ggKbase home page

scnpilot_p_inoc_scaffold_868_21

Organism: scnpilot_dereplicated_Mitochondria_unknown_9

partial RP 3 / 55 BSCG 3 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 17214..19019

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
NADH dehydrogenase subunit 5 n=1 Tax=Tetrahymena pigmentosa RepID=Q09F06_TETPI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 39.2
  • Coverage: 586.0
  • Bit_score: 371
  • Evalue 1.60e-99
  • rbh
NADH dehydrogenase subunit 5 {ECO:0000313|EMBL:ABI51745.1}; TaxID=5907 species="Eukaryota; Alveolata; Ciliophora; Intramacronucleata; Oligohymenophorea; Hymenostomatida; Tetrahymenina; Tetrahymenidae; similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 38.6
  • Coverage: 585.0
  • Bit_score: 342
  • Evalue 8.70e-91
nuoL; NADH dehydrogenase subunit L similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.3
  • Coverage: 611.0
  • Bit_score: 257
  • Evalue 7.40e-66

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Tetrahymena pigmentosa → Tetrahymena → Hymenostomatida → Oligohymenophorea → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 1806
ATGTGTCGTATTTCTGCTTTTTTTTCTATTTTACTTTTGTACTTTATTCTTTTAACAAGTTTAACAATTTTTAGAAAACGAGTAACCTATAAGGGCGTTTTTTATGTTTTCACTACTTTTTTAGGTATTTTTGCTGGGTATCTGTGTGGTATTTTTACTGATATTATTTTATTTTCAGGTGTTTCCGAGTTCAATTGATTATTTAATGGAATAAATTGATACTCCCTTGAAGTTAGTTTTTCTTTAAGGTTGGATAGTCTAAGTTATTTGTTTACACTTTTAGTACTTATTATTGGGCTGGCCACCAACTTTTATGTCCTAAATTATTTAAAGTATGAAGCTAATGAGGATATTTTTGCACTCTTAATTAATTGATTTATGTTTAGTATGATTATTTTAGTTTTAGGTAATAATCTTTTTACTTTGTTTTTGGGTTGAGAATCCATCGGTCTCTCATCATTTTTCTTGATTAATTTTTGAAGTACTAGGAGGGGTACCGTTAAGTCTAGTTTTAAAGCTTTCTTTTTTAACAAAATAAGTGATGTTTTTTTATTTTTATTCTTGATTATTGTAAATTACATTACATATTTAAATAATCTGAATGTTATCAATATTAAATTTTTCTCTTTATTTGTTAACTTTTCAACTATGTATAATTTTGCAGCTTTGTGCTTATTTCTTTGTACGCTTTTTAAATCTGCTCAACTGTTTGGTCATTTATGACTACCTGACTCCATGGAAGCTCCTGTCCCTGCGTCAGCTTTAATCCACTCAGCTACTTTAGTTTCTGCCGGTATTTATTTATTACTGAGGTTTACACCTTTAGTGACACTTACAGATATCCAAACTGCCGCTATTCTTATTGGAAGCTTAACTGCAGCATATGGTGGTGTTGTTTCTGCATCTCAGACAGACATGAAAAAACTCCTTGCTTACTCCACTATCAGTCATTGTGGTTTTTTATTTGTTACTGTAGGAACTCAGTTTTATTATGCTTCAATTATCTACTTATTTTTACATGGTTTGTTTAAAGCTTCTACCTTTTTTTGTGCCGGATCATTTATTAGAGTTGCTGGATCACAGGATACTAGAAATATGGGTAATCTTAGTAGAGTTTTACCAGTTGACACCGTTTTTTTAATTATTTGTGCGTTTAACTTGGGTGGACTACCTTTTTCACTTGGGTATTTGTACAAAACCGCTTTAATTACATCTTTATTAACTACTTCACATTATTTTTTGGTTGTTGGCTTCTGTACAGTCGGTCTATTGACAAGTGTTGTTTACGTCTATCGTCTAGTTTACTACAGTGCTTTCGACACTAGTAAGGAATTTTTTGCTAACTACATATATGAATTACAACAAAAGCATCTTAACGTTGTAAAACATTGATCATTGACTACAGTGGTCCAAATTATTGCTGTATCTATTATTTTATTTTTTACTTTGTGAGTATACGTTTATTTTACAAATTTTTTTATTTCGTCAGATTTCGTTCTTGAAGGTTTCCCGTTAAGCTTGAACATTAATTCTACTACTATTTTGAACGCTAATATTTTTTATAAATCTTATTTTGAATTATTCTATACCCTGTATGTTTTAATTGTAATAATTTTAGGGGTAGTTAGTTGACGTATTGAATACACTTTTTTGTATAGACTAAACTTTTTAATTACCTCAACTTTATGCGTTTTTTTTGGTATCTTATTTTCTTTTATTTTAAAATGTGGGGTCATATTTTGACAGAAGCATCAACACAACAAAACTTCAACTTTGGTTTTTCTACCTACAAATCAGAAATTTTAG
PROTEIN sequence
Length: 602
MCRISAFFSILLLYFILLTSLTIFRKRVTYKGVFYVFTTFLGIFAGYLCGIFTDIILFSGVSEFN*LFNGIN*YSLEVSFSLRLDSLSYLFTLLVLIIGLATNFYVLNYLKYEANEDIFALLIN*FMFSMIILVLGNNLFTLFLG*ESIGLSSFFLINF*STRRGTVKSSFKAFFFNKISDVFLFLFLIIVNYITYLNNLNVINIKFFSLFVNFSTMYNFAALCLFLCTLFKSAQLFGHL*LPDSMEAPVPASALIHSATLVSAGIYLLLRFTPLVTLTDIQTAAILIGSLTAAYGGVVSASQTDMKKLLAYSTISHCGFLFVTVGTQFYYASIIYLFLHGLFKASTFFCAGSFIRVAGSQDTRNMGNLSRVLPVDTVFLIICAFNLGGLPFSLGYLYKTALITSLLTTSHYFLVVGFCTVGLLTSVVYVYRLVYYSAFDTSKEFFANYIYELQQKHLNVVKH*SLTTVVQIIAVSIILFFTL*VYVYFTNFFISSDFVLEGFPLSLNINSTTILNANIFYKSYFELFYTLYVLIVIILGVVS*RIEYTFLYRLNFLITSTLCVFFGILFSFILKCGVIF*QKHQHNKTSTLVFLPTNQKF*