ggKbase home page

SCNpilot_BF_INOC_scaffold_125_125

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Bacteroidetes_37_82

near complete RP 52 / 55 BSCG 49 / 51 ASCG 14 / 38
Location: comp(138450..144410)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PKD domain containing protein n=1 Tax=Flavobacterium johnsoniae (strain ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101) RepID=A5FCL5_FLAJ1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 30.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 672
  • Evalue 1.10e-189
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 694
  • Evalue 1.00e-196
PKD domain containing protein {ECO:0000313|EMBL:ABQ07059.1}; TaxID=376686 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium.;" source="Flavobacteriu similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 30.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 672
  • Evalue 1.60e-189

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Flavobacterium johnsoniae → Flavobacterium → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5961
ATGAAAAAATTTTACTATTTAATTTGGGGATTTGCTGTATTGTTCTTTTCAAATCCAACATTTGCAACCCACCAAATGGGAGCAGATATGGAATATAGCTGTTTGGGCAAGTTTGGCAATGCCATGCGCTATAAAGTAACATTTTCATTTTATAGAAATTGTAGAGATGGAGGTTCAACTTCTGCTTCTGCACCAACAACAGTTTCGCTAAGCGCCATACCGCAAGCTTGCGCAGGCGTAGGAAATGTAACAGCAACCATGGTGCAAATTCCCGGCAAGAGCGGAGTAGAGGTTTCTCCATTGTGCCCAAATCAAATTTCGCAAAGTGGTTGCAATTACTCCGGAAGTGGAAACTCGCCATATCCGGGAGTGCAGGTTTATAAATACGAAGCAACTATTGATTTGCCGCTAACATGCACCAACTGGAAATTTCAAACAACAGACTGCTGTAGAAATGGAGCAATCAATAATATTCCAAACCCAGGAAGCACCTCTCTTTCCATCGAAGCGTATGTAAACCAAGGAACAGACCCATTAACCGGACAACCATATTGCAATAGTTCGGTAACTTTTACACAGCTTCCGGTTCCTTTTGTTTGTATCAATAATATTACAAACTATAATCACGGAGCGGTAGATGCCGATGGCGATTCATTGGTTTATACACTAATAAATCCGTTGGGCGACAGCTATAATCCAATAGGCTTTAATGGAGGATACAGCGTTTCTCAACCGGTAAGAACAAACCCTTCGGGAACATTTAAAATTGATGCTGCAACCGGACAAATGACCTTTATGCCGGGATTTATTGAAGCAGACGTACTTGCTGTTAGGGTTGATGAATATAGAAATGGCGTGCTAATAGGCTCTACCATACGCGATATTCAGGTGAATGTTTTAACTTGTAATGTCTCTATTCCACAGCCGGAACCAATTACAAGCGTGGTAAACGGAAATCAAAAAGACTCCATTACTTTGCAGGTTTGTCCCGGCACTCAGGTTTCTTTCGATATAAAAGTTATTGATCCTAACGGAAGAAACTTAACGTTAAGCAGCAGCCTTCAAGGAAACCCATCGCCATTGCCGGGGGCAAATTTTACACAAGTAAATGTGGGATCGGCACCAAACGATACTGCTATTGCAAGAGTTACTTGGTTGCCCGCTCCGGGAGATACGGGCTGCCACCAATTTTTGTTGATTGCAGAAAATGATGACTGCCCTGTGAAAGGAAGAGCAGCAAAGGTTTACAATGTTTGCGTGTTTAATAAAGTACAATTATTAACCGCCAGCCCAACATATTGTGGAACTCCGGTTCAGCTTACTGCAAGTGGCGGAACAAACTTTACATGGAATCCAACTACGGGTTTAAGCAGCTCAACTATTTTAAATCCAACAGCATCGCCAAGTGTGCCAACTATGTATAAATTTACAAGTGATTGCGGAACAGATTCTGTTTATGTGAATGTTGCCGCACCCTTTGTTTTCGATGCTGGAACTGGCGGACAAATTTGCCAAAACGGACAAATACAATTGAATGCTTCGGTTGATAATAAGTATGCACCATACAAAATAAAATGGACTCCGGCAACCGGATTAGAAGACCCAATTTACGGACTTGCAAACGATTCAATTTTAAACCCAATGGCAAGCCCGCTTACTACAACAAAATATAAAGTTTCTTTTGAAGCAAATAATGGCTGTGTAAATGTTGATTCGGTAACTGTAACCGTAAACGGAACAGGACCGGTGATTGAAGCAAAATCTGATAAAGCAACCGTGTGCCCGGGGCAACCGGCACAGCTTGTAATTCTCACCAATCCGCAATCGTGTGGATTAACCGTTCAACCATGCGATGGATATGATATTACAGCCGATGTGGGAACAAAAACAACCCAATCGGGAAACACTCCGGTGCAACTTCCTTCGCCATTTGGAAATTATACCAAAAGCAACCGCCACCAAATGCTTTACAAAGCAAGTGAAATATTAGCTTCTACAGGCGGAAGAGGAGGAAAAATAAAATCTATCGCCATCAATTTGTTGGCAGCAGGAACACAGTTAAATAATTTTACGGTTAAAATTGCTTGCACTTCTGCCGATAGTTTAATTGGCTATTCAAGTAGCGGTTTGGTTACAGTGTTTAACCCCAAAAACTATACGGTAACTGCAGGTTGGAACACAATAAACTTCGATAATTTTTATGATTGGGACGGAAAATCGAATTTGTTGATTGATATATGCCACAACACGACTACCAACAATGGTCAGCACATGAAATACTATGTTACAAGAACCGATGGCGCAGCAGGAAACTTTCCAAACTATCGTTCAATTTGGTTTACGGAAAGCAACGGCTTCGACCAATGTGGCGTAACCGGAACCGTACCAACCGTGAACGCAGCTCGCTATAAAGATAGACCCAATATGCGCTTTGTAATGTGTGTTGGAGATTTATCAAATGCAACTATTGCGTGGACACCAAATACACCACCCAACGCACCAAATCCGCTTAACAAAGATACAACAACAGCATATCCGCAAACACCACAAGTTTATTCAGTAGCAGTAACAAACCAAAATGGCTGCACCGGAAATAGTTTTGTATTTGTGAATGTGGACACCACAACTCGACTAACAATGAGTAACGACACATTTATTTGTGCCACAAATGCTACGGTAAAAATTAAAGCAAAAGTTACTTCTTCACTTCCTAATCCAAATTATACTTATGCTTGGGCAGCAAATCCATCAGCAGGTTTTGTAAACCCGGGAAGCAAAGATTCGGTAACAGTTTCGCCTACTACAACCACAAAATATTATGTAACAATAACTGGTGGCGCTTGCACCTTGGTAGATTCTGTAACGGTGAGTGTTGGCACGGGTATTCCGGTTAATTTAACTTTGGTAGATTCAATTTCTTGCTTCGGTGCAAACGATGGAACATTATCAGCACAAGTTCCGGGAAATCCGCCAGGTTTAACTTATAGCTGGACACCAAATTCTCTTTCTGGAGGCACAGTGCAAAATCTTGCTCCGGGAGTGTATGCAGTTACCGTAACCAATGCGCAAAATTGCCAAGGCTCAGATACTATTATCGTTAATCAACCGACCCAACTTCAGCTTAATTTCAGTAGCTTAGATGTTACTTGCGCAGGAAAAGCAAATGGTAATATTACCGCAACGGTAATTGGCGGAACACCAAACTACACATTTGGCTGGTCGCCAAGTTTGGGCAACACTTCAATGCCGAATAGCTTAGCAGGCGGAACATATAACCTTACTGTAACCGATGGGCACGGCTGTACCATTGCAGGATCAAGAACCATTACAGAACCACCCGCAATTACTGTTTCCGTTGTAACAACAAATGCCACATCTTTTGGTGGAAGCGATGGCACGGCAAAAGCTATTCCGGCCGGAGGAACTCCTGGATATACTTTTTTATGGACGAATAGCGCACAAACCGACTCAATAAGTGGCTTATCAAAAAACTATTATTGTGTAACGGTTACAGACGTAAAAGGCTGCACCGCTTCAGCTTGTGATTCTGTAAAAGATCCTCCTCCTATAATACTTACATTTACACAAACAAACGTGATGTGCTTTGGCGACTCAACAGGTGGTGCAAGCGTTTCTGCCGTAGGCGGAATTTTGCCTTATACATATAAATGGAGCAGCAATCCACAGAAAGACACTACCAATGCCATAAGCGGAGTAAAAGCAGGAGTTTACACAGTTACCGTTACAGATTCGGCAGGCGTTGCGGTAAATAAAAGCGTAACCATTACAGAGCCAACACAAATTTTAATCACATTCGATTCTGTTGCTATTAATTGTAATGGTGGAAACAACGGCTCATTAACCGCATTGGTAAATGGTGGCACACCAGCTTACACCTATTTGTGGACACCCGGCAATGTGGCACAGCAAACAATTCAAAATATAACAAGCGGAAACTATACAGTTACCGTAACAGATAATAATAATTGTACAGCAACGGCATCTTATTTCTTAACAGAACCAACAGTGCTTTCGGTAACAACAAATGTTCAAAAGAATGTGTTTTGTTTTGGTGGCAGTGATGGTGCGGCAGATGCACAAGCTACGGGTGGAACAGTGCCATATACATACACTTGGAGCAATAGTGTTTCACAAGTAAATACAGTTTCGGCAACAGACCTAACAGCCGGTAGCCAAACAGTAACAGTTACCGATGCAAAAGGCTGTACCGCAACAGCAACATTTACAATAACAGAACCGGCAGTATTTGCGGTAAGCATAACAACCACAAACGCCAATTGCCCAACCAGCAACGATGGTTCGGCAACCGGAAATATTACTGGCGGTTTAGCGCCATATACTTTTTCTTGGGATGGAAACACCGGACCACAAACACAAACAGGGCTTTCTTTTGGAAATCATTCGGTTACAGTTACAGATAAAAATCTTTGCACAGCAACGGCTACATTTACTATTGATACAAACTATTCACTTCGTGTGAGTGTGCAAACAGCAGATGCAACATGCTTTGGTGTAAACAATGGTTCGGTATCAGTTTCGCCAACAAATGGCACACCTGGCTTTACTTTCTATTACAGCAATAGTGCAGATTCTACAGCTTTAGTAGCAGGAAATTATTCAGTAACCGTTACCGATAATTTGAATTGTATTGCGGTAGAAAATTTCACCATAAACCAACCAACAGAAATAGAACTTGCTTTCACCACAAAAGCTCCTTTGTGTAAAGGAGATTCAAATGGAACAGTGAGTGTGGTGGCAACGGGCGGAACACCTGGATATTTGTATGTTTGGAATGATATAGCGGCACAAACAAATACAACTGCTATTGGCTTGCCACAAGGAAGTTATAGTGTAACTGTAACCGATGCAAACCAATGCACAAAAACAGGCAGTGCGGATATTGTAGATCCTACAGGATTAGAATTGCATTTCTTAAACAGAATAGAAATTAGTTGTGCAGGATATGATGACGCAAGCATTACAGTACAAGGAAACGGAGGCACCTTACCTTATACATATTTATGGGCGCAAAACAGTTTCGTATCTACAAATACTAATAGCACAACACTTACAAACTTGGGTCCCGATATTTATAGCGTAACTATTACTGATGGAAATGGCTGTGCAATATCTGATACTGTAGTATTTTCTTCGCCACCGGATTTAGATTTTGATTATATCATTATTGACTCAGTATCGTGTCCGGGATTAGCAGACGGCAAACTTAGAATGTTGGCAAAAGGAGGAACTCCGGGACCAAGTAATACTCCATATACCTATTCAATAAACAATACCGATTACCAAAGTAGCGGAATATTTAAAGATTTAATTTCAGCAGATTACAGAGTGTATGTAAAAGACGTAAACGGATGTATGTACGATACTATGGTAAATGTGCCACAACCACACTTACCACAACTGCAAATATTACCGCAAGACAGCACAATAGAATTAGGCAACAGCATCGTTTTACAAGCCATTGTGCAAGGATATTCAGGGTCGGATATTAAATCATACAATTGGTCGCCAACCATAGGTTTAAACTGCTACGACTGTGTGATGCCAACAGCTACACCATACAATGATATGGAATACACACTCACTTTAGCCTACTTAAAAAATTGCACTGCGGAGCAAACAGTAAATGTGTATGTAAATGATGGAAAGAAATTCTTTGTGCCGAATTTAATTTCACCAAATGGCGATGGCGTAAATGATGTGTGGGAAGTTTATGGATACGATTTACAGTCTTTGTACGTTACTATTTTTAATCGTTGGGGAGAAAAAGTTTTTGACTCCGGAGGCAACCAATTTACAGGTTGGGACGGAACATATAAGGGCGTAAAACAGGAGCCGGGAATTTTTACTTTCTACATAAAAGGAATTTATTTGAACGGAAAAGTTGCAGAAAAAACAGGAACTATTACATTAGTGCGTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1987
MKKFYYLIWGFAVLFFSNPTFATHQMGADMEYSCLGKFGNAMRYKVTFSFYRNCRDGGSTSASAPTTVSLSAIPQACAGVGNVTATMVQIPGKSGVEVSPLCPNQISQSGCNYSGSGNSPYPGVQVYKYEATIDLPLTCTNWKFQTTDCCRNGAINNIPNPGSTSLSIEAYVNQGTDPLTGQPYCNSSVTFTQLPVPFVCINNITNYNHGAVDADGDSLVYTLINPLGDSYNPIGFNGGYSVSQPVRTNPSGTFKIDAATGQMTFMPGFIEADVLAVRVDEYRNGVLIGSTIRDIQVNVLTCNVSIPQPEPITSVVNGNQKDSITLQVCPGTQVSFDIKVIDPNGRNLTLSSSLQGNPSPLPGANFTQVNVGSAPNDTAIARVTWLPAPGDTGCHQFLLIAENDDCPVKGRAAKVYNVCVFNKVQLLTASPTYCGTPVQLTASGGTNFTWNPTTGLSSSTILNPTASPSVPTMYKFTSDCGTDSVYVNVAAPFVFDAGTGGQICQNGQIQLNASVDNKYAPYKIKWTPATGLEDPIYGLANDSILNPMASPLTTTKYKVSFEANNGCVNVDSVTVTVNGTGPVIEAKSDKATVCPGQPAQLVILTNPQSCGLTVQPCDGYDITADVGTKTTQSGNTPVQLPSPFGNYTKSNRHQMLYKASEILASTGGRGGKIKSIAINLLAAGTQLNNFTVKIACTSADSLIGYSSSGLVTVFNPKNYTVTAGWNTINFDNFYDWDGKSNLLIDICHNTTTNNGQHMKYYVTRTDGAAGNFPNYRSIWFTESNGFDQCGVTGTVPTVNAARYKDRPNMRFVMCVGDLSNATIAWTPNTPPNAPNPLNKDTTTAYPQTPQVYSVAVTNQNGCTGNSFVFVNVDTTTRLTMSNDTFICATNATVKIKAKVTSSLPNPNYTYAWAANPSAGFVNPGSKDSVTVSPTTTTKYYVTITGGACTLVDSVTVSVGTGIPVNLTLVDSISCFGANDGTLSAQVPGNPPGLTYSWTPNSLSGGTVQNLAPGVYAVTVTNAQNCQGSDTIIVNQPTQLQLNFSSLDVTCAGKANGNITATVIGGTPNYTFGWSPSLGNTSMPNSLAGGTYNLTVTDGHGCTIAGSRTITEPPAITVSVVTTNATSFGGSDGTAKAIPAGGTPGYTFLWTNSAQTDSISGLSKNYYCVTVTDVKGCTASACDSVKDPPPIILTFTQTNVMCFGDSTGGASVSAVGGILPYTYKWSSNPQKDTTNAISGVKAGVYTVTVTDSAGVAVNKSVTITEPTQILITFDSVAINCNGGNNGSLTALVNGGTPAYTYLWTPGNVAQQTIQNITSGNYTVTVTDNNNCTATASYFLTEPTVLSVTTNVQKNVFCFGGSDGAADAQATGGTVPYTYTWSNSVSQVNTVSATDLTAGSQTVTVTDAKGCTATATFTITEPAVFAVSITTTNANCPTSNDGSATGNITGGLAPYTFSWDGNTGPQTQTGLSFGNHSVTVTDKNLCTATATFTIDTNYSLRVSVQTADATCFGVNNGSVSVSPTNGTPGFTFYYSNSADSTALVAGNYSVTVTDNLNCIAVENFTINQPTEIELAFTTKAPLCKGDSNGTVSVVATGGTPGYLYVWNDIAAQTNTTAIGLPQGSYSVTVTDANQCTKTGSADIVDPTGLELHFLNRIEISCAGYDDASITVQGNGGTLPYTYLWAQNSFVSTNTNSTTLTNLGPDIYSVTITDGNGCAISDTVVFSSPPDLDFDYIIIDSVSCPGLADGKLRMLAKGGTPGPSNTPYTYSINNTDYQSSGIFKDLISADYRVYVKDVNGCMYDTMVNVPQPHLPQLQILPQDSTIELGNSIVLQAIVQGYSGSDIKSYNWSPTIGLNCYDCVMPTATPYNDMEYTLTLAYLKNCTAEQTVNVYVNDGKKFFVPNLISPNGDGVNDVWEVYGYDLQSLYVTIFNRWGEKVFDSGGNQFTGWDGTYKGVKQEPGIFTFYIKGIYLNGKVAEKTGTITLVR*