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js4906-20-3_S2_scaffold_18_24

Organism: js4906-20-3_S2_Melainabacteria_curated_33_49

near complete RP 51 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 28518..31718

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
bge:BC1002_5440 hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family transporter; K03296 hydrophobic/amphiphilic exporter-1 (mainly G- bacteria), HAE1 family bin=MEL_C1 species=MEL_C1 genus=MEL_C1 taxon_order=MEL_C1 taxon_class=MEL_C1 phylum=Melainabacteria tax=MEL_C1 organism_group=Melainabacteria similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 67.8
  • Coverage: 1030.0
  • Bit_score: 1376
  • Evalue 0.0
Transporter hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family {ECO:0000313|EMBL:CCX79701.1}; species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium; environmental samples.;" source="Clostridium sp. CAG:715.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 66.4
  • Coverage: 1046.0
  • Bit_score: 1375
  • Evalue 0.0
multidrug efflux membrane fusion protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 46.9
  • Coverage: 1045.0
  • Bit_score: 921
  • Evalue 1.30e-265

Lists

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Notes

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Taxonomy

Clostridium sp. CAG:715 → Melainabacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3201
ATGGCAGAATATAACGAAAAAGATATTAACTTATTCATTAGACGACCAAAATTTGCGATTGTAATTTCACTTGCAATCGTTTTGGCGGGCTTAATTATGATGTGTGGCTTGCCTCTAGAAGATTATCCGTCAATCACGCCACCTCAAGTTGTAGTAAGTGCAACATATACAGGTGCAAGTGCTGATGTAGTAAGGGATACTATCGCAGCTCCAATTGAGGCTCAATTAAATGGTGTTGAAGATATGATTTATATGACTTCAACGTCTCAAAATGGTTCTTATGAATTGAGTGTATATTTTGAAGTAGGTACAGACCCTGATATGGCGGTAATTAACGTAAACAACCGTTTACAACTTGTTACTCCACGTTTACCAAGTGATGTTAGAAACTATGGTTTAACTGTACGTAAGAGAACAGGTGGTCCTGGTATTTTGATGATTGCTGTAAACTCACCTACAAATGCGTTTGATACTTTATATATTACAAATTATGCATCTATTTATATTAAAGATGAATTAGCTCGTATTAAGGGTGTTTCAAGCGTTAATGTTTATGGGGCTGCTGAATATTCAATGCGTATATGGTTAGATCCTGTAAAAATGGCTAACTACAAGATTTCAGCAACAGAAGTTAAAAATGCGATTATGGCTCAAAATACACAGGTTGCAGTAGGGGACTTGGGTGCAGAACCATTAAAAGATGCTCATGACGTTAAATTTACTTTACGAACAAAAGGCCGTTTGACTTCGGCTAGTGAATTTGAAAATATTGTTGTTTATTCAAATTCAGATGGTTCAAATGTAAAATTGAAAGATATTGCAAGAGTTGAATTAGGTGCGGAATCTTATTGGGGCGACTCATTTATTGGTGGTAAGCGTTCTTCGCTTATCGTAATTAGACAGTTACCTGAAGCTAACTCAATTGATTTGGCTAAAAAATGTGCTAAACGTATGGAAGAATTGAGTAAAGGTTTTCCTAAAGGTTTAGAATATCATATTGAACATGACGAAACAGAATTCGTACAAGAATCTATTAAAGAGGTAGAAAATGCAATTGGTTTGGCTATTTTGCTTGTAGCTTTGGTTACATATTTCTTCTTAGGTTCAAAACGTGCTGCATTCATTCCATTGTGTGCGATTCCGGTTTCATTAATTGGTGTATTTATATTCGTAGCGATGCTAGGATTTTCTATTAACCTGTTAATGCTATTTGGTTTGGTACTTGCCGTAGGTCTGGTAGTAGACGATGCGATTGTAGTACTTGAAAACGCACAAAGACACATTCAAGCAGGTAAAAATCCTCGAGAGGCTACAATTATTACAATGTATGAGGTTACAAGCCCTGTAATTGCAACATCATTGGTATTGATGGCGGTATTTGTTCCTGTATGCTTTATGCCAGGTGTAAATGGTAGAATGTATCAACAATTTGCCGTTTGTATCGCCTGCTCAATGGGCTTGTCAACATTAGTTGCGTTATCGTTAGCGCCAGCATTGTGTTCTACAATTTTGAAAGAACATGATGATGAAAAAGTTCCAGAAATTATTAAAAAATTTGACAATTGGTTTAATAGTATTCGTGATACATACTTGAAATGTGCTCATTACTTCGTAGAATCACCAAAAAGAACAATGATTACCTTAGGTGCTCTTACTTTAATGGCAATTATCATGGGTAACGTTATTCCAACAGGTTTTATTCCAACGGAAGATAAAGGTGCCGTAATGGTTCAAGTACAATTGCCAGACGGTGTTTCAACAGTTAGAACAAAACAAATTGCCGTTCAAATCGAAGATAAAATTAAGGTTATGGACGGGGTTCGTCAAACAATTAACATCATTGGTTTTTCTGGGGAAAATACAGCGTTTATCGTTGTACAATTGAAACCTTGGAGTCAAAGACATAAACCATCTCAACAAATGGACGCAATTATTGGAAAAATTAGAGCACAATTCTCTAATTATCCAGCAGCAAGAGTTGTAGCATTCTCTCCAACTCCAATTCCTGGTATGGGTAACTTCGGCGGTTTTGAATATCAGTTGCTTGATAAAGGTGATAGAAGCCCTCAAGAATTGTACGATCAAGCTCAAAAGTTGATTGCAGCAGCAAATTCAAATAAAAACTTAACATCAGTATTTACAACATATACAGCTACATTGCCACAAATTATCGTCAAGGTTGACGAGGAACAAGCAATGGCTCAAAAGGTTTCTATTAGTGAACTTTATACAACAATGTCAGCTATTTATGGTCAAACTTATGTAAATGACTTTAACAAATTTGGTCGTGTATATCGTGTAATGTTACAAGCTGATGCGGATTTCCGTTCAAAGGAAGCGGATTTGAAACGATTATTTATTAAAAATACAGAAGGTAAAATGGTTCCACTATCTTCAATGGTAAAATTTGAACCGATTGTAGGACCTTATAGTTTAACAAGATTTAATATGTACAATGCTGTTACTATAAATGGTAATGGTGCTGGAAGTGTTTCTTCTGGTCAAGCAATGAAGGAAATGGCAAAGGTTTCAAATGAAGTATTACCACGAGATATGGGCTTTGCATGGTCAGGTAGCTCGTTGCAAGAACAAGAATCAACAGGTCAAATCGTTGTAATTTTGATATTGTCATTAACCTTCGTATATTTGTTCTTGGTTGCACTTTATGAAAGTTGGACTTTGCCAATTGCCGTAATGTTGATTGCTCCAGTTTCCTTGATAGGTGCATTATTTGCTCAATATGTAGCTGGATATTCTTTAGACTTGTACTGTCAAATCGGTTTGATTATGTTAATTGGTTTAAGTACAAAGCAAGCTATTTTGATTATTGAGTTCGCAAAAGATGCTTATGATAGGAACGGTGGAGATGAAGTTGCAGCGGCAATGGAAGCGGCTAAATTGAGATTTAGAGCCGTAATGATGACAAACATTGCGTTTATCTTGGGCGTATTACCATTGGTATTTGCATTTGGTGCTGGTGCTGTAAGTCGTCACTCAGTTGGCATGACAGTATTTGGCGGAATGATGGCAGTAGCATTTATGGGTACCTTGTTAGTTCCAGGCTTCTTTGTATGTATTCAAAGAATGAAAAAAAACTCTCATAACGCTTTAAAAGACGATTCTAAAATGAAAAAGGTATTAGATGATATAAAATCTTTCTTACACGAAGGACTAGAAAAAATAAAAAACGTAGGTAAATAG
PROTEIN sequence
Length: 1067
MAEYNEKDINLFIRRPKFAIVISLAIVLAGLIMMCGLPLEDYPSITPPQVVVSATYTGASADVVRDTIAAPIEAQLNGVEDMIYMTSTSQNGSYELSVYFEVGTDPDMAVINVNNRLQLVTPRLPSDVRNYGLTVRKRTGGPGILMIAVNSPTNAFDTLYITNYASIYIKDELARIKGVSSVNVYGAAEYSMRIWLDPVKMANYKISATEVKNAIMAQNTQVAVGDLGAEPLKDAHDVKFTLRTKGRLTSASEFENIVVYSNSDGSNVKLKDIARVELGAESYWGDSFIGGKRSSLIVIRQLPEANSIDLAKKCAKRMEELSKGFPKGLEYHIEHDETEFVQESIKEVENAIGLAILLVALVTYFFLGSKRAAFIPLCAIPVSLIGVFIFVAMLGFSINLLMLFGLVLAVGLVVDDAIVVLENAQRHIQAGKNPREATIITMYEVTSPVIATSLVLMAVFVPVCFMPGVNGRMYQQFAVCIACSMGLSTLVALSLAPALCSTILKEHDDEKVPEIIKKFDNWFNSIRDTYLKCAHYFVESPKRTMITLGALTLMAIIMGNVIPTGFIPTEDKGAVMVQVQLPDGVSTVRTKQIAVQIEDKIKVMDGVRQTINIIGFSGENTAFIVVQLKPWSQRHKPSQQMDAIIGKIRAQFSNYPAARVVAFSPTPIPGMGNFGGFEYQLLDKGDRSPQELYDQAQKLIAAANSNKNLTSVFTTYTATLPQIIVKVDEEQAMAQKVSISELYTTMSAIYGQTYVNDFNKFGRVYRVMLQADADFRSKEADLKRLFIKNTEGKMVPLSSMVKFEPIVGPYSLTRFNMYNAVTINGNGAGSVSSGQAMKEMAKVSNEVLPRDMGFAWSGSSLQEQESTGQIVVILILSLTFVYLFLVALYESWTLPIAVMLIAPVSLIGALFAQYVAGYSLDLYCQIGLIMLIGLSTKQAILIIEFAKDAYDRNGGDEVAAAMEAAKLRFRAVMMTNIAFILGVLPLVFAFGAGAVSRHSVGMTVFGGMMAVAFMGTLLVPGFFVCIQRMKKNSHNALKDDSKMKKVLDDIKSFLHEGLEKIKNVGK*