ggKbase home page

rifcsphigho2_01_scaffold_53972_3

Organism: RIFCSPHIGHO2_01_FULL_Archaea_Woesearchaeota_29_27

partial RP 37 / 55 MC: 8 BSCG 7 / 51 ASCG 30 / 38 MC: 2
Location: comp(759..2810)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PGAP1 family protein id=5799748 bin=GW2011_AR15 species=GW2011_AR15 genus=GW2011_AR15 taxon_order=GW2011_AR15 taxon_class=GW2011_AR15 phylum=Archaeon tax=GW2011_AR15 organism_group=Woesearchaeota organism_desc=One curated contig, not circularized similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 33.2
  • Coverage: 725.0
  • Bit_score: 388
  • Evalue 1.50e-104
PGAP1 family protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 34.5
  • Coverage: 119.0
  • Bit_score: 66
  • Evalue 2.80e-08

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

archaeon GW2011_AR15 → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 2052
ATGGTAGATGTTGGTAAAGAGATAATTGAACAAATAGAGAATCATAAAAAGAGGAATAGATGGATTATATTTTTGATTTCCGTTGGAGTTATTGTTTTAATTTTACTTATAATATTAGGTATTAGAATAAATTTTATAATAAATGATGAGTTAAATATTAAATTAAGTCCTCTGGATAGGAATATTATAACAACTTATGATAAACAAAATAATATAACATTTGAGTTTATTAATGATAATAGTTTTTTATGTAAGTCTAGTTGTACATATAGCTTTACTGATTTAAGTAACAACAAGGTTTTAGAAGAAGGAGATCTAGTTTTAAGGTCAAAGAGTAAAGTTGTTAAAAGCTATAATTTAACGCCATCAAATTATGGGGCGGGTCAGGAAATATTTTTATTTCAGGTTACTTGTAACAATATAAAATCGGTAGTATGTGGGACTGATGGTCAGGAAAGGTTTAAATCGTCATTTGTAACTTTAAGTTATGATTTAAGTGAGGAGGAAAGAGCTAGAGTTTTAAAGATAAATGATGACTTAAATAGTTTCCTTGAAATTTTAAAGATTGTAGATATTAAAAGACAAGAAATTAATTATCTATTTGAAAGATCTAACCTTAAATTAAAAGACACTTTGTTCTTCGATGATTTAGATTTGTTTAATAATGACCTCTTAATAATTGGCGACTATTTTAGTGATTTATTTAATAAAAGTAAATATATGATAAATTTATGGGATGATGATAACTATGTTCCTTTATCAATTATACTAAATGATTCTAGCAGCAATATAAGCTTAGTTTATAATAAAATTAACTATTCAGAAATTAAGTTATTTGATTTAATTGATAATTATAACAGTTTAGCTTATGATTTAAACAGTCTAAGTGATAGATTTCTAGTTATAGACTCCCTAATCGAGTATTACAACTTAAGCAATAATACTGTTGCTCTACAAGAAGTTATTAACATTAAGACTGAATTTGTTAAATTAAATTATAGTTATAATAATAAAAATAATGATTTTACTTCTTTTAAGAATGAAATTAGTAAATTGTCTATAGGGCTATTTGAATTCACAAATATTTCTAATATTAATCTTTTGAACTTAAATTATTCTTATAAATTAAATTATAGTTATATAGATACAAATTCGAGTATAAACTTTAATTCAAGTGTATCTATAAATATTAAAATTAAAGAACCAATTTGCTGCGTTTTTGGAAGTTGTAAAGTTTGCTGTACTATTAATACTTGTAAAAACGACCCTAGTTTATATCCTATTTTATTTGTTCATGGCCATGCCTTTAACAAAAAAACAAGTCCTGAAGTAAGTTTAAACTCGTTTACTAAAATGCAAAATAGACTACAAGAAGAAGGAATAATTAATGCTGGACAAATTGACATTCAAAACTTAGAGGAGATTACTCCTGGAGAATATGGGAAGAGCGGAAATCCTATAAGTGTTAGAGGGAGTTATTATTACATACATTATTATGATCTTGGTAAATATGCTATTACAACACAGAAAAGTGAGAGAATTGAGAATTACGCCTTGAGATTAAGTGAAATTATTAATATATTAAAAGAAAGAACTGGAAGTGAGAAGGTAAATATAATTGCTCATTCTATGGGTGGATTAGTTACTAGGGAATATATCAGAATATTTGGGGATAATTCTGTAAGTAAAGTTATTTTGATAGCCTCACCTAATAATGGTATAAGTGGCAGGACTAATGACTTATGTGATTTTCTTGGTAGTAAAAAAGAATGCGAGGATATGACTGAGGGAAGTGTATTCTTAAAGAGGTTAAATAATTCTAAAATACAGAATGCAAGAGTTTACACCATTGCAGCTAGTGGGTGTTCAGTTAATAAAGAAGATGGTGATGGGGTCGTTAAATTAAAAAATGTTCCATTATCTTATGCTACCAATTTTGTTGTTAATGGGACTTGTACAGATTTCTTTAAGGTTAACCTACATGACACTATTTTAGACCCTGACAAAACTCCGGAAGTTTATGATATTGTGAAGGAAGTGTTAAAGGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 684
MVDVGKEIIEQIENHKKRNRWIIFLISVGVIVLILLIILGIRINFIINDELNIKLSPLDRNIITTYDKQNNITFEFINDNSFLCKSSCTYSFTDLSNNKVLEEGDLVLRSKSKVVKSYNLTPSNYGAGQEIFLFQVTCNNIKSVVCGTDGQERFKSSFVTLSYDLSEEERARVLKINDDLNSFLEILKIVDIKRQEINYLFERSNLKLKDTLFFDDLDLFNNDLLIIGDYFSDLFNKSKYMINLWDDDNYVPLSIILNDSSSNISLVYNKINYSEIKLFDLIDNYNSLAYDLNSLSDRFLVIDSLIEYYNLSNNTVALQEVINIKTEFVKLNYSYNNKNNDFTSFKNEISKLSIGLFEFTNISNINLLNLNYSYKLNYSYIDTNSSINFNSSVSINIKIKEPICCVFGSCKVCCTINTCKNDPSLYPILFVHGHAFNKKTSPEVSLNSFTKMQNRLQEEGIINAGQIDIQNLEEITPGEYGKSGNPISVRGSYYYIHYYDLGKYAITTQKSERIENYALRLSEIINILKERTGSEKVNIIAHSMGGLVTREYIRIFGDNSVSKVILIASPNNGISGRTNDLCDFLGSKKECEDMTEGSVFLKRLNNSKIQNARVYTIAASGCSVNKEDGDGVVKLKNVPLSYATNFVVNGTCTDFFKVNLHDTILDPDKTPEVYDIVKEVLKE*