ggKbase home page

RIFOXYA2_FULL_CP_36_21_rifoxya2_full_scaffold_226_6

Organism: candidate division WOR-1 bacterium RIFOXYA2_FULL_36_21

near complete RP 46 / 55 MC: 2 BSCG 49 / 51 MC: 1 ASCG 10 / 38 MC: 1
Location: comp(5587..8787)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
cebA; copper/silver efflux system, membrane component Tax=RIFOXYA2_FULL_WOR_1_36_21_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2076
  • Evalue 0.0
Heavy metal efflux pump, CzcA family id=4281992 bin=GWF2_OP3_43_52 species=Syntrophobacter fumaroxidans genus=Syntrophobacter taxon_order=Syntrophobacterales taxon_class=Deltaproteobacteria phylum=Proteobacteria tax=GWF2_OP3_43_52 organism_group=OP3 (Omnitrophica) organism_desc=Same as C2_44_8 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 63.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1384
  • Evalue 0.0
cebA; copper/silver efflux system, membrane component similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 58.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1289
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYA2_FULL_WOR_1_36_21_curated → WOR-1 → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3201
TTGGCTTTACTTGTCGAAAATATAATAGAATTTTGTGCGAAAAATAGATTTATTGTTCTGCTTTTAGTTGGAGCTTTAATCCTTGCAGGTTTTTTTGCTATGCGGCAGGTACCTCTTGATGCCCTGCCTGATCTTTCAGATACCCAAGTTATAATTTATTCACAGTGGGATAGATCTCCCGATATTGTTGAAGATCAAGTTACATATCCTATCATAAGCTCGCTTTTAGGCGCTCCGCGCGTTAAAGCTGTCCGCGGATTTTCTGATTTTGGTTTTTCTTATGTTTATGTTGTTTTTGAAGACGGCACAGATATTTACTGGGCGCGGTCAAGAGTTTTGGAATACCTAAGCAAAATAACTTCTCGACTGCCGGAAGGAGTTAAGGTTGAACTAGGCCCTGACGCAACCTCTGTTGGCTGGGTTTTCCAATACGCATTAGTTTCTGAAACTGGACAGAATTCATTGGCGGATCTTCGCAGTTTTCAGGACTGGTATTTGCGCTATTATCTTCAAGCTATTCCAGGTGTAGCTGAAGTTGCCTCTGTCGGAGGGTTTGTCAGGCAATATCAGGTAAATATCAATCCAAATTCTCTGCTTGCTTACAATATCCCTCTTATGCAGGTTGTTGATAATATCCGTAAAAGCAATAACGATGTTGGTGGGCGGCTTGTTGAATTTTCCGGCGCTGAATATATGATCCGTGGGCGCGGTTATATTAAAGGAAAAGAAGATATTGAAAAAATAGTGGTAGGCGAGACAAAAGACGGAGTTCCTGTAACTATTAAGAATATTGCTGATGTTGCTCTTGGTCCTGACATTCGCCGTGGGATTGCGGACCTTGACGGACGGGGAGAGGTTGCGGGCGGAATCGTTCTAATGCGGCATAAGGAAAATGCACTTAATGTTATAAATGCTGTTAAAGCTAAACTAAAAGAGATAGAGCCAAGCCTTCCCAAAGGCGTTAAAATTGTTACAACTTACGATCGCTCTTTTTTAATAAATGCTTCTATTGCTACTGTAAAAGATAATTTAGTGCAGGAATTGTTAATAGTAAGTGCGATGATAATTTTCTTTCTTATGCATTTACCTTCAGCTTTAATCCCTATCATTGGACTGCCAATTGCTGTTGTTATTGCTTTTATTCCAATGAGCTATATGGGATTGACTTCAAATATCATGTCTCTTGGTGGAATTGTTGTGGCGATTGGAGACATGGTTGATGCTTCTATTGTATTTGTTGAGAATGTTCATACAAGGCTTTCTGAGCTTGCAAAAGGACTGCGGCGCGGCACAAAAGAGGAAGTCATAATAAATGCGATGAAAGAAGTTGGTCCGCCGATTTTTGCTTCTCTTATTGTTATGGCGATATCTTTCTTGCCTGTATTTACCCTCGAAGCCCAGGAAGGACGGCTTTTCAAACCTCTTGCCTTTACAAAAAACTATTCAATATTTTTTGCGGCTCTTCTTGCGATTACATTAACTCCGGCGCTTGTTATGATTTTTATGCGCGGCCGTGAATACAACTTTAAAAACAAATGGCTTACAAATATAACCAATTTCTTTATTGGAGGGAAAATAATTACAGAAGACAAACATCCAATAAGCCAAGCGCTCATAAAATTTTATCATCCGATTGCTAAATGGGCCATCCAAAATAGGTATTTAGTTGTATTAGTGGCGCTTCTTAGTATTTTTATTACTGTGCCGATATTTTTGTCAATGGGGTCTGAATTTATGCCCCCTTTAAATGAAGGGACAATCCTTTATATGCCGACAACTCTTCCCGGGCTTTCTGTTACTGAGGCAAGCAAGCTTTTAAAAGCACAAGACAGAATATTAAAATCTATTCCTGAAGTAGACCGTGTTTTTGGTAAAGCCGGTCGTGCTAACACTTCAACCGATCCTGCTCCTTTTTCAATGATGGAGACAACTATAGTGTTAAAAGATAAAGAATACTGGCGATCCGGCATGACATGGGAAAAGATAATAGATGATATGGATAGCAAAATGAAAATTCCAGGAGTTACGAATGCTTGGACTATGCCTATAAAAGCGCGAATAGATATGTTAACGACAGGCGTTCGCACTCCGATTGGCATAAAAATTTATGGATCAAATTTAAATGAAATAGAAAATATAGGGATTCATATTGAACAAATCCTAAAAGATGTTTCAGGAACTCGCAGTGTTTATGCGGAGCGTGTTACCGGAGGATATTTTGTCGATTTTGATTTGAAGCGCGAGGAGCTTGCGCGTTATGGCCTAACAGTCGATGATGCCAACGATATTATAATGTCAGCAATTGGCGGCGAGAATATTTCTTTAACAGTTGATGGCAGGGAGAGATATCCCATAAATGTTCGATACGGCAGAGAAACAAGGGATGATATTGATAAATTAGGTCGCGTGCTTGTTCCTACAATGCATGGGGCACAAATTCCTCTTGCGCAGCTTGCCGATATTAAGCTTAAATCAGGCCCTTCAATGATCCGAAATGAGAACGGGCTTTTATCAGGATATGTTTATGTTGATATTTCTGGCCGTGATATTGGAAGCTATGTGACAGATGCTAAAAAAGCAGTTTCTAGTAGTCTCAACCTCCCTACAGGGTATTCTCTTTCATGGTCTGGGCAGTATGAATATATGCAAAGGATTAAAGATCGTCTTAAAATATTTATTCCTTTAACATTGTTTATTATTTTTGTCCTTTACTTTTTTACGTTTAAATCTGTAACTGAAACTTTAATTATAATGTTATCTGTTCCCTTTGCGATAATTGGCGGAATTTGGTTTTTATTCTTATTAAAATTCAACATGAGTATTGCAGTATGGGTTGGGCTTATTGCGCTTGCCGGAGTTGCCGCGGAAACAGGGTCTATTATGATTGTTTATCTTGATGAGGCCTATGCGAGATATAAGAGGGAAGGGCGTATGAATTCTATAAGTGATCTTTATTCTGCGGTAATGGAAGGGGCGGTGCAGAGGTTGCGCCCAAAACTTATGACGGTTGGAGCCAATATTTTTGGGCTAATGCCTGTGATGTTAAGTGTAGGTGCCGGTGCTGATGTAATGAAACGAATCGCGGCGCCGCTGATTGGCGGTCTTATCTCTTCAACAATATTAACTCTTATAGTCTTACCTGCGATTTATACGATTTGGAAGAGTAAGGAAATAAACCCCGATTATTCATACCACGAGTAA
PROTEIN sequence
Length: 1067
LALLVENIIEFCAKNRFIVLLLVGALILAGFFAMRQVPLDALPDLSDTQVIIYSQWDRSPDIVEDQVTYPIISSLLGAPRVKAVRGFSDFGFSYVYVVFEDGTDIYWARSRVLEYLSKITSRLPEGVKVELGPDATSVGWVFQYALVSETGQNSLADLRSFQDWYLRYYLQAIPGVAEVASVGGFVRQYQVNINPNSLLAYNIPLMQVVDNIRKSNNDVGGRLVEFSGAEYMIRGRGYIKGKEDIEKIVVGETKDGVPVTIKNIADVALGPDIRRGIADLDGRGEVAGGIVLMRHKENALNVINAVKAKLKEIEPSLPKGVKIVTTYDRSFLINASIATVKDNLVQELLIVSAMIIFFLMHLPSALIPIIGLPIAVVIAFIPMSYMGLTSNIMSLGGIVVAIGDMVDASIVFVENVHTRLSELAKGLRRGTKEEVIINAMKEVGPPIFASLIVMAISFLPVFTLEAQEGRLFKPLAFTKNYSIFFAALLAITLTPALVMIFMRGREYNFKNKWLTNITNFFIGGKIITEDKHPISQALIKFYHPIAKWAIQNRYLVVLVALLSIFITVPIFLSMGSEFMPPLNEGTILYMPTTLPGLSVTEASKLLKAQDRILKSIPEVDRVFGKAGRANTSTDPAPFSMMETTIVLKDKEYWRSGMTWEKIIDDMDSKMKIPGVTNAWTMPIKARIDMLTTGVRTPIGIKIYGSNLNEIENIGIHIEQILKDVSGTRSVYAERVTGGYFVDFDLKREELARYGLTVDDANDIIMSAIGGENISLTVDGRERYPINVRYGRETRDDIDKLGRVLVPTMHGAQIPLAQLADIKLKSGPSMIRNENGLLSGYVYVDISGRDIGSYVTDAKKAVSSSLNLPTGYSLSWSGQYEYMQRIKDRLKIFIPLTLFIIFVLYFFTFKSVTETLIIMLSVPFAIIGGIWFLFLLKFNMSIAVWVGLIALAGVAAETGSIMIVYLDEAYARYKREGRMNSISDLYSAVMEGAVQRLRPKLMTVGANIFGLMPVMLSVGAGADVMKRIAAPLIGGLISSTILTLIVLPAIYTIWKSKEINPDYSYHE*