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bjp_ig2158_scaffold_8157_3

Organism: BJP_Ig2158_Hor_250_2014_Bacteroidetes_37_5_partial

partial RP 36 / 55 MC: 4 BSCG 34 / 51 MC: 2 ASCG 5 / 38
Location: comp(1651..4086)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Collagen triple helix repeat-containing protein n=1 Tax=Fluviicola taffensis (strain DSM 16823 / RW262 / RW262) RepID=F2IGP8_FLUTR similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 46.6
  • Coverage: 421.0
  • Bit_score: 328
  • Evalue 1.70e-86
  • rbh
Collagen triple helix repeat-containing protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 49.4
  • Coverage: 581.0
  • Bit_score: 476
  • Evalue 9.00e-131
Collagen triple helix repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 46.6
  • Coverage: 421.0
  • Bit_score: 328
  • Evalue 4.70e-87

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2436
TTGTTGCATTTACAAGGACCCAACAACACCACCTTTGGCTTTGGTGGAGGTTGGAGAAGATGGATGAGTACAGGTATTTTTATTGGCGAACATTCCGATGGAATGTATGTGGGCATGAAGCCTGTTGTTGGCACCACCAACAGAAGTAACGCAGTAATTAATTGGAACGATGATCCGTTTGCCGGAGTAGTTGATAAACTAAGCTTTGTGTTTACACAAGCTAATAATGGTAATGGAACAGGAACAAACCCTATTAATTCTAACTCTTTGCAGGGGTATGAATTTATGTTATTAGCACCTTCAACAACTGTTTTTAATAGTCAAGGAACTGGCGAGGGTACTATTGGTGTTGGTCCAGTATTTACCGATGCTGCACCGCCACAAAGTCGTTTGCATATCAATGCCGAAGAAAGAATGAACAACTGGCTGCAAATATCCAATCAAACTGGTACAGGGCAATTAGCTAGTGATGGTTTACGTATAGGAATTAATGGCGACAACAATACCAACGTAAACGGTAATGCTCTAATTTACAACCAAGAAACAAGGCATTTGCTGTTTTCTACTGCGAACAACACCAACTTTGTAAACATAGCCAACGGTACAACCCTAGAACGGATGCGGATAACTTCTATTGCAGCACCAACAAACTTAGCAAGTGGAGGTTATGGTGTTTTTAATCCTGCTAATTTAAGCGGCAATTTAACCCGAGTAGCCATAAGCCATAATCCCAACAGCCCAGTAACTCGTCCGTTAAGTTTATTGCATTTGGGTTACAATACAGGTTTGGTAGGGTTTACACCAACATCAACCGATGGTTGGAGAAACTGGATGGACATAGGCACTTTTACCAATAACGGCACAGATAACATGTATGTTGGTTTAAAACAAGAAGCAGGCGCTTTTCCGGCAAACGATAAAAACGATGCCGTAATTAACTGGGGCGATAATGATGCAAGCAGTCCTTTAAACGGCCCCGATAATTTGCGGTTTATTTTTACCTCCACCACCACAGGAGCAGGAAACTCACCAGCCAATACCAACAACGGTTTAGAAGTAGCCCGAATGGTGCCTGCTTTAGCCACAACCCTACCCGCTCCCAATTTTGGCATGGTAGGTATAGGTAATTTTGCTCCCTCAGGACTTAATACTGGACCTGCTGATGTAGTAAACGCCAAGTTAGATATTGATGGCGATTTACGTATTAGAACGGTAACACAAGATTCTAACTTGTTGCAAGTATTGGTAATTGATAGTAATGATAAAAACAGAGTGCATTGGAGAAATATTAATTCTTTTAGTTTAGGAAATTTTTGTTCAGACCCTCAAAACCCAATAACGGATAATTATGAAATACCTTTAAATAATTTTAATTACCATTTCACTGGACAAGGTACAGCGAAAACAAATGTAGGTATTGGGCTTACTTGTGCAACAACTCCTCTAGGTAAATTACATGTGGTTCAAACAGCAAATAATACACTCCTTACTTCCACATTTGGTATAAGTGTTGCTGGTAGATTTGATAATTTAATTACTACTCAGTCTATCGCTGTTGGAGTAATGGCTAATGCTCAAAGTAACAATCCGAATTCAATAAATATAGGTGTTTGGGGTTCTGCACCCACTGGCACGACCAATTTCGCAGGATTTTTTGATGGAAATGTTCAAGTAAACGGAAGCATTAATGCAACAGGAACAATTACCCCTTCCGACCAACAATTTAAACAAAACATACAACCCCTTTCAAATGCAAGCACATTGCTTTCGCAATTAGCCCCAAAAACGTTTAATTTCGATTCAACCAATTTTATAGGCTTTAACTTTGACACTAAAAATCACATGGGGTTAATTGCACAAGAAGTTAGTAATGTATTTCCTAATCTAGTTAAAGAAAGCATTTTACCTGCAGAATATGATACCTTAGGCAACCAAATTAGTGCAGCAGTAAACTACAAAAGTTTAAATTACCAAGAACTTATTCCTTTGTTAATTGCAGGTTTTAATGAGCAACAAACCGTTTTAAACAACAAAGATTCTATTATTGATAACTTAGAAACCCGCTTAGCAACCCTAGAAGCGTGCATTAACCAAACAGGCATCTGCAACAACCATGGCGGCAATGGGCAAGATAACCACAAAGAAAACAACCAAACCGTTACCTTGCAAAACACCAACGCCATTGTGTTAGACCAAAACTTACCTAACCCTTTTGCTGAAAGCACACAAATTAACTACGTTATCCCTGCCGATGTGCAAAAAGCTACTTTGCTATTTTACGATATGAATGGCAGAATTATTAATGAGGTAACTATTAACGAACGAGGCAATGGCTCACTTACCGTTTATGGTGCAAACCTCGAAAAAGGGATTTACACTTATTCGCTTATTGCTGATGGTAAATTAATTGCCACTAAAAAAATGGTGAAAAAGTAA
PROTEIN sequence
Length: 812
LLHLQGPNNTTFGFGGGWRRWMSTGIFIGEHSDGMYVGMKPVVGTTNRSNAVINWNDDPFAGVVDKLSFVFTQANNGNGTGTNPINSNSLQGYEFMLLAPSTTVFNSQGTGEGTIGVGPVFTDAAPPQSRLHINAEERMNNWLQISNQTGTGQLASDGLRIGINGDNNTNVNGNALIYNQETRHLLFSTANNTNFVNIANGTTLERMRITSIAAPTNLASGGYGVFNPANLSGNLTRVAISHNPNSPVTRPLSLLHLGYNTGLVGFTPTSTDGWRNWMDIGTFTNNGTDNMYVGLKQEAGAFPANDKNDAVINWGDNDASSPLNGPDNLRFIFTSTTTGAGNSPANTNNGLEVARMVPALATTLPAPNFGMVGIGNFAPSGLNTGPADVVNAKLDIDGDLRIRTVTQDSNLLQVLVIDSNDKNRVHWRNINSFSLGNFCSDPQNPITDNYEIPLNNFNYHFTGQGTAKTNVGIGLTCATTPLGKLHVVQTANNTLLTSTFGISVAGRFDNLITTQSIAVGVMANAQSNNPNSINIGVWGSAPTGTTNFAGFFDGNVQVNGSINATGTITPSDQQFKQNIQPLSNASTLLSQLAPKTFNFDSTNFIGFNFDTKNHMGLIAQEVSNVFPNLVKESILPAEYDTLGNQISAAVNYKSLNYQELIPLLIAGFNEQQTVLNNKDSIIDNLETRLATLEACINQTGICNNHGGNGQDNHKENNQTVTLQNTNAIVLDQNLPNPFAESTQINYVIPADVQKATLLFYDMNGRIINEVTINERGNGSLTVYGANLEKGIYTYSLIADGKLIATKKMVKK*