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rifcsphigho2_12_scaffold_9553_3

Organism: RIFCSPHIGHO2_12_FULL_Archaea_Woesearchaeota_30_20

near complete RP 32 / 55 MC: 5 BSCG 18 / 51 ASCG 31 / 38
Location: 371..1993

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Sodium/hydrogen exchanger {ECO:0000313|EMBL:KHO51750.1}; TaxID=1579375 species="Archaea.;" source="archaeon GW2011_AR17.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 45.2
  • Coverage: 522.0
  • Bit_score: 435
  • Evalue 1.20e-118
sodium/hydrogen exchanger id=5043948 bin=GW2011_AR4 species=GW2011_AR4 genus=GW2011_AR4 taxon_order=GW2011_AR4 taxon_class=GW2011_AR4 phylum=Archaeon tax=GW2011_AR4 organism_group=Woesearchaeota organism_desc=gwa2_.45_18 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 39.3
  • Coverage: 532.0
  • Bit_score: 401
  • Evalue 1.70e-108
Transporter, CPA2 family similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 37.5
  • Coverage: 530.0
  • Bit_score: 373
  • Evalue 8.40e-101

Lists

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Notes

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Taxonomy

archaeon GW2011_AR17 → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 1623
ATGGTGTTAGAAAGTTTAGTTCATTCTTCAAGTTATTTTATTTTAGGTCCTTTAGTTTTTGGTTTAATTAATGATTTGGATTTAGTAAAATCTCTTAGTGAGATTGGAATTGCCTTTTTGCTTTTTGTTGTTGGTTTGGAGATTGATATAAAAAAATTAAAGGAAGTTGGATGGATAGCTTCAATTGGCGGTTTGTTTCAAGTTTTACTTGTATTTTTATTAGGTTATTATGTTTCAACTTCTTTAGGATTTAAGCATGAAGTATCATTGTATCTTGGAATTGCTTTATCTTTTTCATCTACTATGGTTGTAGTTAAATTATTATCTGATAAAAGTGAAATTGATACTCTGCATGGAAGAATAATTCTTGGTTTTCTTTTAATGCAAGATTTAATTGCGATGATTGTATTAGCTTTAATGCTTGGTATTGGAGATGGTTTTTCATGGTTAGTTCTTTTACCTATCCTAATAAAATCTTTAGTTTTACTTTTGTTAGCTTTAGTTTCTTCCTGGTTTATATTTCCAAGGCTGTTTGATTTTGCTGCTAAATCAAAAGAGTTTTTATTTTTATCTTCTGTTACTGTTTGTTTTTTATTTGCTTTAGTGGCAGATGTAATGGATTTTTCAATTGCAATAGGTGCTTTCATTGCAGGTGTAGCTTTGGCACCTTTACCTTATGCTACAGATGTTAAAGGGCGTGTGGAACCAATAAAGGATTTCTTTGCAACAATATTTTTCGTTTCTTTAGGTGTACAGTTAGTTTTTACAGGGTTAGGAAGTATGATTGAATTGATTTTAATTTTCTTATCATTTATTTTAGTTTTAAAACCACTTTTGATTTTCATTTTAGGTATTTTATTTGGATACTCTTCTCAAGTATCTTTCACGGCTGGAGTTTATTTGGCACAGATAAGTGAGTTTTCATTAATTTTGATTTCAAGTGCTTTAGTTTTAGGAAATGTATCAGCTCCGGTGTTTTCATTAATTGTTCTATTAATGGCTTTGTCTGTAGTTACTACTTCTTATTTTATAGAACATGCTCATTCTATTTATGGTTTTCAAAAAAACTTTTTAGAATGGTTTGAAAGATTTTCTATTGTAAAAAGGGAAAAATTGGAATATGGTAATAAATCTGTTAAAAAGAGTGCAGTTTTATTAGGCTGTGGAAAAATGGGTATGATGTTTATTGAAACTTTAAAAAAATTAAAACAGGATGTAGTAATCTTAGATAATAATCCAAAGGTTATTCAAAATCTGATGACAACTAAAATAAATTGTAGATATGGTGATGCAACTTCTCGCGTGATTCTTGAAAGTCTAAACCTTAAAAGTGTGAAGATTATAATTTCAACTATACCTGATTTGAAGGTTAATCAATTTGTTCTTAATTATATTAAATTCATAAATCCAGAAATTTTAGTAATTCTTACGGCTAATAGGACGAAAGAGGTTTTAGATCTTTATGATTTAGGTGCTGATTATGTTATAGTTCCAAGGGTGATTTCTGGTTCGAATATTTCTGAAATGCTGTTGAAGGTATTTAAATCTAAAAAAAATCTTGGGATTCTTCGTGAAGAGAACCTTAGGGTTCTTGAGAAATTACAAAGTTTGGGGATGGGTTAA
PROTEIN sequence
Length: 541
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