ggKbase home page

ACD20_24_14

Organism: ACD20

near complete RP 51 / 55 MC: 13 BSCG 50 / 51 MC: 4 ASCG 0 / 38
Location: comp(14495..15613)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
polysaccharide pyruvyl transferase CsaB similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 36.3
  • Coverage: 353.0
  • Bit_score: 210
  • Evalue 8.50e-52
seg (db=Seg db_id=seg from=254 to=271) iprscan interpro
DB: Seg
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null
S_layer_CsaB: polysaccharide pyruvyl tra (db=HMMTigr db_id=TIGR03609 from=10 to=319 evalue=5.8e-90 interpro_id=IPR019896 interpro_description=Polysaccharide pyruvyl transferase, CsaB) iprscan interpro
DB: HMMTigr
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null
  • Evalue 5.80e-90

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

uncultured bacterium → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1119
ATGTCATTAAAAAATATGAAGAATATAAAAATTTTAATATCCGGATACTATGGTTTCGATAATTTTGGTGATGATGCAATACTGCATACACTTTTACATAACCTTAAAACCAATTTTGAGAATTGCCAAATAACCGTTATCTCAAAGAATCCTGCTAAAACAAAACAGCTTTATGGTATTAACTCTGTTGGTACATTTAATTATCAAGAGATTATTAAACAGATGCTGGCTGCAGACTTATATATAAGTGGAGGAGGCAGTCTCCTTCAGGATATAACAAGTTTAAAAAGCCTGTTTTATTATTTATCCTTAATACTTTTGGCAACACTCTGCAAAGTAAAAACATATATATATGCTCAGGGAATAGGTCCTATTAAAAGCAAGCTCGGGCAGTTTTTAACGAAAAATATTCTTAAAAAGGTTGATTTAATTACCGTCAGAGATCAACAAAGTAAGGACTTTTTAGATAAATTAGGGATAAATTCTATATTAACAGCTGATCCAGTATGGTGTATGGATGTAGAAAAAATAAACAATAATTCATGTCTGAATAATGAGAAAATAAAAGTAGGAATTCAGCTTAGAGATTGGTATTTATTGAATAATGAAAAGCTTGAGCATTTAGCAGAAGCTATAAACCTAAATTTCAATAGTAATTATCAATTAATCTTAATTTCCTTGCAGGACTCTCATGATCTGGCTATTACAGAAAAGTTTAGAGAGATTTTAAAATTAAAAAATGCCGGCCCTGATATTCAATTAATGTCTGACTTATCAATATTTGATAGTATTTCGTTATTAAGTCAGCTGGATTGTCTTATAGCAATGAGATATCATGCGAATCTTATTGCTATAAAGTCTAATGTTCCTGCTCTGGCTTTATCTTATGACCCAAAAGTTGAGATTCTATCTAGCGAAGCAGGAATTCCTTATGTCTCGATTGAAAATTTAGATAAAGAAGAGTTAAATAAGAAAATATTTGATTTAATTACGCAAAAGACTACTTATGAAGATAAATTAAGAGATTTTGCAGCTAAAAAAGAACTTGAATCTCGACAAAATGTTGATTTATTGAGTAAAATATTATTTGAGGATAATTTTTCAGGGGTTAAAAATTGA
PROTEIN sequence
Length: 373
MSLKNMKNIKILISGYYGFDNFGDDAILHTLLHNLKTNFENCQITVISKNPAKTKQLYGINSVGTFNYQEIIKQMLAADLYISGGGSLLQDITSLKSLFYYLSLILLATLCKVKTYIYAQGIGPIKSKLGQFLTKNILKKVDLITVRDQQSKDFLDKLGINSILTADPVWCMDVEKINNNSCLNNEKIKVGIQLRDWYLLNNEKLEHLAEAINLNFNSNYQLILISLQDSHDLAITEKFREILKLKNAGPDIQLMSDLSIFDSISLLSQLDCLIAMRYHANLIAIKSNVPALALSYDPKVEILSSEAGIPYVSIENLDKEELNKKIFDLITQKTTYEDKLRDFAAKKELESRQNVDLLSKILFEDNFSGVKN*