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scnpilot_expt_750_p_scaffold_7755_2

Organism: SCNPILOT_EXPT_750_P_Bacteroidia_45_5.3_partial

near complete RP 45 / 55 MC: 1 BSCG 45 / 51 MC: 3 ASCG 13 / 38 MC: 3
Location: 1111..4014

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor n=1 Tax=Pedobacter heparinus (strain ATCC 13125 / DSM 2366 / NCIB 9290) RepID=C6XTJ2_PEDHD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 52.0
  • Coverage: 958.0
  • Bit_score: 1032
  • Evalue 0.0
  • rbh
TonB-dependent receptor {ECO:0000313|EMBL:ACU05770.1}; TaxID=485917 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter hepari similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 52.0
  • Coverage: 958.0
  • Bit_score: 1032
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 52.0
  • Coverage: 958.0
  • Bit_score: 1032
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Pedobacter heparinus → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2904
ATGAAACAAAAAAAAGTAAAAATTGTACAATTGGTATTCTCTTTAGGTAAGTTACTAGTTGCATACCTGTTTTTTCTATTAATTTTTGCTGCGACTTCAGCCCAAGGTCAAATTGTTGTTACCGGCAAGATAATGAATGAACGAGGAGAGCCTTTATCCGGGGCAACTGTAAAAATAAAAGGTGTGTCTACTGGTACAAGCACTAACGAAGAAGGCATATTTAGTGTTAATGTTGGTAATCTTAATATCATACTTGTTGTCAGTATGGTGGGGTTTCAAACTAAAGAAATTTCATTAGAAGGAAAAACAAGTATTGGTATTGTGTTAGAAAGGGGAAATGATGCTTTATCGGAGATAGTTGTGGTAGGGTATGGAACTCAGCAGCGAAGAAGCGAAATAACAACTGCCGTTTCAAAGCTAGATAATAAAGTTTTAGAGAATATCCCCTACTCAAATGTTGCAGCTGCATTACAAGGCACTCTTGCCGGTGTGCGGGTACAAACTAACTCTGGCCAACCAGGAGCAGCACCAAACATTATTGTGAGAGGTGGTACTTCCATTAACAGTCCAAACAGTTCTCCTCCCATTTATATTATTGATGGTGTGTTGAGAAGCAACATGAATGACATTAGTGCACATGATATTAAATCAATACAGATATTAAAAGATGCAGCTGCTACTGCCATTTACGGTGCACAAGGCTCTAACGGTGTAGTAATTGTTGAGACAAAATCAGGGCAATCTGGTAAAACACAGATAAATTATAAATTCGATATGGTTAGGTCTGAAGTTACCAAAACTTATGACATACTAGCCGGAAAAGATGAGGCCTATTTTGCAAGATTGGGACTTTTAGCTACAAGTAGAATTAACCCCGCTTTCCTTACTCAACTAGACGGAAGTACGTATTTAGGTGGTGCAGGGAATGATCTTACCAACAATACAACTAATTCACTACAATATTTAACACCCGAAAATCAACATAAATTGAATGAAGGATGGGAAAGTATTCAGGACCCTGTTGATCCTTCAAGAACTTTGATCTTTAATAGTGTGGATTGGCAAAGCTTATTATTCAGGAAAACACTCTCCCAAAGTCATGCTATTTCGGTTTCAGGGGGTACCCAGAAAGCCCGATTTTATTTAGGCTTAGGATACATGGATAGCAAAGGGATTGCTATTCAGACAGATTATAAACGATTTACAATGAACCTAAACGGAGAATTGAATATTAATGAAAAAATAAAGTTATTCTCCAGGGTAATGTATTCCAATACTCAAAATACGCAAGTGCCTACAACTGATGTCTTCAAATCTTCTTTAATAGCACCATCAACTAACAAGTTGTATTTTGAGGATGGGACATTGTCTCCAGGTAGAAATCTTAGTTTTACTAATCCGTTCTACCGAATGTCAGTATACAATCCCAAGAATCTCGCAAACGATCTTACATTAATAGTAGGAGGCCAGGCTGAGATTGTTGAAGGATTAACTTTCAGTCCCCTGGTTTCGCTGCAATACAGGGGTGGGTATTCCAGGAACTTTTTGCGGAGTTATTTAGATGGACCGACTACATTTGTAACTTCCCGCACAGCTTCGGGCTCTTATTCCGAGAATTTCAGACCCCAGGTAAATGCTGTATTAAACTATGCTAAAGTATTTAATGAAGATCATGATTTTGAAATAAAAGCAGGGTTATCTTATCTGTGGGCAAACAATATTTCATTATCTGCAACTGGTCAAAATGCAGCGACAGACATTATCCCTACATTAAATGCTTCTGCTACGCCAACAGCAGTATCGGGCTCAGAAACCCAGCATGCTTTAGTAGGATATTTTTCTAGAGCAACCTATAACTATAAAGGAAAATATCTTTTCGGCGCAAGTTTAAGATATGATGGCGCATCTAATTTAGGCGCTGACAATAAATGGGGCTTGTTTCCCGGAGTTTCAGCCGGCTGGAATATTGACAGGGAGAAATTCTGGGGTTTTTTACCAACCGGATTGGCTAAGTTAAAATTAAGAGCCAGCTATGGTGTTACCGGTAATATTAGTGGTTTAGGGCTGTATCAGGCACAAGGAGAATATAATGCATCCTCAAGATATTACGGTTCCTCCGGTATAATGATCTCAACATTGCCTAATCAGAATTTAAAGTGGGAGCAGTCAAAAACATTTGATTTTGGTGCAGACCTGGGATTGTTTAATAACAGAGTGAATGTAATTTTCGACTATTACAGAAGAGTTACTGAAAACCTGTTAACATCCTTAACCTTACCTCCTTCTACAGGATTCCCCAGCATCTTAACCAATTACGGAACTCTTGAGAACAAGGGATATGAAGTAGAACTATCTGCACGGGTATTATCTCCGGAATCTCCCCTGCAATGGAATATTGCATTAAACGCTGCCAAAGTTAACAGTAAAGTTTTGAGGCTACCTGAAAATGGTATTGAAAATAACAGAGTCGGAGGTGTATATGTTTTTGACCCCAGCGCAGGAAATTATGCATGGTTAGGTGGGCTTCAAGAGGGACAACGTATTGGAGATTTATATGCATATCAACAGATAAGCATCTACTCAACTGACGCCGAAGCAGCTAAAGGACCTGTTGATATGTTACTGCCCAGTGCGAGTAAAATAAAATATGGTGGTGATGTAAATTGGCGCGATGTTGATAAAAATGATACGATAGACACAAGAGATCGTGTATACCTTGGTAATATTATACCAAGGGTAACGGGTGGCTTTAGCAGCATATTGAGTTATAAAAATTTAAGCTTTACCGCTAGAGTAGATTATACACTGGGCGCAACCGTTTATAATGAAACAGCGGCAAGGTTAGAGGGAAACTTTAACGGAACAAATGCTATTAGCGCAAGTATGCTAAGATCATGGCAGAAA
PROTEIN sequence
Length: 968
MKQKKVKIVQLVFSLGKLLVAYLFFLLIFAATSAQGQIVVTGKIMNERGEPLSGATVKIKGVSTGTSTNEEGIFSVNVGNLNIILVVSMVGFQTKEISLEGKTSIGIVLERGNDALSEIVVVGYGTQQRRSEITTAVSKLDNKVLENIPYSNVAAALQGTLAGVRVQTNSGQPGAAPNIIVRGGTSINSPNSSPPIYIIDGVLRSNMNDISAHDIKSIQILKDAAATAIYGAQGSNGVVIVETKSGQSGKTQINYKFDMVRSEVTKTYDILAGKDEAYFARLGLLATSRINPAFLTQLDGSTYLGGAGNDLTNNTTNSLQYLTPENQHKLNEGWESIQDPVDPSRTLIFNSVDWQSLLFRKTLSQSHAISVSGGTQKARFYLGLGYMDSKGIAIQTDYKRFTMNLNGELNINEKIKLFSRVMYSNTQNTQVPTTDVFKSSLIAPSTNKLYFEDGTLSPGRNLSFTNPFYRMSVYNPKNLANDLTLIVGGQAEIVEGLTFSPLVSLQYRGGYSRNFLRSYLDGPTTFVTSRTASGSYSENFRPQVNAVLNYAKVFNEDHDFEIKAGLSYLWANNISLSATGQNAATDIIPTLNASATPTAVSGSETQHALVGYFSRATYNYKGKYLFGASLRYDGASNLGADNKWGLFPGVSAGWNIDREKFWGFLPTGLAKLKLRASYGVTGNISGLGLYQAQGEYNASSRYYGSSGIMISTLPNQNLKWEQSKTFDFGADLGLFNNRVNVIFDYYRRVTENLLTSLTLPPSTGFPSILTNYGTLENKGYEVELSARVLSPESPLQWNIALNAAKVNSKVLRLPENGIENNRVGGVYVFDPSAGNYAWLGGLQEGQRIGDLYAYQQISIYSTDAEAAKGPVDMLLPSASKIKYGGDVNWRDVDKNDTIDTRDRVYLGNIIPRVTGGFSSILSYKNLSFTARVDYTLGATVYNETAARLEGNFNGTNAISASMLRSWQK