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gwf2_scaffold_3163_20

Organism: GWF2_OD1_43_38_partial

partial RP 34 / 55 MC: 1 BSCG 35 / 51 MC: 4 ASCG 5 / 38
Location: 19127..21109

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA ligase (EC:6.5.1.2) KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.6
  • Coverage: 667.0
  • Bit_score: 614
  • Evalue 2.70e-173
Ligase protein {ECO:0000313|EMBL:KKT16188.1}; TaxID=1618968 species="Bacteria; Parcubacteria.;" source="Parcubacteria bacterium GW2011_GWF2_43_38.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 660.0
  • Bit_score: 1294
  • Evalue 0.0
DNA ligase similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 614
  • Evalue 3.00e+00

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parcubacteria bacterium GW2011_GWF2_43_38 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1983
ATGATTAAACAAGAAGCTAAAGTCCGCATTCAAAAATTGCGCACCGAGATCAATCATCACCGCTATCTTTATCATGTGTTGGATAAGCAAGAGATCTCGGATGCGGCTTTGGATTCGCTAAAACACGAACTGGTTAAACTGGAAAAAGAGTGGCCGGAATTGATTACGCCCGATTCTCCGAGTCAGCGCGTCGGTGGTAAGGCCTTGGCAGGATTTAAAAAAGTTAAGCACCCGCGGCCAATCCTTTCCATTGAAGATGCATTTAATTTTACAGAAGTAGCTGAGTGGCAACAACGCAATGTCAAGTTAATCGGCCAGAATATAAAAGGTTATTTTGGCGAACTGAAAATGGATGGTTTGGCTATGGTATTAACTTATGAGCAAGGTATTTTTGTGCGAGCAACTACTCGGGGAGATGGTTTAGTTGGGGAGGAGGTAACACTAAATATTAAAACCATAGAAAGTGTTCCTTTGCGTTTGGAAAAAGTAGGAATGAGCTTACCTGAGAGGTTGGATATTAGGGGCGAGGTAGTAATTACCAAGGCGGAGCTTGCCAGGATTAATCGCTTGCAAGAAAAAAAAGGAGCGTCTCCATTTGCTAATCCGCGCAATTTAGCTGCCGGCACTATTAGGCAGCTTGATCCTAAGGTGACAGCTAACAGACGTATGGATTTTTATGCTTTTGAAATACTGACTGAATTGGATTTACCAACCCATGCGCAAGTTCATGATTTGTTAAAAAATTTAGGCTTTAAAATTAATCCTCATTGCCGCCCCTTATCAGACTTGGCTGCAGTTGATCTTTATATAAAAACATGGGAGAAAAAAAGAGAATCTTTGCCTTATCAAACTGATGGTGTGGTTATAGTGGTTGATAATATTGCTCAAGAGAGCATTTTAGGTTTTATTGGCAAGTCGGAGCGCTGGATGCTGGCTTTTAAATTTCCAGCCGAACAGGCGACGACGCGCGTTAAAGATATTATTGTGCAGGTTGGCCGTACTGGTGTGCTGACGCCGGTAGCGGTGCTGGAGCCAGTAACTGTTGCTGGCTCTACTGTATCGCGGGCTACTTTGCATAATCAAGATGAAATAGACCGCCTTGATATTAGGATTGGTGACACGGTCATTATTCAAAAAGCTGGGGATATTATTCCTGATGTAGTGGAAGTTTTAAAACGTATGCGCCCAGCTAAGGCGAAAAGTTTTACGATGCCGAACAAATGCCCAGCGTGTGGTAGTGCTGTGGTAAGGAAGGCGGGTGAGGTAGCGCACTATTGTTCTAATCTGCATTGTTTTGCCGTGGCGCGTGAGCGGGTTTATCATTTTGTTTCCCGGTCAGCACTAAACGTTATGGGTTTAGGCCCTAAAATCATTGATCAGCTGATGGATAATGGTTTAGTAAAAGATACGGCCGATCTATTCACTTTAACTGTTGATGAACTGGAACCATTGGAGCGTTTTGCCGAAACCTCGGCTAAAAAAATAGTTGAAGCCCTGGCTGGCCGCCGTAAAGTAAGTTTAGATAAATTTATTTATGCTTTGGGGATAAGGCATGTGGGTGAGGAAACCGCCAGGGATTTAGCCGGACATTTCGGCACCCTGGGTAAATTAATAGTAGCCAAACATGAGGAGTTTGAAAAAATTAGCAATATCGGACCAGTTGTTGCTAAAAGCTTAGCAGAATTTTTCTCTTTAGCGCCTAATAGAAAATTAATTGAACGACTGCAAAAATTTGGAGTGAAAGTAGAAAATTATGTGAGGTCCGGCCCAGGTAAATTTAATGGTAAAACTTTTGTGTTAACAGGCACACTGACTAACTTAACTCGTCAGCAGGTCGGGGAAATAATCAGGCAGCAAGGTGGCTCTACCAGTGAGAGTGTTAGTGCTCAGACTGATTATCCAGGATCTAAAATGACCAAGGCTAAAAAATTAGGTGTCAAAGTTTTATCAGAAGATGATTTTAATAAGTTGGTTAATAAGTAA
PROTEIN sequence
Length: 661
MIKQEAKVRIQKLRTEINHHRYLYHVLDKQEISDAALDSLKHELVKLEKEWPELITPDSPSQRVGGKALAGFKKVKHPRPILSIEDAFNFTEVAEWQQRNVKLIGQNIKGYFGELKMDGLAMVLTYEQGIFVRATTRGDGLVGEEVTLNIKTIESVPLRLEKVGMSLPERLDIRGEVVITKAELARINRLQEKKGASPFANPRNLAAGTIRQLDPKVTANRRMDFYAFEILTELDLPTHAQVHDLLKNLGFKINPHCRPLSDLAAVDLYIKTWEKKRESLPYQTDGVVIVVDNIAQESILGFIGKSERWMLAFKFPAEQATTRVKDIIVQVGRTGVLTPVAVLEPVTVAGSTVSRATLHNQDEIDRLDIRIGDTVIIQKAGDIIPDVVEVLKRMRPAKAKSFTMPNKCPACGSAVVRKAGEVAHYCSNLHCFAVARERVYHFVSRSALNVMGLGPKIIDQLMDNGLVKDTADLFTLTVDELEPLERFAETSAKKIVEALAGRRKVSLDKFIYALGIRHVGEETARDLAGHFGTLGKLIVAKHEEFEKISNIGPVVAKSLAEFFSLAPNRKLIERLQKFGVKVENYVRSGPGKFNGKTFVLTGTLTNLTRQQVGEIIRQQGGSTSESVSAQTDYPGSKMTKAKKLGVKVLSEDDFNKLVNK*