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DolJOral78_scaffold_690_7

Organism: DOLJORAL78_Gammaproteobacteria_37_15

near complete RP 47 / 55 MC: 1 BSCG 45 / 51 ASCG 11 / 38
Location: comp(7758..11822)

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Value Algorithm Source
RecBCD enzyme subunit RecB {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01485}; EC=3.1.11.5 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01485};; EC=3.6.4.12 {ECO:0000256|SAAS:SAAS00145970};; Exonuclease V subunit RecB {ECO:0000256|HAMA similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 42.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1104
  • Evalue 0.0
recB; DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit beta (EC:3.1.11.5) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 42.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1012
  • Evalue 9.00e-293
exodeoxyribonuclease V subunit beta n=1 Tax=Psychrobacter sp. PAMC 21119 RepID=UPI000289E5A4 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 42.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1106
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Psychrobacter sp. JCM 18900 → Psychrobacter → Pseudomonadales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4065
ATGACAAACAATAATATCCCCGCTATTAATATCAACCTATCTGGCAAACACCTGATAGAGGCATCGGCAGGTACGGGTAAAACTTGGACGTTAACTGGCATCGTGTTGCGTTTGTTGATAGAAAAAAAAGTAGCACCAGAACAAATCATATGTACGACCTTTACCCGTGCTGCAGCTGCAGAAATAAGACAACGTATTCATGAACGGTTAACAGACTTTTATTATCTGTTAAATTGGTTAACTGGCTTATCAAACGACAGCAAAAACTATGCATGCTTGTATCCAAAAAATATTGAAAATAAAAATACAAAATCAAGCACTTTAAATAAAACACAATTAAAAAAAGAACGCCATGAAAAACGCAAGATAATGCTTTTAAAACTGGCTCAAAACCACTCAAATATTGAAAAACTATTAGAAGATGAGGTCAATATTCACCTTATTAACTATTTAGCAGATAATATTCATCAGCATCCTTTAGACGATGCAATACGACGTTCAACAAGCCTGTTAACAACATTAGATAAGCTGTTTGTCAGTACCTTAGATAGCCTTGCCCAAAAATGGTTGAGTGAATATAGTGCAGAAACAGGCGTTAGTAAAAGGATGAGTATTTGTGATGATGAATGGGTTGTTATTAATAGCATTATCCATGATGAACTGCGTCAGTTTCAAAGCCATATTTATCATAATACACCTGACTTATATCAAATACTGCAACAAGGCGGGCATTTAACAACCGTTGCCGATTACAAAAATGCGGTGGATAAAGCATTACAATTTATGAATGTACCAATTGAAGCGGTTGAGGTTAAACCCTTTGATTTTGATGGTTTAAAACGTTTTTTAACTCGTTTTAATAATCACAATTACAAAGACATTGAGCCATATTTTGATTTAGAGTTTTGTGCACAACAAAATCTTAAAAAAAATACAAATTTATATAAATATTTAAACTGTATACCAAAAATTATTGAATCGATAAAAAAATATGGCATTGATTTTAAAACATATTTAGATTCAGATAGTACAAAGCTAATGTTAGGTTTAGCTGATTTTTATTTTGAAGGTAAACACTTTAAGAAAAACTCAGAAAAAGAACAAGCAACCTTTTTGGCACTACCAACAATTGCTTTATTAGTCAGTCTTTTAGACTATCAACAAAAACTAAACGATTACATTAGTGCAACCTTAGCAAATTTAAACAGACATATTGCAATTAAAGTGCGTGAACAATTGCCGCTTATTTTAGAAGAACGAAGCCAAACCACTTTTAGTTTACAAATGGTGCGTTTAAATCAGGCATTAGCAGGTAAGCAAGGAAAAAAACTTGCAAAATATATCCGATACCAATACCCAGTAGCACTCATTGATGAATCACAAGACATTAATAGTGAACAAGCAGAGATGATTCGTAAAATTTATCTATCTAAAGACAATACCAGCAATCGTGGGTTTTTATTGCTAGTGGGAGACCCCAAACAAGCGATTTATGGCTTTAGAGGTGGTGATGTCGCTAATTATAATGCTGTTAAAAATTTATATAAAGAAAATGAAAATAAAATTCACACACTTGAGCAAAACTTTCGTTCTTCTAAAGCACTCATTAGCTCTCTAAATTATTGGTTTGGAGCAGAAACTAAAACTGAAACGGATGATAACCCCAGTCAATTGAGTGAGTTAGGTGAGGGTATTTATTATCATCACATCAGTGCTATACAAGATAAAAGCAAACTTATTTGGCAAAAAGACTTTGCTCTTAAGCCCAATCAACCCGTTTCTATCATTCATCTTCCCTACCAAAATGACCATAAATATACAGAAACTGATGTCATTGCCAAACATATTGCCAGCCTAATAACAAGCAAAACAACGCTCAATGGTAAAGCATTAACTGCCAGTGATTTTGCAATTTTAGGACGAACCAAGCAAGCATTAAATGAAGCAGAAGTAGCCTTAAAAAAGCTCAATATTGATAGTGTAAAAGTTGGTGATAAAAGTATATTTGATACTCGTATGGCAAAAGATTTATTAGCGGTATTACAGTCTGTATTAAATCCATTTGAGCATGCTTTGATTAACCGTACATTAACCTCATCTTGGTATGGTTTTAGCCTTGATGAAGTTAAGCACATGCAAAATAATAAAAAAGAAAAACAAGATAAACCGCAGCAATACAGTAGTTTTCAACAATTTTGTAAAACTGCGGCAACGCTATGGACACACAAAGGCATTTTAACAGCAATGGAGTATTTGCTGAGTAACAATAATCCACTGAAACAAATAAGCGTTTGGGAGTATTTGGCAAGTAATACAAATAAATCAGATGCCCAAAGAGCCTTGATTGATTTGCGTCAACTGTTAGACATTTTGGCACAATACACCAGCTCAATGGGTGAGCATGAATGTATTACTTGGCTTAATAAACAAATTGCTCATGCGACCACAAAAAAACCTTCTGACTGGGCAATACAGCATCCAATGCCAACACAAGCAGGGGTTGAATTAATGACCATCCATAAATCAAAAGGGTTGGAGTTTCCAATTGTTTATATACTGGGCATGGGCAGTAAATTTAGTCATATTAAACAAGCACATAGCTTGTATCTTTCATCAAATACTGGGGATAGGCTGCAAACTCGTAAGCTGACAACCTGTGAGGGCGAAAATATTATAAAAGTGGTAGAAGAGGAAGCAACGGCAGAACTAAAACGTTTAATTTATGTTGCCTTGACTCGTGCCAGTGAGCAAGTTTTTTTCCCTTTAACTGACTTTAAGCCAACCAAAACAACACCTAAGGTAGATAAGTATAAAAAGTATCCAACAAATATTTGGCTCGATTGTGTTGGCTCAAATGAATATCTACTCCCTACAAGATTAAAAAACCACATTTGTTGGCAAGAAAGTGAGGTTATCACTAAATATTTTAAAGACAATCAAGTAAATAAATTACTTAACAATGACCATAATAGCAAGCGACAACAAAGCACACAGCTAATTGACTATCCAATTTATGATGATGTGATTAAACGCAAAAGCTTTATTGGTTGGGCAAAAACCAGCTTTACCGCTTTGGCACACAACTTACATAATGAGGTAATGGACACCGCCGTTAACGAGGCAGATTATGATAGCATTGAGCAAAAGCTCTTAGATAAAGAGTTTAATGATAAAAGTGATTTAAGAATTACTCAAACGGCAATAGATGAGCAAAAACAAATCCGTTTTAATTTTGTAAAAGGTGCAAATGCTGGGAGTTTTTTACATAAAATATTTGAGCTGCTAGATTTTAATAATCAATCAACTTGGAGTGACAGCATTGATAAGTGCGTACTTGAGTTTGATTTGCCTGATATTTATGGCTCTACTAAAATTCAAAAACAACGGATAGAAAGCAGATATGGTAGAGATAAAAAGGGTACACTTATTAAGCAGGTGGATATAAAATCACTTAATCAAGATACTCATGAACAATTAAAAAACTGGATTGATGAGGTTCTTAACTCTTCATTAACCGCTTCTAATATTTCTTTAAAAGAGATAATGCCAAAAAATCGCTTAGCAGAGCTTGGTTTTAGCATGAAATTAGGTGATGATTTTTCAGTCAATAAAATAAGCCAAATATTTGCTAAATATTTGGGAAAAGATGATGAGCGATATGTCAATTTAGCCAGCACCAGTAATCAAAATATCTATCGTTATTTACGAGGCGAGATTGACCTTGTTTATCAACACAACGGCAAGTTTTATGTGGTCGATTATAAGAGTAATCACCTTGGCAATCAGATAACGGACTATAATCAAGCAAAGCTTTCAACAGCCATGAATAAAGCAGGCTATTGGTTACAGGCAATAATTTATCAAGTGGCTTTACATCGCTTGTTAAAGTTACGTCTCGCCAATTATACGGGTAATGAAGCAAACTACCTTGGTGCGGTTGAGTATATGTTTGTGCGTGGTTGTCTTGCTAAAAACGATGATGCTGATAAAGCAAAATATGGCAAGATTAATTGGGATATACCCGTTGATATGGTTTTGGAAATGGATGCTATTTTTGGGTATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1355
MTNNNIPAININLSGKHLIEASAGTGKTWTLTGIVLRLLIEKKVAPEQIICTTFTRAAAAEIRQRIHERLTDFYYLLNWLTGLSNDSKNYACLYPKNIENKNTKSSTLNKTQLKKERHEKRKIMLLKLAQNHSNIEKLLEDEVNIHLINYLADNIHQHPLDDAIRRSTSLLTTLDKLFVSTLDSLAQKWLSEYSAETGVSKRMSICDDEWVVINSIIHDELRQFQSHIYHNTPDLYQILQQGGHLTTVADYKNAVDKALQFMNVPIEAVEVKPFDFDGLKRFLTRFNNHNYKDIEPYFDLEFCAQQNLKKNTNLYKYLNCIPKIIESIKKYGIDFKTYLDSDSTKLMLGLADFYFEGKHFKKNSEKEQATFLALPTIALLVSLLDYQQKLNDYISATLANLNRHIAIKVREQLPLILEERSQTTFSLQMVRLNQALAGKQGKKLAKYIRYQYPVALIDESQDINSEQAEMIRKIYLSKDNTSNRGFLLLVGDPKQAIYGFRGGDVANYNAVKNLYKENENKIHTLEQNFRSSKALISSLNYWFGAETKTETDDNPSQLSELGEGIYYHHISAIQDKSKLIWQKDFALKPNQPVSIIHLPYQNDHKYTETDVIAKHIASLITSKTTLNGKALTASDFAILGRTKQALNEAEVALKKLNIDSVKVGDKSIFDTRMAKDLLAVLQSVLNPFEHALINRTLTSSWYGFSLDEVKHMQNNKKEKQDKPQQYSSFQQFCKTAATLWTHKGILTAMEYLLSNNNPLKQISVWEYLASNTNKSDAQRALIDLRQLLDILAQYTSSMGEHECITWLNKQIAHATTKKPSDWAIQHPMPTQAGVELMTIHKSKGLEFPIVYILGMGSKFSHIKQAHSLYLSSNTGDRLQTRKLTTCEGENIIKVVEEEATAELKRLIYVALTRASEQVFFPLTDFKPTKTTPKVDKYKKYPTNIWLDCVGSNEYLLPTRLKNHICWQESEVITKYFKDNQVNKLLNNDHNSKRQQSTQLIDYPIYDDVIKRKSFIGWAKTSFTALAHNLHNEVMDTAVNEADYDSIEQKLLDKEFNDKSDLRITQTAIDEQKQIRFNFVKGANAGSFLHKIFELLDFNNQSTWSDSIDKCVLEFDLPDIYGSTKIQKQRIESRYGRDKKGTLIKQVDIKSLNQDTHEQLKNWIDEVLNSSLTASNISLKEIMPKNRLAELGFSMKLGDDFSVNKISQIFAKYLGKDDERYVNLASTSNQNIYRYLRGEIDLVYQHNGKFYVVDYKSNHLGNQITDYNQAKLSTAMNKAGYWLQAIIYQVALHRLLKLRLANYTGNEANYLGAVEYMFVRGCLAKNDDADKAKYGKINWDIPVDMVLEMDAIFGY*