ggKbase home page

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_rifcsplowo2_12_scaffold_102086_2

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_31_6

near complete RP 44 / 55 MC: 3 BSCG 43 / 51 MC: 5 ASCG 9 / 38 MC: 3
Location: comp(167..3949)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
outer membrane cobalamin receptor protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2552
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor id=4247499 bin=GWF2_Bacteroidetes_33_38 species=Fluviicola taffensis genus=Fluviicola taxon_order=Flavobacteriales taxon_class=Flavobacteriia phylum=Bacteroidetes tax=GWF2_Bacteroidetes_33_38 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=a699 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 45.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1065
  • Evalue 0.0
outer membrane cobalamin receptor protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 40.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 883
  • Evalue 1.00e-253

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3783
ATGTTGAATAAACTAGCTGTTTTAGTGTCTCTGTTATTTGCAGTTTCTTTTGCAATAGCTCAATCAAATGGAACGATAAAAGGAAAGATGCTCGATAAAGGAAATGGGGAACCATTGCCGTTTGCAAATGTTGTATTGTTGAGAGGTGGTTCTCAAGTAACAGGAACAATGACTGATTTTGATGGTAAATTTACTTTTACTGCATTGGCTCCAGGTAAATATGAAATTCAAGCTACTTATGTTGGTTATCAAGCAATAAAAGTAAATGACGTTGTTGTAAATAGTGGTAAAATTACTTTTGTGCCAGATATTAAAGCAGCTTCTGGAAGTGAAAATTTAGATGAGTTTGTGGTAATCGATTATGAAATTCCTCTTATCTCTAAAGATCAAACTTCATCTGGAGGAATTGTAACTGCTGAGGATATTAAAAAAATGCCAGGACGTTCAGCTACTTCTATAGCAGCTACTGTTGGTGGTGTTTATGAAAAAGATGATGGTTCTAATGACTTAAATGTTAGAGGTGCTAGAAGTGCTGGAACAGACGTTTATATTGATGGTATTAAAGTAAGAGGAACTCAAAACTTACCTAAATCTTCTATAGAACAGGTATCCGTAATAACTGGTGGAATCCCTGCACAATATGGAGATGCTACCGGTGGAATTGTTAACATTACGACTAGAGGTGCAACTAAAGATTGGTTTGGTGGTATCGAGTTTGTTTCTTCTGGATTTAAAAGTGGAAATAATGTGATTGGTTTAGATAAATTTGGTTATAATCTTGTTGGCTTCAGTTTGTCTGGACCTATAAAAACTAGAAAAGATTCTGCTGGTAATAAAAAAGATGCTATTGCAGGATTTTTCTTGTCTGGAGAAGGAACGCACGAACTTGAACCTAGACCTTGGTACACAGGAGATTGGAAAGTGAATGATGATAAAATGGCAGAACTTAATGAAACTCCTTACATACAAAATTTAGGAGATGAAGTTGGAGGAGTAATCAATAGTGCGAGTTATATCAAATCATCAGATTTAGAAAAAACACCTTTTCGGTTAAATGTTTCTCGCAAAGCGTTTAACTTGGCAGGTAAAATAGATATTACTACTTCTAAAACTACCAATGTTGCAATTGGTGGGTCGTTTGATTATAGAGATTTTAATAGAGAAGAAAGAGAAACTGGCACTGCTTTTCAACTTTTTAATTTTCAAAATAATCCACAAACTATTGATAGAACTTGGAGGGTTTATGGTCGATTTACTCAACGATTTGCTAATTCTTCCGAAGAAGAAAACCCATCGTTGGTGAAAGATGCTTTTATTAGTTTTCAGGTGGACTATAGCAACTACAATGCTACCACTCAAAGTGAAGAACACAAAAAGAATTTTACCCACTACGGATATATTGGTAAATTTACAACTACAAGAGTTGATGTTATTGGAGATGCTCCTAATATTCATTATGTTCAAGACCCTGCATTACATGGGCAGTTAGATGACACCTTACGTGATGGATTAGGTAATCCAGTTTTTATTTCTGGATATTTCTCTCAGCCAAATTCAATTTTATATAGTTTTGAACCGGGAGATATCAATCCAATTTTAGCTAATTATACCTCTAATTATTATGATTTGTTTGCTGGAGATCCAGTTAATCATTTTCAAACACCAGTAGATGTACAAGGTAACGCTGGACTTTTAAATGGTGATGACCCTGGTGATGTTTATGGATTGTGGTCGGGTATGGGAAGACAACGTAATGGATTTTCGTTTCAAGACCAGTCGCAGTTTAGAGTATCTGCTCAAGGTAGTGCCAGTATAAAAGATCATGCCATACAAATAGGTTTTGAGTACGAACAACGAGATGATAAATTTTATTCTGTAAATGCAAAACAATTATGGCAATTAGGACGACAACTAACAAATACTCAAATACAAGAATTGAGTTATGAGCAAGGAACATTTACTGAAATTCCAGGGTATAATAATTCTATTTCTGCTTTTATCCTTCAAAATTATTACCTCGAAGGGGAGCACAATCAATTTGATAAAAATTTACGTAAAGCATTAGGAATGGATGAAAAAGGAGTGAATTGGATTGATTTTGATTCTTATGGTCCTGATGTGTGGGACATTGGAATGTTTACCCCTGATGAATTAATTAATAATGGTGGGTATGTTAATAACTTCGGATACGACCATACTGGTGAAAAACTTTCTGGAAATCCTAGTTTAGATGACTTTTTTAATAAAGTGGATGAGGATGGAAATAAACTTAGAGAGAATCCAGGATTTAGGCCAATTTATGTTGCGGGTTACATTCAAGATAAGTTTGCTTTTGATGATTTAGTATTTAATATAGGTGTTCGTATTGATAGATATGATGCCAACCAAGCAGTATTAAAAGATAAGTATTCTTTATTTCCTGTTAAAACAGTTGGAGAGATTGATAATATTGTTACACCTGCTAACATCGGAAGCGATTTTGTAGTTTATGTCTCAGACCCTGCTAATCCTACCATTACTGACATTACTGGATATCGTAATGGAGATACTTGGTACAATGCAGATGGAGAAGAAATAACAGACCCTTCTGTGTTAGGTTCTTCAGGAAGACCAAATCCTTGGTTAGTTGACCCTAATGATAACAGTGTTTTTGATGATTTAGACGGAGAGTCTTTTAAAGATTTTGAACCTCAAGTGAACATTTCTCCTCGAATTGCATTCTCTTTTCCTATTTCTGATGAAGCTTTGTTTTTTGCACATTACGATGTGTTAACACAACGACCAGAAGATAACAATAGATTGGATTTAATTAGTTACTTGGGATTTGGAGATGGTGGAAGTAGTATTTTTGGAGGAGGAATCAATAACCCTAATTTACGTGCCGAAAAAACAATTGATTACGAGTTAGGTTTTCAACAAAAATTAGACAATTATTCATCGCTTAAAATTTCTTCTTTTTATAGAGAGATGAGAGACCAAATTCAATATACTCAGGTGATAGGAGCATTTCCTGGAAACTATTTTACCTTTGAAAATAAAGATTTTGGTACGGTTAAAGGATTAACTCTTTCTTATGATTTAAGAACAAGAGGTAATATTTCTTTAAGAGCTAGTTACACTTTACAATTTGCTGATGGAACAGGTTCGAGTACTACCTCTTCTCAAAATTTAGTATCATCTGGTAATGGGAATTTAAGAACACTTATTCCACTTAACTTTGATCAAAGACATAGAATAGTTTTATCTGGTGATTACCGTTATAAATCAGGAAAAAGTTACAATGGTCCTAAAGTATTTGGTAAAGATATTCTACAAAATACAGGCTTAAATGTTACTGCCCGAATGGGTTCTGGCACTCCTTATACCAGACAAAATAAAACTATTGGTTCTGGTGTATTATTTACCACCCAAGGTAACTCTGATCAAGAAGGACAAACAAATGCTTCTAGATTACCGTTTACCACAACTATTGATATGAAATTAGATCGGTCCATTGATATTAAATGGGGAAAAGGAGAAGACGATGATAAAAAAGAGGCAACGTTAAGTATTTATATTCAAGCTTTAAATGTGTTAAATGCTGGAAATATTATTAGTGTGTATAGCTTTACTGGAAACGCCAATGATGATGGATTTTTATCATCTGCAGAAGCTCAACCTTTTATAGTAAATCAGGTTGATGAGCAATCTTATAGAGATTTATATACTACAAAAGCTGCTTACGATGGTAGCAATTATGCTTTGCCTAGAAGAATTAGATTAGGTATTGAATTAAACTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1261
MLNKLAVLVSLLFAVSFAIAQSNGTIKGKMLDKGNGEPLPFANVVLLRGGSQVTGTMTDFDGKFTFTALAPGKYEIQATYVGYQAIKVNDVVVNSGKITFVPDIKAASGSENLDEFVVIDYEIPLISKDQTSSGGIVTAEDIKKMPGRSATSIAATVGGVYEKDDGSNDLNVRGARSAGTDVYIDGIKVRGTQNLPKSSIEQVSVITGGIPAQYGDATGGIVNITTRGATKDWFGGIEFVSSGFKSGNNVIGLDKFGYNLVGFSLSGPIKTRKDSAGNKKDAIAGFFLSGEGTHELEPRPWYTGDWKVNDDKMAELNETPYIQNLGDEVGGVINSASYIKSSDLEKTPFRLNVSRKAFNLAGKIDITTSKTTNVAIGGSFDYRDFNREERETGTAFQLFNFQNNPQTIDRTWRVYGRFTQRFANSSEEENPSLVKDAFISFQVDYSNYNATTQSEEHKKNFTHYGYIGKFTTTRVDVIGDAPNIHYVQDPALHGQLDDTLRDGLGNPVFISGYFSQPNSILYSFEPGDINPILANYTSNYYDLFAGDPVNHFQTPVDVQGNAGLLNGDDPGDVYGLWSGMGRQRNGFSFQDQSQFRVSAQGSASIKDHAIQIGFEYEQRDDKFYSVNAKQLWQLGRQLTNTQIQELSYEQGTFTEIPGYNNSISAFILQNYYLEGEHNQFDKNLRKALGMDEKGVNWIDFDSYGPDVWDIGMFTPDELINNGGYVNNFGYDHTGEKLSGNPSLDDFFNKVDEDGNKLRENPGFRPIYVAGYIQDKFAFDDLVFNIGVRIDRYDANQAVLKDKYSLFPVKTVGEIDNIVTPANIGSDFVVYVSDPANPTITDITGYRNGDTWYNADGEEITDPSVLGSSGRPNPWLVDPNDNSVFDDLDGESFKDFEPQVNISPRIAFSFPISDEALFFAHYDVLTQRPEDNNRLDLISYLGFGDGGSSIFGGGINNPNLRAEKTIDYELGFQQKLDNYSSLKISSFYREMRDQIQYTQVIGAFPGNYFTFENKDFGTVKGLTLSYDLRTRGNISLRASYTLQFADGTGSSTTSSQNLVSSGNGNLRTLIPLNFDQRHRIVLSGDYRYKSGKSYNGPKVFGKDILQNTGLNVTARMGSGTPYTRQNKTIGSGVLFTTQGNSDQEGQTNASRLPFTTTIDMKLDRSIDIKWGKGEDDDKKEATLSIYIQALNVLNAGNIISVYSFTGNANDDGFLSSAEAQPFIVNQVDEQSYRDLYTTKAAYDGSNYALPRRIRLGIELNF*