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gwf2_scaffold_1737_28

Organism: GWF2_TM6_36_131

near complete RP 48 / 55 BSCG 49 / 51 ASCG 10 / 38
Location: comp(27629..31966)

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Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta {ECO:0000313|EMBL:KKQ19519.1}; TaxID=1619072 species="Bacteria; candidate division TM6.;" source="candidate division TM6 bacterium GW2011_GWA2_36_9.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2853
  • Evalue 0.0
rpoB; DNA-directed RNA polymerase beta subunit KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 66.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1996
  • Evalue 0.0
DNA-directed RNA polymerase subunit beta similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 1245
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

GWA2_TM6_36_9 → TM6 → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4338
ATGTCTTACTTGGATCGAAGTAAGCAGGTTGTTCGTAAATCATTTGGCAAGCTGAAAGATATTGTTCCGGTTCCGAATTTAATTGAGGTGCAGTCAAAATCATTTAATGATTTTGTGCAGCTTGATTATCTTCCAGAAGAGCGGTTTCCGACGGGACTTGAAAAAGTATTACGTGACATTTTTCCTATTGATTATGAAGGAAAAATGTCACTTGAATATGTCAGTTATCAGTTAGGTGATTGGGCGTGTACCTGTGGCAAATTAACTGGAATTGTTAATCGTTATTCTTGGACTTGTTTGGCATGTAAGGCTTCTGGTTGTTCCAGGATTAATGAACATATGCAATGTCCAAAATGTAAAAAAGATGATGTTGTACGTTACAGAGTATGTCCAGCGTGCTTAACAAGGGTTTGCTTGAAGTTGCCAATGACAGTTGATGAATGTCGTTCAAGTGGGCAAACGTTTGCACTTCCTCTTCGTATAACTGTTCAATTAATTGGCTGGAATGTTGATGTTGAGGGAAGCAGGTCTGTTCGTGATATTAAAGAACAGGATATTTTCTTAGCTGATATTCCTGTTATGGCAGATCTTTATGAAGATGAGGGTCGTTATAAATTAGGTGATCAGGGGACCTTCTTAATCAATGGCGTTGATCGTGTTGTTGTAAGTCAGTTGCATAGATCGCCTGGTGTTGTTTTTTCACAGAGCAAAAAAGCAAGTGATTTGCGTGGTCGTCCTTATTATCTTGCGCGTATTATTCCAATGCGTGGGTCATGGATTGATTTTGAATTCGACAACAATGATTTGCTTTATGTTCGAATTGATAAGAGGAAAAAGTTGCTTGTTACGACATTTTTACAAGCACTTGGTATTCCTCGCGATGAGATTATTTCTAAGTTCTACAGTTCAGATGCAATTTATGTTGAAAAAGATTCATTTAAAAAGAAATTAAATGATAATTTGATTGGCCAGCGTTTAGAAGCAGATATGTTGCCCAAATCATTTGAAGGTTTTGTTGGCCGTCGTATCACAAAAAATCTTCTCAAGCAATTGCATGAAGCTAAAATTGATCATTTAGAACTCAAAAAAAATCTACTTTTAAATAAAGTTTTTTCAAAGGATGTTGTTGATACCGAAACCGGTGAAGTTTTAGCCGGTCAAGGTGAACCATTTACTGAAGATCATTTTGATAAATTCAAGAAACATGAAGGTCTTTCTTTTGAGTTGATCGCTTCATACGGATACGTTTTCCAACCAACAATTGCGTTGACGCTTGCTCATGATAGTTGCATGACGCAAGATCAAGCACTTAAAGAGTTGCATTATAAGGTATGGCCTGGTGATAGCGCATCAATAAAAGACATTCTTAAACGTTTAGAAACCATGCTTTTCTCTCCCCGCGTATATGACTTAACTAAGGTTGGTCGTTTGCGCATGAATAGAAAATTAGGTTTAACTGTTGCAGAAGATATAACAACTTTGACAATTGAAGATATTATCGCGACCGTGCGTTATTTGGTGAATATGCGTGAACGTGGCGAGGGTGAGCTTGATGATATTGATCATTTGGGTAATCGTCGTGTACGTTTAGTTGGTGAACTTTTGAGTAATCAATTTTATGTTGGTTTCTCTCGTATTGAACGTATTGTTCGTGAAAGATTTAGAGTTCAAGATTTAAATGCATCATTGATGCCACAAGATTTCTTGAATGTAAAACCATTAGCTGCTGTTATGCGTGAATTTTTTGGAACGGGGCAGCTGTCACAGTTTATGGATCAGACAAATCCGCTTTCAGAATTGGCTCATAAGCGACGTTTATCTGCATTGGGACCTGGTGGTGTTATGAAAGATCGCGCGACCTACGAGATTCGCGACGTTCATACCTCTCACTACGGTCGTATTTGTCCAATCGAAACACCTGAAGGTCAAACGATTGGTCTGATTTCGTCATTGGCAACCTATGCGATGGTGAACGATTTAGGTTTTATTGAAACAGCATATCGACCTGTTAAGGGTGGTAAACTTCTTGATGAAGTTATTTTTCTTGATGCATTCCAAGAGTCAGACAAATATATTGCACAGGCTGATGCAGTTGATAAAACTGGAAACAAAATTGAAAAAGATACGGTGCTTGCTCGTTACCAAGGTAACTTTTTGTATACCGATCTTGATAATATTACCTATATAGATTTATCACCAAAACAGTTAGTTTCGGTTGCATCTGCATTAATTCCATTCTTAGAACATGACGATGCGAGTCGTGCGTTAATGGGTGCGAATATGCAACGGCAGGCTGTTCCTCTTATTCGTTGCCAAACACCATTGGTTGGTACTGGCATGGAAAAAGAAGTATGTAAAGCTTCGCCAGGCGCAGTTATTAGCGCAAGGCATGCGGGTGTGGTTGAATATGTCTCATCAGAAAAAATTATTGTTCGTGCCGATGAAGCATCGTTCACGACGACTGATGCGTGGTTAGCTGGCGGTGTTGATGTTTATCATTTACGAAAATTTGAACGCTCCAGTTATAGTACCTGGATTCACCAAAAACCGATTGTGAGTGTTGGTGATCGCATTGAAAAAGGTCAGATATTAACTGATGGTACTGCAATTACCAATGGAGAGCTTGCATTGGGATCGAATCTTTTAGTCGCATTTATGCCATGGCATGGTTATAATTTTGAAGATGCTATTGTATTGAATAAGCGACTCGTTGCTGAAGATGTTATGACGTCGGTTCACATTGATGAATACATTGCTGAGGCGCGTGATACAAAGCTTGGCCCTGAAGAAATTACTCGCGACATTCCTAATGTAAGTGAAAAAGCATTAAGTGCACTTGATGAAGACGGGGTTGTGCTCATTGGTAGTCGTGTGCGACCGGGAGATATTTTAGTCGGCAAAGTTACGCTTAAAGGTGATGTGCAATATTCCCCAGAAGAAAAATTGCTCCGTGCTATTTTTGGTGAAAAATCGCGTGAAGTTCGTGATACTTCATTGCGCGTGCCACCAGGAATTGATGGAACGGTTGTTGATGTTAAAGTCTTTTCTCGAAGCGGCATTCGTAAGGATAGGCGTTATAAAGATGTTGTAACCGCTCAAACGGCAAAGTTTGATTCAGAACATGAAAAGCAATTACGCATTTTGGGTGAAATGGTTTCAGATAGAGCTATAGCATTAATGAAAAAGCAGGGGCCTGCCGCAAAAATTGGTGCAAAGCTTCTAAAAAATAAGAAAACGTTTGATGTTGATGCTTTGCGTGAACTTGCGCCAGAAAAGTTGCTTGCTCTAAAAACCGATGACGAAACTACTAATGATAAGTTAAATCGTCTGTTGCAAACTTATGAGACGCAACTTTCTATTTTAGAAAATTTAAGAAAAGAACGTATTAGCTCGTTAAAGAAGGGCGACCCATTGCCTTCTGGCGTTATCAAAATGATTAAGGTATATGTTGCATCTAAACGACATGTACAAGTTGGTGATAAGATGGCAGGGCGCCATGGTAATAAAGGTGTGGTTTCCACGGTTGTTCAACGTGAAAATATGCCGTATCTCGATGATGGAAGAACTGTTGACGTTGTGCTTAATCCTATCGGTGTTCCTTCGCGTATGAATGTTGGCCAAATTTTAGAAACAATACTTGGTTTTGCAGGCATTCAGGCTGGACGTCAATTGCGGGAACTCATTGAAGAAAAGCGTATGGATCAGGCGATTTCCCAATTAGAAAAATGGTATGGTAAATCGTTTATGAAAGAATACGAAGAAGCCTACGGAAAACGCGCAATTCTCGAGCTTGCTGAACGTACTGCTGAAAAGGGTCTTTCTTTTGCAACGCCAGTTTTTGATGGTGCTTCATTTGATGAAGACATTTCGCCTTTATTAAAAGAGCTTAATTTGACGCAATCAGGAGCTTATGTTGTGCGCGATGGCCGTACGGGTGAATATTTTGAACAACCAGTAACAATCGGTTCAATTTATATGATGAAATTGAATCATATGGTTGATGACAAATTGCACGCTCGTTCTGTTGGTCCTTACTCATTAGTAACACAACAACCTCTTGGAGGTAAGGCTCAGTTTGGTGGTCAACGTTTTGGTGAAATGGAAGTTTGGGCTCTTGAAGCATATGGTGCAGCATATACGTTACAAGAAATGTTGACGTATAAATCTGACGATGTTACGGGTCGTCATAGAGTGTATGAAACGATTGTTCGCGGTGATGGCAAAGAGATTCCGGATCCAGGATTACCAGAATCGTTTAATGTCTTGATTAAGGAACTTCAAAGTTTAGCTTTACAAGTTGATTTATTTAAGGGAAGCAGGGAGGAAATAAGTGAATAG
PROTEIN sequence
Length: 1446
MSYLDRSKQVVRKSFGKLKDIVPVPNLIEVQSKSFNDFVQLDYLPEERFPTGLEKVLRDIFPIDYEGKMSLEYVSYQLGDWACTCGKLTGIVNRYSWTCLACKASGCSRINEHMQCPKCKKDDVVRYRVCPACLTRVCLKLPMTVDECRSSGQTFALPLRITVQLIGWNVDVEGSRSVRDIKEQDIFLADIPVMADLYEDEGRYKLGDQGTFLINGVDRVVVSQLHRSPGVVFSQSKKASDLRGRPYYLARIIPMRGSWIDFEFDNNDLLYVRIDKRKKLLVTTFLQALGIPRDEIISKFYSSDAIYVEKDSFKKKLNDNLIGQRLEADMLPKSFEGFVGRRITKNLLKQLHEAKIDHLELKKNLLLNKVFSKDVVDTETGEVLAGQGEPFTEDHFDKFKKHEGLSFELIASYGYVFQPTIALTLAHDSCMTQDQALKELHYKVWPGDSASIKDILKRLETMLFSPRVYDLTKVGRLRMNRKLGLTVAEDITTLTIEDIIATVRYLVNMRERGEGELDDIDHLGNRRVRLVGELLSNQFYVGFSRIERIVRERFRVQDLNASLMPQDFLNVKPLAAVMREFFGTGQLSQFMDQTNPLSELAHKRRLSALGPGGVMKDRATYEIRDVHTSHYGRICPIETPEGQTIGLISSLATYAMVNDLGFIETAYRPVKGGKLLDEVIFLDAFQESDKYIAQADAVDKTGNKIEKDTVLARYQGNFLYTDLDNITYIDLSPKQLVSVASALIPFLEHDDASRALMGANMQRQAVPLIRCQTPLVGTGMEKEVCKASPGAVISARHAGVVEYVSSEKIIVRADEASFTTTDAWLAGGVDVYHLRKFERSSYSTWIHQKPIVSVGDRIEKGQILTDGTAITNGELALGSNLLVAFMPWHGYNFEDAIVLNKRLVAEDVMTSVHIDEYIAEARDTKLGPEEITRDIPNVSEKALSALDEDGVVLIGSRVRPGDILVGKVTLKGDVQYSPEEKLLRAIFGEKSREVRDTSLRVPPGIDGTVVDVKVFSRSGIRKDRRYKDVVTAQTAKFDSEHEKQLRILGEMVSDRAIALMKKQGPAAKIGAKLLKNKKTFDVDALRELAPEKLLALKTDDETTNDKLNRLLQTYETQLSILENLRKERISSLKKGDPLPSGVIKMIKVYVASKRHVQVGDKMAGRHGNKGVVSTVVQRENMPYLDDGRTVDVVLNPIGVPSRMNVGQILETILGFAGIQAGRQLRELIEEKRMDQAISQLEKWYGKSFMKEYEEAYGKRAILELAERTAEKGLSFATPVFDGASFDEDISPLLKELNLTQSGAYVVRDGRTGEYFEQPVTIGSIYMMKLNHMVDDKLHARSVGPYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEMLTYKSDDVTGRHRVYETIVRGDGKEIPDPGLPESFNVLIKELQSLALQVDLFKGSREEISE*