ggKbase home page

sw_8_scaffold_1279_2

Organism: SW_8_unknown_27_15

partial RP 0 / 55 BSCG 0 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(413..2917)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Predicted protein n=1 Tax=Naegleria gruberi RepID=D2VED4_NAEGR similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 38.7
  • Coverage: 718.0
  • Bit_score: 605
  • Evalue 7.20e-170
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 39.8
  • Coverage: 714.0
  • Bit_score: 630
  • Evalue 6.60e-178
Predicted protein {ECO:0000313|EMBL:EFC37665.1}; TaxID=5762 species="Eukaryota; Heterolobosea; Schizopyrenida; Vahlkampfiidae; Naegleria.;" source="Naegleria gruberi (Amoeba).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 39.8
  • Coverage: 714.0
  • Bit_score: 630
  • Evalue 2.90e-177

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Naegleria gruberi → Naegleria → Schizopyrenida → Heterolobosea → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 2505
ATGAGTGTAACGAATATTTTAAGGAAAACAATTATTACATTTTTCTGCGTTTTTACCTTTATTACGCTGGTAGTGTTTCTAGAAGGATATTGTAATAGTGATAACTACCCAGAAAAGATCTATGAATACCTTAATAAAAAAATTGATCAAAGAACGAATGTAAATAATACATTAGAAGAATTAAAAATAATAGCAGACTCTTACAAAACTCAAATAGAACAAGGGAATTACGAAAACAGACAAGCACTTGAGGAAACTGAAAACAAAATCACTTATTTGAAAAATATTCAAACAAGACTAGAGGCAGATATTGATGCACTAAAAACAAAACAGGAAAAAGTATTTCAGAAAAAAAATATAACAGTTTGTAATGGAATTGCTTCATTTGAGGATACAGTGTGCTCAGGGCATGGTAATTGCGAAGGTAAAGATAAATGTATTTGTGACAGTGGTTGGACTGGAGATCAATGCGATATACCAACGTGTTCATCGATATCTTCAACAAACACAACTGTTTGCTCTGGAAACGGTCGTTGTATAGGAGTGGATCAATGTGAATGCAAGAAAGGATGGACAGGGGGAAATTGTCATTTACCAACTTGTTTTGGAATTTCAAGTAATGAAAAGGATCGGGTTTGCTCAGGACATGGAAAATGTAACAAAGTGGATAAATGTGATTGTGAATCCGAATGGAAAGGAAAAGTATGTGATATTCCAATGTGCCATGGACTTGATGCATTTAATGAAACTGTGTGTTCAGGAAATGGTGAGTGTAAACAACCTGATCGTTGTTCTTGTCAAAGTGGATGGACTGGAAATGAATGTCAAAAGCCAATTTGTTGGGGAATTGAAGATGGAAGTGGAAATGAATGTTCGGGTCATGGTTCATGTATTGCTCCATATTCTTGTGATTGTCATAGTGGATGGGGAGGTTTAAATTGTGATATACCTATATGTAATGGAAAATTGTCAAATGATAGAGGTGTATGTTCAGGACATGGTAATTGTGAAAGTCCAAATAATTGTCAATGTTACTATGGATGGACTGGTGATAATTGTGATACACCACTTTGTTTTGGAATTAAAGCAACACAGAGTAGTGTTTGTTCAGGAAATGGAACTTGTGATAGTGTGGATAAATGTAGTTGTGAAGATGGATGGACTGGAGAAGAATGTAATGTTCCAATGTGTTTCAATCGAGCAGCCAATGATTATAGAGTGTGTTCAAGAAAAGGAAAATGTGTAGCACCAAATCAATGTGAATGTGATAATAATAATAAAGGAGATGATTGTAGTAATTGTGAAAGTGGATGGACAGGAAAAGATTGTCAAACACCAATTTGTTTCAGTAAACCAGCAAGTGATAGTAATTCTTGTTCAGGAAATGGTAAATGTATCAATCCAGGAAATTGTAAATGTGAAACAGGATGGACTGGAAATCAGTGCCAAGAGCCATTATGTGATGGAAAAACTAATAGTGATGGTAATGTTTGTTCAGGTCATGGAACTTGTGAAGATCCTGATTATTGCAAATGTGATACAAATTGGACAGGAGAGAAATGTAATATTCCAAAATGCTCCAATATTCCAGCAACACAAAGTGGTGTATGCTCTGGCCACGGAAGTTGTGATGATGTTGATACTTGTAATTGTCATAGTGATTGGACAGGTAATAATTGCGAAGTACCAATTTGCTTTGGTGAATCAACATTCAGCGGTAACCCATGTTCAGGGAATGGAGATTGTAAAAGACCTCATCAATGTAGTTGTAATACAGGATGGTCAGGAGAAAGTTGTGAAAAACCATTATGTTATGGAATTGAAGATAGTAATCAAAATGTTTGCTCAGGTCGTGGAAAATGCATATCAGTTGATACCTGTGAATGTGATGATGGCTATGGAGGTGACATGTGTGAAATACCAAAATGCTTTGGTGTAAGAGCAGATAGTGATGAAGTGTGTTCAGGACATGGAATCTGCTATGATGTGGATGTTTGTAAATGTGATTATGGTCACGATGAAAACAATTGTAGTGAAGTATTGTGTTATGGTAAGAGGGAAAGCGATTTAAGTGTATGTTCAGGACATGGTACATGTGTTGGTGTAGATCAATGTGATTGTAATAGTGGATGGAAAGAGCCTACATGTGACAGATCAGAGTTTTCATGTAATGGAATACCAGCCAGCGATCCAAGTGTCTGTAATCAGAAAGGAAGTTGTGTCGCAAGTGAAACCTGTGAATGTCAGACAGGGTATGGAGGACAATATTGTGGAGAATATGCTTGTAATGGGACTAAATCAAGTGACGGTGATTCATGTAATGGAAATGGCGTTTGCACTGGTGAAGATACATGCACATGTTATTTAGGATATAGTGGAACATATTGTGAAAATGACATGATACCCGATAGATCTGTCACGCTTGACATTGGAGGTATTAGTAATATTTGGAAAGTCATAACTAAGTCATCAGATGACATAATTAATGAATTCGGTAAGTATTAA
PROTEIN sequence
Length: 835
MSVTNILRKTIITFFCVFTFITLVVFLEGYCNSDNYPEKIYEYLNKKIDQRTNVNNTLEELKIIADSYKTQIEQGNYENRQALEETENKITYLKNIQTRLEADIDALKTKQEKVFQKKNITVCNGIASFEDTVCSGHGNCEGKDKCICDSGWTGDQCDIPTCSSISSTNTTVCSGNGRCIGVDQCECKKGWTGGNCHLPTCFGISSNEKDRVCSGHGKCNKVDKCDCESEWKGKVCDIPMCHGLDAFNETVCSGNGECKQPDRCSCQSGWTGNECQKPICWGIEDGSGNECSGHGSCIAPYSCDCHSGWGGLNCDIPICNGKLSNDRGVCSGHGNCESPNNCQCYYGWTGDNCDTPLCFGIKATQSSVCSGNGTCDSVDKCSCEDGWTGEECNVPMCFNRAANDYRVCSRKGKCVAPNQCECDNNNKGDDCSNCESGWTGKDCQTPICFSKPASDSNSCSGNGKCINPGNCKCETGWTGNQCQEPLCDGKTNSDGNVCSGHGTCEDPDYCKCDTNWTGEKCNIPKCSNIPATQSGVCSGHGSCDDVDTCNCHSDWTGNNCEVPICFGESTFSGNPCSGNGDCKRPHQCSCNTGWSGESCEKPLCYGIEDSNQNVCSGRGKCISVDTCECDDGYGGDMCEIPKCFGVRADSDEVCSGHGICYDVDVCKCDYGHDENNCSEVLCYGKRESDLSVCSGHGTCVGVDQCDCNSGWKEPTCDRSEFSCNGIPASDPSVCNQKGSCVASETCECQTGYGGQYCGEYACNGTKSSDGDSCNGNGVCTGEDTCTCYLGYSGTYCENDMIPDRSVTLDIGGISNIWKVITKSSDDIINEFGKY*