ggKbase home page

rifcsplowo2_01_scaffold_30779_1

Organism: RIFCSPLOWO2_01_FULL_Archaea_Pacearchaeota_33_25

partial RP 33 / 55 MC: 7 BSCG 16 / 51 ASCG 28 / 38 MC: 2
Location: comp(1..3039)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Lytic murein transglycosylase Tax=CG_Pacearch_03 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 35.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 579
  • Evalue 1.20e-161

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

CG_Pacearch_03 → Pacearchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 3039
ATGAGGAAATTATTATTATTTGCTTTAGTTTTGTTTTTATTTACTTTTATTAGCGCTCAAGTTGTAACTGAAAATAGATTTTCTGGAAATAGAGGAGGCACAGCAAGTTATATTAACTATGGAAGCAGTTTTACTTCGTATTATGGCGCTGAAGCCAGCACTTATTGGCCTGTTCTTTCAAATAGAGATGAATGCACAAATAGTCAAGATATAATTGTTCAGGTTTCTCCTGTTGGATGTCAGCCTGCGGTTGTTCGAAGCGATTTATTGGCGGAACAGAATGTTCCTGTTTTTTGTCAACTTGATTTGTTGCAGATTAATCCTGCAATAGATATTAAACAGATTAGAAATTTACGTTTTAGCGGACGTTATCCGCCTGAAGTTGCCGGGGTTGGGTTTCATCCTGCAAGAGCTGCTTTAAGGACGACTAATCAACTTCTTGGAAGTCCTTTGGAAAGCAACATAGGATATGTTGTTGTTGTTTTGAAGAGAAATATTAATGAAACGAGCATGCCCAAATTCTTTAATTTTACACTTTCTGCTAGTGTTGATTATTATTCTGGAAATTCTGTTGGGATAGGAGTTAGTGAGATGTTATTACAAGAGACTGCAGATAAAGATTGGGAACTTGCTAAACGCAAACAGACATTTTTTGGAGGGAAGTTTTCAGTCAGGGTTAAAGATGTGGATACTAATTCAATTGGAGTGGAACTTTATTCTGGAGATTTAAAATATTCTGAATTAACTTTAAGAAAAAACCAACCGCAGTCTAACTCTGTTTATCTTCCCGGGAGTTATTGTCAGACTTCTCTTCAGTTAAGTTATTCTGATTTTGTTTCGCCTCCAGTTATTGCAAGACTTAAAGTAGATAATGATGTTCTTGATTTGTATGAAGGTTCTAGGTTTTTGAATAATAAGTGCCTTGTACGTAAAGTTTCTGGTAGTTCTACTAAAGGCGAAGTAGATATTAGTTGTGGAAAAGAGACTTTGAATTTGAGGACTGGCGCGCAATTGCTTAAAGTTGGGGATAAGGTATATATGGTTGGAGGTGATTTGAAGGTTATTAAAGATAAGGAATATTCTATTGATAAAGTAATAAATGATTTAAAAACTGGTAAGTTATCTTATGAAATTAAATCTGGCGAGACTAACGCTAAGTCTGAGCCAGTTGATTTCGATAAAGTAAGGCTTGTTAGTCAAGCCAAATTATTTGATTCTGACTATGGAGAAAATGAGCAGTATATATTAAATGCGACTGAATATTATGAGTTGCTTGCTGATTCTTATGGCAATGAGAAGAATGGTCCTTTGGCAGAGTCATATGGTGAGACTGCTTTGAGCAGGGCGATTCGTTTATCTAATGATTGGGGAAAGAAAAATAATGCTGTTAGATTGATAAATAAATATTTGGATTTATATCCTAATGGTAAAGATTCTGTTGAGTTTACTGGTATTTTGAATGATATTTATACGGTTGATAGTTCATTGGCTGGGCAGGGTGTTGAAACTGAAGATGGTTTTCATTTGATAAGACTTATAGATATTACAAATTCTGGAAAGAAGTCTAGCGCCAAGATTAGTTGGGGAAATGAAGAGGAGGTTGTTAATCAGGGAGGGACTTTTGAAACTAGTTTAGGTAAATTAGGATTGGTTTCAGTTATTGATTCTGAAAAGATTAAAGTTAATATTATCTGTAAATCTGCTAATGCTGGTAAAGATTATGAAATTAATTCAAGAGATACTACTAAAATTAGTGATTGTGGTGGACCTATTCGCGTTTCAAATATAGACTGGCAGAATTTTGTTAAATTAACTATTTCTCCTATTACTCGAAGTAGCACTGTTGGTAATTTTACTGTCGGAATTGGAATTGAGAAGAGAGCTATTGAGCTTACACCAGAAAAAGCTAAGAAGAAGATTGAAAATTTGAATAAGACAATTAAGAAATGGGAATCTATTTCTAATAGTTTAGGGAATGTTGTTCGCGGGTTGAAGGGAGCTTGTTTTGCTACTGCAGGTGTTTTGATAGTTAAGAATTTCGTTACTGGTTTGGGCGGTGAATCTCTTGCTCGTCGTGATGCAATGTCTGGAGATAATGGATGGACCAAGATTTGTCAGGATGAGGTCAATAATAAAAAAGAAGGTTCATTGACATTGACGCAGTGTTATAATACTCATTCTGAAGATATAAAGAAAAGTGTTGATGCAAGAGTTAAAGCAATTAAGAAGACTGGCGAAGTTACTTCTGAAATAGAAAATAGAGCAGGTATAAAAAATCCTAGTCGTGAAGGGATTTTTGCAGGAGATTCTTTTAACGACGTTGAAGCACGAAAGGCGTTGATTGATAAGATTAAAAGGGATTGTGGAACTAAGACATTTACAATTGGGATCGAACAGAGAACTGTGGATAGTTTATTACCCACTGCTTCTACAATTACGGATGAAAATGCAAAACAGTATAGTTATTCTCAACTTAGAGATATTTATTACAATTGTCAGATAATTGATAATAAAGGCAGTAGTCAAGGAACTAAGAAAGCTGAGACAGATTTATCTGTTATTGGGAAGTCTGTTGATGAGAGATTGAGATATGAGAAAGACGTTACTCAATATAATGGTATTGGTTTGTACACTCTTGATGTAGGTGTTAAGGGAACTTATTCAGGTGAAACTGCTAAGACTTTAAGGAATAAAGGGTTTGACATTCCTCTAGGGATTGGCAATGATGTTTTTGTACAGGTTGTTAGGGGGAGAGATAAACCTTATTTAATTACTCTTGATAAAAATACTGCAGGTTATCAAAGAAAAGATATCTATAGTTTAGATGATAAAACTGTTGGATCGAAGTTGAATATTTTAACTTCTACTCTTCCTAGTGGAGGTCAGACTGATTTGACTGGATTGCCAAGTACTTTTGATTTAGTTAATTCTGGTAGTTATTATAATTCATTTGCTCCTGGTGAAAGCACCGTTAGGTATTTTGAAACTGAGCCTTACAAAGGAACGCCTGCTGTTGTGCCTTTCGATTTAAATAGAGGG
PROTEIN sequence
Length: 1013
MRKLLLFALVLFLFTFISAQVVTENRFSGNRGGTASYINYGSSFTSYYGAEASTYWPVLSNRDECTNSQDIIVQVSPVGCQPAVVRSDLLAEQNVPVFCQLDLLQINPAIDIKQIRNLRFSGRYPPEVAGVGFHPARAALRTTNQLLGSPLESNIGYVVVVLKRNINETSMPKFFNFTLSASVDYYSGNSVGIGVSEMLLQETADKDWELAKRKQTFFGGKFSVRVKDVDTNSIGVELYSGDLKYSELTLRKNQPQSNSVYLPGSYCQTSLQLSYSDFVSPPVIARLKVDNDVLDLYEGSRFLNNKCLVRKVSGSSTKGEVDISCGKETLNLRTGAQLLKVGDKVYMVGGDLKVIKDKEYSIDKVINDLKTGKLSYEIKSGETNAKSEPVDFDKVRLVSQAKLFDSDYGENEQYILNATEYYELLADSYGNEKNGPLAESYGETALSRAIRLSNDWGKKNNAVRLINKYLDLYPNGKDSVEFTGILNDIYTVDSSLAGQGVETEDGFHLIRLIDITNSGKKSSAKISWGNEEEVVNQGGTFETSLGKLGLVSVIDSEKIKVNIICKSANAGKDYEINSRDTTKISDCGGPIRVSNIDWQNFVKLTISPITRSSTVGNFTVGIGIEKRAIELTPEKAKKKIENLNKTIKKWESISNSLGNVVRGLKGACFATAGVLIVKNFVTGLGGESLARRDAMSGDNGWTKICQDEVNNKKEGSLTLTQCYNTHSEDIKKSVDARVKAIKKTGEVTSEIENRAGIKNPSREGIFAGDSFNDVEARKALIDKIKRDCGTKTFTIGIEQRTVDSLLPTASTITDENAKQYSYSQLRDIYYNCQIIDNKGSSQGTKKAETDLSVIGKSVDERLRYEKDVTQYNGIGLYTLDVGVKGTYSGETAKTLRNKGFDIPLGIGNDVFVQVVRGRDKPYLITLDKNTAGYQRKDIYSLDDKTVGSKLNILTSTLPSGGQTDLTGLPSTFDLVNSGSYYNSFAPGESTVRYFETEPYKGTPAVVPFDLNRG