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SCNpilot_cont_300_bf_scaffold_1944_1

Organism: SCNPILOT_CONT_300_BF_Parachlorella_chloroplast_29_7

partial RP 13 / 55 BSCG 10 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(160..2640)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Hypothetical chloroplast RF1 n=1 Tax=Parachlorella kessleri RepID=C7BF04_PARKE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 94.4
  • Coverage: 834.0
  • Bit_score: 1592
  • Evalue 0.0
  • rbh
Hypothetical chloroplast RF1 {ECO:0000313|EMBL:ACQ90979.1}; TaxID=3074 species="Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Trebouxiophyceae; Chlorellales; Chlorellales incertae sedis; Parachlorella.;" sou similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 94.4
  • Coverage: 834.0
  • Bit_score: 1592
  • Evalue 0.0
ORF1995; hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.2
  • Coverage: 493.0
  • Bit_score: 195
  • Evalue 5.40e-47

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parachlorella kessleri → Parachlorella → Chlorellales → Trebouxiophyceae → Chlorophyta → Viridiplantae

Sequences

DNA sequence
Length: 2481
ATGTCTATTGTATCTTCTATTCGAGATTACGTTGAATTATTAAATACTCTAAGTGATTCTTTAGGGAATCAATTAACTTCTACTAAATTTATTAGTGCTTCTGTTGTTTATTTTTTAGATACTATTAAATATAGTATTTACTATATATTTAGTTTTCAATGGCTCCGTGATTTTACTTTGTTACCTGTAAATATTCCACAATATTCTCAAGCTATTTTTTCTGAACATTTATTTTTAGAAACTCCTGGAAAAGTTTTTTTTGAATTTTTGGAAATACCCAGTATAAATCAAAATAAATTTTTTTTAGGTTTTTTTAATAGTTTTTTCTTAACACTTCCTATTACAGTAACTCATATTATTACTTTTCGCCGATTAATTATTCAAGGAGTTCCAGCTGCTTTTTTTTCATTTTTTGGTTTTATATTAGGACAAACTTTATTTATTCTTTGTGTAACTTTTGGTATTCGTAGTATTTTAATTCCGTGGTTATCTTTAGAACCACTTAATTATATTCTTGGTTTCATTTTAATTTTTCAAATTGTCTATAGTATGGTGGGTGAAAATTTAACTGTACTGAAATGGAATAATCAATCACATAAACAATTTTTTAAAAAGTTTTTTATCACAAATTTAATTTTATCTTGGTGCGAACAAAGTTGTATTTTTCAATATTTTAGTAATCTTACTTTAACTGGACATCCAACTATTTTAGAAGGTTTTTCCTCAAAAACTGTAATAGCAAGTTTTTTCTGTCATAGTAATTATATTTTAGGTATATTTCTTGGTAGTATTATTTTTTCTCTTTTTTGGATATTTTTTATTTGGCAAATAAAAAATTTAATTCTAAGTTTTACTCGAATTTCTCCAGCTAGTTTTGTACAAACTGTAAATCGAGGAACTTTTGTTATTGTTTTATCATTTACTTTAAGTTCTATACCGTTTTATGGTTTAGATTATTTATTTGCTGGTCCTTTAGGTTTTATATCTCAAGATTATGTTTTTAAAAATACTTTTTTGGATCAAAATGAAATAAAAGATCCTATAGCTTCTGGGCTACCTAGTGATAAAAAAATATCTTTAAACATTGATGTTTCACCTTTTGATCGTGGTCGTTATTTAGTTTTTCCTGAAGATTCTGATCACTATAGTTTTGAAGATTTAAATTATCGTAGTGAAATGGATTGGACTAGAAGATCAGAAAAAGAGTCTAGTATTACTGAATCAAAAGCTGGATTTTTTTCTATAGGCAAAATTTTCAAAAAACAAAAAGATCAATCTGTTAATAACTTGGTTTATCAATCTCCTGAATCTATTAATGAAGCAAAATCTAATTTCTTACTTTCTCAAGAAGAAATCATGAATTATAAAATTGCTGATTCCGCAATACCAGAATATCGTTTTAATGGCTGGTATAATTTAGATTCTGATAATGTACCTGATTTAAAAGATGAAAACATTATTGACACTTATAGGCAATTTAATGAAACTAGTTTTTCTCCTGATTTTTTACGTGAAAATTCATTGATGGAAATAAACATTGAGAAAAAAATCAAACAAAAATACTATTCAAACCCTATTTATAAAAATTTATTGACATTAGATATCGATCTTTTTTTAAATCGTCAACCACCTTCTTGGTTTTTAGGGCCAGAACATGAATTAGATTTACATGAAAAACGACAATTATTGAATTCTTATTATGATTCTTTAAGATGGTACACAAAATTGCCATATGCTGAAAATTTTGAAAATTTTTTTAATGGAACAAAAAGTTTTACTAATAAAATTTACAACCAACAATTTAAAGGTACGTTACGATCTCTTCGACGTCTTTTTTGTTTAACAATAATTTCACCTGATATAATGTCTACAAAATCTAATGATTTTGTTTTAAAATATGATCAACCTTTATATCAAGGAAAGTTGAAATTTTCTCCTTATCATGAAGAAATTGCTGAAATAGAACCTTTTGATAAAAAACAAAATAATTCACCAAATGGAGAAAAAATATTAAATCCATTTTTAAAAGATTTTATTTCAAAACCACTTTATACTGGTTGGGATGATAATTTAAGAAAATTTGTTATAACAAATAAATTATTACCTCGATCCGTTACTGGTTATGAAATGAATAGATCTCCAAATTGGGACACCAAATTTAGTCTTGAAAAATCAAATAAGTTAAAATTTAATGCAGGTAATTCAGAAACAATTTATTTTTCTGTTTGGCCGAAAATCAAAAATAATAAACTTCAAGAAAAAGTACCTTTTACTTTTTTATTTAGTAATAATACTCCAGATTCTGAAATTGACAAAATTGGAGAATATCAAGTTTACAATACCGTTCCATCTAATTTTGAAATTGTTCAAAAACTATCAAAACCAGATTCTGGGTTTAATTTTGTTGATTTAGCACCTAAACGAGGTGGTTTTATTTGGTCAGGAACTATTCCTTTTGATTTTAAAAATATTTTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 827
MSIVSSIRDYVELLNTLSDSLGNQLTSTKFISASVVYFLDTIKYSIYYIFSFQWLRDFTLLPVNIPQYSQAIFSEHLFLETPGKVFFEFLEIPSINQNKFFLGFFNSFFLTLPITVTHIITFRRLIIQGVPAAFFSFFGFILGQTLFILCVTFGIRSILIPWLSLEPLNYILGFILIFQIVYSMVGENLTVLKWNNQSHKQFFKKFFITNLILSWCEQSCIFQYFSNLTLTGHPTILEGFSSKTVIASFFCHSNYILGIFLGSIIFSLFWIFFIWQIKNLILSFTRISPASFVQTVNRGTFVIVLSFTLSSIPFYGLDYLFAGPLGFISQDYVFKNTFLDQNEIKDPIASGLPSDKKISLNIDVSPFDRGRYLVFPEDSDHYSFEDLNYRSEMDWTRRSEKESSITESKAGFFSIGKIFKKQKDQSVNNLVYQSPESINEAKSNFLLSQEEIMNYKIADSAIPEYRFNGWYNLDSDNVPDLKDENIIDTYRQFNETSFSPDFLRENSLMEINIEKKIKQKYYSNPIYKNLLTLDIDLFLNRQPPSWFLGPEHELDLHEKRQLLNSYYDSLRWYTKLPYAENFENFFNGTKSFTNKIYNQQFKGTLRSLRRLFCLTIISPDIMSTKSNDFVLKYDQPLYQGKLKFSPYHEEIAEIEPFDKKQNNSPNGEKILNPFLKDFISKPLYTGWDDNLRKFVITNKLLPRSVTGYEMNRSPNWDTKFSLEKSNKLKFNAGNSETIYFSVWPKIKNNKLQEKVPFTFLFSNNTPDSEIDKIGEYQVYNTVPSNFEIVQKLSKPDSGFNFVDLAPKRGGFIWSGTIPFDFKNIFK*