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RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_rifcsplowo2_12_scaffold_30257_9

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_31_6

near complete RP 44 / 55 MC: 3 BSCG 43 / 51 MC: 5 ASCG 9 / 38 MC: 3
Location: 4979..7090

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Diguanylate cyclase/phosphodiesterase (GGDEF & EAL domains) with PAS/PAC sensor(S) n=1 Tax=Winogradskyella psychrotolerans RS-3 RepID=S7VLG1_9FLAO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 26.9
  • Coverage: 717.0
  • Bit_score: 249
  • Evalue 1.10e-62
sensory box protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 703.0
  • Bit_score: 1429
  • Evalue 0.0
sensory box protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.4
  • Coverage: 459.0
  • Bit_score: 198
  • Evalue 6.30e-48

Lists

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Notes

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Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2112
ATGATAAATTCATCATCATTGAACAATCAAAAGTTACATATAAATTTACCTGAAAAAATAATTCAGTTATTAGACTTTTTTAATGCATCGTCCGATGTGGTAGTGATTTGCGATGTTAATTTATGCATTCATTATGTTAATCCAACTTATACTAAATTAACGGGTTATAAAGCCAATGAAGTTTTGGGTAAAAACTATATGGATTGGAATAATGATGCAGCTACTAAAATTTTGAATAAAAAAAATTGGACTAAAATTATAAATGGCAAAACGATAACTATTACTTGTAACAATACAAGAAAAAATGGTAAAGAGTATTTTTTAGAAAAAAGCATTATTCCTGTTCATTCCAAAAAAAATACTGGAACGGTTACTCATCTTATTTTTTCTGGAAGAGATACTACTGAGCAATTAAAAACAATTAACAGCATAATACAAAGTAAAAAAAACATAGTAGAAGCTAATAAAATTGCCAAGTTAGGGTTTTACAATTTCAATATTAAAAATGATTGTTGGACCAGTTCTAACGAGTTGAACAATATTTTTGGGGTAACAGATAACTTTCCTAAAGATTTTAATTCTTGGTCGAGTTTAATTCATCCTGATTACAAAGATTTTATGGTAAAGTACTTTACTGAAGAAGTATTAACCAAAAAAAAGAAATTTGATATCGTTTATAAAATTATTGATTTTAAGACTGGACAAGAAAAATGGGTGCATGGATTGGGAAACCTGAAATTAGATGAAAAACAACAGCCCATCGAAATGCTTGGTACGATACAAGATATTACCGAATCAAAAGAATTAAACCAAAAATTATTATTTAGTGAAAACGCACTAAAAGAAGCCCAAAAAATTGCAAAAATTGGTTCATGGGTACTCGATTTGGTTAATCATACACTTATATGGTCTGACGAAATATACCAGATATTTGATACGACACCACAATCGTTTGGCAATTCGTATGAAAAGTTTCTAACCTATGTTCATCCCGAAGATAGAGAATTGATAAATGAAGTCTTTACTAATTCTATTAAAAATAAAATTCCTTATGGACCAATTGTTTATAGGCTAATAATGGCTGATGGCGAAATAAAATATGCCGAAGCTTATGGTGAAACCGAATACGATTGGAATGGTAATCCTATCCGTTCGAATGGTGTAATACAAGATATTACCAAACGAAAACAAGTAGAAAAAGAATTGATGGCAAGTGAAGATAAATTTCGTTCCATTTTCCATTCACTAACCGCAGGAATGATAATTGTGATAGATGAGAATGGGTTTATTTTAGAGTGGAACGAAGGTGCTGAATTAAACTTTGGTTACGATAGGCATGAAATGCTTAATAAGCCATTAACCATGTTAATGCCAAAACGCTATAGAGAAGGACATGAAAAAGGATTGGCTTTAGCTGTAAAAAATAGAATATTGGCTCATAAAGGAGAAACTTTTGAGCTGTTTGGATTACATAAAAATGGTAAAGAATTTCCAATAGAATTATCGTTGGGTAGTTGGGAACGAGAGGGTAAATTATTTTTTAGTGCCATTATTATTGATGTTACCGAACGAAAATTGTCAGAAAAACATTTACTTCAAGCAAATTCAATTTTAGAAGATATTGATTCGATTGTATTGTTAACCAATAATAAAGGAGAAGTAGTATATACAACTTCTTGCACAACAAAATTAATAGGTTTTGAACCTAACGAAATTTTGGGCAATAAATGGTGGGAAGCTACCTTTGTTGATAAACAAGAAAGCGACCGAATAAAAAATGAATTGATTAGTTATTTAAAAAATAACGAAACGATTAGAACAACCAATCACCCACGCTTATTAAAATGTAAAGACGGTAGCTTAAAATGGTTTGAATGGCACAACTCAAAAGGAGTTGATAATTGTATTATTAGTGTTGGTTATGATATTACCAACAGAATAATAGCCGAACAGGAAATTAACAAGCTTTCGAAAGCTATAGACCAAAGTCCTGTTACAGTTGTTATTACCGATTTATATGGAAATATTGAATACGTAAACCCCAATTTTGAAAAAACTACAGGATATACGCTAAAAGAAGTAAAGGGTGAAAATTCTAAAATATTAAAATAG
PROTEIN sequence
Length: 704
MINSSSLNNQKLHINLPEKIIQLLDFFNASSDVVVICDVNLCIHYVNPTYTKLTGYKANEVLGKNYMDWNNDAATKILNKKNWTKIINGKTITITCNNTRKNGKEYFLEKSIIPVHSKKNTGTVTHLIFSGRDTTEQLKTINSIIQSKKNIVEANKIAKLGFYNFNIKNDCWTSSNELNNIFGVTDNFPKDFNSWSSLIHPDYKDFMVKYFTEEVLTKKKKFDIVYKIIDFKTGQEKWVHGLGNLKLDEKQQPIEMLGTIQDITESKELNQKLLFSENALKEAQKIAKIGSWVLDLVNHTLIWSDEIYQIFDTTPQSFGNSYEKFLTYVHPEDRELINEVFTNSIKNKIPYGPIVYRLIMADGEIKYAEAYGETEYDWNGNPIRSNGVIQDITKRKQVEKELMASEDKFRSIFHSLTAGMIIVIDENGFILEWNEGAELNFGYDRHEMLNKPLTMLMPKRYREGHEKGLALAVKNRILAHKGETFELFGLHKNGKEFPIELSLGSWEREGKLFFSAIIIDVTERKLSEKHLLQANSILEDIDSIVLLTNNKGEVVYTTSCTTKLIGFEPNEILGNKWWEATFVDKQESDRIKNELISYLKNNETIRTTNHPRLLKCKDGSLKWFEWHNSKGVDNCIISVGYDITNRIIAEQEINKLSKAIDQSPVTVVITDLYGNIEYVNPNFEKTTGYTLKEVKGENSKILK*