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gwc1_scaffold_3647_16

Organism: GWC1_OD1_Parcubacteria_43_61

near complete RP 41 / 55 MC: 1 BSCG 47 / 51 MC: 3 ASCG 11 / 38
Location: 13386..19466

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cell surface glycoprotein {ECO:0000313|EMBL:KKT16586.1}; TaxID=1618911 species="Bacteria; Parcubacteria.;" source="Parcubacteria bacterium GW2011_GWC1_43_61.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3990
  • Evalue 0.0
fibronectin type III domain-containing protein KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 314
  • Evalue 2.30e-82
Cell surface glycoprotein alias=AR15_final_v5_1111 id=5800634 tax=GW2011_AR15 species=Methanosarcina barkeri genus=Methanosarcina taxon_order=Methanosarcinales taxon_class=Methanomicrobia phylum=Euryarchaeota similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 34.1
  • Coverage: null
  • Bit_score: 383
  • Evalue 3.40e-103

Lists

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Notes

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Taxonomy

Parcubacteria bacterium GW2011_GWC1_43_61 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 6081
GTGTTGCGGCAAGCAATCATGCGCCGCAAAGTTGGCTTTTTTAGTAAAAAATTACAAGTAAATAAAAATTTAATAAATATGAAAAATATCATTTGGGGGGGGGCGTTAAAAGGTAAGGAATCTTTTTACAATAAGAAAGGAATAGTTTTAGCCGTTGCCGCAATCGTTTTGGTTAGCGGTTTTTTTGCGCCTAGTTTAGCTTTGGCAGCGGCAACGGTTACACCCGCGAGCGGAGGCACAAATATTTCAATTGATACAACTTCTGCTCCGCTAGGAAGCGGAACTTATAAAACACTAAGCGGTCCCGGCATAAACGAACTTGTAGCCGGAGATATCTCTACAGGAATACACACGATTACATTGCCTGCGGGTTGGGAGTTTGAAATCTCCGCGATCAGCATTACCACTTTCGGTAGCGACATAGCATTTCAATCTACCAGTATTACTCCAAGTCCAACATCTTTTTCTTTCAATGTGACGGCACAATCAACCACTGGCGGCTTTGTGGGCTTTGGCGGTCTTAAAGTTAGACCGACTGGCACTACTCCAAGCACCAGCAACATAACCCACTCGGAAGCAAGTATTGTCGGAGTAACAGATGGAAGCACGAATTTCGGAACTCTCACGACTATTCCGGGAACTGTTACAAAGCTTGCCTTTACGACGCCGCCGGGTGCGACTACGGTATATGGCTCTAATTTAAGCACCCAGCCGGTTGTTAAGACACAAGACCAGTTCGGTAATGAATCATCAAACGGAGCATCCGGTAAAACAGTAACGCTCACTCTGGTTCCCGACACGGGCAATATAGTCGGTACGGCTTCGCTCGACATAAGTAGCGGGACGGCATCGTTCAGCGGCTTAACCGTAGATTCGGTTGGTACGAAACAATTAACCGCTATGGTTGAAGGCCTTACAAGTGCCAATAGCGGTTCTTTTGAAATCACTCAAAAGGAACTGACAGTTTCCGGTTTATCAGCTACAAGCAGGCCGTATGATGGCACCACAGTCGCAGAGGTGACTGGCACACCGGCACCTGTCGGCGTTGTTGATGGTGATGATGTCTCTCTAGCCGGGACAGCCGTTGGGCCATTTGACAGCGCAAATGCAGGAAGTAGAACCGTTGCTGTCACAGGTTTATCTCTCGCAGGAGCAGATTCCGCGAATTACACTCTCACACAGCCGACGTTGGATTCAAGTATTACAGCAAAGGTAATTACGATTACTCCAGATTCTGGTCAAACAAAAGTCTATGGCGAAGTCGACCAAGCACTCATGTATACCAATACCGCTTTGATTGGCGGAGACTCCATTACTGGCGCCTTGAGTCGCATTTCAGGAACAGATGTCGATGCTTATTCCTACACGCTCGGCTCTCTGTCTGCAGGTGGCAACTATTCTCTGAGTCTCGGAGGAACTGAATCATTCACAATTACTGCGAGGCCTCTCACGGTTACTGCAACTGGAATCACTAAACCCTATGATGCCAACACGGATGCCACCGTTACTCTTTCTAGCGATAAAATTTCAGGAGATGACGTGACACCTGCGTACACGTCTGCCTCATTCTCGGACAAAACTGCTACGGATGGCAAGACAGTAAGTGTAAGCGGCATTAGTATTAGCGGCGCTAAAGAGGGGAATTATAACCTGCTTAACGAAACTGCTGTAACAACAGCAAATATCACCAAAAAGTCGATTACTGCAACTCTTAATGTAAAGAATAAGATTTATGACGGTACTACAAGTTCGTCATTCCAAGCGCTGCCGACGCCCCATATTGTTCTGAGTGACGTCATTCCAGGTGATGATGTAACTGTTTTAAGTGAAGGTACGAAGTCTTTTCTAGACAAGCATGTAGCTAATGACAAGACAGTAAATGGTTCCGGCATAACTCTTACAGGAGTGGATAAAGACAACTACATATTCAACGGCACCGGAACAGGTATAGCAAATATCACTGTTCGGGCTATCGCTGTTACTGCTGTAACTGACTCAAAAACGTATGACGGCACAACAGGGTCCCTTGTAGAACCGGCAATTACAACCGATCTTGAAAGTGATCCAATAGCTCCAGGTGACACAGATGATTTCTTCCAAACTTATGACACTGAAGATTTTGGGATAAACAAGACACTCACACCGGACGGAGTAGTGCATGACGGGAATCCGATAGAAGGTAATAACTACACGGTTACACTCGCTCTAGTTTCAACAGGTGTAATTACTAAGGCACCCCTTACTGCCACCATTACCGTTTCAAACAAGGTTGTTGACGGAAACACTTCCGCAACAATACTCACTCGCATCCTTGTTGGTAAAATCGATGGCGATGATGTTACTCCAAACGCAGACGGTGTAGCGACCTTCGCTAGCGCAAATGTAGGAAATGGTCAGACAGTGACAGCTTCCGGCATAACTCTCGCTGGCGATGACAAGGACAACTATTCTTTTGACGATACGGCCACAGGAACAGGAAACATTCTGCCAGTTCCAACGACGGTTTATGTAAACGGTAGCTGGGCTGGAACAGGGGCATGGACAGACCCGGATGGCGCAGGTCCTGCAACATACTTCGGCTACGACGCATTTGCCACAATCCAAGAAGGTATTAACGCGGTAGCGGCAGCCGGAACTGTGAATGTCGCAGCTGGAACTTATGTTGAGAATGTATCGCTTGATAGTAAGCCAAACATCACGATTCAAGGAGTCGGTGATACGACTGTTGTTGAACCGGGAACTGGCATTGGCTTCGCTATTACGGATTCAAATGGGGTGACGATTAAGAATCTTAAAATCCATACGACAGGAGCCGATGCGCACGGCATTTGGGTCGCTGGTACTCCTAATGAAGGCAGTGCCGTGAACGGTCTAACTGTGCAGGACACGACAATAGTCGTTGATGGTTATTCGACTGGCATCTATGCAGAGCAAGTGAATCCCGCTCATACAGGCTGGCTAATAGGAGGTTTTGGGCATGGCAACACGATAACAATAAACCAGGGCACCGGAGTTACTGGCGATGGATTGGACCTGCACGATGTCTCGGGCTCAACAGTAAGTTACAACACCATTACGCTTAACACCCCGACTAACAGCACCAATGTGCTGTGGACGAGCGAACTCTCTGATCTAACTAACCTGGTATTCAACAACAACACAGTAAGTGGTTCTAGCGGAAGTGAAATAGCTTTCGTTCCAAACTTTGTGATTCCGACGAATTCTTCAACAATCACAACTGTAACGGTTTCTGGAAACACATTCAGCAATTGGGGTTCAAGAGGATTGAGAATTGGAAGTGGGGTTGCTTCCGTCATTGTGAGCGAGAACAAATTTCTCGGAACAGGAGAAACATTGAAGAATGAAGATGTTTCAGAAGTTAATGCCGAGAATAACTGGTGGGGTACGGCAGTTGCTTCCACAATTGATGGCAAGACAAATGGGACGATAGACTTTGAACCCTACTATGTTGAAAGCGGAATGAGTGTTCTTAGCAGTGATGCTGTTGACACGGTATATGTTGATGGCACTTACATTGACGGTAGTGCTGGTATCCATATTTTCGGCTACGATGCCTTCGCCACAATTCAGGAGGCGATTGACGCGGTAGCGGCAGCCGGAACTGTGAGTATTGCGGCGGGAACCTATGACGTAACATCAACTCCGGGTATTACGGTTGATAAATCAGTTACTATTAGTGGAGCTGGTGCCGACACGACAACGGTAACCGGAAGAAATAAAAACGGAAGCGTTGTAAACGGTTCAGACATACTATTCAATGTTACCGCGAACAATGTAACTATTGAAAAACTGACCATTGACCTTGGAGACTCGGATTCTGATTATGATGTAGGCGTGTTCACGGCTAATTCCAGTGGAATAAATAATTTGACTGTCCGAAACAGCGCCCTACTATTTGCCGCCTTTGGCAATTCTATTGGCGAGCAGTTGATTCACTTGGGCGGTGGCAGCGGTTCTACTGTCAGTGACAACATTCTTGAGACAGCCAGCGGAAATTCAGGACTATATGTGGGAGACGGTGCCAACACATCATTAACGGTGAATGGTAACACCGTCGCGCCTCAATCAGTCGTATCCGCTCCGAATGCGGCAGGTGCAAACGATGCGGATGGCGGAGGAACGCTCTTTAATCAGATGGGCCCAGTAACCAACAGCACCATTAGCGGCAACAACTTCACCAACACTGGGATTGCAATTTACCTTGGCGCCGGCAGTTCTAACACCGACACTGTTACTGTAAGCAACAACATCTTTACCAGCAATAACAAATTTAACAGCGATAACTTCGGCGGAATAAATGTTGGGGATGGTGTCAGCGGTACGGTAAACGCAGAGGCAAACTGGTGGGGGACAACTAACGGCGCGACTATTGCCGAGGCTATTAGTGGCTTGGTTGATTATAGGCCATGGTGTACAAGTGATACTTGCACTCCAGTTGACCCAACTTCGCCTACTATTGCCGTAAACGAACTTCTCACCAATGATACAACTCCAACAATAACCGGCACTGTTAATGAAAGTAGCGTTGTAAAAATTAATGTCAATGGAACGGATTATACAGCTTCAGTCATTGGGACTTCTTGGTCAGCGGATGTAACTAACACACTTACAGCGGGAACTTATAGCGTTACTGCAACTGCCGAGGACTTAGCCGGAAATATTGGGACTGACACTACCAGTGATGAATTAACAATTGACACTATTGCACCGACTGTCGCTTTAACTAAAAATCATACCGATCTTATTGTTCGCGATGCCGATACTGTTATCATAACGGCAACTTTCAACGAGGTAATGACCGCCCCTACAATTAGCATAGGAGACATAGTATCAGGAGCAATTATGACAAATACTAGCGGTAACATCTGGACATATTCTTGGGATGTTCCGGCCGGAAATGATGGAGTCGTAGCGGCTACCGTAGTCGGCGCTGATTTGGCCGGCAATCCATACGCGGGGGCGGATTCAATTTTGTTCAC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PROTEIN sequence
Length: 2027
VLRQAIMRRKVGFFSKKLQVNKNLINMKNIIWGGALKGKESFYNKKGIVLAVAAIVLVSGFFAPSLALAAATVTPASGGTNISIDTTSAPLGSGTYKTLSGPGINELVAGDISTGIHTITLPAGWEFEISAISITTFGSDIAFQSTSITPSPTSFSFNVTAQSTTGGFVGFGGLKVRPTGTTPSTSNITHSEASIVGVTDGSTNFGTLTTIPGTVTKLAFTTPPGATTVYGSNLSTQPVVKTQDQFGNESSNGASGKTVTLTLVPDTGNIVGTASLDISSGTASFSGLTVDSVGTKQLTAMVEGLTSANSGSFEITQKELTVSGLSATSRPYDGTTVAEVTGTPAPVGVVDGDDVSLAGTAVGPFDSANAGSRTVAVTGLSLAGADSANYTLTQPTLDSSITAKVITITPDSGQTKVYGEVDQALMYTNTALIGGDSITGALSRISGTDVDAYSYTLGSLSAGGNYSLSLGGTESFTITARPLTVTATGITKPYDANTDATVTLSSDKISGDDVTPAYTSASFSDKTATDGKTVSVSGISISGAKEGNYNLLNETAVTTANITKKSITATLNVKNKIYDGTTSSSFQALPTPHIVLSDVIPGDDVTVLSEGTKSFLDKHVANDKTVNGSGITLTGVDKDNYIFNGTGTGIANITVRAIAVTAVTDSKTYDGTTGSLVEPAITTDLESDPIAPGDTDDFFQTYDTEDFGINKTLTPDGVVHDGNPIEGNNYTVTLALVSTGVITKAPLTATITVSNKVVDGNTSATILTRILVGKIDGDDVTPNADGVATFASANVGNGQTVTASGITLAGDDKDNYSFDDTATGTGNILPVPTTVYVNGSWAGTGAWTDPDGAGPATYFGYDAFATIQEGINAVAAAGTVNVAAGTYVENVSLDSKPNITIQGVGDTTVVEPGTGIGFAITDSNGVTIKNLKIHTTGADAHGIWVAGTPNEGSAVNGLTVQDTTIVVDGYSTGIYAEQVNPAHTGWLIGGFGHGNTITINQGTGVTGDGLDLHDVSGSTVSYNTITLNTPTNSTNVLWTSELSDLTNLVFNNNTVSGSSGSEIAFVPNFVIPTNSSTITTVTVSGNTFSNWGSRGLRIGSGVASVIVSENKFLGTGETLKNEDVSEVNAENNWWGTAVASTIDGKTNGTIDFEPYYVESGMSVLSSDAVDTVYVDGTYIDGSAGIHIFGYDAFATIQEAIDAVAAAGTVSIAAGTYDVTSTPGITVDKSVTISGAGADTTTVTGRNKNGSVVNGSDILFNVTANNVTIEKLTIDLGDSDSDYDVGVFTANSSGINNLTVRNSALLFAAFGNSIGEQLIHLGGGSGSTVSDNILETASGNSGLYVGDGANTSLTVNGNTVAPQSVVSAPNAAGANDADGGGTLFNQMGPVTNSTISGNNFTNTGIAIYLGAGSSNTDTVTVSNNIFTSNNKFNSDNFGGINVGDGVSGTVNAEANWWGTTNGATIAEAISGLVDYRPWCTSDTCTPVDPTSPTIAVNELLTNDTTPTITGTVNESSVVKINVNGTDYTASVIGTSWSADVTNTLTAGTYSVTATAEDLAGNIGTDTTSDELTIDTIAPTVALTKNHTDLIVRDADTVIITATFNEVMTAPTISIGDIVSGAIMTNTSGNIWTYSWDVPAGNDGVVAATVVGADLAGNPYAGADSILFTIDNTAPAVAITQPAADSSVNSVKVIIFTDNGTAPQCSIDNSIWVNCVSGTTTLGDVAGFNALADGNFNLYLRDIDVAGNSGTAQVALVKDTTAPSIMGKTPSANAVGVAPSSDITVTFNEDVVFTGANVTITNNPAKTVTFVSGTKIATIDPTDNLANNTKYTITLTGVTDTIGNALPDTSWYFTTSASYSISLTTGWNLISLPVVPTDTNASAVLGTVLNDSAKIETIWKYDPEAGTWGAYHPGVGMLSDFSDMTAGEGYWINYLSSTAGTIAGTGNLFQEGNSAPPQKTLAAGWNLIGYYQLENVINTTATKALSSVSGQWTQLRTYDNSLKQFQSVTESNYMKPGEGYWIFMKSSS*