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RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_rifcsplowo2_12_scaffold_83883_6

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_31_6

near complete RP 44 / 55 MC: 3 BSCG 43 / 51 MC: 5 ASCG 9 / 38 MC: 3
Location: 4515..6416

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Collagen triple helix repeat-containing protein n=1 Tax=Fluviicola taffensis (strain DSM 16823 / RW262 / RW262) RepID=F2IGP8_FLUTR similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 39.3
  • Coverage: 654.0
  • Bit_score: 370
  • Evalue 3.00e-99
Collagen triple helix repeat-containing protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 634.0
  • Bit_score: 1300
  • Evalue 0.0
Collagen triple helix repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 39.3
  • Coverage: 654.0
  • Bit_score: 370
  • Evalue 8.40e-100

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1902
ATGAAGAAAAATTATTTAAAATTAGCAGGAGCAATTACTTGTTCCTTTTTAACATTTTCTTCCTTTTCACAAAATTGGAAAGTTGGAGGAAATAGTTTTGGTCAAATGGGTGGAAGCCCACCTATACTTGGAACTATGGCGGGAAATAATCAGCCTATCAATATGTACACCAACGGTGTACAACGCCAAAAGTTAAATGGGAATATTAGCTACCCAGTTAACGGTTTTGCTGGTATCCGTGATGGTTATTTATTGTTGGGACAAGATGTGCCTAACAAAGGAGCATTTAGCATGTTTCATATTAATGGTGGAAACACCTTCGGAATTCAAGAATTGGGCTACCGTAACTGGATGAAGTATGGGATGACTATAACATCCAATACCGACCAGATGTACATGGGTCATCGAGCACTTAGTACTACCGAAACAGATGCAGTAATACAATGGAGCAACGACCCCACTACTTCTGGACCTGATAATATGGTATTTATTTTTACACAAGGTACGGGTGCACCAACTGGTAATGCAGCTGATTTAAGTGGAAATGATATAGATGGCAGAGAGATAATACGGTTAACTGCAATAGGAAATGTTGGTATTGGACCACGTTTTAATAATACATTTATGCCACAATCAACCTTACATCAACATCAACAAAATTATAACAGCAGTTGGATGCAAATAACTAACCAAACCATGACAACAACAGGTGCACAAGGTGCTCCAACAGTTATTGATGCTTTTAATGGTTTTAGATTTGGTATTTTAGGAAGTATACAGCAAATACGAAACGGAAATGCTTTGGTGTACCAACAAGAAGAAAGACATTTATTATTTTCTACCAATGCCAACACTACTGCTGTAACTCCTTTAAACACGCTAGAACGAATGAGGATTACTTCTATTAATGCTCCAACAGTTTTAGCAGGTGGTGGTTATGGAGTAAACAACCCTGGAAATCTTACCAATGTTAATTTAACACGAGTGTCTATTAGTCACGACCCTGCCAACCCTGTTACCCAACCATTAAGTTTGTTGCATTTAGGATATAATACAGGAGGAAGTTCCAGTTCTACTGATGGTTGGAGAGATTGGATGGACATCGGTACATTTACCAGTAACGGAACCGATAATATGTATGTTGGATTGAAATTAGAAAAAGGAATTTTAAACGACCGTTTTGATGCGGTTATCAATTGGGGCGATAATGACGCTACCAACCCTGCAATTGGTCCTGATAATTTACGGTTTATCTTCACTTCCAATATTAGTGCAAGTATTCCTCCTGCTAATAGCACAAAAGGATTAGAAGTTGCACGCATGGTACCAGACTTGGCAACTACCCTAACTGCTCCTAATTATGGCATGATGGGAATTGGTGATTTTTCTCCACTTGGACCAAATAATGCACTTGCTGATGCAGTAGATGCCAAACTCGATATTGATGGAGATTTGAGAATTAGAGAAGTTACTGAAAGAGATACTTTATTGCAAGTTTTAGTGATAGATAGCAACGACCACAATCAAGTGCATTGGAGAAGTGCGAATTCTTTTGGCTTAGGAAATATTTGCGGTTCTGCAACTCCAAACCCTTTAACAAATAATTGGGAAATCCAACTACCAGGTAATACAGTTTATAATTTTAGCCAAAAAGGTGTGGTAAATATTACTGATTTAACTAACTGTAATCCAATTGCAAAATTATATGTTAATAGTGGAGCATGGCAAGCTTCTGTTGCATCAGTTAATTCGGCTGTTTCAGGTTATGCAGGATATTTTGTTTCGAACAATGCTACTGGTACTGGGGTATATTGTAAAGCTCCTATTGACCCTGACACTACTAACTTTCCTCCTGTAAGTTTGGCTTTATTTGCTGATGGTGATGTTTTTGTAAGTGGTACT
PROTEIN sequence
Length: 634
MKKNYLKLAGAITCSFLTFSSFSQNWKVGGNSFGQMGGSPPILGTMAGNNQPINMYTNGVQRQKLNGNISYPVNGFAGIRDGYLLLGQDVPNKGAFSMFHINGGNTFGIQELGYRNWMKYGMTITSNTDQMYMGHRALSTTETDAVIQWSNDPTTSGPDNMVFIFTQGTGAPTGNAADLSGNDIDGREIIRLTAIGNVGIGPRFNNTFMPQSTLHQHQQNYNSSWMQITNQTMTTTGAQGAPTVIDAFNGFRFGILGSIQQIRNGNALVYQQEERHLLFSTNANTTAVTPLNTLERMRITSINAPTVLAGGGYGVNNPGNLTNVNLTRVSISHDPANPVTQPLSLLHLGYNTGGSSSSTDGWRDWMDIGTFTSNGTDNMYVGLKLEKGILNDRFDAVINWGDNDATNPAIGPDNLRFIFTSNISASIPPANSTKGLEVARMVPDLATTLTAPNYGMMGIGDFSPLGPNNALADAVDAKLDIDGDLRIREVTERDTLLQVLVIDSNDHNQVHWRSANSFGLGNICGSATPNPLTNNWEIQLPGNTVYNFSQKGVVNITDLTNCNPIAKLYVNSGAWQASVASVNSAVSGYAGYFVSNNATGTGVYCKAPIDPDTTNFPPVSLALFADGDVFVSGT