ggKbase home page

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_rifcsplowo2_12_scaffold_6267_16

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_31_6

near complete RP 44 / 55 MC: 3 BSCG 43 / 51 MC: 5 ASCG 9 / 38 MC: 3
Location: comp(14979..18131)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Conserved repeat domain protein n=1 Tax=Saprospira grandis (strain Lewin) RepID=H6L034_SAPGL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 29.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 376
  • Evalue 1.20e-100
PKD domain-containing protein Tax=RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2164
  • Evalue 0.0
PKD domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.9
  • Coverage: 900.0
  • Bit_score: 422
  • Evalue 4.00e-115

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFCSPLOWO2_12_FULL_Bacteroidetes_31_6_curated → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3153
ATGAAACTAAAATACATTTTACTTTTAGCTATCATTGCTATTATTCCTTTTTGGTCAATGGCTACACATGTAGTTGGAGGATCTTTAACTTATGAGCATTTAGGAGGAGCATCTTATCGTGTAACCTTTAAAATGTATAGGGATTGTAGCCCATCTAGTGTTCAATTACCTAACAGTGTTAGAATTGAGGTTCGACAACCCAATGGTTCTAGTTTTGCCATAGATAAAGATATTGTTATTCCAAAAACTCAAGTTGCTATTTTAGACCCATCTATAGATACTTGTGCATATAACCCAGGAGTTTGTGTTGAAGAAGCTATTTATACTACTATTGTTAATAATTTACCACCTAATCCAGGTGGGTATCATTTATTTTACACTACTTGTTGTAGAAATGCTAGTTTAATAAATGTAAATAATCCATTAAGTTCGGGTGAAGGATTTTATACCTATATTCCTGATAATAGTTTATTATTAACAAACTCTAGTCCTCAATGGAAAAATTTCCCCCCAGTGTTTATTTGTCAGGGAAATCCATTGGTGTTTGACCATGGTGCTACCGATAAAGATGGAGATTCTTTAGCATACTCCTTTTATCGTCCATTTGAAGATAATGCACCCACTTTTCCAGGCAACGTCGCTACTTTTACGCTAATTAACTATAATGCTGGTTACAGTTTTACAGATCCTTTAGGTGGAAGTAGCTTAACAATAAATTCATCTACTGGAGTAATCACAGGAATTCCACCTTCACTTGGTCAGTTTGTTGTTGGAGTTAAAGTGGATGAATTTAGAAACGGAGTTCAAACTAATACTGTATATCGAGACTTTCAATTTAATGTTCTTAATTGCCCGCCTTTGCCTATGCCTGGAATTGCACCAGTTACAGGTTGCTCTGGGTTAGCAATAGCTTTTACTAATACTAGTACACCATTAACAGGAAATTCATTTTATTGGGATTTTGGAGATCCTTTTACTACCTCTGATAATTCGACACTTGTTAATCCAACTTATGCTTACCCAGCAATTGGAACTTATATTGTAATGTTAGTTGCACAAGCAGGAACTCCTTGTGCTGATACTATTTATGAAACGTTAACTGTTTCTGGTATTACTCCTAATTTTACTTATACCGATTCAATTTGTGTTAACAATCCAGTCAACTTCTTTGATGCCTCAGTGCCTACTGCAAACACAACTACGAATAGTTGGGATTGGGACTTTGGAGATGCTGGTGCGGCAGTTATTCCTACTCCAACCCACACTTATTCTACACCAGGGACGTATTCAATTCAATTAATCGTTAGCACAACCACTGGATGTGTCGATTCTATCTCTAAAGATATTTTTGTCCAATCTTTGCCACAAGCTTTTACAATTGATACGTTCGCCTGTACGAGTAATCCGATAATAAATTTAAATGGAAGTGTAACTGGTGCTAGTGGAGGTTTATGGATTGGATCGGGTGGATTTAACCAGAGCAACACCAACTTAAATGCTACCTATAACCCTACCGCTGGAGAATTATCAGCAGGATTTGCTACTCTTATTCTTTTTACAACTGGAAATGGACTTTGTCCTTCAAACTCTGATACCATGACTATTCTTTATTCTATTGGAATTACCGCAAATGCTGGAAACGATATTTCTGTATGTAAAGACACTGCTTCCATTCCTCTTTCTGGAGTTATTACAACAGCTTCTGGAGGGCAATGGGTATCAAGCGGAACAGGAACTTTTCAGCCAAATCCATTTAATTTGAATGCTGTTTATATTCCTAGCTCAGCAGATACAGCGGCTGGCTCTATTTTTATTTATCTTAATTCAACAGGTAATGGAAATTGCATCCCAGATGCAGATACTTTAACCGTTACATTTACAAGCACACCTTCAACATCTATTTTATCAAATGACACTGCATGTGCAGGAAGTATTTTTATCCCAATTAGTGCAAACTCTACAACAGGTACAGGGTATTGGCAAACTCTTGGTTCAGGATATTTTTCCCCTAATGATTCATTAAACAACACCACTTATTTTGCCGATTCAACTGATAATTTTAATGGAAATGTTACCTTAATTTTTACCTCAACTAATAATGGAGGATGCCAAAGTTATATGGACACATTAACTATTGCTTTAATCCCAGCACCAAATGCTAATTTTTCTTTCACTTCTGTTTGTCCTAATGATACTGTGTTTTTTAATGATTTAACCACTTCCGTTGATCCTATTAATTCATGGAATTGGACTTTTGGAAATAGTTTAAACGATAATACTCCAAACACTTCAACAGTATACGATTCTGCAGGAGTTTATAATGTTAGTTTAGTTATTTCGTCTTCGAATGGATGTAGCGATTCAATTACTCAACAAGTTTTAATCTATTCCATTCCAAATGCAAATTTTAGTGCTAACGGAGTTTGTGAAGGAGCAAACAGTGAATTTATTGATGCTTCAACTGTTAATGGTTCTTCAATAAATTATTGGTATTGGACTTTTGGCGATGGTGGAATCGATTCTGTTCAAAACCCTATTTATTCTTATGTAAATAGTGGAACTTATACCGTTAATCTAATAATTCAATCAGCTCAAGGATGTTGGGACACGATATCAAATTCTGTTTCTATTCAACCTCCTCCAACAGCTGGATTCAATAGTAGCCCAAGTTCGGTAAAAGTAAATGAGATTTTTAGTTTTTCTGATATTTCAGCTTCAAACATTGTAAATTGGCAATGGAATTTTGGAGATTCTTTGGGAACTTCAACTTTACAAAATCCCTCCTATAGTTATACTTCTGCTGGATATTTTACTGTATGTTTAACTGTCGTTGACAACATGAATTGTACCGACTCTATTTGTGAAGAAGTAATAGTTTTTATGCCACCTCAAGTTCCAAATGCATTTTCACCAAATGGTTCTGGTCAAAATAATACATTTAATGTGTTAGGTGGACCATATCTCGAATTAAATTTTAAGATTTATAATAACTGGGGGGAATTGATTTTTGAATCTGACCAACAAAGCAAAGGATGGGATGGTACTCGCAATGGGGCTGCACAACCTATAGGAGTATATATTTATACTGTTAATGCTGTGACACTTGATAAAGAGCAATATACTATTAAGGGAGATGTAACATTATTGAGATAG
PROTEIN sequence
Length: 1051
MKLKYILLLAIIAIIPFWSMATHVVGGSLTYEHLGGASYRVTFKMYRDCSPSSVQLPNSVRIEVRQPNGSSFAIDKDIVIPKTQVAILDPSIDTCAYNPGVCVEEAIYTTIVNNLPPNPGGYHLFYTTCCRNASLINVNNPLSSGEGFYTYIPDNSLLLTNSSPQWKNFPPVFICQGNPLVFDHGATDKDGDSLAYSFYRPFEDNAPTFPGNVATFTLINYNAGYSFTDPLGGSSLTINSSTGVITGIPPSLGQFVVGVKVDEFRNGVQTNTVYRDFQFNVLNCPPLPMPGIAPVTGCSGLAIAFTNTSTPLTGNSFYWDFGDPFTTSDNSTLVNPTYAYPAIGTYIVMLVAQAGTPCADTIYETLTVSGITPNFTYTDSICVNNPVNFFDASVPTANTTTNSWDWDFGDAGAAVIPTPTHTYSTPGTYSIQLIVSTTTGCVDSISKDIFVQSLPQAFTIDTFACTSNPIINLNGSVTGASGGLWIGSGGFNQSNTNLNATYNPTAGELSAGFATLILFTTGNGLCPSNSDTMTILYSIGITANAGNDISVCKDTASIPLSGVITTASGGQWVSSGTGTFQPNPFNLNAVYIPSSADTAAGSIFIYLNSTGNGNCIPDADTLTVTFTSTPSTSILSNDTACAGSIFIPISANSTTGTGYWQTLGSGYFSPNDSLNNTTYFADSTDNFNGNVTLIFTSTNNGGCQSYMDTLTIALIPAPNANFSFTSVCPNDTVFFNDLTTSVDPINSWNWTFGNSLNDNTPNTSTVYDSAGVYNVSLVISSSNGCSDSITQQVLIYSIPNANFSANGVCEGANSEFIDASTVNGSSINYWYWTFGDGGIDSVQNPIYSYVNSGTYTVNLIIQSAQGCWDTISNSVSIQPPPTAGFNSSPSSVKVNEIFSFSDISASNIVNWQWNFGDSLGTSTLQNPSYSYTSAGYFTVCLTVVDNMNCTDSICEEVIVFMPPQVPNAFSPNGSGQNNTFNVLGGPYLELNFKIYNNWGELIFESDQQSKGWDGTRNGAAQPIGVYIYTVNAVTLDKEQYTIKGDVTLLR*