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LSDeep1_scaffold_1864_1

Organism: lsdeep_lsdeep1_unknown_47_5

partial RP 32 / 55 MC: 7 BSCG 34 / 51 MC: 9 ASCG 9 / 38 MC: 1
Location: 1..5802

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Value Algorithm Source
Cell surface protein n=1 Tax=Methanosarcina acetivorans (strain ATCC 35395 / DSM 2834 / JCM 12185 / C2A) RepID=Q8TI67_METAC similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 29.6
  • Coverage: 1383.0
  • Bit_score: 411
  • Evalue 4.60e-111
  • rbh
cell surface protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 29.6
  • Coverage: 1383.0
  • Bit_score: 411
  • Evalue 1.30e-111
  • rbh
Cell surface protein {ECO:0000313|EMBL:AAM07633.1}; TaxID=188937 species="Archaea; Euryarchaeota; Methanomicrobia; Methanosarcinales; Methanosarcinaceae; Methanosarcina.;" source="Methanosarcina acetivorans (strain ATCC 35395 / DSM 2834 / JCM 12185 /; C2A).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 29.6
  • Coverage: 1383.0
  • Bit_score: 411
  • Evalue 6.50e-111

Lists

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Notes

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Taxonomy

Methanosarcina acetivorans → Methanosarcina → Methanosarcinales → Methanomicrobia → Euryarchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 5802
ATAACTGTTATAGAAAAGGCAATTAGTATAACATTAACTAATAATACAATTAATGAAAATACAGAATCTGGATCTACGATTGGTTCATTTACATCAACTATTAATACTGGTGAAACTGTAAGTTATACATATGAATTGTTAGATACAGCGGATAATAAAGTAGCCATATCTGATAGTAGCCTGAATACGACATCAACTGTAATTAACTATGAAACTGACAGTTCATTTAATATTACTGTAAAAAGTACCTATGCTGATATAAGTTCCAGCCAAATATTTAGAATTGACGTTGCTAACATCAACGAGGAGCCTACCGGCTTTACCATTAATAATTCATCCGTTAATCAAACTGATCTTTCGGGGACAACAATCGGTACATTTGAGGCAATTGACGGAGATAGTACAGGCACGTACACATACACATTATTAAACAACACTGATAAATTTAAAATAGTGGGTAATACATTACAAACCAGCAAAGACTATCTTATTGCCGGATCCTATAATGTGAGTGTTAAGTTAAATGATAATAACATGTTTTTCTACACTAAAGATATTACTATTAATGTAATTGCTGGGGAAGTAACATTAACTACAAATAACAGCGTGACAACAGCAACATTTTATGGTAACGGCATTGGAACATTAACGAATGGAACAACTAAGTTACAAGGGGCAACTGTTGCAATCATTCAAAATTACACCACTATTAGTGGGGAAGCGTTCTTGGGGGCGACAGGATTAACGTCAGTTACTATTCCCAGTAGTGTCACCAGTATTGGAGTGAAGGCGTTCAAAAGTGCGACCAGTTTGATTACCGTATCATTTGAAGATATATCTAATTCTAATTTAGAAAAGATTAATTATGGTGCGTTCTGGGGGGCGGGGGCATTGACCTCTATTACTATTCCTAAACGTGTTACCAAAATTTATGATAGAGCGTTTATGAAAACAACAAATTTGACCGAAGTAATATTTGATGATATATCTAATTCTCAGCTGGCACATATTTATGGTGGTACTGGTAGTGGTAATAATAACTATGGTGATAACGTGTGGTTCGGCGGAGCATTCCTCGAATCTGGGTTGACTTCTATTATTATTCCTGCTAGTGTACAAACAATTGGAAGGCGTACATTCCGTGATACAAGTTTGAATACGATCACATTTCAACCGGATTCTCAATTAAACACGTTAAATTATGGTGCGTTCGAAGAATGTACCATGTTGACTTCCATTACTATTCCTAAGTCGGTGCGTTCTGGGGGTGGTATATATTCAAGTGAATATCTGTTCAAAGGATGTTCCAATTTGACTACTGTAACATTTGAAGAACCCACTAGTTTAACAACCATTAGCGTTGGAATGTTCAATAAATGTACAAGTCTAACATCTATTACTATTCCTGCAAGTATCACCAGTATTGGAGGCGGGGCGTTCACCGGATGTAGTTTACTCGCTAACTTTACTCTCGGATACGGAACAACCGGTAGTAGGTTAACGAGTGTTTTGTCTAATGCATTTTCAGGCACTGTACTTACTGATGTATATGTGGAAAATGCAAAGCAGACCTATTTCACAGGTAGCGGTGCTTGGCCAGCAAGTGCGGTTTTTAAAGGATGGGGTAGAATAGCTGCTGATATAGGGGTATCAGGAGAAATACTAATCCCAAATACCGTCACCAGTATTGAGATTGATGCGTTCTCAGGGGCGTCAAATTTGACTACAGTATCATTTGAAGAAGTTTCTACCCTAGAAACGATTGGAACAAGTGCGTTCAAAGATGCGACCAATCTAGTAACCATTACTATTCCTGCAAGTGTCACCAGTATTGGAGTGGAGGCGTTCAAAAGTGCTACCAATTTGACTACAGTATCATTTGAAGATATATCTAATTCTAATTTAAAAAAGATTGATTATGGTGCGTTCTGGGGGGCGACCGCGTTGACTTCTATTACTATTCCTAAAAGTGTTACCGAAATTTATGATAGAGCGTTTATGAATACAACAAATTTGACTACCGTAACATTTGATGATATATCTAATTCTCAACTGGCAACGATTTATGGTCAAGATGATAGAGACAGCGAATGGGACGGCGGAGCATTCCGCGGATCTGGGTTGACTTCTATTATTATTCCTGCTAGTGTAGAAACAATTGGAAGATATACATTCCGTGATACAAGTTTGAATACGGTCACATTTAAAGCAGATTCTCAATTAACCACGTTATATTATGGTGTGTTCCGAGGTTGTACCGTTTTGACTTCAATTATTATTCCTAAGTCAGTGGTAGTCGCAAGTCAATATCTGTTCAACGGATGTACCGCTTTGCAAACTGTAGAATTCGAAGAAGGCACTGGTTTAACAACCATTAACGTTGGAATGTTCGTAAATTGTACAAGTCTAACATCTATTACTATTCCTCCAAGTGTCAACAATATTGGAAATGCTGCGTTCTCAGGTTGTACCGTTTTGAGTTCTATTGTTATTCCTGCAAGTGTTGTCAGTATTGGAGTGACTGCGTTCCAAAGCACTGGGTTGACTTCTATTACTATTCCTTCTGGTGTCGCCACTATTGGAAATTATGCGTTCAATCTTGCTGGAAGTTTGCAAACTGTAACATTTGAAGGAACTTCTGAAATAAACACGATTGGACAAGGTGTGTTCAAAAACACCGCAAGTTTGAATTCCATTAATATTCCTGCAAATGTCAACACTATTAGTGGCGAGGCGTTCTATGGTTGTACCGCGCTGACTTCTATTGACATTCCTGCAAATGTCACCAGTATTAGAGATAGTGCATTCTTTCAATCTGGACTGACTTCCATTACTATTCCTCCACTTGTTGAAAGTATTGGTCCTAGTGCATTCTGGTCTGCTACAAGTTTGACTTCCGTAACATTTGAATCAGATTCTAGCCTAAACACGATTGGTGCTGGTGCGTTTAATAATACATCGTTTACGTCCTTTACTATTCCTGCAAGTGTCACCAGTATTGGAAATGCTGCGTTCCAAACTGCGAAATATTTGACTTCTATTACTATTCCTCCACTGGTTACCAGTATTGGAAATAACACGTTTTTAAATGCCCACGAGTTGACTTCCATTAATATTCCTAAAAGTGTCACCAGTATTGGAGCCAATGCGTTCAAAGATGCGAACAGTTTGACGATAGTAACATTTGAAGATATATCTAACTCTAAATTAGAAAGCATTGGCGGCAATGTCTTCGATGGGGCGGCAAAATTATCTTTTATTACTATTCCTCCTCTTGTTACCAGTATTGGAAGTGATGCGTTCAAGGATACAAATTTAAGGTCCATTACTTTTAAAACCGATGTATCCAATTTTACACTTCTTGATGACACTATGTTCCCGGTAGGTTCAGATTTAAACCCAATTACAAGCATTTACGCTTCACAAGCACTTATTACAGCAAAAGTTTGGACTGCTAATGTGAGTTCTACTATTGGTAGTCAGAGCATCATGATTAGAGAACTAGATGGGGTAGCACCGAGTTTCAGCAGCACAACCATTTTAGACAACTCTTATGCAATAGTTACATTTAATGAACCAGTAACTCATAGTAATGGTACGGACTTGACAGTAGATGATTTTACTTTGTCTATTAGTGGTGGAACAGCAACACTTCTAAGTGGTTCACCAACAAGTATAACTCAGAATACCGAAGGTACTGAATATACTCTTGGTTTTTCATTAGATGGAATAGCGGATGGAATTGAAACATTAAAAGTTGACCTCTCATCAAATGCCGCAATTTACGACGCGGTCGGAAATATTTTTCCAACTGACAAACCTCAACCCAACTCTACTGCAAAGTTAAATGATCAAACTGCTCCTAGAATTACCAGTACAACCGTTAATGACATCAATACCACTGTAACAGTTACCTTTTCTGAAGCAGTAAATGGTTTGGCAGTAAATGGTTTGGATAGTAGGGTCTTGTCAGTAAATGATATTAGTTTGTCTATTACTGGTGGAATAGCAACACTTCTAAGTACTACACCAACAAGTATAACTCAAAATGACGAAGGTACTGTATATACTCTTGGTTTCTCGTTAAATGGAAGACCGAACGGGAGTGAAACATTAACAATTTTACCATCATCAGATACTGCAATTCAGGATGCTGGCGGAAACTCTGCTAGTAGTGTCAGTCAATCCAACAATACGCCATCATTATATGATCAATCGAAATATTCCATTTTTATTGATATTAATGATACACAACATCTGATCCTTATTAATAATGAACCGAAATCGATTGTGTCAACGACCTACACCGATGTTATTGGCGATAATACAAATTTAAAAAGCGTTACTGTAAGCAAAGATGTCAAACAAATTGGAGATAATGCCTTCTTAAATGCGACAAGTTTGACTACCGTATCATTTGAAGCAGACTCTTCATTAAACAGCATTGGAACAGGTGCCTTCCAAGGTGCGATAGGGTTAATGTCAGTTACTATTCCCAGTAGTGTCACCAGTATTGGTCCTAGTGCATTTGAAAGTGCTACCGGTTTGACCCAAGTAACATTTGCCCCAGATATTTCATTCGGTGGTATTCCTGGACGTATGTTCTATGATGCTAGCGGTTTGACTTCTATTGACATTCCTAATACTGTTACCACTATTGGAGCAAAGGCGTTCTATGGCGCGACAAGTTTGACTACCGTATCATTTGAAGAAAATTCTACCCTAGACACGATTGGGTCAGAAGCATTCCGTAATACGATAATTGCAAGTATAGAAATCCCTGCTAGTGTTACCACTATTGGGACTAGTGCATTTTACTGGAATTGGCGTTTGTATACTCTAACATTTGAAGCAGGTTCTAACCTAGAAACGATTGGCGCCAGTGCATTCAGAGAGACCAGTTTGGATACCATTACTATTCCTGCGAGTGTTACCACTATTGGACCCAATGCGTTTGAGGGTTCTGACCGATTTGGCCGCGTACAATATATAACATTTGC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PROTEIN sequence
Length: 1934
ITVIEKAISITLTNNTINENTESGSTIGSFTSTINTGETVSYTYELLDTADNKVAISDSSLNTTSTVINYETDSSFNITVKSTYADISSSQIFRIDVANINEEPTGFTINNSSVNQTDLSGTTIGTFEAIDGDSTGTYTYTLLNNTDKFKIVGNTLQTSKDYLIAGSYNVSVKLNDNNMFFYTKDITINVIAGEVTLTTNNSVTTATFYGNGIGTLTNGTTKLQGATVAIIQNYTTISGEAFLGATGLTSVTIPSSVTSIGVKAFKSATSLITVSFEDISNSNLEKINYGAFWGAGALTSITIPKRVTKIYDRAFMKTTNLTEVIFDDISNSQLAHIYGGTGSGNNNYGDNVWFGGAFLESGLTSIIIPASVQTIGRRTFRDTSLNTITFQPDSQLNTLNYGAFEECTMLTSITIPKSVRSGGGIYSSEYLFKGCSNLTTVTFEEPTSLTTISVGMFNKCTSLTSITIPASITSIGGGAFTGCSLLANFTLGYGTTGSRLTSVLSNAFSGTVLTDVYVENAKQTYFTGSGAWPASAVFKGWGRIAADIGVSGEILIPNTVTSIEIDAFSGASNLTTVSFEEVSTLETIGTSAFKDATNLVTITIPASVTSIGVEAFKSATNLTTVSFEDISNSNLKKIDYGAFWGATALTSITIPKSVTEIYDRAFMNTTNLTTVTFDDISNSQLATIYGQDDRDSEWDGGAFRGSGLTSIIIPASVETIGRYTFRDTSLNTVTFKADSQLTTLYYGVFRGCTVLTSIIIPKSVVVASQYLFNGCTALQTVEFEEGTGLTTINVGMFVNCTSLTSITIPPSVNNIGNAAFSGCTVLSSIVIPASVVSIGVTAFQSTGLTSITIPSGVATIGNYAFNLAGSLQTVTFEGTSEINTIGQGVFKNTASLNSINIPANVNTISGEAFYGCTALTSIDIPANVTSIRDSAFFQSGLTSITIPPLVESIGPSAFWSATSLTSVTFESDSSLNTIGAGAFNNTSFTSFTIPASVTSIGNAAFQTAKYLTSITIPPLVTSIGNNTFLNAHELTSINIPKSVTSIGANAFKDANSLTIVTFEDISNSKLESIGGNVFDGAAKLSFITIPPLVTSIGSDAFKDTNLRSITFKTDVSNFTLLDDTMFPVGSDLNPITSIYASQALITAKVWTANVSSTIGSQSIMIRELDGVAPSFSSTTILDNSYAIVTFNEPVTHSNGTDLTVDDFTLSISGGTATLLSGSPTSITQNTEGTEYTLGFSLDGIADGIETLKVDLSSNAAIYDAVGNIFPTDKPQPNSTAKLNDQTAPRITSTTVNDINTTVTVTFSEAVNGLAVNGLDSRVLSVNDISLSITGGIATLLSTTPTSITQNDEGTVYTLGFSLNGRPNGSETLTILPSSDTAIQDAGGNSASSVSQSNNTPSLYDQSKYSIFIDINDTQHLILINNEPKSIVSTTYTDVIGDNTNLKSVTVSKDVKQIGDNAFLNATSLTTVSFEADSSLNSIGTGAFQGAIGLMSVTIPSSVTSIGPSAFESATGLTQVTFAPDISFGGIPGRMFYDASGLTSIDIPNTVTTIGAKAFYGATSLTTVSFEENSTLDTIGSEAFRNTIIASIEIPASVTTIGTSAFYWNWRLYTLTFEAGSNLETIGASAFRETSLDTITIPASVTTIGPNAFEGSDRFGRVQYITFADGSLNSIGTGAFQNTMSTSIAIPAGVTSIGINAFLGAFKLETITVDGSNSYFSSDVNGVLFDNDYKLLIKYPEGKGSSTNYDVTVDDSNKYVLNGDPSITPLFYVGVTYTFKLSNTDITNHPLEIRNDADISLSTTSGTIVTFTPSEAGDVKLYCTNHGDGMGSYYNPISVDSSGISTTYNIPNSVTTIEANSFINTDINKVFASAHTFSSNTWTDGQTSTIGGKYITVIEKAISITLTNNTINENTESGSTIGSFTSTINTGETVS