ggKbase home page

sw_8_scaffold_210_3

Organism: SW_8_UNK

megabin RP 51 / 55 MC: 46 BSCG 48 / 51 MC: 40 ASCG 38 / 38 MC: 38
Location: comp(1243..4485)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Fischerella sp. PCC 9339 RepID=UPI0003071332 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 21.5
  • Coverage: 522.0
  • Bit_score: 100
  • Evalue 1.30e-17
High-affnity carbon uptake protein Hat/HatR {ECO:0000313|EMBL:AHJ27340.1}; TaxID=313624 species="Bacteria; Cyanobacteria; Nostocales; Nostocaceae; Nodularia.;" source="Nodularia spumigena CCY9414.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 21.1
  • Coverage: 507.0
  • Bit_score: 92
  • Evalue 3.70e-15
WD40 repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 22.8
  • Coverage: 215.0
  • Bit_score: 71
  • Evalue 2.30e-09

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Nodularia spumigena → Nodularia → Nostocales → Cyanobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3243
ATGGATTCAGCGTTTGTCAAAACAGATGAAACAGCACTTGAAGTTGATAGCAATGTTAGTTTAGATGCGTATAGAAACGATTTCACAGATTTCTCTGGAACAGGAGTAAACATAACTAATACTAATACATCGATAAAAATACAAAACAATACTTTCGAGAAATACTCAGGAACAGGAGTATATAGTGAAAATAACGATGTAACAACAGTTCGTGAAAACACATTTAATAATTCTACATTTGGAACAGGAGTTGAAGTAATTGGTTCAAGTGTAGTAAGTGGTTCAAATAATGACAATGTTAATAATAATAGTTTTAATGATAAAATAAATTCAGGTGTAGTTATTCGAAATAGTGCATCACCACAGATTGATAACAATACAATATACGCTAACACATATGTATCAAGTGAAACAACGTATACTATAGATGGTTCGAATTGGCACAATATCAATCGTGCTAATGGAACTGACGCCGAGCAAGAGTCAATGATTACAGATAATATAAGTTCAAATACTAATGTAGATACATGGTGTATGGATAGTGATTGCGAGGTAACGTCGGAGCGACCAACAGGAGAACTTAACTTAACACTTAAATCAAACTTTTACGATGACACAAAATTAGTTACTGTAAAAATTGGTTCCGATGAAGCTCCTGATGGACAGATAGAATACGAAACAACTCCAAATGAAACAGTGCTAAGTGAAGACGTATGGACCGAAGATACCGATATAAAAGTTAATGTTAATAACAGCGGAACAACAATAACTTCTACCGCCAATATTACTGAAAATGATAAAACTGATAAGATTATCAATCTTGATTATAAATTTGATGCAGACACAACTCCAAACAGAATAGAATATAATGATACAGTGTATTACGAACCAACAGTAATAAATACACAAGATAAAGAACAAGAAGTGTATGTTAACTTCACAGAAGACGGAACAGTAATTAGTCAAAATAGAGTAGTAGTTCCAGCAGATTCTTCTGAAACAGTAACAATTGAATATTCACCACCATCTGATACATCAATAGATGAACATAACCTATCATACGTTGTTGACGATGGATTGATTGAAAAAGAATTTAATGTTGAATTCTATGAGAATACGTTGAAGCATAATGCTCACGAGGATTATGTTAAAGATGTTCATTATGATGCTGAAAATAATATGCTTTGGAGTGGTGATGACCTTGGTTACTTGGTTGGTTACGACATAAATAATAAATCGGTGGAATATAAAAATTACACAGGAAAAGTTAGAGCTATTAACTACGATGCGAATAATAATATTGTGTGGATAGCTGGCGGTGATGGATATAATGACAAAGTTAAGGGTTACAGTGTAGCTGATGAGGAGGTAATTTATCAACACAGCTTACATGATAGTAAGGTTAATGATGTTCATTATGATGCTAAAAATGATGTAATTTGGAGTGTAGCTGATGGAGCAGGAAGTTTCGGCACCAAAAAACATCTAATTGGATGGAGTGTTAGTAAACAATCTAAAGAATATGAATGTTCAGATTGTGCAAATAGACTGACGAGTGTAGATTACGATAGTGAAAATAACACTGTATGGGTTGGTGGAGGCGCAGGTTATAACATCGTAGGATATGATGTAGACACTGAAACAGTTGAACATCAAAAACAAGATAAAGGTAGTTATAGTAGAGATACAGTGAAAAATGTTGAATACGATAGTGATAATCATCTTGTATGGAATAGTTACGGTGAAAATGTCTCTGCGTATGACATAGAGAATGACGAAATAATAAATGAACATGCTAAAGCTTATTCTGATGTAGAGGCATTTGACTACAACGCTCAAAACGAAGTTGTTTGGACTGATATTGGAACAGGAGTCGTTGCATGGGATATCAATATTAAAGAAAATATTTATGAGAACTCAACTTCACCTCATTCTGTTAACACGGTTGAGTATGATAATCAAAACAATATTCTTTGGAGGAGTGGTGCTGATGACACTGTTGTTGGTGAAAGAGTGAAATTTGAATCAAGTTCATTCACGTTACAAGCCGATAGAAATCCAAAGAAATTGGATTATAATGAAACAGTTGAATACAAACCAACAGTTACGAATGAAGAAAGTTCAGAACAGAAAATAAACATTAGACTTGAAGAAGACGGCACATTATATAATGAAAAAACCGTGGTAGTTCCAGCAGATTCCTCTGAAACAGTAACATTTGAATACACAGCACCGAAAGATGATTCAGTGCAAGATTATCAGCTTACATATAGAGTCAATAATGATGTTACAGAAGACTTTACCGTTACTTTTAATGGTAGTCGAGGTCACAGTAAACATTCTGAATATTCAACATTTTCATCTCCTGTTTATGCAATAGATATTGACTCTCAAAGCAACATTGTTTGGAGTGGAGACTCAAGAGGTGGCGTAATCGGTTGGAATGAAGTTAACCAAGAAGTTGATTATAATTATGAAGTTGAAGGTGTAAACGATATTGATTATGATAGTGAAAATGATATTGTATGGGCTACAGATTTCGGTGAAAATGTAACTGGTTGGAATGTAACCGATGAAGAAATTGCATATAAACACAAAGAAAACGGTAAATATGGTGCGTATGCTGTCAAATATGATGGTAATAATGACATTGTTTGGAGTGCAGGATACAACGGAACTATCATTGGATGGGATGTAACCAATGAAGAAGTAGTATACGAAATTTCACCACATTCCTCTGAAAAAGCCATTCGTAGTATTGATTATGATAGTGAGAATGATATTGTATGGAGCGCAGGACACAATGGTGACGTTATTGGTTGGAGTGTGTCTGATGAGAAAATAATATATAAATATACTGAACACAGTGACAGCGTAATAGATGTTGATTATGATAGTGAGAATGATATTGTATGGAGCGGAGCAAAAGATGGTAACGTTGTTGGTTGGAATACTACAACTGAACAAGTTCAATATGAAAGACAAAGTTATCATGAGGTTCGTGCAGTTAAATATAATAAACAAGAAAATGTTGTGCTTATTGGAGAAACAAATGGAAGAGTAAGTGTTTGGGACTTCAACAATGGAAAACTTGACTATGACCACTATCGACATAGAAATAAAGTTAATGCTGTTGGTTACAGTCAGCAAAAGAATGTTGTGTGGAGTGGAGGAACTGACAATGGCGAAGAAAAACATGTTATTGGTAAATATTACAAAAATACATCTTCTGATTCCAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1081
MDSAFVKTDETALEVDSNVSLDAYRNDFTDFSGTGVNITNTNTSIKIQNNTFEKYSGTGVYSENNDVTTVRENTFNNSTFGTGVEVIGSSVVSGSNNDNVNNNSFNDKINSGVVIRNSASPQIDNNTIYANTYVSSETTYTIDGSNWHNINRANGTDAEQESMITDNISSNTNVDTWCMDSDCEVTSERPTGELNLTLKSNFYDDTKLVTVKIGSDEAPDGQIEYETTPNETVLSEDVWTEDTDIKVNVNNSGTTITSTANITENDKTDKIINLDYKFDADTTPNRIEYNDTVYYEPTVINTQDKEQEVYVNFTEDGTVISQNRVVVPADSSETVTIEYSPPSDTSIDEHNLSYVVDDGLIEKEFNVEFYENTLKHNAHEDYVKDVHYDAENNMLWSGDDLGYLVGYDINNKSVEYKNYTGKVRAINYDANNNIVWIAGGDGYNDKVKGYSVADEEVIYQHSLHDSKVNDVHYDAKNDVIWSVADGAGSFGTKKHLIGWSVSKQSKEYECSDCANRLTSVDYDSENNTVWVGGGAGYNIVGYDVDTETVEHQKQDKGSYSRDTVKNVEYDSDNHLVWNSYGENVSAYDIENDEIINEHAKAYSDVEAFDYNAQNEVVWTDIGTGVVAWDINIKENIYENSTSPHSVNTVEYDNQNNILWRSGADDTVVGERVKFESSSFTLQADRNPKKLDYNETVEYKPTVTNEESSEQKINIRLEEDGTLYNEKTVVVPADSSETVTFEYTAPKDDSVQDYQLTYRVNNDVTEDFTVTFNGSRGHSKHSEYSTFSSPVYAIDIDSQSNIVWSGDSRGGVIGWNEVNQEVDYNYEVEGVNDIDYDSENDIVWATDFGENVTGWNVTDEEIAYKHKENGKYGAYAVKYDGNNDIVWSAGYNGTIIGWDVTNEEVVYEISPHSSEKAIRSIDYDSENDIVWSAGHNGDVIGWSVSDEKIIYKYTEHSDSVIDVDYDSENDIVWSGAKDGNVVGWNTTTEQVQYERQSYHEVRAVKYNKQENVVLIGETNGRVSVWDFNNGKLDYDHYRHRNKVNAVGYSQQKNVVWSGGTDNGEEKHVIGKYYKNTSSDSN*