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NECEvent2014_3_5_Clostridium_ultunense-rel_31_38_scaffold_78_61

Organism: NECEvent2014_3_5_Clostridium_ultunense-rel_31_38_plum

partial RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 0 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 5
Location: 48533..50104

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
O-antigen polymerase n=1 Tax=Clostridium cellulolyticum (strain ATCC 35319 / DSM 5812 / JCM 6584 / H10) RepID=B8I8C7_CLOCE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 37.1
  • Coverage: 407.0
  • Bit_score: 297
  • Evalue 2.00e-77
O-antigen polymerase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 37.1
  • Coverage: 407.0
  • Bit_score: 297
  • Evalue 5.70e-78
Tax=BJP_IG2157_Clostridiales_35_16 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 38.4
  • Coverage: 518.0
  • Bit_score: 344
  • Evalue 3.40e-91

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

BJP_IG2157_Clostridiales_35_16 → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1572
ATGGATATAAGAAAAGCTATTGAAGGAAGTTTTATTTTCAACCTATTACTTAGGCTTAAAAAATTATCAGATAATAGTTTTTTATTTAGGATGCAAAATAAAACCGATAATAAAGGAAAATATAAGCCTGAAGAATATAAAACTTGGATGGATATTAGTTTTATTTATATATTTCTTATGAATTTAGATAAGAAATTTATGAAGATGGAAGAATTTATATTTAACTCCTTAAGAAATAGTGTAATTTTAAGACCCTTTATGAAAAAAATAAATACAGAAGAGGTATCTCCAGAAAGACCTATTAGAGATAATAGCTATTTATATAAAATAATCAAAAAGATAAAAGGTAAAGGTACTTGGTTAGATTTATTGATATTTATTCCTGCTTCTTATATAGTTGTGGATTTTGTAATTAGAAGGACTCGAGGATTAGCTTCTTTAGGTTCCATATGGGATGAATTATTATTAATTCTTCTAGTTGGATATATAATTCTTAAAAGAATATTATCTGGTGGAAAAATTAAGCATAATTTTACACCTATGGATTTGCCCGCGGCTATCTATATAGTTTTAGGAATTTGCCATGTGTTTATAGTTGCGCCTAATCTAGGTATAGCAATAGAAGGATTTCGCGCAGTTTTCCAGCATATTCTTTGGTATTTTGTGGCTACACAATTTATTAGAAGTATAGAAGATTCTGAGAGAGTGATTAACTTAATGCTTTCTACAGGACTGTTCATGGGAGTCCATGCAGTATATCAATATATTGCGAAGGTTCCTATGCCTGGGAATTGGGTAGATACAACTGAAAATATTAGAACTAGGGCTTTTTCTATAGTTGGTAGTCCTAATATATTAGGTGTTATTTTTGTTTTACTTATTCCTATTGCAATTTCAATGCTTATTACTCATAAGGATAAATATATGAGAGTATTTTATTTTAGTGCAACTATATTTATGACCATAGGTTTACTTTTGACTTTATCTAGGGGAGCATGGTTAGCTTTTGCTGGAGCTATGTTTATTTTCATTATTACTTTAAATCCAAGGTTAATAATACCTTTTATAGCCTTTGTAGGTATATTTATTTTATTTGGTGGTTCTTTAAGTCAGAGATTATTGTTTATGTTATCTCCTGTATACCTAATAAAATCTGCGGCTGGAGGTAGATTATATAGATGGGAAATAGGGCTTACTATGTGGCGCAGAAACAGATTATTCGGCGTTGGACTTGGTAGATATGGTGGAGCAGTAGCAATTAATAATCAATTGGCTCCTTTCTATCTAGATAATTACTATCTTAAAACGTTAACTGAAATGGGGATATATGGTATAGTTGGTTTAGCTTTTGTTATTATATGCTTTATTATTTTTGCTATGAAGATAATAAGATATCAGGATGATATTAAAAAGAGAATCCTTGCTATCGGATTATTTTCAGGAGCAATGGGGGTACTAGCGCAAAACTTTGTTGAAAATATATTCGAAGTGCCCGCTATGGTCATATACTTTTGGATTGTAATTGCATTAATAAATACTCTTGCACCAAAAGGAAAGACAGAAACCAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 524
MDIRKAIEGSFIFNLLLRLKKLSDNSFLFRMQNKTDNKGKYKPEEYKTWMDISFIYIFLMNLDKKFMKMEEFIFNSLRNSVILRPFMKKINTEEVSPERPIRDNSYLYKIIKKIKGKGTWLDLLIFIPASYIVVDFVIRRTRGLASLGSIWDELLLILLVGYIILKRILSGGKIKHNFTPMDLPAAIYIVLGICHVFIVAPNLGIAIEGFRAVFQHILWYFVATQFIRSIEDSERVINLMLSTGLFMGVHAVYQYIAKVPMPGNWVDTTENIRTRAFSIVGSPNILGVIFVLLIPIAISMLITHKDKYMRVFYFSATIFMTIGLLLTLSRGAWLAFAGAMFIFIITLNPRLIIPFIAFVGIFILFGGSLSQRLLFMLSPVYLIKSAAGGRLYRWEIGLTMWRRNRLFGVGLGRYGGAVAINNQLAPFYLDNYYLKTLTEMGIYGIVGLAFVIICFIIFAMKIIRYQDDIKKRILAIGLFSGAMGVLAQNFVENIFEVPAMVIYFWIVIALINTLAPKGKTETN*