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SCNpilot_expt_300_bf_scaffold_1997_1

Organism: SCNPILOT_EXPT_300_BF_Rotifera_33_5

partial RP 8 / 55 MC: 3 BSCG 4 / 51 MC: 1 ASCG 5 / 38 MC: 3
Location: 1..3192

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Low density lipoprotein receptor n=1 Tax=Philodina roseola RepID=B2L3N0_PHIRO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 42.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 900
  • Evalue 1.40e-258
Low density lipoprotein receptor {ECO:0000313|EMBL:ACC43983.1}; TaxID=96448 species="Eukaryota; Metazoa; Lophotrochozoa; Rotifera; Bdelloidea; Philodinida; Philodinidae; Philodina.;" source="Philodina similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 42.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 900
  • Evalue 1.90e-258

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Philodina roseola → Philodina → Philodinida → Bdelloidea → Rotifera → Metazoa

Sequences

DNA sequence
Length: 3192
CGAATGATACTTGAAAATCGTGTTAAAATCGAAACATTTACATTTCATTCGTATGATTCTCTAGATCTTGATACGACACCTTATCCGTATCGATGGAGACGAGAAACCAATACCGAATATTCATATATTCGTCGTCATATTTCATTTCAAACAATTTGTGATGGATACGATGAATTAACACCGATTCTTCTAGATGGACGAAATGAAACGGATGAAACCGAATGTGAACAATGGTCATGTAGTAATATTTACACATCTTGCAATGGCTATTTCAATTGTCTACATGGAGAAGATGAAATAAATTGTCACTCTCATTCAGTATTATCACCAATGAATTGTTCGTTGAATCAATATCTATGCATATCAATTCATACAAAAGAATTCATCTGTTTATCATCATCAAAAATCAATGATGGATTCATCGATTGTGTCGGTGCTAATGATGAACAATTTGTTTGCTATAGAGATAATGTCGATAATCGTTTTAGTAATTTTTATTGTCAAATGAATAATTTAACAAGATGTATACCAAGACAGGTACTATGCGATGGAATCAAACATTGCGATGATGAAATCGATGAATATTTTTGTGGAAAAAATTTATCAAAAAATTATCTTTACGAAATATTTTCACATAGAATCAAATATCCATCGGTAGATTTATTGTTGAATCGATTAGATAACATCAAACGAAAATCTATGACATCATCTTTATCACAAACAGCATATTGTCATCGTGGATTTGCCGTACAAATCGATTCAACAAAATCGATCTGTTTTTGTCCACCGAGTTTTTACGGTGATCGATGTCAATATCAAAATCAACGTGTTAGTCTCACTCTACAATTTCGAACATCATCGAATTCTTGGGAAATATCATTTGCGATTAGTATTTCATTGATTGATAATTCTCATCAACGATTGATTCATTCCCATGAACAATTGACTTATTTACCAATTCGAGAATGTCATACAAAATTTCATTTTTATCTACTCTATTCAACGAAACCAAAAGATTCGACGAAAGAATACTTCATTCATATAGATATCTATGAAAAAGTATCGTTAAATCATCGAACAAGTTTATTATATCCCATTGAATTTCCATTTCTTCCTGTTCATCGTTTAGCTTTTATTATCGATATACCATCAACGAATGATTCACTAACTAATTGTATAACTAATAATCCATGTCTTCATGGACAATGTTTGCGATATTACAACGGTCGACAGAATCCTATTTTCTGTCGATGTGATCGAGGATGGTCTGGTCGTGATTGTTCCATACGAAATACTTGTACTTGTTCTTCAGATAGTTTATATCTCGGTATGACGCATCACAATCGATCGGTATGCGTTTGTTCTCTACATAAATTTGGTCCTCGATGTCTTCTAACGAATTCAATCTGTTTAACCAATAAAACTGCACGATGTTTCAATGGTGGTGAATGTATTCCACGTGATGTGGATATTCAATCGAATGAAAAATATACATGCGTTTGTCCAACAGGTTATAAAGGCAAACAATGTGAATTTAGTGAAAATAAATTAATTCTTTCGTTTGGCAAAGATCTTGTCTCAACACAATCGATATTTTTACATTTTATTCTATTAGAAAGTTCATCACTATCTCAATCCTATCAACGAACGACTACTTTTCGAACAATTCCCTACAAACAAAAATCAATACCAATCTACTATTCACAACCATTTCATCTTCTTTTTATTGAATTTCAAAATAAAAATTATTATTTAACTTCGATTCGAAATGAAAGTCAACTATCAACAACGGCAACAATCAATCATTTCGATCGATGTCCACATATAAACGAATTATTTAATAAAACATTTACTGAAATGCATATAATTCGTCGTATCACATATTATCATTTGCCTTGTCGTATGTCTGCATACAATCTATCATGTTTTTACGATGAAATTCATCTATGTTTATGTCAAACTCATCGTGGAAAACGTGTAGCCAATTGTTTCGAATTCAACCATAGTCAAACATTTGATTGTCAAGGTCGAAGTGTATGCGAAAATGATGCATATTGTTTTCAAGATTCTCCAGCATGTCCTCGACGATCGATCTGCGTTTGTCGACCTTGTTTCTACGGAACATATTGTCAATTTAGTACGACTGCATTTAGTCTATCACTTGATGCAATTCTCGGTTACCACATTCAGCCAACATTGCGATTAACTCAACAGCCAGCACTTATTCAAATCAGTATATTATTCAGTATGATTTTAATTGTCATTGGATTAATGAATAGTTTGTGTGCATTGATTACGTTTAAAGAACGAAAATTATGTGAAGTTGGCAGTGCGATTTATCTTTTGACTGCATCGATAACAACACTGTTAACAACGATTATTTTTGGAATGAAATTTTGGATTCTTATCGAAGCACAACGAGGCGCTATTACTGATCGAATATTTCTGAGAATTCAATGTTATTTTATTGATTTTCTTTTTTCGTGTTGTTTACATATGGATCAATGGTTAACAGCTTGTATTGCCGTTGAACGAGCTGTTATAACAATAAAAAATGTTTATTTTAATAAAACGAAAAGTAAACAATGGGCGAAAATTGTTATTCTGATTTTATTTTTATTTATTTTTGGTACAAATATTCATGATCCAATATCTCGACAATTAGTCGATGAAAAAAACGAACTCGCACAACGCATTTGGTGTATTGCTTCGTATTCATCGTCGTTAAAAATCTATAATTATACAATAAATACATTTCATTTTATTGCACCATTTCTACTCAATTTCTTCTCGGTTATTATTCTTTTTACAAAAAAAACTCATCAACAATCGAATATTCGTCGAAATCGTTCGTACAGAGATATTCTATTGGAACATAAACATTTAGTTCTTGGTCCAATCGTTTCTATAACACTTTCTCTACCACGAATTCTTCTTTCGTTTATTTTCAAATGTATGAAATCAACGAGTGATTCATGGTTATATCTATTTGGTTATTTGATTTCTTTAAGTCCTTACATGTTAACATTCGTTGTTTTTATTTTACCTTCGAAATTCTACATGAACGAATATCGACAAGCCATTCGACAGATTCAAAATCGTCTAAAACGATGGACTGATTCTATTCTAAATCGGCTTCTATTTTTTCAAAAAATACGAATTTCGAAAAATAATCGAGTGCATCCTATGTAA
PROTEIN sequence
Length: 1064
RMILENRVKIETFTFHSYDSLDLDTTPYPYRWRRETNTEYSYIRRHISFQTICDGYDELTPILLDGRNETDETECEQWSCSNIYTSCNGYFNCLHGEDEINCHSHSVLSPMNCSLNQYLCISIHTKEFICLSSSKINDGFIDCVGANDEQFVCYRDNVDNRFSNFYCQMNNLTRCIPRQVLCDGIKHCDDEIDEYFCGKNLSKNYLYEIFSHRIKYPSVDLLLNRLDNIKRKSMTSSLSQTAYCHRGFAVQIDSTKSICFCPPSFYGDRCQYQNQRVSLTLQFRTSSNSWEISFAISISLIDNSHQRLIHSHEQLTYLPIRECHTKFHFYLLYSTKPKDSTKEYFIHIDIYEKVSLNHRTSLLYPIEFPFLPVHRLAFIIDIPSTNDSLTNCITNNPCLHGQCLRYYNGRQNPIFCRCDRGWSGRDCSIRNTCTCSSDSLYLGMTHHNRSVCVCSLHKFGPRCLLTNSICLTNKTARCFNGGECIPRDVDIQSNEKYTCVCPTGYKGKQCEFSENKLILSFGKDLVSTQSIFLHFILLESSSLSQSYQRTTTFRTIPYKQKSIPIYYSQPFHLLFIEFQNKNYYLTSIRNESQLSTTATINHFDRCPHINELFNKTFTEMHIIRRITYYHLPCRMSAYNLSCFYDEIHLCLCQTHRGKRVANCFEFNHSQTFDCQGRSVCENDAYCFQDSPACPRRSICVCRPCFYGTYCQFSTTAFSLSLDAILGYHIQPTLRLTQQPALIQISILFSMILIVIGLMNSLCALITFKERKLCEVGSAIYLLTASITTLLTTIIFGMKFWILIEAQRGAITDRIFLRIQCYFIDFLFSCCLHMDQWLTACIAVERAVITIKNVYFNKTKSKQWAKIVILILFLFIFGTNIHDPISRQLVDEKNELAQRIWCIASYSSSLKIYNYTINTFHFIAPFLLNFFSVIILFTKKTHQQSNIRRNRSYRDILLEHKHLVLGPIVSITLSLPRILLSFIFKCMKSTSDSWLYLFGYLISLSPYMLTFVVFILPSKFYMNEYRQAIRQIQNRLKRWTDSILNRLLFFQKIRISKNNRVHPM*