_score: 2197
  • Evalue 0.0
Cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 76.9
  • Coverage: 1422.0
  • Bit_score: 2136
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Chryseobacterium gleum → Chryseobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4353
GTGATTGGAATATTTACCCTGGCATTAATATGCTGGGGTGCATATTCCCTTACGCAACTTCCTATTGATGCTACACCGGATATTACCGATAATCAAGTAATGGTTATAACAGTAACTCCAACTTTAGCTGCGCAAGAAGTTGAACAGTTAGTTACGTTTCCGGTAGAACAAACAATGGTTAGCATTCCAGGTATTAAGGATATGCGATCTTTTTCTCGTTTTGGACTTTCTATTGTAACGATTGTGTTTGAGGAAAAGATTAACATATATTGGGGTAGGCAGCAAGTACAAGAACGATTGTCTTTAGCTGCTAAAAATATACCTCAAGGTGTTGGTACGCCGGAGATGGCGCCTGTTACTACTGGATTAGGTGAAATTTACCAATATGTAGTTCATCCAAAAAAAGGATTTGAAAACAAATTTGATGCAACTGAATTAAGAACTATTCAGGATTGGATAATAAAAAGGCAACTTTTAGGAACACCAGGTGTTGCAGAAGTCAGTGGATTTGGTGGATTTGTGAAGCAATACGAAATTTCAGTTGAGCCCGATAAATTAGCAATTTATAATATTAGTATTACGGATATATTTTATGCACTAGAAAAAAATAATCAAAATACAGGTGGTGCCTATATAGATAAAGGTCCAAATGCTTATTTTATTCGCAGTGAAGGTTTAGTAAGAAATATAGAAGAAATAAAAAAAATTGTTGTTAAAAATCAAGGCGGATCACCCATTTTGATTCGCGATATAGCAAATGTTGGATTTGGTAATGGTCCACGTTATGGAGCAGCAACTAGGAATGCTGAAGGGGAAACTGTTACTGGAATTGTTATGATGCTTAAAGGGGCAAATTCTTCAGAAGTAATTACTAATGTAAAAGCAAAAATAGAAGAAATCAAGAGGAGTTTACCTGAGGGGGTAGAAATTGAACCTTTTCTGGATAGAAAAAAACTAGTTGATGGAGCCATTTCTACAGTTTCAACTAATCTAATTGAAGGAGCTTTAATTGTAGTTTTTGTGCTCATCCTGTTTTTAGGAAATTGGCGTGGAGGACTTGTTGTTTCGTCTGTTATACCTCTAGCTATGTTATTTGCAATTGCTATGATGAATCTTTTTGGTGTTTCTGGTAACTTGATGAGTTTAGGCGCAATTGATTTTGGGATTATTGTAGATGGAACAGTTATTATTGTGGAATCAGTACTACATAGGATAATAAGTAGTAATGAAAGGTATGGCGAACTTAAAAAATTATCGCAAAAGCAAATGGATGAAGAAGTATATCAATCTTCAACAAAAATTAGATCAGCCGCTGCTTTTGGTGAAATTATTATTCTAATTGTTTATTTGCCTCTATTGGCATTGGTTGGTGTAGAGGGAAAAATGTTTACCCCAATGGCTCAAACTGTTTCTTTTGCCATCTTAGGTGCATTCATTTTATCGTTTACTTATATTCCGATGATATCATCTTTGGCTTTGAGTAAAAAGATTAGTCGTAAAGAGAATTTTTCAGATAAAATGATGAAAGCAATTCAAAATATTTATGGACCAATAATTGAAGGGGCAATTAAGCGAAAATATTTAGTTATGGCAACTGCTGTTATATTTTTCATTATTACTATAGTCGTTTTCAAAAGGATGGGAGGGGAGTTTATTCCTCAATTAGATGAGGGTGATTTTGCAGTTGAAACCAGGGTGCCCGTTGGTAGTTCAATTAATCAAATTATTGATGTTTCAAAAAAAGCTCAACAAATATTGCTAAAGAATTACCCTGAAGTAAAGCAAGTTGTGAACAAAATTGGTTCTGGCGAAATACCTACTGACCCTATGCCAATTGAAGCTGGGGATATGGTTGTGGTTTTAAAGCCCAAAAATGAGTGGTCTAGTGCCACCGATCGGGAAGAACTCATTGACAAAATGCAGCAATCACTTTCAGTTATACCCAATGCAACTTTTAGTTTTCAACAACCTATTCAGATGCGATTTAATGAACTACTAACTGGAGCTAAACAAGATGTTGTCTTGAAAATTTATGGAGAAGATTTAGATATGCTTTCTGATATTGCCTCTGATATTGGGCACAAAATATATGACGTTGTTGGCGTTGAAGATTTGTTTGTAGAAGAAATTACAGGCTTGCCACAAATAAGTATTTTATTTGATAGAGACAAAATAGCACAATATGGTATGAATATAAATGAAATTAATGCTGTAATTGAAACAGGGTTTGCTGGAAAAAAAGCTGGTTTGGTTTATGAAGGAGAGAGAAGATTTGATTTGGTTTTAAGACTAGACAAAGAATCACGGGCTGATATTCGAGATGTTCAAAATTTATTCATAAAAACGCCGAATGGTCAGCAGATTCCGTTGAGCGAAGTTGCCAATATTTCTTTTAAACCTGGTCCAATTCAAATACAGAGGGACAACGCTAAAAGAAGAATTATTATTGGTTTTAATGTTCGCAATAGAGATGTAAAAAGTATAGTGAACGATATTCAACATATTATAAATTCAAATGTAAAAATGCCTGCAGGATATTTTATTTCTTATGGAGGTCAGTTTAAAAATCTTGAAGAAGCTAACAATAGACTTTCTATAGCTTTACCTATTGCATTATTTCTCATTCTTTTACTATTGTATTTTACGTTTAATTCTGTTAAGCAAAGCTTATTAATTTTTACTGCTATTCCTCTCGCTTCTATTGGTGGAGTTATTGCACTTGTAATTCGGGAGATGCCTTTTAGTATTTCTGCTGGAATTGGTTTTATTGCCTTGTTTGGAGTAGCTGTTTTGAATGGAATAGTCCTTATTGCTGAATTTAATCAATTAGAGAAAGAGGGCGTTGATGATGTTTATAAACGTGTTCGTTTGGGTACGAAAATTCGATTAAGACCAGTATTAATGACAGCAATGGTTGCGTCCTTAGGCTTTCTCCCAATGGCAATTTCTTCTTCATCTGGAGCCGAAGTACAACGTCCTTTGGCAACAGTTGTTATTGGGGGCTTAATATCTGCAACATTACTTACATTGATAGTACTTCCAGTACTTTATATTCTATTTACGAAACCTTTCTTTAATTTGAAAAAAAATAGCGCAACAAGTAAATCCTTTTTCTTGTTTATTTTAATTGGAATATCTTCTACAATAATAGCTCAAGGGGTACCATCTAAATATGAACGACCATTAACCTTACAGCAAGCAATAAAGGAAGCTTTAGATAAGAATAATAGTATTAAAATTGCTGAGTATAATATTCGTGTTCAAAGGGTTTTGAAGCAGGGAAGTGTAACTATTCCCAAAGCAGAGTTCTCTTATACCCAAGGTGTTGTAAGTAATCCAACAATAAATGATAATCTGATCAATGTAACACAGCGATTTGATTTTCCTACAATATATAATGAACAATCTAAGTTATTGCAGGAGAGAATAAATAGTTCAGAAAGCAATAAGGTTGTTAATGAGACAATACTTATAGAGAATGTTAAGTTGGCATATCTTCAATTTCAATATTGTTTGGAAAACAGGAAATTATTAAATGAATTAGATAGTATTTATTCTAAATTAAGTCGCTCAAGTGATGAGAGATATAGATCAGGGGAAGGAACTAATCTTGAGAAAATGACTTCAGCGCTTCAGTCTAAACAAATTCAAAATGAATTAGCAAAAAATAGTGTAGATATACAAATTGCAAAGCAACTTCTACAAACTTTGTTAAATACTACAGAAAATATTAGTATTTCAGAATCAATATTACCTTCCCCAAAAATGACATTAAGAGACAATGTTTTTTTAGTTGATAAGAACCCAGTTATTAGATTTTTAAAACAAGAGCAAAAAGTGAGTCAATATGAGTCTAATGTCGAGAAAAGTAAAAAGCTGCCTGACATTATATTGGGTTTCAGTTCACAAACTTATAAAGGGTTGCAGACTATTAACGGAATAAATAGAGATTTTACAGGGAAAAATAGGTTCAATTTCTTTCAAATTGGACTTGGACTTCCTTTATTACCAGGAGGGTATAAATCGAGATTGTCAGCAATGAAAATAAATGAACAAATAGCACAAAATAAAGTTGAACTGAATACTTCTATTCTTAGCGGTAAATTTAATGAGCTAATTCTACTAAATTCAAAATTTCAAAAAGAGTTAAATTATTATTCCAGTCAAGCTTTACCTCAAGCCAATTTAATTATTGTAGATTCTGAAAAAAAATATCAAACAGGAGAAATTTCTTATTCTCAACTTTTGCAAAACTACACTCTTGTAAACGGAATTCGAACTAGGTACTTAGAGATTTTATATAATTATAATAAAGTAATTATTTCAATTGAATCACTAAATGGCAATCAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1451
VIGIFTLALICWGAYSLTQLPIDATPDITDNQVMVITVTPTLAAQEVEQLVTFPVEQTMVSIPGIKDMRSFSRFGLSIVTIVFEEKINIYWGRQQVQERLSLAAKNIPQGVGTPEMAPVTTGLGEIYQYVVHPKKGFENKFDATELRTIQDWIIKRQLLGTPGVAEVSGFGGFVKQYEISVEPDKLAIYNISITDIFYALEKNNQNTGGAYIDKGPNAYFIRSEGLVRNIEEIKKIVVKNQGGSPILIRDIANVGFGNGPRYGAATRNAEGETVTGIVMMLKGANSSEVITNVKAKIEEIKRSLPEGVEIEPFLDRKKLVDGAISTVSTNLIEGALIVVFVLILFLGNWRGGLVVSSVIPLAMLFAIAMMNLFGVSGNLMSLGAIDFGIIVDGTVIIVESVLHRIISSNERYGELKKLSQKQMDEEVYQSSTKIRSAAAFGEIIILIVYLPLLALVGVEGKMFTPMAQTVSFAILGAFILSFTYIPMISSLALSKKISRKENFSDKMMKAIQNIYGPIIEGAIKRKYLVMATAVIFFIITIVVFKRMGGEFIPQLDEGDFAVETRVPVGSSINQIIDVSKKAQQILLKNYPEVKQVVNKIGSGEIPTDPMPIEAGDMVVVLKPKNEWSSATDREELIDKMQQSLSVIPNATFSFQQPIQMRFNELLTGAKQDVVLKIYGEDLDMLSDIASDIGHKIYDVVGVEDLFVEEITGLPQISILFDRDKIAQYGMNINEINAVIETGFAGKKAGLVYEGERRFDLVLRLDKESRADIRDVQNLFIKTPNGQQIPLSEVANISFKPGPIQIQRDNAKRRIIIGFNVRNRDVKSIVNDIQHIINSNVKMPAGYFISYGGQFKNLEEANNRLSIALPIALFLILLLLYFTFNSVKQSLLIFTAIPLASIGGVIALVIREMPFSISAGIGFIALFGVAVLNGIVLIAEFNQLEKEGVDDVYKRVRLGTKIRLRPVLMTAMVASLGFLPMAISSSSGAEVQRPLATVVIGGLISATLLTLIVLPVLYILFTKPFFNLKKNSATSKSFFLFILIGISSTIIAQGVPSKYERPLTLQQAIKEALDKNNSIKIAEYNIRVQRVLKQGSVTIPKAEFSYTQGVVSNPTINDNLINVTQRFDFPTIYNEQSKLLQERINSSESNKVVNETILIENVKLAYLQFQYCLENRKLLNELDSIYSKLSRSSDERYRSGEGTNLEKMTSALQSKQIQNELAKNSVDIQIAKQLLQTLLNTTENISISESILPSPKMTLRDNVFLVDKNPVIRFLKQEQKVSQYESNVEKSKKLPDIILGFSSQTYKGLQTINGINRDFTGKNRFNFFQIGLGLPLLPGGYKSRLSAMKINEQIAQNKVELNTSILSGKFNELILLNSKFQKELNYYSSQALPQANLIIVDSEKKYQTGEISYSQLLQNYTLVNGIRTRYLEILYNYNKVIISIESLNGNQ*