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RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_rifcsplowo2_12_scaffold_29578_4

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_31_6

near complete RP 44 / 55 MC: 3 BSCG 43 / 51 MC: 5 ASCG 9 / 38 MC: 3
Location: 1786..6072

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA polymerase III, alpha subunit n=1 Tax=Algoriphagus machipongonensis RepID=A3I2C1_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 62.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1824
  • Evalue 0.0
DNA-directed DNA polymerase III PolC Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2856
  • Evalue 0.0
DNA-directed DNA polymerase III PolC similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 61.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1789
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4287
ATGTTTCTACTATTTGATACCGAAACCACAGGGCTACCAAAAAATTTTAAAGCACCTGTTTCTGATTCCGATAATTGGCCCCGAATGGTTCAATTGGCATGGCAATTACACGATAATTTTGGTAAATTGTTATCCGCAAAAAACTACGTTGTTAAGCCCGATGGATATGAAATACCATTGGGTGTTTCAAAAATTCATGGTATTACTACCGAACGAGCATTAAGAGATGGAATTGACTTAAAAATTATTCTAGAAGAATTTAATGCCGATTTAGAAAACACACTTTATAATGTTGGTCATAACATTGAGTTCGACATTAATGTAGTTGGTGCAGAATTTTATCGTTTGGGCATCGCAAATAAGTTAACTGCCAAAAACAGAATTGACACCATGAAATCAACTATCAATTTTTGCGAATTGCCTGGTGGTCGTGGTGGTGGATTCAAATACCCTTCATTAACAGATTTACATATCAAGCTTTTTGGAAAAGGTTTTGGCGATGCTCATGATGCGGCTTATGATGTTGATGCTACTGCTCGATGTTTTTTTGGATTAATAAGTGGCAGGGTTATTCAATTGAAAGAGGTACCCAATGTTGATTTATTAGTTTACGAAGCTCCTGCACTTGCTGAAGCTAATTTTAAAGATAAAAAAGATACCGCAATTGAAGTAAATGAAATTCAACATATTGCAGATACTTCGTCTGCCATTGCGGATAATCTTGTTGATGTACCTTTTGTTCATTTACATAACCATTCACAATTTTCTATTCTACAAGCAACCACAAAAGTGACTAACTTAGTGAGTAAAGCTCAAGAAATGGGAATGACTGCAGTTGCATTAACAGACCATGGAAACATGATGGCAACCTTTCATTTCGTTAGAGATGCAATAAAAAAAGGAATTAAACCAATAGTTGGCTGTGAGTTTTTTGTCTGTCGTAATAGAAATGACAAATCGTACCAAGACAATGGTTTTCAAACGGTAGTTTTAGCAAAAAATAAAAATGGTTATCAAAACCTTATCAAACTGGCTTCCTACGCCAATACAGAAGGTTTTTATTACGTACCACGTATTGACAGAGAACTTTTACTACAGTATAAAGATGATTTGATTGTTTTGACTGGAGGGATTTGGGGAGAAATTCCTAATAAAATTTTATTTGAAGGAGAACAACAAGCTGAAGATGCACTTCTTTGGTGGAAAGAACACTTTGGAAGTGATTTTTATATTGAAATCAACCGACATGGAGTTGAAGAGGAAAATGAGATTAACAAAACTCTATTATTATTTGCTAAAAAACATACTATCAAATGTATTGCGACTAACAACACCTATTACATCAACAAATCTGACGCAGAAGCTCATGATGTTTTACTCTGTATCAGAGATGCACAACCGTTAAGTCAACCTAAAAAATACATAGGTAAACGAGGTAGAGAATTCCGTTTTGGTTTCCCTAACGATGAATTCTATTTTAAATCGGCAGATGAAATGAAACGTTTATTTGCAGATTTACCAGAAGCAATTATTAATACCAAAGAAATTGTAGATAAAATAGAAACTTATGAGTTGACGAGAGAGGTTCTACTTCCAAAATTTGATATCCCCGTTGATTTTAAAGATGCTGCAGATTTAGAAGATGACAGTTTAAATATTGGTGAAAATAATTATCTACGACACTTAACGTATGAGGGAGCCAAAAATCGTTATGGCGAACTTAGTAATGAAATAATAGAACGTATTGATTTTGAATTAGATGTTATCAGAAAAACTGGCTATCCAGGGTATTTTTTAATTGTTGAAGATTTTATCAGAGAAGCACGTAAAATGGGAGTTTCTGTAGGACCAGGAAGGGGTTCAGCTGCTGGTTCTGTTGTTGCTTATTGCACCAAAATAACAAATATTGACCCACTAAAATACAATTTACTTTTTGAGCGTTTTTTAAATCCAGATAGAATATCAATGCCAGATATCGACATCGATTTTGATGATGAAGGAAGGCAAAAAGTAATTGATTATGTGATTCATAAATATGGCTCCAACCAAGTAGCTCAAATAATAACTTATGGAACTATGGCGGCTAAATCTTCTATACGAGATACTGCCAGAGTGCTTGAACTTCCTTTAAGTGATGCAGGAAGATTAGCTGGTTTAATACCAAACATTGAATTAAATAAAATTTTTGATTTAAGCGAAGCCGATTTAAAGTTAAAATTACCTAAATCGGAGGATTTTGAACGTGCAAAAGAATTAAAAGAAATTGCAAATGGCAACACCTTAGCATCTAAAACTGTCAACCACGCCTTGATGGTTGAAGGTTCGATGCGAAATACTGGAATTCATGCTTGTGGTATTATCATTACTCCAGATGACATTACCAACTACGTTCCAATTGCTTTAGCAAAAGATTCTGATATGGCATGCACCCAATTTGACAACTCTGTTGCAGAAGACGCTGGATTGTTAAAAATGGACTTTTTAGGTTTAAAAACATTAACACTTATTAAAGATGCTGTTCAAATAATAAAAGATAAACATGGGATAGAACTCGACCCAGAAAGTTTTGACATAGAAGATGAGAATACCTATCTTTTATTTCAACGAGGTGAAACAAATGGTATTTTCCAGTATGAATCTGCCGGGATGCAGAAAAATTTAAAATATTTAAAACCAAGTGTTTTTGCCGATTTAATTGCCATGAATGCACTTTACCGTCCTGGACCGATGGAGTATATTCCTTCTTTTATCAAAAGAAAACATGGTGAAGAAAAAGTGGAGTACGACCTTCCAGAAATGGAAGAATACCTTAAAGAAACGTATGGAGTTACTGTGTATCAAGAACAAGTAATGTTAATTTCTCAAAAAATAGCTGGTTTTTCTAAAGGAGATGCTGATGTGTTGAGAAAAGCTATGGGGAAAAAGCAAATTGCGGTATTAGGTAAAATGAAACCAAAATTTATCGAACAAGCTCAAGAAAAAGGGCATCCTAAAGATAAATTAGAAAAAATATGGAAAGATTGGGAAGCTTTTGCTGAATATGCTTTTAACAAATCGCACTCAACTTGTTATGCTTGGATAGGTTTTCAAACAGCTTATTTAAAAGCTCATTATCCAGCCGAATATATGGCTTCTGTTTTAAGCAACAACATGAGTGACATTAGTAAGGTTACCTTTTTTATGGATGAGTGTAAAAGAATGGGAGTGCAAGTTTTAGGACCCGACATCAATGAATCGGTGCATAAATTTACAGTAAATAGTAAAGGACAGATTAGGTTTGGATTAGGTGCACTGAAAGGTGTTGGTGAAAAAGCTGTGGAATCAATTATTGCAGAGCGTAGCATTAATGGTCCTTTTAAATCAATTTTTGATGTTACTAAAAGAATAGATTTGCGAGCTGCAAATAAAAAAACATTAGAAAGCCTCACACTTGGTGGAGGATTTGATTCTTTTCCCAATGTTCATCGAGCCCAATATTTTTTTCAACAAGACGGTATTACTTTTTTAGAAAAAGCCATCAAATACGGGAATAAATTTCAAGAAAATAAAAATTCTTCTCAAGTATCTATTTTTGACACCATTGAAGAAGAAGCACTTGATGAACCAAAACTGCCTCAATGTAACGAATGGACTACTCTAGAGAAATTAAATCATGAAAGAGAGATTGTTGGTATTTTTATTTCTGGACACCCTTTAGATGATTTTGCTTTAGAGATTAAAAATTTTGGAAAAGGGAATTTGAGTTTGCTTTCTGATTTTGCTACTATTAAAGGTAAAGAATTAGCATTGGCAACTATTTGCACTGGTGTACAAGATAAAATGACAAAAAATGGAAAACCTTTTGGAATACTTACTGTAGAAGATTATACTACTTCTTTTGATATTTTTGTTTTTGGTGAAGATTATATAAAATTTAAACCTTATTTCATTCAAGGTCAATATCTTTTTATTACAGGAAAAGTACAGCCAAAGCAAAAACAATGGTCTAAAGAAACTGATGAATTAGAATTTAAAATATCAGCGATAGAATTATTATCTGAATTGAGAGAAAAAAAAGTAAAAACACTTACTGTTAATTTAAAAAGCAAAGATGTTACTGTTGAATTAATTGAAAAAATTTACGAATTACTTGAACAGCACCAAGGTAAATGTGAATTTTCGATACAAGTAAAAGATGACGAAGAAGGTATCATTAAATTATCTTCAAGGAGTAAAAGAATAAGCGTTTCTGATCAATTTTTACAAAACATTAATGAAATAAAAGAGATTACTTACCAATTAAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1429
MFLLFDTETTGLPKNFKAPVSDSDNWPRMVQLAWQLHDNFGKLLSAKNYVVKPDGYEIPLGVSKIHGITTERALRDGIDLKIILEEFNADLENTLYNVGHNIEFDINVVGAEFYRLGIANKLTAKNRIDTMKSTINFCELPGGRGGGFKYPSLTDLHIKLFGKGFGDAHDAAYDVDATARCFFGLISGRVIQLKEVPNVDLLVYEAPALAEANFKDKKDTAIEVNEIQHIADTSSAIADNLVDVPFVHLHNHSQFSILQATTKVTNLVSKAQEMGMTAVALTDHGNMMATFHFVRDAIKKGIKPIVGCEFFVCRNRNDKSYQDNGFQTVVLAKNKNGYQNLIKLASYANTEGFYYVPRIDRELLLQYKDDLIVLTGGIWGEIPNKILFEGEQQAEDALLWWKEHFGSDFYIEINRHGVEEENEINKTLLLFAKKHTIKCIATNNTYYINKSDAEAHDVLLCIRDAQPLSQPKKYIGKRGREFRFGFPNDEFYFKSADEMKRLFADLPEAIINTKEIVDKIETYELTREVLLPKFDIPVDFKDAADLEDDSLNIGENNYLRHLTYEGAKNRYGELSNEIIERIDFELDVIRKTGYPGYFLIVEDFIREARKMGVSVGPGRGSAAGSVVAYCTKITNIDPLKYNLLFERFLNPDRISMPDIDIDFDDEGRQKVIDYVIHKYGSNQVAQIITYGTMAAKSSIRDTARVLELPLSDAGRLAGLIPNIELNKIFDLSEADLKLKLPKSEDFERAKELKEIANGNTLASKTVNHALMVEGSMRNTGIHACGIIITPDDITNYVPIALAKDSDMACTQFDNSVAEDAGLLKMDFLGLKTLTLIKDAVQIIKDKHGIELDPESFDIEDENTYLLFQRGETNGIFQYESAGMQKNLKYLKPSVFADLIAMNALYRPGPMEYIPSFIKRKHGEEKVEYDLPEMEEYLKETYGVTVYQEQVMLISQKIAGFSKGDADVLRKAMGKKQIAVLGKMKPKFIEQAQEKGHPKDKLEKIWKDWEAFAEYAFNKSHSTCYAWIGFQTAYLKAHYPAEYMASVLSNNMSDISKVTFFMDECKRMGVQVLGPDINESVHKFTVNSKGQIRFGLGALKGVGEKAVESIIAERSINGPFKSIFDVTKRIDLRAANKKTLESLTLGGGFDSFPNVHRAQYFFQQDGITFLEKAIKYGNKFQENKNSSQVSIFDTIEEEALDEPKLPQCNEWTTLEKLNHEREIVGIFISGHPLDDFALEIKNFGKGNLSLLSDFATIKGKELALATICTGVQDKMTKNGKPFGILTVEDYTTSFDIFVFGEDYIKFKPYFIQGQYLFITGKVQPKQKQWSKETDELEFKISAIELLSELREKKVKTLTVNLKSKDVTVELIEKIYELLEQHQGKCEFSIQVKDDEEGIIKLSSRSKRISVSDQFLQNINEIKEITYQLN*