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RTP_03222018_0_2um_scaffold_2107_11

Organism: RTP_03222018_0_2um_Betaproteobacteria_48_16

partial RP 38 / 55 BSCG 40 / 51 MC: 2 ASCG 11 / 38 MC: 1
Location: 8806..12291

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1 n=1 Tax=Nitrosomonas europaea (strain ATCC 19718 / NBRC 14298) RepID=Q82TX2_NITEU similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 42.0
  • Coverage: 1125.0
  • Bit_score: 826
  • Evalue 2.80e-236
pilY1; type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1 similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 42.0
  • Coverage: 1125.0
  • Bit_score: 826
  • Evalue 7.80e-237
Tax=RIFOXYD1_FULL_Hydrogenophilales_62_11_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 40.0
  • Coverage: 1249.0
  • Bit_score: 851
  • Evalue 8.60e-244

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD1_FULL_Hydrogenophilales_62_11_curated → Hydrogenophilales → Betaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3486
ATGTTAAAAATATCTAAAAAAAATAGCTTGGCGTTAGCGGTTTCTTTTGCTTTTACGATCATGGCGGGTGGTGTGCATGCGGCGACTACGCCATTAAGTATTTCAGCAACACCGTTATACATTACTGTGAATGTGGCACCGAATATCGTGGTGACATTAGATGATTCAGGATCCATGGCACAAGCCTTTGCGCCTGACTCATTAAGCAGTTTGACATCAACGAAGCGGTTTAAAGCCGCTTCATTCAACCCTCTCTACTATAATCCTAGCGTTGTTTATAGTCCGCCTAAAAAATCTAATGGCACGAGTTATGCTAATTCAACTTATACGGCAGCGTGGATTAACGGCTTTGATTCCACTCGTGGTACGCGGAATTTATCAAACACCACTGTAACGACTAGTTACAACCCTTCTAGTACGTCGATTTCGGTAATAGGTTCGCCAGGTCCCGCCTATTATTATATTTATGATCCAGTGGCAATGAGTGCGACCTGCACGACGCCTTCCACCAACACCGACGGTTGTTATAAGCAGTATTTTGTAACGACTGCTGAGCAACAGAATTTTGCCAACTGGTATTCGTATTATCGCACGCGTAATCTGGCGGTGAGTAGTGGCGCCATGCTTGCTTTTGCAGGCTTGGACTCTAATGTACGCGTTGCTTGGCAGGGTTTGTTAACTTGTACTACTTTTGGTACGAGTTGTGTGGGTTGGAGTAGCGCTCAATCCACCGCCAGCAGAGATAATAGAATCCGCGTCTTTACCGGCGCGCAGAAAGATAATTTTTATACATGGGCGAGCCGTTTACCAACCTACTCTAGTACGCCACTGCGTACTGCGATGAAGCGAGCCGGGGATTATTATAAGACAACTGGGGTTGCTAGCCCTTATGCGAATGTTCCTCAAATCACAGATTTGCCAGAATATAGTTGCCGTAAAAACTACCATGTGATGATGACCGATGGTATCTGGAATGACAGTTTTACCTTGACAGCGCCTGCCAATGCAGACAATACAACGACAACACTTCCGGAAAAAGTGCTTGATGTTACTTCTTATTCAGCAAAACCGCCTTTTAAAGACACAAATAGCAGTAGTCTAGCTGATGTGGCATTTTATTATTGGGTAAATGATTTGGTGTCTGGGTTAGCTAATAATGTCGGGCAATATATCCCAGATAATACGGGTACTCCAACAGAACAGTTCTATAACGCCAAGAATGACCCTGCAACATGGCAACATATGGTGAATTTTACTGTTGGGTTAGGTCTTGAGGATACTTTGGTATCATCTGGTACTAATTCAGGCTGGTATGGTGATACTTATGCTTCCAATGAAACAAATACAGATGGTTATGCTGCGTTAGTGACAGGTAATAAAACATGGCCAGGAACGGGTTCAAATCTCAGCCCCGGCAATGTGTATGATTTATGGCATGCGGCGTTAAATAGCCGTGGACAGTTTTTTAGCGTTGATACGCCAGCGTCTATAGGCACCGCTTTCACAAGTATCGTGAATACTATTTTGGCAAGTACGCCTTCGGCGGCCTCTCTAGCAGCTAACTCGACTAAGCTGGATACGGGTAGTGCTATTTATCAAGCGAAATTTAATAGTACTGATTGGAGTGGTTTGCTACAGGCTTATCAAATTAACTCTGATGGGACGGTAGGGGCTTTACAATGGGAAGCTTCTAGTTTGTTACCCGCAGCGTCTAGCCGTAATTTATATACGATCAATAATGCAACAGGTAGCGGTTTGGCATTTACGACAACGAATTTTGCCAGTTTGTCCACGAGCCAGCAGGCTAATCTGAATACCACGCTGAGTGGAACAACTGACACTAAAGGATTGGATAGAGTCAATTGGTTGCGTGGTGATAAAACTAAAGAACAGAAAAATGGCGGCACATTCCGTAATAGAACCAATGTGCTAGGTGACATCATTAACTCTGATCCTGCTTTTATACAAAATACCGATTTTGGTTATACATCACTGCCTGCCTCTGCGCCAGAAGGTAGTACTTACGCTACATTTAATGCGCTCAACACTGCTCGTATCCCTATGCTTTATACCGGTGGTAACGATGGTATTTTACATGGGTTTCGTGCTGACTTAACGGATGCTAATTCCGGACATGAAATTTTTGGATTTATTCCTGGTGCTGTTTACCCAAATTTAAGCAAATTAACGGATCCTACTTATAGTCACGGATATTATGTTGACGGTGCGCCAACAGTAGGAGATGCTTATATAAACGGTGCCTGGAAAACCATCTTGCTGGGTACGTTAGGGGGAGGAGGCAAGAGTGTGTTTGCATTGGATGTGACTGATCCAAGCGCATTTAATGGTACAAAAGTGATAGGGGAATACACCGATACAGATTTGGGTTATACCTATTCAACTGCAAGAATAGCAAAGTTACGTGATGGTTCCTGGGCAGCTATTTTTGGTAATGGTTATAACAGCACTGCTGGCAAAGCATATTTATTCATTGTTAATTTATCTACAGGTGTTATTACAAAAATAGCAACTGATGCTACTGAAAGTAATGGTTTGTCTACGCCAACTTTACTGGATGTTGATAACGATAAAGTAACAGATTATGTTTATGCAGGTGATTTACAAGGTCGTGTTTGGAAATTTGACCTGACTTCAACTACACCATCAAGCTGGGGATTAAGTTACTCTGGTCAGCCATTGTTTACTGCACGTAATGCGGCTAATCAGCCACAACCGATTACGGGTGCTGTTAATGTGGGTCCTAATTCAGCCGCAGGTGCAGGTAACCTGGTGTATTTTGGTACTGGGCGTTATGTGGCTACAGGTGATCAAACTGTAACGGAGACCCAAACTTTTTATGGTATTTGGGATAATGGCGCGGCTGTTGCAACAACGAACAGAAGTGAGCTGCAAGAACAAACTATATTAGCTGAATCGGCTTTTGGGACTAACACTGTCCGTGCCACAAGCCAAAATTCGATTAACTGGAGTGTGCAAAAAGGGTGGTATATGGACTTGTTGCAGCCGCCATCAGCTACCCAGCAGGGTGAGCGCGTGGTTACACAGCCCTTGTTGCGAAATGGGACAGTTATTTTCACTACCTTGATACCTTCTACTGACCCTTGTGTACCCGGTGGTACGGGCTGGTTGATGGAGGTAAATGCTCAAACAGGCGCACGTTTGGATGAATCCGCACTTGATTTGAATGGAGATAAACTGTTTGATGCGGGTGACTACGTTACTATAACGATAGGGGGTGTGCCAACTAAAGTAGTGGTCACGGGTCTTAAATCTACAGTAGGTATTATTAAAACACCTGCAGTTGTGGATACCGGAACCGGGGTTGAATACAAATTTCTCTCAGGAACCAGTGGTGCAGTACAAAGTATCACAGAAAAAGGTGCGGTGCCTCCTCCTCCTCCAGTCCCGCCAGTAGTGGTTCCTACATCCACAGGTTCTAGAACATCTTGGAAGGAGTTACTCTGA
PROTEIN sequence
Length: 1162
MLKISKKNSLALAVSFAFTIMAGGVHAATTPLSISATPLYITVNVAPNIVVTLDDSGSMAQAFAPDSLSSLTSTKRFKAASFNPLYYNPSVVYSPPKKSNGTSYANSTYTAAWINGFDSTRGTRNLSNTTVTTSYNPSSTSISVIGSPGPAYYYIYDPVAMSATCTTPSTNTDGCYKQYFVTTAEQQNFANWYSYYRTRNLAVSSGAMLAFAGLDSNVRVAWQGLLTCTTFGTSCVGWSSAQSTASRDNRIRVFTGAQKDNFYTWASRLPTYSSTPLRTAMKRAGDYYKTTGVASPYANVPQITDLPEYSCRKNYHVMMTDGIWNDSFTLTAPANADNTTTTLPEKVLDVTSYSAKPPFKDTNSSSLADVAFYYWVNDLVSGLANNVGQYIPDNTGTPTEQFYNAKNDPATWQHMVNFTVGLGLEDTLVSSGTNSGWYGDTYASNETNTDGYAALVTGNKTWPGTGSNLSPGNVYDLWHAALNSRGQFFSVDTPASIGTAFTSIVNTILASTPSAASLAANSTKLDTGSAIYQAKFNSTDWSGLLQAYQINSDGTVGALQWEASSLLPAASSRNLYTINNATGSGLAFTTTNFASLSTSQQANLNTTLSGTTDTKGLDRVNWLRGDKTKEQKNGGTFRNRTNVLGDIINSDPAFIQNTDFGYTSLPASAPEGSTYATFNALNTARIPMLYTGGNDGILHGFRADLTDANSGHEIFGFIPGAVYPNLSKLTDPTYSHGYYVDGAPTVGDAYINGAWKTILLGTLGGGGKSVFALDVTDPSAFNGTKVIGEYTDTDLGYTYSTARIAKLRDGSWAAIFGNGYNSTAGKAYLFIVNLSTGVITKIATDATESNGLSTPTLLDVDNDKVTDYVYAGDLQGRVWKFDLTSTTPSSWGLSYSGQPLFTARNAANQPQPITGAVNVGPNSAAGAGNLVYFGTGRYVATGDQTVTETQTFYGIWDNGAAVATTNRSELQEQTILAESAFGTNTVRATSQNSINWSVQKGWYMDLLQPPSATQQGERVVTQPLLRNGTVIFTTLIPSTDPCVPGGTGWLMEVNAQTGARLDESALDLNGDKLFDAGDYVTITIGGVPTKVVVTGLKSTVGIIKTPAVVDTGTGVEYKFLSGTSGAVQSITEKGAVPPPPPVPPVVVPTSTGSRTSWKELL*