ggKbase home page

rifoxyc1_full_scaffold_2162_11

Organism: RIFOXYC1_FULL_Pacearchaeota_33_130

partial RP 34 / 55 MC: 2 BSCG 20 / 51 MC: 1 ASCG 28 / 38 MC: 2
Location: comp(11103..13742)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Parallel beta-helix repeat-containing protein {ECO:0000313|EMBL:KHO54981.1}; TaxID=1579377 species="Archaea.;" source="archaeon GW2011_AR19.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 38.4
  • Coverage: 617.0
  • Bit_score: 383
  • Evalue 1.10e-102
psp3; putative alkaline protease id=5044478 bin=GW2011_AR5 species=GW2011_AR5 genus=GW2011_AR5 taxon_order=GW2011_AR5 taxon_class=GW2011_AR5 phylum=Archaeon tax=GW2011_AR5 organism_group=Archaea organism_desc=gwa2_.48_18 Replace with curated version! similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 25.5
  • Coverage: 674.0
  • Bit_score: 176
  • Evalue 1.50e-40
KP-43 peptidase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.0
  • Coverage: 731.0
  • Bit_score: 169
  • Evalue 5.10e-39

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

archaeon GW2011_AR19 → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 2640
GTGGGGTGGTGGAGATTTGAACAGAGTAATTCAAGTGGAACTTTGGCTGTGGATGAAATGGGAAAGAAGAATGGGAGTGTGAATGGCAGAGCGCCTTGGACACAAGCTGGAAAGTTTGGAAAAACTTATGAATTTAATGGGGTAAACCAATCAATTACTATAGGAACTACGCCTTCGCCAAATAATATATCTTGGACAATTAGTGCTTGGACAAAATCTAATTCTGGTGGTGCTTCAAATCAAGAAGTAATTGGAAAAGGTTCTAGTTCTCCGGGGGGCAGTGGGTTTCATTTATATTATGCTAGCAGTAAGTTTTATCTTTATTATTATAAAGTTGGAACTGCTGGAATTCAGCAAACTATTTTTGGTAATGCATCTTTACCCAATAATTGGTATCATGTGAGTATTGTTTATAATGGGAGTGATATTATTAAATATCTTAATGGGTCACAAGATAGTTCTGTAAACATTGGAACATTTAATCCCAATAATAATTATATTTTATATATTGGCACTGGTCTTGGCTATTTCAACGGCACAATCGATGATGTAATCATCTTCAACAGAAGTTTAAGTGCTGGAGAAATTTCATCATTATACAATGCCTCGGCAACAAAATATTATAATAATTTTAGTGGGCAACTTACAGATGGAACTCACACATTTACTGGTTATGTTGTGGATAAGGGGGGAAATTTGAATGTGACTGATACAAGGACAATTACTATTGATAATAGTTATCCGCAAATATCAATTACTTCGCCTTTGAATAATACTAATTGGAGTGATATTAATCTTGATGTAAATTATACTTACACTGAATTAAATGTTGGAAGTTGTTGGTATACTAATAATTCTGGAGCGGTTAATAATACTTTGACTTGTGGAAATAATATTACTGGGGTTTCATGGTTAGAGGGAATAAATAATGTTACAATTTATATGAATGATAGCGCTGGAAATACAAATAGTTCATCTGTGATGTTTTATGTTGATACAATAAATCCTGATATTTCAATAATAACTCCTATTAATAATACAAATTCAAGTAATAATAATTTAGATATTAATTATACTACTTCAGATATTGGATTGGGAATTTCATCTTGTTGGTATAGTAATGATAGTATGAGTATTAATAATACAATTATTTGTGGTGAGAATATAACTTCTATGATTTGGGCAGATGGGGGGCATAATGTTACAATTTATGTTAACGATTCTGTCAATAATTTGAATTGGAGTTCTGTTACTTTCTTAGTTGATACAACTTCTCCTTCAATGAACATAACAGAACCTCAGAATACAAGTTATGCTGTGAATGTTTCTTGGATTAATTATACTTATACTGAATTGAATTTGGGTTCATGTTGGTATTCAACTGATACAGGTGCGACTAATTCAAGTGCTGTTGTTATGGGGACTAATTTCACAGATGTAATTAGCGTTGAGGGAAGTAATAATTGGATTGTTTATTATAATGATTCTGTTGGAAATCAAAATTCAACAAATGTGACTTTCTATAAGGATAGTTTAATTCCTGTTGTTTCATTAATAACTCCTGCGGATGCATATTCATCAACAACTGCAACAATTTCATTTACTTATAATGTGACTGATGCTTCGAGTGCTAATTGTTCTTTGATAATTAATGGAGTTGTGTGGAATTTTAATAGTTCAGTAGATATATTCGGTAATACTAATCAATTTGACAATACCACTGCAGTCGGAAGTTATACTTGGAGTGTTAATTGTTCTGATGAATTGAATAATGTTGGAAATTCGAGTGTGAGAAATTTCACAATTACTTCTGTACCGCCTGTTTCTCCTACTGGAGGAGGTGGTGGAAGTGTAGGAGGAAGCGAAACCATCGCTGTTGTAGAAGAAAATCCTTTTGTTGTTCAAGATAGTTATGAAACTACAATTTCATTAAATCACATCGAAGACGATAAAATCTCAATTGAGAACACAGGTTTAACTCCGCGTGTTGTGAATGTCCAAGTTTTAACTATTCAAGATATTTTAATCTTAGATGAATCTCAGTTGACTATCGATGCTGAGAGTAGCAAGGATTTAACTTTTAGATTAACTCCTCCTAAAGAGCCAGGAATATATGTAGGTAAGATTATTATTTCTTCAGAAAGTTTCCAAGAAACTGTTTTGGTTTCAATTAATGTTAAGACTGAGAAGAGTTTGTTTGATATAATTATGTCCGTTATTAACGAAGATAAGCGTGTAAGAAATGGTGAGAATTTGTCGGTGCAGATTGATTTATTGCAAATGGGTATTCGTGAAAAGATGGATGTAACTTTAGAATATGTGCTTAAAGATTTTGATGGTAAAAATTATTTTACTGAATCAGAAACAATTGCGGTTGATACTCAGAAAACTTTGATGAAGGATTTTTCCGTCGATGAAATTCCAAATGGAGATTATGTTTTAGGTGTTCAATTAGTTTATCCCGACGGAGTTGCTGTTGCAAGCTCGCAGATAAAGATTGGGGAAGATGTTGAAATCGGAGAAAATAATGTGATGATTACTTCTTTGATTTTGGCTTTGGTAATTCTTGCTGGTGGAATTTCTTTCATGACAGTGAGGCACAGAAGAATGATTAAGAAAATCAAAAGTAAGAAGATTTAA
PROTEIN sequence
Length: 880
VGWWRFEQSNSSGTLAVDEMGKKNGSVNGRAPWTQAGKFGKTYEFNGVNQSITIGTTPSPNNISWTISAWTKSNSGGASNQEVIGKGSSSPGGSGFHLYYASSKFYLYYYKVGTAGIQQTIFGNASLPNNWYHVSIVYNGSDIIKYLNGSQDSSVNIGTFNPNNNYILYIGTGLGYFNGTIDDVIIFNRSLSAGEISSLYNASATKYYNNFSGQLTDGTHTFTGYVVDKGGNLNVTDTRTITIDNSYPQISITSPLNNTNWSDINLDVNYTYTELNVGSCWYTNNSGAVNNTLTCGNNITGVSWLEGINNVTIYMNDSAGNTNSSSVMFYVDTINPDISIITPINNTNSSNNNLDINYTTSDIGLGISSCWYSNDSMSINNTIICGENITSMIWADGGHNVTIYVNDSVNNLNWSSVTFLVDTTSPSMNITEPQNTSYAVNVSWINYTYTELNLGSCWYSTDTGATNSSAVVMGTNFTDVISVEGSNNWIVYYNDSVGNQNSTNVTFYKDSLIPVVSLITPADAYSSTTATISFTYNVTDASSANCSLIINGVVWNFNSSVDIFGNTNQFDNTTAVGSYTWSVNCSDELNNVGNSSVRNFTITSVPPVSPTGGGGGSVGGSETIAVVEENPFVVQDSYETTISLNHIEDDKISIENTGLTPRVVNVQVLTIQDILILDESQLTIDAESSKDLTFRLTPPKEPGIYVGKIIISSESFQETVLVSINVKTEKSLFDIIMSVINEDKRVRNGENLSVQIDLLQMGIREKMDVTLEYVLKDFDGKNYFTESETIAVDTQKTLMKDFSVDEIPNGDYVLGVQLVYPDGVAVASSQIKIGEDVEIGENNVMITSLILALVILAGGISFMTVRHRRMIKKIKSKKI*