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RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_rifcsplowo2_12_scaffold_98879_2

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_31_6

near complete RP 44 / 55 MC: 3 BSCG 43 / 51 MC: 5 ASCG 9 / 38 MC: 3
Location: 814..2610

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PAS domain S-box n=1 Tax=Flexibacter litoralis (strain ATCC 23117 / DSM 6794 / NBRC 15988 / NCIMB 1366 / Sio-4) RepID=I4ANS7_FLELS similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 32.6
  • Coverage: 390.0
  • Bit_score: 213
  • Evalue 4.40e-52
PAS domain-containing protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 598.0
  • Bit_score: 1183
  • Evalue 0.0
PAS domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.6
  • Coverage: 390.0
  • Bit_score: 213
  • Evalue 1.20e-52

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1797
ATGAAACCAGATATATTTCAATTAGATTTTAGCAGAATAACTGTTTTGTTATTTACACTTATTCCGGTAATTATTAATTTTGGAATTTTTATTTATATTTCTCTATACCTCACTAGAACAAGAGTTACCGGTTATTTCTCTCTGTTTGTTTTTATGCTGGGATGTTGGCAATTAGCGGATGGATCTATTAGAATGAGCATTACATTAGACGCTGTTGAAATGTGGTATCGAATATCAATTATTTTCGCATTATTTTCTATGTTATTTGGAGTATTATTTGCAATATATTATACTAAGTTGGACAAAAAGATATCAAGGAATGTTATATTTTCTTTTTTTGTTTTTCCTACGTTTATTTTTTTTCTTTGTATTCTTGCCCATTTGGATAAATACTCAATCGTAGTTTCTGAAAAATGGTATTGGATAGTCAATCCGAAACCAACGATTATCACAACTGCTCTTTTATTTTGGCTTAGTGCAGGAGGTTTAATCATGCTTTTTTTATTTAGTCGGAACTATTTTAAAATGGAAAAATCTTCTTTTGAACAAAGACAATCTTTCTTATTGGTACTTGGTTCCTCTTTTCCTATTCTTATTGGAATAGTTGTTGAAGTGGTACTTCCCTTAATTTTTGATATTGATGGAATTCCTATTACGACAAGTTTAACGACCTCCATTTCTATTATGTCCCTAATAGCTATAAAAAAGTATGGCTTATTGGATTTTTCCCCAAAACATCAATGGGATGATATTGTCAAAACAATGAATGAAGGGATATTAATTGTGGATCTTGACGAAAAAATAAAATATGCAAATGATGCATTTTGCAATTTAGTGGGATATGATTTTTCTGAGATGAAAGAAAAAAATGCTACTGAATTGTTTGTAAAAGATAATGATGGACGTACAAGGATGAAGCCTATTGTTGAAGCACGAAAAAATAATATTTCCAATCATTACGAGATCTGCCTCACAACAAAAAGCGGAGAAAAAAAGTGGCTGCTGGTAGGAGGCTCCCCATATTATGATAAAGAGGGAAAAATAATAGGGTCGATTGGTATTCATTCAGATATTACGAAAAGGAAAGAGATGGAAGAAAATCTTATTGCCAGCAATAATGAACTTGAAATATTTATTTATAAGGCTTCCCATGATTTAAGAGGTCCGCTTGCTTCTATTATGGGATTGGTGAATGTGAGCAATTATGAAATTAAGGATGAATTGTCCAGACGTTATATGGATATGATCGGATCCTCTACTCAAAAATTAGATCATACTTTATTGGAATTGGTGAAAACAATGAAAATAAAAGACACAGAACGCTTTGATGATCAGATTGATTTTAAAAATTTAATAGAAACGAAGTTAAGCGAGTTTGAGTTTTTTAAAGACTTTGAAAAGCTTAAGATCGACATCAATATTTATGCCAGTGATAAATTTTATTCAAATAAATTTTTAATTGAGACCATTCTTCATAATTTAATTGAAAATGCTATCAAATATCAAAGTGGCACTGAACCTCAGTCTTATTTAAAAATTGATGTGGCCGATCAACCAAATGGAATTCAAATTATTATTGAAGATAATGGAATAGGTATAAAATCTTCAGTGCAAGGACTAATATTTGATATGTACTATAAGGCGGTTGAAACATCTAGAGGCTCAGGGTTAGGGTTGTATTTGGTAAAAAAATGTGTTGAGAAACTAGATGCTGAAATAGACTTGAAAAGTTTCATTGGAAAAGGATCAACGTTTACCATTTCATTAAAAAACGGGGATAAAAGGCATCAGAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 599
MKPDIFQLDFSRITVLLFTLIPVIINFGIFIYISLYLTRTRVTGYFSLFVFMLGCWQLADGSIRMSITLDAVEMWYRISIIFALFSMLFGVLFAIYYTKLDKKISRNVIFSFFVFPTFIFFLCILAHLDKYSIVVSEKWYWIVNPKPTIITTALLFWLSAGGLIMLFLFSRNYFKMEKSSFEQRQSFLLVLGSSFPILIGIVVEVVLPLIFDIDGIPITTSLTTSISIMSLIAIKKYGLLDFSPKHQWDDIVKTMNEGILIVDLDEKIKYANDAFCNLVGYDFSEMKEKNATELFVKDNDGRTRMKPIVEARKNNISNHYEICLTTKSGEKKWLLVGGSPYYDKEGKIIGSIGIHSDITKRKEMEENLIASNNELEIFIYKASHDLRGPLASIMGLVNVSNYEIKDELSRRYMDMIGSSTQKLDHTLLELVKTMKIKDTERFDDQIDFKNLIETKLSEFEFFKDFEKLKIDINIYASDKFYSNKFLIETILHNLIENAIKYQSGTEPQSYLKIDVADQPNGIQIIIEDNGIGIKSSVQGLIFDMYYKAVETSRGSGLGLYLVKKCVEKLDAEIDLKSFIGKGSTFTISLKNGDKRHQN*