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NECEvent2014_9_1_Candida_parapsilosis_39_137_scaffold_317_12

Organism: NECEvent2014_9_1_Candida_parapsilosis_39_137_plum

megabin RP 29 / 55 MC: 7 BSCG 0 / 51 ASCG 35 / 38 MC: 10
Location: comp(14719..19959)

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Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase {ECO:0000256|RuleBase:RU004279}; EC=2.7.7.6 {ECO:0000256|RuleBase:RU004279};; TaxID=578454 species="Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3507
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit A' (EC:2.7.7.6) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 46.3
  • Coverage: 887.0
  • Bit_score: 728
  • Evalue 4.40e-207
DNA-directed RNA polymerase n=4 Tax=Candida parapsilosis RepID=G8BEH9_CANPC similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3507
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Candida parapsilosis → Candida → Saccharomycetales → Saccharomycetes → Ascomycota → Fungi

Sequences

DNA sequence
Length: 5241
ATGAGTAGAACATTTCCGTTTTCAAATGCCCCCCTCCGTTCAGTCAAAGAAGTCCAGTTTGGTTTGCTATCCCCTGAGGAAGTAAGGGCCATATCTGTTGCCAAGATTGAGTATCCGGAAACAATGGACCAAGCAACCAAAAGACCTCGTGAAGGTGGTCTCAATGATCCAAGATTGGGCTCGATCGATAGAAATTTCAAATGTCAAACTTGTGGCGAGGATATGGCTGAGTGTCCAGGTCATTTTGGACATATAGAGTTGGCCAAACCTGTATTCCATATTGGGTTCATTGCCAAAATTAAAAAAGTCTGTGAATCCATTTGCATGCATTGTGGGAAGTTACTATTGGACGAACTGAATCCGTTAATGGCACAGGCGATTAAGATCAGAGACCCTAAAAAGAGATTTAATGCCGTTTGGAGTATATGTAAGAGTAAAATGGTTTGTGAGACAGCCACCAGCGAGGAAGAGATGAATGATCACAATGTCAGAGGAGGCTGTGGACACACACAACCAACCATCCGTAGGGATGGACTAAAGTTGTGGGGAACTTGGAAACACAATAAAAACTTTGAAGAGAATGATCAACCTGAACGTCGTTTATTAACGCCTTCTGAGATTCTCAACGTGTTTAAGCATATCAGTCCAGAGGATTGTTATAGATTGGGATTCAATGAGGACTATGCTAGGCCCGAGTGGATGTTGATCATTGTTTTGCCAGTGCCACCCCCACCAGTAAGGCCATCTATTGCGTTCAACGACACGGCCAGGGGAGAGGATGACTTGACGTTCAAGTTAGCTGATATAATAAAAGCCAACATAAATGTCCAACGTTTGGAAATTGATGGTTCTCCGCAACATGTCATTAGTGAGTTTGAAGCATTGCTTCAGTTTCACGTAGCCACTTATATGGATAATGATATTGCAGGACAACCACAAGCGTTGCAGAAAACGGGAAGACCAATCAAGTCAATTAGAGCAAGGTTGAAGGGTAAAGAAGGGAGGTTGAGAGGTAATTTAATGGGGAAAAGAGTGGATTTTTCGGCCCGTACAGTCATCTCTGGTGATCCTAATTTGGACTTGGATCAAGTTGGTGTTCCAATATCAATTGCCAAGACCTTAACCTATCCCGAAATAGTAACACCATACAACATTCACAAATTGACTGAATTGGTGAGAAACGGACCAAATGAACATCCTGGTGCAAAGTATGTGATTAGAGATACCGGAGATCGTATTGATTTGAGATACAACAAAAGAGCAGGTGACATCGCTTTACAATATGGGTGGAAAGTTGAGCGTCATTTGATGGACGATGATCCAGTCTTGTTCAACCGTCAACCATCATTGCATAAAATGTCTATGATGGCGCACAGAGTGAAGGTTATGCCATATTCTACATTCAGATTAAACTTGTCAGTAACTTCACCGTATAATGCCGATTTCGATGGTGACGAAATGAACTTGCATGTACCTCAATCGCCAGAAACTAGATCCGAGTTGTCACAAATTTGTGCTGTTCCTCTTCAAATTGTGTCGCCACAATCTAACAAGCCAGTCATGGGTATCGTGCAGGACACGTTGTGTGGTATTCGAAAGATGACCTTGAGAGATATTTTCATAGAGTATGATCAGGTGATGAATATGTGTTATTGGATCCCTAATTGGGATGGTGTTATCCCACCACCAGCAATAATTAAACCAAAACCCTTGTGGTCGGGAAAACAAATGTTGTCGATGGCTATACCAAAGGGTATCCACATTCAAAGATTTGATGGTGGAAGAGATTTATTAAGTCCGAAGGATACTGGTATGTTGATTGTGGATGGTGAAATCATGTTTGGTGTTGTTGATAAAAAGACCGTAGGTGCAACCGGTGGTGGTTTGATTCACACAGTAATGAGAGAAAAGGGGCCTCAGGTTTGTGCTCAGTTGTTTAGTTCGATTCAAAAAGTGGTCAATTTTTGGTTGCTACACAACGGGTTCAGTATTGGTATTGGGGATACTATTGCCGATGCCAGCACCATGAAGGACATTACGAAAACAATTCAAGAAGCTAAGCAAAAAGTGCAAGAGATTATTCTTGACGCCCAACACAACAAATTAGATCCAGAACCAGGTATGACATTGAGGGAATCTTTCGAACACAATGTCTCTCGTGTATTGAATCAAGCACGTGATACCGCTGGGCGTTCAGCCGAGATGAGTTTGAAGGATTTGAATAATGTGAAACAGATGGTTACTTCCGGTTCCAAAGGTTCTTTTATCAATATTTCACAAATGTCGGCGTGTGTTGGTCAACAAATTGTGGAGGGTAAGAGAATTCCTTTTGGTTTTGCCGACCGTTCCTTACCTCACTTCACTAAAGATGATTATTCTCCAGAATCAAAGGGTTTTGTTGAGAACTCGTATTTGAGGGGTTTAACTCCACAAGAGTTTTTTTTCCATGCAATGGCAGGGAGAGAAGGTCTTATTGATACCGCCGTCAAGACCGCAGAGACTGGTTATATTCAACGTCGTTTGGTCAAAGCTTTGGAGGACATCATGGTGCATTACGATGGTACTACTAGGAACTCATTGGGTGACATTATCCAATTCATCTATGGTGAAGACGGTATAGATGCGACACAGGTTGAAAAGCAATCTGTTGATACAATCCCAGGATCTGATGCAAGTTTTGAACGCAGATACAGAATCGACTTGTTGGAAAAGAATGGCTCAATTTCGGAGTCATTGTTGGAATCAGGCAAAGAAATTCAGGGTGATGTCAAGTTGCAAAAATTATTGGATGAGGAGTATAATCAATTGCTCAAGGATAGGAGGTACTTGAGAGATGTTTGTTTCCCCAATGGTGACTTCAGCTGGCCATTGCCAGTGAACTTGCGTCGTATTATCCAAAATGCACAGCAAATTTTTCACAATGGTCGTTACAAGGCATCGGACTTGAGATTGGATGAAATTGTCAATGGTGTACGTGATTTGTGTACAAAGTTGTTAGTTGTCAGAGGTAAAACTAAATTGGCAAAAGAGGCACAAGAGAATGCTACTTTGCTATTCCAATGTTTGGTAAGATCAAGGTTGGCTGCGCGAAGAGTCATTGAAGAATTCAAGTTGAACAGGTCTTCTTTTGATTGGGTTTTGGGTGAAATTGAGACACAATTCCAGAAATCTATTGTCCACCCCGGTGAAATGGTTGGTGTTGTTGCTGCGCAGTCTATTGGTGAGCCGGCTACTCAAATGACATTGAATACGTTCCATTATGCCGGTGTTTCATCAAAAAATGTCACTTTGGGTGTTCCAAGACTTAAGGAAATTTTGAACGTTGCGAAGAATATCAAAACCCCAGCATTGACTGTGTATTTGGATCCAGAGGTAGCCTCGGACATTGAATTGGCCAAGATTGTTCAATCTTCGATTGAGCACACTACTTTGAAGAATGTCACTTCTTCGACAGAGATCTACTACGATCCAGATCCAAGAACCACAGTTATCGAAGAGGATTATGATACCGTTGAGGCATATTTTGCTATTCCCGATCAAAAAGTTGAGGAAAGCATCGAGAAACAATCGCCATGGCTATTGAGATTGGAGCTCGACCGTGCCAAGATGTTGGATAAACAATTGACAATGGCCCAGGTTGCGGAAAAGATTTCGCAAAACTTTGGTGAAGATTTGTTTGTTATTTGGTCAGACGATACTGCTGACAAGTTGATTATTCGTTGTAGAGTGGTTCGAGATCCAAAAACCTTGGACGAGGATGCCGATGCGGAAGAGGATCAAATTTTGAAACGTATTGAGGCTCATATGTTGGAGTCTATTTCATTGAGAGGTATTCCTGGTATCACAAGAGTGTTTATGATGCAACACAAGGTGAGCAAGCCAGATGAGACCGGTGAGTTTAAACAAGGTAAAGAGTGGGTGTTGGAAACCGATGGTGTGAACTTGGCCGATGTTATGGCAGTTCCCGGTGTTGACTCAGCTCGTACTTATTCCAATGACTTTATTGAAATTTTGTCGGTATTGGGTATAGAAGCTACTAGGTCTGCTTTGTACAAAGAGATTTTGAATGTTATTGCATTCGATGGTTCTTACGTCAATTACCGTCATATGGCGCTTTTGGTTGATGTGATGACATCGCGTGGTCATTTGATGGCCATTACTCGTCATGGTATCAACAGATCTGATACAGGTGCTTTGATGCGTTGTTCTTTTGAGGAGACTGTTGAGATTTTGTTGGATGCCGCAGCCGCTGCCGAGTTGGATGATTGCAAGGGGATTTCAGAGAATGTTATGTTGGGACAAATGGCACCATTGGGAACCGGTGCATTTGATGTTATGGTTGACGACAAAATGTTGCAACTGGCCCCAACTAATGTCGCGATGGAGGTTATTGCCGACGATGGCGGAGCTACTCCTTACAGGGAAGCTGAAATGCAAGATGATAGGATTCAAGTTGATGAAAGTGCTGGTTTTTCTCCTGTTCATCAAGCACCAACAGCAGAAGGTATGAACGGAGGCTTGACTTCTTATGGAGGGCAACCAACCTCACCAAGTGCCACTTCTCCATTCAGTTACTCAACTAGTCCAAGCTATGGAGGAACAAGTCCAGGCTATGGTGGCACCAGCCCAGGGTATGGTTACTCGCCAACATCTCCAAGCTACTCACCAACATCTCCAAGTTACTCACCTACTTCCCCAAGCTACTCACCAACATCCCCAAGCTATTCACCAACATCCCCATCTTACTCACCTACATCTCCATCTTACTCACCTACGTCTCCAAGCTACTCGCCAACATCTCCAAGTTACTCACCTACATCACCAAGCTATTCACCTACGTCTCCATCATACTCACCTACATCTCCAAGCTACTCACCTACATCTCCAAGTTACTCGCCAACATCTCCAAGTTACTCACCTACATCTCCAAGTTACTCACCTACTTCCCCAAGCTACTCACCAACATCCCCAAGCTACTCACCAACATCCCCAAGCTATTCACCAACATCCCCATCTTACTCACCTACGTCTCCATCTTACTCACCTACGTCTCCAAGCTACTCACCTACATCACCAAGCTACTCACCTACGTCTCCATCTTATTCACCTACATCACCAACGTATTCTCCTACGTCCCCGCAGTACTCACCAACGAGTCCTCAGTACTCGCCAACTTCTCCAAGCTACTCTCCTGGATCTCCAGGCTATAACCCTGAATCACCCAAGAAAGAAGAGAAGTAA
PROTEIN sequence
Length: 1747
MSRTFPFSNAPLRSVKEVQFGLLSPEEVRAISVAKIEYPETMDQATKRPREGGLNDPRLGSIDRNFKCQTCGEDMAECPGHFGHIELAKPVFHIGFIAKIKKVCESICMHCGKLLLDELNPLMAQAIKIRDPKKRFNAVWSICKSKMVCETATSEEEMNDHNVRGGCGHTQPTIRRDGLKLWGTWKHNKNFEENDQPERRLLTPSEILNVFKHISPEDCYRLGFNEDYARPEWMLIIVLPVPPPPVRPSIAFNDTARGEDDLTFKLADIIKANINVQRLEIDGSPQHVISEFEALLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKTGRPIKSIRARLKGKEGRLRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLDLDQVGVPISIAKTLTYPEIVTPYNIHKLTELVRNGPNEHPGAKYVIRDTGDRIDLRYNKRAGDIALQYGWKVERHLMDDDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVMPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNLHVPQSPETRSELSQICAVPLQIVSPQSNKPVMGIVQDTLCGIRKMTLRDIFIEYDQVMNMCYWIPNWDGVIPPPAIIKPKPLWSGKQMLSMAIPKGIHIQRFDGGRDLLSPKDTGMLIVDGEIMFGVVDKKTVGATGGGLIHTVMREKGPQVCAQLFSSIQKVVNFWLLHNGFSIGIGDTIADASTMKDITKTIQEAKQKVQEIILDAQHNKLDPEPGMTLRESFEHNVSRVLNQARDTAGRSAEMSLKDLNNVKQMVTSGSKGSFINISQMSACVGQQIVEGKRIPFGFADRSLPHFTKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMAGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDGTTRNSLGDIIQFIYGEDGIDATQVEKQSVDTIPGSDASFERRYRIDLLEKNGSISESLLESGKEIQGDVKLQKLLDEEYNQLLKDRRYLRDVCFPNGDFSWPLPVNLRRIIQNAQQIFHNGRYKASDLRLDEIVNGVRDLCTKLLVVRGKTKLAKEAQENATLLFQCLVRSRLAARRVIEEFKLNRSSFDWVLGEIETQFQKSIVHPGEMVGVVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSSKNVTLGVPRLKEILNVAKNIKTPALTVYLDPEVASDIELAKIVQSSIEHTTLKNVTSSTEIYYDPDPRTTVIEEDYDTVEAYFAIPDQKVEESIEKQSPWLLRLELDRAKMLDKQLTMAQVAEKISQNFGEDLFVIWSDDTADKLIIRCRVVRDPKTLDEDADAEEDQILKRIEAHMLESISLRGIPGITRVFMMQHKVSKPDETGEFKQGKEWVLETDGVNLADVMAVPGVDSARTYSNDFIEILSVLGIEATRSALYKEILNVIAFDGSYVNYRHMALLVDVMTSRGHLMAITRHGINRSDTGALMRCSFEETVEILLDAAAAAELDDCKGISENVMLGQMAPLGTGAFDVMVDDKMLQLAPTNVAMEVIADDGGATPYREAEMQDDRIQVDESAGFSPVHQAPTAEGMNGGLTSYGGQPTSPSATSPFSYSTSPSYGGTSPGYGGTSPGYGYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPTYSPTSPQYSPTSPQYSPTSPSYSPGSPGYNPESPKKEEK*